MmuINT1026287 @ mm10
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Seq C2 exon
GTAATGGGACTTCTGACCAACCACGGTGGGGTACCGCACCAGCCTCAGACCGACTATGCTCTCTCCCCTCTCACTGGGGGCCTGGAACCCACGACCACGGTGTCAGCCAGCTGCAGTCAGAGACTGGAACATATGAAGAATGTGGACAGTCTGCCCACATCTCAGCCCTATTGTCCCCCCACCTATAGCACCGCAGGCTACAGTATGGACCCTGTCACAGGCTACCAGTATGGGCAGTATGGACAAAGTAAGCCTTGGACGTTCTAGGGGGTAGTTCCTCCTGGAAGGGAGAGAGATCACCTCTTGCTTGAGAACGGGGAACTGGAGGCATGTTTAAGCCTTTCATCCCAGTATCATTTTTTTGTGGCAAAGACAGCTGATTGCTACAGCACAGGCTCCCTTGTGTAATTATTTGCTTAACTGATGTCAATAACATCTTGCAGTTATTAATTGCTGGGACGGAAAACCGGATTGTCAGTAGGTAAAACACAGAGGTTGGCCAAAATGAAATAACCTCTAGCATTAGAAACACATGTTCTTAATGAGGTCAGCGCCAGGATCATATGGGGATAAGCCCAGGACACAGAGTTGTGTCAAACTTGTCTCAGGAATAAAAATATTAGTCTCGATCCTTTGATACCGTGGTATTAAATATGACATTGTCAGCCTGTAGCTGATCTTGCCCCTAACTGTGAATTGTCCCAGCATGACCTAAAAAGCTGCGTGTGTTTCCTTACAGGTGCCTTTCATTATCTCAAGCCAGATATTGCATAAGTGAACTGTCCACTTGGAGCCCTGTTTCCGGCCTCCACAGACTAGACATGAAGAATCTTCTCAGAAACAAAACAATAAAAAAAATTTAAAAACAAACAAAAAATAAATGAAAAAAAATTCAGCTTTTGGGGGAGGTGGAGACAAAAGAGATTGATTTTCTTTCTCCAGTAGTTGCTTTCAGATTCTTTGAACATATTGGACAAAAGGCAGGGGAGACAAGGAAGACCCAGAGCTCTAAAATGCACCATTTTTAAGACAGTGATGTAACTGGCTACATATCAAAATGGCCCCAAATCTTTGTTGCTGATCAAAGAAGCTAAAACATTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGATTTTCACGGGGTGGTTTGAGTAAGCAGAATGTTCCCATATATTGTAGTTGAATTCCTGAAAGTTAACAGGTTTGATGTCTAAGGCTGACCAAGTTTATGACATTCACACTGCTTATGTAGTGAATTGGGAATGGAGAAATCCTTGATTTTGACACACTGGAAACCGATATGAAAACCAACACCACCATTGTATAGGGCACTAGACTAGATGTGAAGGATCTCCCCAGTAAATTATTACCATACCTTCATTTGTAACCTAGTTATCAACCGATGTCCCTGACATGTCTTGTAAAAAGATGTGGGATAATGAGAAAAAAGTGTGTTATCTGCTGTGGGGATAGATGGATGTCATTTACTTCCCAAGTCACATTGATTTGGAGGCCAGTTGGTGGGGGGGGGGGAAGGGTATGATGTAGAGGAAGTGACACCCATCACATATCTGCTTCTCAGCGTGCAATACTGTGTACCTCACAGATGCTTTGGCAATGGCCAAGGTGATAGAAATGAAATCAGAACTATATTTTTGCAGGTGTTTTTATTTTTGCAGCCCATAACTCATCGTAGTAGAGTGCAGTGATGTTTGCTCGTTGCCAAACAACTCACATCCTGCTTGTTCCTTTTGTTCAGAGACCATGTCTGAGAATCAAGCTCTCTACAGAGATGGTGTTTACATTCGTCTCTTTTCTACAAAAGGCAGGGCTAGAACAGAAATGTCCACGTGGCTCTCATGTACTTTTAAATTATACAACGATACCCAATATTAAAGGATATAGGGAACAGGTTTACATACATTCATGTGGTGACATTTAGGATGTCAATAAATCTGTGTTTTGAAATGTTAAGAGAAAGATGAAGGTGGGCGGTGCTGTTATTTATTTCTTTCTATTCTTGGAACCATGAATGAGGTAGGCACAAATACATTCCCTTTAGATTTAAGAACAATGAGGTAGTGTGTTAGCAGGACTAGACATAGAACTGAGTTATTTTATACGTTGGGCAGGGTGATGGAACAGGAGACATAGTATCTTTGTGTTGCAGCCTCAACCAACAATGATGTGTTGTAAAAATGTCTTTCATGTAAAAAGTGCAGTAAATATTTACTATTTATAATGAATAAACAGTTAATGAAAATGTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000004872:ENSMUST00000087086:7
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
C1=1.000 A=NA C2=0.988
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF123603=Pax7=WD(100=63.9)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types