RnoINT0039213 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000012759 | Col19a1
Description
collagen type XIX alpha 1 chain [Source:RGD Symbol;Acc:1308920]
Coordinates
chr9:30627993-30666879:-
Coord C1 exon
chr9:30666826-30666879
Coord A exon
chr9:30628047-30666825
Coord C2 exon
chr9:30627993-30628046
Length
38779 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGT
5' ss Score
9.25
3' ss Seq
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3' ss Score
7.63
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]