MmuINT1035804 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000072774 | Zfp951
Description
zinc finger protein 951 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2441896]
Coordinates
chr5:104835720-104859793:-
Coord C1 exon
chr5:104859667-104859793
Coord A exon
chr5:104837516-104859666
Coord C2 exon
chr5:104835720-104837515
Length
22151 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGG
5' ss Score
9.16
3' ss Seq
TCCCTCTGTTTAATTTGAAGGGA
3' ss Score
7.94
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types