DreINT0125518 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000044574 | rbms3
Description
RNA binding motif, single stranded interacting protein [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-060929-244]
Coordinates
chr16:39887238-39907166:-
Coord C1 exon
chr16:39907009-39907166
Coord A exon
chr16:39887297-39907008
Coord C2 exon
chr16:39887238-39887296
Length
19712 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACCGTAAGT
5' ss Score
10.43
3' ss Seq
TTCTTTTGTGTCCATTGCAGGTA
3' ss Score
12.26
Exon sequences
Seq C1 exon
CAGTCATATGCCCCGCCCCCTCCGCCCATGGCTCCGCCCAGCCCCAGCACCAATAGCAGCAGCCACAGTGCAGCGGAGCAGCTCAGTAAAACCAACTTGTACATCCGGGGCCTTCCGCCTGGCACCACCGACCAGGACCTCATCAAACTCTGCCAACC
Seq A exon
GTAAGTGTCTCTCCCAGATGACTCCTATCTTTCGCTACCTGTTATGCTCTTCTCTCTGTTTAAACAGGATTGCCATCCTATGTGTGCAGTTGCTCTATACCTATTTATAGTTGAATAGACACAGGTGCCCACATACAAGAACTCATGCAATCATGTAAATGCACACAAAGAAGGTCAGAGGGATAACAAAAAGAGTCACTATGCTTGGTTAACAGAGAAGAATATAGAGACTAGAGGATGAATATGGCCTCATAAATGGATGGCAAGTCAGCATCATTAGCGTGTAGGGAGGTCATTATGAAACACTGTATAAGAACCAGGGGGCAGCTTGCATAATCTTATTCTCTGATGACTCATGCAGATGTAAATCCTGTGTGGGGGCTTTCTGCCTTAAAACCTTAGACATTTACTCCAGCGCCATGACCTCTTTTGAGTATTTCTGAATTTCCTAATTTCACCCATACCAAGCTGACCATGAGAATATGGGTCTGGGGTCACCAGTTTCTAAGCAACATTTAAGCCAAGACTGCTTTTTTTAAGCGGACCCTGAACAGATGAGTGCAATTACCAGGCCAGTCAGTTCCCAGAATTCATTGTGATCTTTTTGTGAGTGTGTGTTGTTGAGGGAGAAGTTGAAGTAAAAGAAACATTAAAAAAAACTAAAATGCATGCCACTTATAATTCTCCAAAAGTCTAAACTAAGAGGGTAAAATGATGAAACCTCAACCCACAACCTCCCACAGCATCTCTCAATTTCTCTCTGGGTCTCGGGCTACTACGGTCCAGGTTAGCCCAAGGCCTGGAGTGGGATTGGAATAAAAAATTCATGATTATAAAAGTTTTATTAGCTGCGGCTGCCGTGCCAAATGGGCAGTAACATTTTGGAAAGGTCAAAGGGGTTCGCCTTGGGGCTCACTTCCGGAGCTCAGCAGAAAGAAAAAAAAGAGAGCGTCTACAAACACACTTTGCATTTTTTTTTATAACACCACAGTGATTTAGATGCCATGCATGCATATCTACAACCCTAGTGTCTCGATCTAAAGCTTACAGCTGCGTGCATGCATACGCACACATTTTTGCACACAGTTAGTGACCCTTTTCCGTCCTCCAGTGGCTCTTACGCAGTGGCGGGAAGGGCAGTGAAAAGTGCTTCTGTCAGGCTGACATTTCGGAGATCTTCTTGTGTGATTCCCGGCGGAAGATTGGCAGGGTTTTGAGGCTGAAGGTACAATGGGGTTAGACTTTAAAGGAGAAAACGTGTGGCCTCAGCAAAATCCCAAACCTCAGGCATGAAAGTGAGCCCCTCTTGTTTTCAGCTTTTATTAATTAGATTATCTGATAATTAAGGAATGGCACGTTGTCAAGATGCAGACGCTGAATGTCTGCCACATTACAACTTTGAAACAAACATCTAGATTTTAACATCTCAATGATGTCGGATTAGAAGAGGTGAAAAGGTCAAATTGGAGGAGCGTAACATTTACTGAGACGAAAAGAGCCGAAAATGCACTAGGGCATTTTCATAAAAGGCTTGAATATGAGTCATGAATTATTAATGAAGGCCTTAGGTGAATACGTCGTCATGATGTTTATGCGCTTTCATTGTGCATCTGCAATCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTGCTGGCGGAAACCAGAGGGCGGAGAGTCATGTCTGTGAGCCAGTTCATTACTTTTCCTTTCCATGATTCGATATTATGGAGTATTAACCCTCAGGACACCGCATTTTACAATACCATTTAAAATAATTGCATTTCAGATCCCCTCATTATGTCTCTGATTGTAATCTAATGCAACAGAGAGAAAGTGAATACAATCCAACTCAATTCTGCTCTCACTCAGAGCAAGCTTTTAAGGGAGAAATTAGGATTTTCAGTTTAAGTAAGTTCAATATGTTTTTGGCCAATTTGTTTGTCATACGTACAAAAAATGTATCGTCAGTTAAAACCTGAGCATGCAGAAGTATTTCATATGTCTAGAGAAAATTTGTTTATTAATGTTTTGAATACTTTGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAATGTAATAATGTAAGTAGTAGGTAGTAGTACACTAATGCCGAATTCAGACTGCATGATTTTCCAACTCACATATGTTTTCATACTGCATGACTATCTGGGGTAGCATTCCGTCGCTGCTGTGTTTATACAACTGGATGGATTGGCGACAGATGGTTTCACACTGCATGACTTTACAATGGGAAGAATCGCCGACAACTTTGTCTTGGTCCTTAAACTACGTCTCACAACCTAACACACGCGAGAAGTGACATGAAAACAACGCAATGTCATGAAGTATATCTTTTATTATTAACTACATAATGAGAAAGAAGCCGTTAGTGTTAGTAAGTTTACTTATTTTGCTCACCTGTGTTTTGAAGGGTTTTTGAAAGGTTTTTCCTTTTTCGACCCGGTTGTGCTCAGACAAACATGGGTGCTTCTGCCAAATTTCCACTAGTTTTTCATCCATTTCTTGAGTCCAAATAGACCGAAAAGAACTTCTTCCCCGACCTCTCGGTGGCCTGCAAATACCCATACTAGTGGATGCTGCTTTCTTATTGACTGTAGGTAATCGCCGCTGTTATTTTTAATCAAAACACATTTCACACAGCATAATTTTTAAGACAGGTCCAGCTAATACCATGCCAAATATTTAACAGGTGTCGGCGGATCCCGTCTTTGATAGTTCACACTGTGTGATTGTTACTCACGTGAACAAGCATAGTTTGCCTGTGATTTCAGGCATTTGTCAGTGATTTCTCAAAACCTGTCGGAGACTCAATATTAAAACTAAAATCATTAAAACTTTTAATCTCTTCAAAATAGTAGATTAAAAAAAAGTTAGTGTGGAGTTTGTATGCTGTCTAATACATGACTGTCTGTTTGTGCCGCAATTTAAGTTCTTTCACATCATCTTGCACTAGAATGTTTTATAACCACCTGAACATCCAAACTGGCAAGGCTTAAAAATACATGCAATTTTCATGATGGCATTTCAGTGGTCTAATCTGGCGGCACAGTGATTTTTGTGTAGAGTTTGCATGTTCTCCCCATATTTGCATGGGATTCCGCCAAAGTCCAAAGATATGCGGTATAGGTAAATTGGATAAACTAAATTGGCCATAGTGTACGAAGTAGTTTGCAGTAAATTCCGCTGTGGCGACCCCTGATAAATAAGAGACTAAGCCGAAGGAAAATGAATAAATGGTTCTATCTGGCATTTGAAAAATTCTCAATTGTCCCTCAAACTTTAACTCCAAGTACTGTAAATGGGAATTCAAGTTCAAACATGGTGTAGCTCAGGAGTCATTATAAATACACACACACACAAATGAGTTGATATACACTAACAGCACAGCGCTACAGTATAAATCAAGGTCGATAGGCTATCTCAAATAGTTTATTTTTCAAGTTTATTCAATTTTATCAGATTTTTTCTTAGATGAGAAATGTTTTAGTCCATATTTAAAACCTTTGGCTTTTTATTCCGAATGTGAAATCTAAAGGGAGACAGATGCAAGATTACCAGGAACTCTTTTCTTTTTTTGCTTAGAAGAAAAGTCTAGGGAGCAGGAGACTTCATTTGCTCTTCGTTTAATCTCATTGCTGTCTAGGAGAAACAACTGAGATACAAAATTGATCTCATTTGTGCTTATTTTCCCTTTGTGTGCATGTGTGAGTAAGATGAGAATGTTATTATATTGCTTCCAATGGAATCTTGGCATTCAGCGCTTCTCATTTTATCGGTTTTATTCTACATTCCTCTCCTATGTATAAAAAATAACTTATATACTTCATATTTGCTGAAAAGCATCCAAGGCTTGCTGCCCAAAATGGCAACCCCCCCACCCCACACTCCCACCCGCACTCTCTCTGTCTTTCAGCCTGATTGACTAACTGAGCCAGTGGAGGAATTGCCCTTGTGTACTGGGCTGCCATATCTAGGGGGGCCTCTAGGGTGGGATCTCATTTTCAGTCGGCAGATCCCCCCCTGGGCTCGAATAACTCAGGCATCCAGAGCATGCAAACCATTTCTGAGCCAGTGACAAGGCTAGTAACAGGTCACGGTTTTTATTTCAAAGTGTTGCTTTCTTACCATACATTTGTCATCTTCTTTTTCATAGACTAAAATTTATGTCTTTTTTTCATGGCGGTAGAAAGCTCTAATCACATGGAGGAAATCGGGCTAGTGTTTCTAATGATTTGACGACAGATCCATAATTCATAGTGTTAAACTCAAATTTTATTCATGTCACTGCTGTAGTGCAAAATAGGGTATGGTTCAAAAAGCAGCTCCATTTCTAATAGATGCATATTAGTAAATGTCACTCTTGTCTAATTTAAAACTGTTGTATTTACTGTTTTTATTGTCACATGGCTGCAGAACTCTTGGGATTTAACATGCAAGATGTATTAAAAAGGCAACACTTTATAATAAGATTCTATTATTTAATGTTCACTAGTCTTGTCACAATATTGTATATATTGATGTATCACACAACAGCTGGACATGACCTCAATCATTTTTGGTTATGTAATACATATCGCCCATACATTAAAACCAATTCTAGCAACATTTTAGCTGATTGCGCAACATCTCATCCTCTTGAGGTGTCAGTATGGTTAAAAAATAACTAGAATTTTACCAAAAATTACTATATTGACTATAAAATCTATTCCCCTTATTCGCATTGTACGAGTTGGTGCAGCTATTTGATTTTTTTTTGGCTCAAGACTTCCAATCCCATTCACTTCCATTAATTTTTAGACATTAAAAACAGTTTGTTTTGCCGCTTGATGTTGCAAACTGATCAAAGTGATATTTTCTTATTATATTATTATATTTTGTGTGTATGGTCATGCAACCACTTGTTTGTAAAGCAAGTAGTTTGACCGTTTTCTGCCGTTTATTATTCCTAGTCATTTCTCCCTTAGGCAACTGAATCGGGAGTTCTAAAACAATTGCAAAAAAAGCACACTTCCGCATTGAAGAATATTATCAATATAATGTATTAGACTAGATTAATTATAATGTATTATAAGGTATCAGACTACTGAAAATAGATCAGATAGATAGCAGATATCGCAGCCTCTGTTACTGTTTACCTTGCACTTTTTTGTTAACATTTATTATTGTTTATTTGTTAAGAATAGTTTCACATTCTAATTTCAATGTCTAATTATTCAATTGTTAAATGACTATAATTAAGAATAAAATATTAGGTGTTCTTCAGGAGAGTGTACTTGCATTGTGATTATATTGTATTGCCATTCTGGCATTATATAATGAGTGGCACAAAACGGTCTTAATATGACAGTAATGTTTACCTCAATATTTTTTGGTGCAATATATCGTACAACAAAAATTCATATTGTGACAGGCCTAATACATTATTTACTAGCATGAACAAAAAATGAACAATATAGTACAGTATTTATTTATCTTTGTTTATATATTTATAGTTCCTATATAGTTCCTTCTTAGTTCGTGTTAACTCACAGTGTGTTATTAAATTTTAACAAGTTTATCTTTGGAATTTAAAAATGCGTTAATATATATTAATAAATGGTGTACAAGTAGTGTTCAATTTTAGTTCATGAATTAATTACAATGGGAAAAAAAGCTTTTATTCATCCAATAAAAAAAAATAAAAAATAGCGTAATGGTTTACATCTAAATTTAACCTCTTGATCCAATAAAAAATAAATAATTTATCTTAAACAACATTTTCTATTTCCATGAGAGTTATTTTATATAGCCTGGTACAAAGCATACTTGTCTTGTTGAAGAAATTCAATTAATTAAAATTATCTTTTTGTTCTAAACAAGAAAATATAGCTTTAATTAAAACAACAACTCCCATAATTTGTTCATTCATTTAATAAAAAAAGGGTAAAGGTTTCACATATAAATTTGATTACTTAAGCAAATGAAAAATAATCGTTTGCCTTAAACAATATTTTTTAAGACCATGGAAGCACAAAGCATATTGAGTTTCTGTTTAATACGCATGTACTGGTCTGTGTGAGTAACCTTAAAATTTTACATTGGTCAAAACAAATATTTCTTAGTTGAGCTTTTAATCAAAAACATTTATATTTAACTATGATTTGAATCTAAAATATATTACTTAAAAAAATAATAGTATTAAACTGAAAAAAAAAAGATTTTTAATTGAATTACTGCGTGAATTTTTTTTCAGTGTAACATTAATCCTTATTGTAAAGCATCACCATCAAAAATATTGTAAAATCTATTAAGTATTAATGTGATCTCAAAGCTGAGTTTTCAGCATCCGTTACTCTCGTGTCAAATGATTTATCAGACATTTTTCAGATGCTCATTTGGAGCTCAAGAAGCACCTTTTATTTCTATAAGCTTTGGTAGTCTGTGTGACATTTAATATTTATAAATTTTTGATTACTATAATCATTTTATTCCTAACAAAGTAAATGTCTTTACTGTCACTTTTGAGTTATAAATGTAATGCATCTTCAATTTAACATCTGAGAAAGTACTAATTTCCTTTTATAAAGACATTGCCTAAAATTTGCATTTTTCTGCATTTTAATGTTAATAAAATTGTGAATTGTATGAATTTAAACACCTTTTTGCTTGCTTTTGTAAATTTTGGTGCTGGATATCCAACGTAAAATTTGTTTCCTGAAGAAAAACCTTGAATAGTTTAATGTTTTCATGGGGGCACAGAATCAAATTGGCATTAAGTGATGTTTCCCTTATGAGACTTCTCTGTAATATCTCTGGTTATTTCTCACTGCTTTTTTAAAACCTGAAAGCAGTAACATGTCTCCAGAATTCAGACCTAATCTGAGGTCAGATGAGTGTCCGACTCCTCTTGAAGCTCAGCTGCTCTGGGTCTGTTCAGAAGAGCATGTGAGGGGCAGAAAAGCCGCTAGCCATGAAGAGTCGTCTTGAAGTCTTTGTAAACTCAATCTCTCTGTCTCCCTCAGTATCACACAGCTCTTGTCAATATGTGCGAGTTGGGAGATGAAGTGGGAAGCTTAGTCCAAAGGTGCCTAAACACTCAGGATAAAGGTCTTTTAGGCTGGATTCGACTCTGTTTTATTGATATCAGCTCTGTCTTGTGCTTTCCTGCTTCCTAAGCAAGGTGTCAGTCATCTTTTTGAACCCTCCTCAGCAGTTCAAACCACACACACACTCACTTACCAATCTCTTGTGCTGAAGAACAGACAAAAAAAAAAAGCGAGGCATGCCTTGTCCTGTTAGCACGGCTCCTGTTGCGTTTTTGGACACACAGACCTAGATTTACTATAAATAATAAATAAAGGGCACTAATAATGTAAGAGACCCAACTAAAGGATTCTAATTTGCTAGTACAATCTACCAGATTGCATGTGTGCTTTTTTGGTCTTACTCTGGGTGATTTTACTAAGGTTAAGTTCACGCATGCAGCCAGACTTGCAAATAAGTTGGTCACACCCATGTTTAAAAAAGGGATTTGTGGTTGGTAACTTCAGCGAATGTTAGACATGTTGCTCACTTTCAACCTTAACTAAATAATAGGACACCTGTGGTGTTCTGTATTCACTTGTTGTGTTCAGGTCTTGCTTCCACCTGGTATTAACATGCATTCAAATGCATTTTTTTTTAACCCTCGAGTCTGAGTTCGAGTTTTATCTACCAATACCGAAACCCGATCTGATGCTTCTATAATACATAAAAAAAGAAGAGCAAAGAAACAGATCCAGGATGTGCCTTATTTTTTTAATTTACATTATTTTAACATTCCACACTTCTGTTTTAACAAACGGAGCACTTCTGTAAGGTGACTTGAGCAATCAAGCAATAAATAACATCAATTCTTCACTTTTGGACTTTAATGCAACAGTAAATATATAAATATATAAAATCGAATTTAAAAACAAATAGCACCTCAACTTAAAATACCCGGCAGGCAATCCCAAGTTTACATATCTCACAGTTTGCTATGGCAATGTTGTCGTCATCAACTTTATAATACCTCCATACTGCAGACTTACTCACGCATTACGCTTCAAGCTACTTCCTTGTTCTGCTATCATGCCACATGGTTGCTGTTTCTGTGTGAAGTCAAGAAAGAGGTCTAACTCTGTTCACCGCATAACTATGGATGTGTTATAAAGTTATGAGAATATATATGTTGAGTCCAGATCGGGGAGGTAACGACTGATTTCAACTGAGTCTGAAACCGCGCGATCGGGCCTAATTTGTGATCACGTGATCGGATCTGGACAGCCCTATTCATAACTACTAATGAACATGTATATAACTAATGAACTACTAATGAATGTCTTAACACTTGTGTGCTGTTGGGGATGTTTTACTTTGGTGTGATTTGAGGCTTAATTTTACCAGAACCCTCTCTATGTTTCTGCAAATTGAATGATTTTTTGTGACTAATTTGATTTCGAAACATATTTTGAGAAAATGCTTTGAAAATTTTCAAAAATTCAGCAATACACTCTGGGCAAATTTACTACTCTTTCAAAAAATTGTACAATTTAATTTCATTTAATTTTATTTAATTCATAACAAAAGGCAAAACCATGACTTCATATAATCATGCATTCTTGATTCTTGGTGGTTTTTCCTGTGGGAAAGAGGTACAATTGGTAACTTTTGTTGACTTTTATATGGCGTTAGCTGGAGTATAGTGTGGGTGGGGTTGTATGTGACTTTACAGTGTTTACGGTACATTTACAGTATTTTCAGTACCTTGCTGTTTTACTTCATAGAACGCTATATAAAAGCCAGACACTTTTCGCACAGGCCTATCTAAAGGATTAATGGTGTCAACTGATGATCAACAGTAAAAATGACTAATTTTACCTCTTACCAATAGAGAAAACCACTAACACACATGAATGCATGATTATTTAGTGTCATGGCTTTGCAAATAAAAATTTAGTTATAATGGAAGTCAATGGGGCAATGACAAAAGGGTAGTCAATTTGAACAATACTCAAGGATAAATAATAGGCAGTTAATAAGACAGTAGTTAACATTATGAATTGTGACCTGAACTTAAGTGTTACATAAAAATATAATAAAACACTTAACTACTGTACTCCTGATATAAAATCTGATAATACCTATTTTAGTATCAGTATCTTTTAGGGCTTTGCAATACATCAAAATTACTGAAATGTTGCAAATGTGCATATCACGATATACATTATTTAATTGTTCGCAATAAATTTAATACAATTTAATACAAAAGTATGTTTGTGTTCCTGCCACTAGCACACCCTCATCACATCAGGCAATAGTGATGTATACTCACCTCTCTGAAACCAACCAGGCTGGACATGTTGTTTTTTAGTCAAAAACTATTTTACTATGAATACTGACATACAGTTTGAGCAGTCAAGTTAAGAAATTATGATTTAAGATAAACTATGTCAGTTTGATAAAACTAGAGAAGCAAATTGGTGGTGATATTTATTTATTTGTTTATTGGTTCATTTAGCTACATTGTTAAAAGGTCAGATTTGTTTTATGCAACAGTAAAACATGGCTGTTCACTTCAGAAGTTGTAGTGCTTTCATTTCCCTGAAATATGTCGCATTGCATATTGCATTATTTTACTTGCTATTGCATAGCATTTTTCATCAATATTGCACAACCTGAGTATTTTTTTAAATTATTTTGTTTGCCTTAATGATGCATTTTGTAATTGTTACACAGCACCTTAAGCTTAAACCATGTGGATTATTAGTATATAGGTACAAAGCAGATCTTGATATTGTCAGTTAATGAAACACACTGTATAATTTCAACTACAGCTGTCATTACTATATATATATATATATATATATATATATATATAGTATGGTTTGCCTTGTCTGCATTATAGGCAGAAATGCTGTTTTGTTAACCTGTTTTGATTTTCTAGGTCTGTGTTGTATATTAGACATTAATAAACCACGGGAAACATTTTGTGTGCTTTCTAATAAGCTTAGATGTGGCTTTATTCATGCAAACATTTACCAAATCAAGGCCACAGAGCTGTAGGAAAGCGAATCCTTCTTTTTCAAAGTCAGAGGGCATCTTTCTGGATTCCAACGGTGCAAACAAGCGTACAAACAAACATCAGATGCTTGTAACTTACGGCACAGAAGTGTCGAGCGGCATGTCAGACGAGACAGCTGCATTGGTAGCCAATTAAGAGATCCTACACACCCACCTGGATAGAAGTTGAAAGAATGCTGGTTCACATCTCTCGGCACGAGACATCAAACGGTCCAGCATCCGTGGCTGCCGGCGCTCTGGGGAAAATAAAAACACAGATCAGAGTGTGTGACGGCCCTTTAAGAACTGTCATTAGCACTTCACACACCGCAGCTGAAAGCTTCGTACACAAGACGTGTTGTGTTGTGTTGACGGTGATCAAATCAGCTGGGATCTGCTCCCAGCTTGGGCTGTCACAGCACGTTGAGCCGTGTCGAAATCTTTCAAAAGTGTGTGCGCACATCTAGAAATATATATTTCTCTTTATTGAAAGTCATTCTAGGCATTTTGGTTAACCTCATGTGGTGTTTACAGTTTTTTTTTTTGTGCTCATGTTGATTTGATTTTGTGTGCTTGTGGGTTGACTAAAGCGCTGCAAGGGTTCAATGTGTGCTGTGTTGGAAAGGGTGGTGGCGTGTGTTTGGTCCTGGGTTTGTCATTTGTGGGACCTGACGTGCTCTGGTCAGTGTGGAGAAAAGGTTCTTTCATCCAGATCACCAGAACATTGTGATCCCACATGCTGGCTGAAGCGCGGTATTTCGCAGAAAGTTTTGGCGTGTGTGGTATCAGTAGGCCTAATTAAAGCTCTCAGAGTATCTGTTATTGTAAGGGCGTTGCTGCCTTTTTTCTTTTTTTCTTTGATTCTGTTTGTTACAGCTGGCTTGCCTTTCTGCTGATATTAATAGTTGTGTGCATCCCTCACTAAGAATGTAGGCATAGGAATTCAGTATAAATGTAACATAATCGGATAAATCTACTCTGGCATTCCTGTATCTTATCATTGACCCCTCTAAAAAGCCCTATTATTTATACAGTATAGTATATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTGGTTTTTGTAGTTTACAAGGACATGTCTGTCATCGTATTTCAAAACATTTAAAAAAACATACTTGATGGAGTCTTTTGGAATTCAGGCTTTGCTACAGGTTTCTTGTGAGGGTTGGGTTTAGGGTAGGGTAAAGCCATATAATAATGGTTATCACAGTGTAAAAACATTATGCCTATGCAGAAACTACTTTTGGTCGTCATAAACTACATATACAAGTAGGGATGCAACAGTTATAGATTTTGGTTGTACGATTATAGTCTGAGGAATAATCATGATCACGGTTATCATGATTATTGTGCATTCATTAATTTCAAAACACTTCTAGATCAGAAAATCACATGGAAAGCTCCTTATATTTTAAAGTGTTATTTATTGCTGCTCAGTAAACAACTGATACAGTTCATTCATTCATTCATTTTCTTGTCAGCTTAGTCTATTTATTAATCTGGGGTCGCCACAGCGAAATGAACGGCCAACTTATCCAGCACGTTTTTACGCAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCATCACTGGAAAACATCCAGAAACATTCGTTCACACACACACTCATACACTACGGACAATTTAGCCTACCCAATTGACCTGTACCGCATGTCTTTGAACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCCATGCGAACGCAGGGAGAACTTGCAAACTCCACACAGAAACGCTGACTGAGCTGAGGATCGAACCAGCGACCTTCTTGCTGTGAGGCAACAGCACAACCTATCTACTGCGCCACTGCTTAGCACAAATAATACAATATATAATATAATATAATACAAGTAAATAAAAACTAACAATTGTCTGTTTCTCCTTGGACTTAAAAATAAGTTAAAAACGTTTTGACATTAAACATAAGTAATAGTAATATAAAATTATTAGTAAAAGTAATAATTTTACTCTGAAAAAAATGACAGAACAATGAATAAATAAAAATACGATTACATAAAAAATAGTATTTTTTCTAATGTGAGTCATATTAGTGAACTATTTTCCTTTTAAAGAAAGCAAATGTAGTCAAAGGCTGCTAAACCTCTGTCTAAAAGACACTTTTGATTAACTATATTACAAAATTGTTTGGTGTTTTCCTTTTGTTTAGTTTTTTTTCTCTTTGAAGTAGAAATGTTTATATTCCATACAATGTGCAAAGCTGATTGGCCAGTTCTTGTCATGTAACTTGCGGTGCATTTGCAGCATTCTTGCAACTAGGTGCGCCTAGAAAACGTGAGCGTTGCTCCCATGTGCTCTCAAGGCTGCACGCCTCCATTGGAAATAACAAACTTGCACGCGCAAAAGACACAACATGTGAACTGCCCTTAGTTAATAGCCTCAGCCATAGTTAATCCAGTGTGCGTGCATATTAGCATTGATGTACAAGCTTGGAACTTTAAACTAGCGCAAATTTGGCATAACTCTTGTTTAGTTGCAGCAATTTTGTTCCATACAGATACACTGTGTCGAGAAGCCTTTTTGATAATTACCCATGACCAATTAAAGTGCAGTTAATAGTGAAATCTGTTAATTGTTGCATTCCTATATACTGTACAAGTACGTGAGTGTGTATGTATACACAAAGTCCCTTTAAGGCAAGTCATTTCACTTTACAGCCGTCTTTGAAATGGGGCATTCAAACATCAAATTCTCCAAAATTGCTTGCCAAGCTTATGATTAATTTCATATTAGGAATCACCAATACAAATAAACAACAACTGTGTCTTTAGTTTAATTTCTAAAAGTTCTAATCACACAAAATCTGCAGAAACTCAAATTTGATCCAAGCCCCTCCCACCAAAGATTTGTCAGTCTATTACGATCGATGATTGGCTCCTGTACAAGTAGGCGGGGCTTCATTCGCCATGTTGACCACTACAGGTCTTGTGTATTTTATATTCTTTGGTATACACACACACATATTAAACTTTACTGTCACTTTACATTAATTCAATTCTGAACAATGTAGAATAAAATCTATTTATATAGAAATAACATATTAATGAAAATCAGTTTGATGCGTGAAGACAAACATATTATTTTTCACACCCCGTTTTACCATAACAATTTGTAGTTCTTTGATGTGACATATTTTATGACGCATAAATGAAACAGCATGTTTAATTAAATAAAAGTTAAATGAACATGAAAGGTGACAGTTGGTCGAGACGTATAGTGGTATCAGCCGAAAAAAGAGTGTGAAAAAAGTGTCCTATTTGAATGATTTAGACCAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCTGTCCAAATTAATTAATGCAATATAGTACCAGAAATGTGGAATCATACTGTAAACATTTTCAAAATTTTTCTAAAATACAGTACTATAGAGCTGGATTTTAGACTAATACGATTTTGCTGCTGGCAGGTCAACAAATTGCAAACTGTTGAAAATAGAAACCAATCAATCTTGTTGTGCATTCCTACTTTTTTGTAGTCATGGCTGGTTAGAAGACTAATCTATTTATTATGAATGAACCTTACTGTATGTATCTGCTGCTCTTTTGTGTTTGAAATGACTAGAACTTGCAATATGCTATTTTTGTCTTTGAGTTTATGATATTGCTGTAAATCATAATCATCATATATCAAAAAGTACACTGTTTACTAATATTGTAACATAAAGCTTCTCTCACTGTAAACCATTTGACTCTTTGGCTTGATGTTATTTAAGGTCAGATTCTTGGCACTAGACATCCATGAGGGGAACTCCATGCTTGAGGTTCTGAACGCTTTCAGCTTGTAAACACACTTGAATCTTGTGCCTAATCAAAAGTTAACATCCATAGAATTTTTTTGTTTTAATGTTAATCAACAGTAACCATGGTACAAAACCCATAAAAACATTAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAACAAGTTCAGCACTTCATTAGTGTGACTGATAACACTTGAGATTTGCCAGCATGAATTTTACATATGTGCAGACTGTAATGAAATGCATGCAATGCTAATTAAGCTAGTGCATCTTTTAGTTCTAAAGACAGTAAGAACATTAAAGGAATAGTTCACACAAAAATAAAGCTTCCATCATTATTTACTCATTTGGAAGCTTTCTTTCAATCCTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCTAAATTCAGTGCAGGTTTTTTTAATTAGACATAGGGTATTTTAGTGATTCAACCATTGTATTTTTCTTTACATAATCTTTAATAGAGGATGTTTACCTATGTTGAACCTAAGAGAATGTATCCCTTATTCCACACAGATCCAACAGTTACATTTTTGTTTGTTTCTGAATTCAGCAATAGAAAAAAGTTTTTAAAAGATATTTGGGGGGGGGGGGGGATTTTTTACCTTTTTGGGATAGGATAGTAATCAGAGATGCAACAAGAACTGGCCTGGCATGTGTCGATGCATTGCCCATGTGTCCATTTGTGCCAGCAATGGAGAACCACCAACAATACTCCTGGCTTTATGTAGGGATTTTTATGACAAGACTGTCTGAACTAAACATGCCAATTCACTTGCCATTGACTCTCGTAATTCTGGAAGGCAGTTGCAAGTTCCGTCTTTCTCAGTGACATCTCACATGATCGACTGTGAAGCCACATGTAGTCTGAAATTACAAGCAATGCTGATTGAGTCCTTTATCAAGTTTTTGGGCATTCTATTGCTCCTTGAAATCAGTAAAAAAATTTGATTATTTTTTTCTAATAACCAGTAGCATAAATCTATAAGCAAAGCTTGAGTGTTATATGCCAGTTTGACCCTTTGCTCATTTTGAGTGGACATTTCTCTGAATACAGTAAAAGTGACCCATTGAAAACAAGCACATACTAACAATGTGTTTAAAGAAAATATTGAAAATGCAAAAAATATGCAGTCAAAAGTTTGTTTGTTTTTTCATGTTTTTTTAAAGGAAATTATTCTGTTCATCAAGGCAGCATTTATTAAATGTAAAAAATATGTTAAATTGTTAAATATTTATTGCATTTTTAAATAACTGCTTTCTTATTGTATGTGGTTTCAAATGAAACTATTAGTCCAGTCATTATTGCTTTTATTACTATTTCCATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAAGCTGAAAATTCATCAAAATCAGCTGAAGATTCAAAATCACTGGAATAAATTATTAAATAAAATAATGAACTACTTTTGAACAGTTATTTTATAGTGCAATAACATTTCAAATTATTTTTGATTGAATAAATGCAGCCCTGGTGAGCAAGCTTATTTTAAAACATTAAAAAAAAAAACTTACTGACCCCACACTTCTGACTGTTAGTGTATATGTGCCAAAAAATGAATAATTAAAAGACTAGTATTTTCAGCAACCAAAGTATAGTTGACAAGTGCTGCAGTTTCCACTACATATGGCAATACATCTAAATGCACCTTTAACCTGGGGTAGAGCAACGTCACATTGCAGCAGTGCTGCTCTCCATCAGCTTAAAGCTACCCTGATGTTGATTGTTGAGTGTGAGCATGATCAGGACAGTTTGCCAGATGTTCTCACAGTCAGCTCCTCCACCTTTGGCTGAAGCTTTAGCTGTGTCATCCTGACAAATGATCCTAAAGAACATTATGCTAACCAGAAAGTATACGGCATTGGAGTCATTAAAGTTTTTGAGGTTTCGACAAAGACTTTCATTTCGCAACTTATAAATCAAAACCACAGTCATCTACAGGACATTATCCCACCTCAATAGTGTGCAATGCTTCATTTATTAGCATCTAAACAAACTTAACAAGATAGGCACATGATTAGAGGGGCATTTTGCTCCTTGCCTCCCTTATTGACTGTGAGAGCATGTTTGTAATGGAACTTTCCTGTTCGTGACTTTTATGTTAGTAAGGCATCCATGTGCATGACCGCGGCATGGCACTGGCTTGCGGAAACGTTGCCAATTATGCTGACTACATTCCTCCCTCAGCTCCACCCCCGACCCACTCACTCATCTGAGACGCCTGTGTTTGTCCAACCAGTTGTTTTGCAAGATGAAATGGCAGCAAATCAAGCGTTCGAGTCAAATGGTTCTCATGTGTTTCCCTCACATTTGTGCGCTACATGCTTTCTCCAACAGAGCGCCTCTTTTTCATGTCTTTCCCTCTCTGTTATGTGGTTTCTCTCGTCCTCAGGCTTCCACTTTGTTTACTGACAAACCATATTGATAAAAAAAAATCTAACAAAACCAGTATTGTTTCTATAATGAGTTTCTGCAATAGCAGAGTTGTGATTATCCGTATTTGGGAGAAAAAAACATCGGCCCACTTTCTTGCTGTGTGATGGTGTGAATTGCAGAGGACTTTGTTGATAAATTCGCACAAAACCTCATATATGTTTTTCTATCCACTATCAACCTTGCAACGTTCTACTGTGGCTTACGGTATTCATTTGTGTTACTTCTGCAAAGCTCTGCCGTTCGCGGGCTTATAAGGGATATGAGATGAATTAGCTGCCATTTCCAGACATCAGCTTTACAATGGCTCGGTGGGACGCTGCTTCTCATGGTGACAGGGAAATGATCCTTCCCTTATTAAACGCCTCCATCCTTATAAAGGTGGGTAATATAGTCTCCCGCTTTTACCTGGAGGTTGGGAGCCGCATTAAATATTAATTAAAAGTCACATCAGGAGCGGCACGCTTATATCAGTCTTCCCAGTCTTCAGGCAGAGACGGAAGCGATAAGTAACTTTATTACCTTCATCGTGGATGAAGGGGAGGAATAAGGAGGAAAAAAAACAGGACTAAGGAGAGGAAGGAGATTCATCTGTTGTGCAGACACTTTCGTGATTCTGTGACGAAACTGATTTCGCTATGTGAATAGGGGTTTTGTGGGTTAGAGAGAGAAAAAAGAGAGAGATTATTGCAGAAATACAAGAGTACTCCGTGCTTTGAGCTGAGGTGAAAAAGCGAAAACGAGGGCGGGGACTTTTGTGGTGTAGATTGGGGCTCTGAGATGCTTCCAGTGTTTAATTAAATCACTGGGGTTTGAGACTCACGTCCTGTGCCCAGAATCAACCTCCCCTTGTTTACGGTGTCCTGTTAAGGAATGTATTGATGTATCGATAAACATCCCTCCGTCAAGGTTTTAATGAAGCTAAGCTAAATCTTTATTAAACATACTCTTTGAGTTAGACTCAAACTTTTTAATTAACCAAGTTCGGAGGAGGCATTACACTTGGGTTTTTTTTTCTCTAGTTTGGGCATTAGCTTGTCTCAGGGGCTGGCTTTTATTAAACTTGCAGATCTTAACTTGTTTCTTTTCTTTGTCATGTGAAGGTCACATTTAAACTAGTTCCTTTTGAAGCTACCCCTTTTCACAGACCCTGAAGAAAATTCATCCTATATGGTTTAGAAATGCATGTCATACAGTTGATCTCATTGAATGATTCATCTATATTTTGTCAAGTGAATTTGTTTCTATAGCACTTCATACAATATAGCTTATAAAAGAAGCTTTAAGTGGCGTATAGTATGCAGTTATTCCATCTACTTAAACCCTGTTACTTTCTTACAATTGACTTCAATCTCGCATTCACATCTACCTGATAGAAACGTTCTTTATTCCTAACCAGCCATGACACTGATATACAACAAGCTTACAGAGACCATTTCAAAAAGCACTTCTATTTCTGCTGGAATATTAAACAAATAATGAAAATCACGGGTGCTGAATATGTCTTTTAAAAATAGTGAAATGGTTTCGCATTTACGAGCTTGGTCATGTATGTTTTTTTTCATTTTATTGAGGGTTCAGTGCAGTTGCAGAGAGAGTCTGTCTACACAATCTTCTGACTGGCTGTAAGTCTGTATTTCACTGATTTTGTGGTGTAGGGATAATTAACAGTTTTAACTCAAAAAGGACCAGTCTGTCAGATGAAGAAGAGCCGGAGTCAGAGATTAACTTAAAAAGAAAGTTTACTGAAGATAATTTGCAGTGTCATCAGCAGAAGCCAGCTTCAAAACTCGCAAATGAGTTTGTAGGCTGCTCTCCTCTCTGTGTGCGTACACTTCTGAACGATATCGCAATATCTCAAGCATACAAACGTTAGACAGGCACTAGGCTGTTCAAAGCTGACCCCAGACCTGTGAAACCATCCATAACATCCATAACATATCGGGGTGCCCATTTCTTATGAAGGCCCAAAAACCTAACTTGATTGAGGGGGGTGGGCTGAAGTTAAATAAACCAAACTATTACATTAAAGCTACCATGGTATTTTCCTAAAAATACTTTAATCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGATATATATATATATATATATATATATATATATGATATATGATATATATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTAAATGTATGTTTTACATTTTATAAAAAGCTTTTTAGATTTTTATGTTGTTCAATGCTGATTTCATTGAATACACTTGATTTGCTCGGCAAGGATATTTACATTTCTTAAAATCTGATTCATGCACAACATTTATTGAAACATTTTCACTTGTTTCTCAACAATTAAACAAACAAAAGGTTACGTTAAAATTAGAAATGACAAGCTCTGTTGAACCCATTGACCCCAATCTTCTTATCGTTCTCCCTCTTTTCTCAGATGGCAAGGTGGGCCAAATCAAAGGTTTCCATGAGCCAACTTTGGCCCACGGGCCCTAATTTGGGCATTTACGATCAAATAGAACACAAATACATTCAAAGTACAATATGTATCTTACCCAAGGCTGAGTGTACTCTCAGCTGTCTTTATCGAAACTGGTTAAATTGGCAAAATTTACACCCAAACTTGCAGGTTACAGGAATTAACTTTAAAGATTTAACACTTAAAATGCCAAATTTCAATTTTGATATAATTAACACATAGCAAATACAAATATGAACAGTGGTTTCCAATACTTCAAGAGTCCAGGTCAACTCCATGAGCTCTGACTGGCTGGGTAGATCCTGAGGAAACAAATCATTTGGTATACAGAAAAGCAATTTCATTTTTTTGCAGTTTTACTCTGAGGTGGGATGACACTAAGGTCATCATATAATCTAGGTTCTTAAACATTCAACTTTGTTAATAATCAAAAAGACATAAGAAAGGATATGTCTTACTCCATATTGGAAAAATCCATGCCATCATCACATCTATTAACCGTATTGCGCTGGGTGTAGACTGACACATTTCTGCCTTCACTGCAATCTTTTGTATTAGTGGGATAACAATGCTAAAATGGAGTTTTGCCTATATTTCATGTAATAGATTGTAATACTGTATACTTGATCAAGCCAGCTTTCATTTGAGCTGATCCTGTTGTTCTTTTGTGTCCATTGCAG
Seq C2 exon
GTATGGAAAAATAGTGTCAACAAAGGCAATCCTGGACAAAAACACCAACCAGTGCAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000044574:ENSDART00000138388:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.655 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF062597=Abhydrolase_8=PU(38.3=93.2),PF0007617=RRM_1=PU(29.4=45.5)
A:
NA
C2:
PF062597=Abhydrolase_8=FE(18.7=100),PF0007617=RRM_1=FE(29.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]