GgaINT0092978 @ galGal4
Intron Retention
Description
NA
Coordinates
chr2:39841958-39870313:+
Coord C1 exon
chr2:39841958-39842127
Coord A exon
chr2:39842128-39870254
Coord C2 exon
chr2:39870255-39870313
Length
28127 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCCGTAAGT
5' ss Score
10.11
3' ss Seq
GTTTTTTGTTTTTTCTTTAGGTA
3' ss Score
11.66
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Features
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Human
(hg19)
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Mouse
(mm9)
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]