MmuINT1029675 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000039607 | Rbms3
Description
RNA binding motif, single stranded interacting protein [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2444477]
Coordinates
chr9:117056737-117110118:-
Coord C1 exon
chr9:117109961-117110118
Coord A exon
chr9:117056796-117109960
Coord C2 exon
chr9:117056737-117056795
Length
53165 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACCGTAAGT
5' ss Score
10.43
3' ss Seq
TCTCTCTCTCTCTCTCTCAGGTA
3' ss Score
13.54
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types