RnoINT0076411 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001795 | Itgb5
Description
integrin subunit beta 5 [Source:RGD Symbol;Acc:628869]
Coordinates
chr11:70140138-70156430:-
Coord C1 exon
chr11:70156345-70156430
Coord A exon
chr11:70140343-70156344
Coord C2 exon
chr11:70140138-70140342
Length
16002 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTATGT
5' ss Score
9.81
3' ss Seq
TTTCTTTCCTCTCCACCCAGTAC
3' ss Score
8.26
Exon sequences
Seq C1 exon
GGCTCAACATATGCACCAGTGGAAGTGCCACCTCATGTGAAGAATGCCTGTTAATCCACCCAAAATGTGCCTGGTGCTCCAAAGAG
Seq A exon
GTATGTGTCCTGGGGTGGGGGAGGGGCTGGGGCAGAGTGGGTGGGACCAGAGCCACGGAAATTTACATCAGAGGCTGAACAGGTGCTGGCTCGTTCACACATCGTCCTAGGGTTTCTATTCCTGCACAAAACAAAATGAACCATCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGGAGAGGTTTTATTCGGCTTACACTTCCACACTGCTGTTCGTCACCAAAGGAAGTCAGGACCGGAACTCAAGCAGGAAGCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGAGGCCATGGAGGGGTGTTGCTTACTGGCTTGCTTCCCCAGCTTGCTCAGCTTGCTCTCTTATAGAACCCAAGACCACCAGCCCAGGGATGGCACCATCCACAATGGGCTGGGTCCTCCCCCCTTGATCACTAGTTGAGAAAATGCCTTACAGCTGGGTCTCATGGAGGCATTTCCTCAAGGGAGGCTCCTTTCTCTGTGATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACACAAAACCAGCCAGTACATACATCTCTGATTTGTTCTAGGTGTTTGCTTACAAGGGTTCTATTGACCAATCACCTCTTTAGCCTATCATCTTACCTGTCCAGGTTTTTTGTTTTGTTGTTGATTTTTTTTTTTTTTTAAATCTGAGACAGTCTTACTAAATTGCTTGGGCTTTGAATTTGTTCTCTAGCCTAGGCAAGCCTTGCATTTACAATCCTCCCACCTCCGAATCTCCAGCACCTGGGGTTATAGACCTGTGCTTAGGCCAGACTCTCAGCTTTCTTTTCTGGGTTCTCTCCTTGTTTTGTTTGTGTGTGGTGCTGAGGATTGAACCTAAGGCCTTGTGCCCGCTAGACAGGTGCTTTAGCATTGGGGGACGTTCTGTCCTCTTTTGACTGGGTTGCTCACGGGGTTAGGGATTGATTGCAGGGCCTTGATCTACGCTGAGGTGAACTCCCAGCCTACAAGTTCTGATCTCTTTGTGGTGTTGAATGTTAATCGTATTTGGAGAAACCAGACTTTGTTCTGTTTTGTGTGAGAGCCAGTTAGGACTCAGCTATAGTCTCCTGGTCTTTGGATAAGCATCTGAGGAAGACCTGAACTTATGAAGTGAGTTTCTTGGGTAACAATTCAAAGCAGGCTTGGGCTGGTGGTGTCTGTAAAATACCATGATGTAAAATAATGGCTCTTCCTTTAAAGGGAGCTAAAAAAAAAAAAGTTTGTTCTGAGCCACTGTGGCCTGGGAACAAGGATTATAGTATGCTCTACCCTGGACAAGTTAAAGGAACTTTTGTAGTCTCAGAACAAAAGGAAGTCAGACATATCTGCTGCTAACATTGATGAGAGCATTGGCAGGCTCTACTGCAGAGCTAGGGGATCTCTTTAACAGGTTTTCTTTTTTCTTTATGTTCTGTCTGTCGTCTGTCTGTCTACATATCTTATTTTTTTAATTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCCGAGACAAGGGGATGGCTTTGGCTGTCCTGGAACTCTATCTGTAGACGATGTTGGCCGCAAACTCAGAGATCTGCCTGCCTCTGTGTGTGGTGGGAGCCCTACCCCCCAGTGCTGGGATTAAAGTCGTGGGTCACCACTGTCTGACTTCTTTTTAGATTCTTAATGAGACAGAGTCTCACTGTGTAGCCCTGGCTAACCTGGCACTCTCTGTTTAGACCAGGCTGGCACTCACAGAGCCAAGTGCTGGGATTAAAACCATGAGCTACCACTCGAGGCCCTTATTTATGTATTTAAATTATGCGCGCGAGTGTGCGCGTGTGTGCGAGTGTGCGTGTGTATTTATTCTTGTGAGTGCAGAGGCCAGAGCCATCAGATCTCTGCAGATGAGTTACAGGCCGGGTGTGAGCTGTTCAACATGACTCTGGGTCTCTATCTAACATGTTCTTGCCAGTGGAGCCATATCTCTAGCTCTTTAGATTTTGTTTTTTTTTTTTTCTTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGTTTTTCAAGTCAGGGTTTCTCTGTGTAGCCTTGGCTGTCCTGGAAGTAACTGTAGACCAGGCTAGCCTGGAACTTAGAGAATTCTCTCAAACTCACTGGGCCTCTGGGCATGCCTACGTGGAGTGGAGTGGAGAAGGCCCATCCACTATGGTTGGACCCATTCCCTGCCTGGAGACTGTGTAACCTAGGAGACAAGTGACAGCTTGCTTCTGTCACATTCTGCTTTCTGATTGGGTGTGATTGGCTGTCTGGAGCCCCTGCTCCCTCGACTTCTCCACCCACCGTGATGGATGGTACCCTAGGACTCTAAACTGCTTCTATTAGAGTCATTTATCACAGCAACAGGAAAAGAAAGTGGGACAGGGTCTCTTGCCCAGGCTGGCCTCTCTCCCGCTGCAGGTGGAGATGACTGTGGACTTCTGATCCTCCTACTTGATTTACTGAGTGCGGGGACCACAGACTGTGCCACCACTCTGGCTGACGTGGTGCTGGGGGTTGAAACCAAGACCTGGTTCGTGTTAGGCAAGCAGCTTGCCAGCTGAACGGCATCCCCAGCCCCCTCTCATGGGCTTGATGCTACGGCATTCTCCTTTTAGGATTGGTGGAGCCCAGAGGCCTGCCTTAGTCTCACTTAGGGATGCAGTGAGAAGCTTACTTGTTCTGACGTTAGTTTGAATGCTAAGGATAGGCAGATATGAAAGGGCCCGGGATAGTTTTGATTCTTGACTTACAGCGGTGCAGCTCTCCTTAATCCTGACGTACTAGTCAGGTTGCAGGGCCCTTACTAAGCACGCAGAGATAAATGCTTAATTAGGTGTCTTCAGAGAACTTTGTTCCCCACGGCATGCAGGTGCCTAGCTGTCATTCTAATATGGTTTATTTAACCTTTATTAGATCATTAGGCTTCGTGGAATTTTATTTAAGAGAGGACTGTACCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTGACCACAGCATTTAGGAGGCTTACGCAGGTGGACTTTGAGTTAAGAGGCCAACCTGGGCTACACGCGCAAGACCCCGCATCAAAAGCAAAACAAGGGCTGAGGATGTCTCAGCAGCTAAGAACCCACACTGGTTTTGCAGAGGACTCCAGGTTGGTTCTCAGCGGCCATATCCGACAGCTCCCAGCCCCCTGTACTGTTGAACGCCCTCTTCCGTACCCTGAGGATACCTCTGCTCGCATGTGCACATACGCACACATGCAGACATGCGCTTTGTAAGGGTCCGTGATTGGCCAAAGAATGATACCCCAGACTCAGAGAATTTGCAGACGCGTTTTATTCTGCAGAAGCCCAGGATGCTGGGGTCTCCCAATCCCAAGATAGAGAGACAACCAAGTGAACTCACAGGCCTGATTTACAGCACCTTAGGGAATTCCGGGGTGGGTGACCTTTATCTTACTCCATCTCCAGGGACATTCCATTACCTGGGCATGAGGGCTGGAAGTTATTGCCGAGGAAGTAGCTGAGGAAGTCTGGAAACTGCTGCTGACCCATTGCCCTTGCCTCAGGCCAGGTGCTGGGCCAGGTTAGTAACGGACTTACCTGTGCTTGCCTGGACTTGCCCAGCTTTTAGGCCTAGTCTCCTAACTGCCAATTTAAAGCCTGTCATGGAGTCAGCCCAGCCTTCTCCAAAGGAGCACTTAACACAAAAATTAGGAAGTAAATCTTATCTTAAAAAGTCAAAAATGAGAACAAGACTGCCATTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTTTGAGACAGAGTCTCACTATGTAACCCTAGCTTGCTTGGAACTCTTATGTAGACTAGACTGACCTGGAATTCCTCTCAAATGCTGGAATTAAAGATATGGTATGATGCCCAGCACCCATTTCCATTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTATATACAAGTACACTGTAACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATTCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCCATCCCTCCAGCCCCCCATTTCCATTTCTTAAAGCCCTATAGTCCTATAGTAAGGAATATGGTTGGGTAATGTTAGATATTATATATAAATATATATATTAGGTAGGTCAGTTTTCTTGGTGGGTGTTCTCTTGCTGTGAAGAGATACCACGATCGTGACAGTTCTCTTATAAAGGACAGCTTCTTGGGGCTTAGGTAGCAGGGGTTTGGTTCATTATCAGCATGGAGGGAAGGAAGCATAGCGGCACGCAGGCAGATGTGGTGGTGGAGAGGAGCTGAGAGCTTACATTTGCATCGATAGGCAGCAGGAAGAGATGCTGTTCTGAGCTTGAGCATTTGAAAACCAAAGCCCCGCCCCCAGTTACACACTTCCCCCTCCAAGGCCACACCTCCTAACCTCCCTCAAGTGGCTCCACTCCCCAATAACCAAGTTTTCAAATATTCAAGCCTATGGGGGCCATTTCCGTTCAAACCACCACACTAGTTTTCCTTGCTTCCTTCCTGCCTGCCTGCCTGGATTTAGAGCCTTGCAAACACAAACATGATACTTGGCTACTAGGAAAATGACACCGAACAGACCAGAATGTGCTTGGCACCAGACCTGCTGCCACGTTGGCACCCAACACATCGGCAGAGGCAGGGAGGCGTGAAGTACGCTTCATCTTTCATCTTGGTTCCTGAGGGAAATGTGCTTCCGACAGTGTTTTGCGCGAATTAAGTACTATAATATTCTCAGTGTAAAATTTTAATATTTGTCCTGGGCTTGGGGAAATGATCAATTTCTAAGCCGCTGCTGCTTTTTTCCCCAACAGGGAGGGAGGGTCTCACTCTGTAGCCCGGGCTGGTCTGGAACTCAGAGATCCGCCCCGCTCTGCCTCCCTACTGCTGGGATTACAAGTCTGTGCTGCCGTGCTCAGTTGAGCTTTTTGTCTTAAGGGAAGTGTCCACTTCTCTAAACTGTTGTTAGAACCATGGAGCACAAGCCCTCCCTTTGTGAGTACAAGGAGGCAAGACTTATAGTTTGGGGCTAGCTCAAGGTGACTTCTGGAGGTAAACACACTTGTTTTATTGACGATATTCTGAGAGATATAAAGCAACTTACTTGCTCAAGCCACACACATGTGTCAAAACTGGCTCTCTCATCTGAGCCTCAGGTCTTCTTGATGACAGTGTAACCTCGGTGCAGTAGGGAGATTATAACCCGACTAGCTACTGAAGCAATGAATCTTCACAGAACCAGTCTGAAAGACCCCCGGAGCAGGGAGACCCTCACTCAAGTCTCGGGATGATGCGACCCCCCCAAGAACTCACACAAGACTGTCCTTGCTGTAATAAACATGAGGTTTATTGATAGGAACCAGTGCACTGGGGTCGAGACTCATATTCCACGCAGGGGCAGTGGAGTTCGACCCCGAAAGGCTGGGAGAAAGGGTATTTAAAGGGAGAAACCACAACCCGAGGGGGCAGGGATGGTGTCATTGGAAAGAGTCGAGAATACTAATGAAAAATCACAAGGAGGAGCTTCCTGTTTCTCAAGATTGTTCTCTAAGATTTTAATCTAACTTTATGGTCAGCTAGTACAGGTAGAGGGCAGGGTCTGGAATTTGAGGTGTTGGGGCTTTTTTAAACTTCTGACTTCTTAGCTGCATTTTTTATTCTTTCAAGTCCTTTCCTGTTTGTAGTGCCTTTGTTATGAACCTTCTCTGGAACCATTTTGGTTCTCTGTGACCTCAAGACAGATCTAGGCCTTAAGGCACCTGCTCCCTGCCCACTGGTGTCCCCTGCCCACTCTCAAGACTTCTTCCACCAGGAGAGCTACTGAGGCTCCAGGGTGTCACTTGGTAAAGCCCACATGATTCCCCACACTGCTAGCTCTCCCTAGGGACTTTCCCAGCTGTCCCTTCGTCCTTTTGCTAACAACTTCTGGTTCCTAATTATCAGTTCAAGGAGCTGGAGCCATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACCGACTGTTCTGCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCACCCATATGGCGGCTCACACCTGCCTGTAACTCTAGTTCCAGGGAATCTGACACTCACATAGACACACATGCAAGCAAAACACCAATGCACATAAAGTAAAAATAAACTATATATACATATATATTACATGCATATAATTTATAAATATACATATAATTATATATATAACTTATTATACATATAATTACACACTTAAAATTTTTATATATGAATACAAAATAAAAATTGTTTTTACATATACATATGCATATAATTTATATTATACATATTAACATATGTATTATATATAAACTATGTAATATACACATAGATATGCATATGTATATAATTTTTATATATGTATATATTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATGTATATATAGGCATAAGTCAGTTCAAGTCTTATTCACTCTTTGAAAACTTTCCATGGTAGACCTGTCTCTGTCCATCCATCTCCCCACCTGTTCATTCATTTGCCCATCTGATATAAGAAGGGAAACTCCCTCCATTGGAAACAGAGGGCGTGGCTTTAATCATTGCCGTATCATTCTTGCAGTGGTTCTATGCCGTGGCAGTTGCAGGGTGGGTATCAGCTGAAGGATTTCATTGGATGGCTGTTCTTTCTATGCACCAATCATCAGGTCCCGGCTTGCTCTTCGTCTGTGTCTTTCCCCCATTCTCCTCTCACTGGGTTAATGTAATTTTGTTGCCAGTTAAATCTTCTTTTCGTCTTATTCATAAACATGTCCTTCCGAGGTCGGGGCAGGAATTCATGTTTGATAAAAGAGGCCTTCTAAACAGACATGGAGCTAGGCAAAGTTTAAGTCCCAGTTTTGCCATGATTTACTCTTTATCTGAGTCAGGGCCTTTTGTAGCCCAGGCTAGTCCTGACTTGCTGTATACCTTAGGATGACCTTCTGATGGTCCTGTCTCTACCTCCTAACCTGTAGGATTATGGGAGTACCACCATACCCAGTTTGTTTGTTTGTTTAGGTAATGTCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTTTTTTTCCGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTGCTAGGCAAGCGCTCTATCACTGAGCTAAATCCCCAACCCCTAGGTAATGTCTTAAGATGTAGCCCAGGCTATCCTCAAATTCAGCCATCTGGCTTTGCCTCCTGGGATTTTCAGGTGTGAGGTGTTTCACTGCCCCACAAGGCTGCTGTTAATTTCTTGAAACACAGAAGAAGCTGCCACTGCCCAGCTCTGAGTCTCACTGTATGCACACGGAGTTAGGGAAAGGAGGGCTTAGGGATGGGGCTCCTAATGAACTGAACCTCCCAGATGGCCGTATGAGTCATCCAGTAATGAGCATTGTGGCTTATGAACATATTCTGGTGAAATGGATAGTGGGGTCTGGGAGCCAGGGTTCGTCCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGATGTATAGGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACACATCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGGGCCACCAAGTGGTTGCTAGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCTGGCCCCAGGGTCCATTTTGGATTCTTAAGTTACTCTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTAATAATGTATTTATTTTTATATTTATGTGAATTGATGTTTTGCCTGGATGTATGTCTTAACGTTGTTGGTTCCCTGGAACTGGAGTTATGTACACAGGTGCAAGCTGCCATATGGGTGCTGGGAATTGAACCCAGGTCCCCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAAACACAGAGAAATCTCTCCAGTCCCAGTTTCTCCCTTTCTTATACAATACTTCCAAAAGTCTGACCTGATATTAATAGTAAATAAGTCATTCTGAGTGACACATTTTTGGTCTAGTCCATACATGGGTTCCCTACTTAGCCCACTGCTTGCCCTCTGCTTGCACAGAGCCTCACTCTTGGCTGTGCTGGAATGCTTCCCCAGGGGCAGCTCACCCCAGAGTTCCCATCTCTCTGGTGAGCTGCTCCTCACTACAGGAAATGGATTGCGTTTTGGGATGTTAGGGCTGTCGAATTCAGGAATGGTTGCGACCTAACTTATGCTTTAGCAAGACAGAGTAAGTATAGCTTGTGCCTTCTTAACCACGTGCTGGGATGCTGCCAGAGGTCAAGGCCCCTGCAGGAGCATATGCTACACGAGCATACTCAGGGCTGGTACCCAGAGGACAGCATCTCTGGATCCCAGCCAGAGTTAGCCAGAGTGGCTCTTTAATGTATTTTCCAGACGGGATCTTAATCGGTAACCAAGACTGCCGTTGAATTTAGAATCCTCCTTTCTCAACCTTATTCAAGCTGGATTACAGGTGTGGTACAGGATTACCCCTCTGTCACCCCCAGCCTCATGTCTTTGTTACTCCTCGAACCCAGTCCCCAGGGAACCCTGTCTCTGATTTGACATTCCCTGTGATCTAATGTCCACTTTTCCTGTCACTGTCTTCTTCTGTAGGAGCTGAGTTGGAGACAGCTCGGGTCCTGTCTCCCTTCCTGAGTGCTTTCTGCTGGTTCTCTGCCTTCTGTAGCATGGTCCTGTTTACCCTGGCCGTCTTGATTTTGTTTCCCGTGCTTTGCTGGGGGCTTCAGCTTTACTCTCTCTGCCTTTAGCACCAGGCTCTCTAGACCATTTCCTCTCAGACGGTAGGCTGCCCCCTGTTTTACCCTGTCTACACTGCCCCGCCTCTGTCCTCAGCGAATGCTCCCTCAACCTGTTCTGGCCTGCCTGACCCTGAGCCTCTTAGAACACTTATAGCACATCATAGCACATCAGTTTATCATCTGCTGTGATAATTTTGTCTGTCACTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCTCTGCCCCCCCCCCTTTTCTTTTTTTAGTTTTTCTAGACATGATCTCTCTGTGTAGCCCTGGCTATCCTAGAACTCACTCTGTAGGCCAGGCTAGTCTCTCCACCTGCCTCTGCCTTCCTGGTGCTGGGATTAGGGGTGTGTGCCTTTTAGCTAACCATGAATTAATTACTGATTGTTAGTTAATAACTAATTAATTAATAATTAAAGACAGAGACTCTTGTATCTGTAGTTTTTTGTTTTTTTTTTAAACATAACTCTGCTCTTCCCTCAGAAGACTCAGCCAAGAATGAGGGTGGATACTTTGTGGCAGGTTGAGGGCACCACCCCCCACCCCATGTGTCTAAAGCTCGCACCACTACATGTAGAGCGAGTGTGTCTGTGTGCCAGGAACCAAGGGAAAGGAGTTGGGTGACCTAGTGGTCTGTGTCCTAGGCAGGCAGGCCTGCAAATGACACACTGAGGATGCTCCTGGGAGGTCAGGGGGCCAGATTAGAGAGGGTACAAAGGACAAACATAGGCAAAGTTTGCAATCTGTTGTTGGGAACATGGGCAAGTTGCTACGGTGTTCATGGACAGTGCCAGTCTGCTGGGAATTCCAAGAGAAGCATGAAATCGGGTAAGGCCACCTCTGTGGGTCTGAAGTCCTGTGGGAGGACAGGGATTTGCTTGGTTGGGGAGAGGTCAGAGGTGGGAAGAGGCTAGTGATGGCTGAGCTGGGGGAGGTGTCCTTGCCTTTGGCCTTGGCCTTGGTGGGTGTACAAAGAAACACCCACACCAAAAGAAAATACAAATAAAAACAAACAAACAAAAAACCCTATAAAACCAGCATTTGACCAACTTGCAAGGATGTATACATTCATTAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGGAAAAAGGAAACGGTTTTGAGAGGAAGCTATTAAGATAGTACTTAAAACCTGTGGTAAAGGTGCTGAAGTGTAGCTCTTCATCGTCGATGGCTTCTGACAGCAAGGACCCATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAGGGGATGCCCACAGGGAGTTTGACCATGCTCTAATGAGTATACGGGCAACACAGATTGTACTTGCTGTGTTTTTGGGGCTAGGCGGGGGCAGGCTGGGGGCACAGGGGTGGGAGGGTGAACCTGGGAAGAAAAAAGAGAGAGTGTGATCGGTGTGTGTGGCATGAAATTCCCCAATAATTAATAATATTGTGTGTGTGGGGGGAAACATATACAAACAAACTCTAAAGGTAATGTTTGGCCAAGTCCTGACGTGATGTACAGTCGTTAAAAGAATCTATGCTGGGACTAAGGGAGCAAATTCGTCTTGGTCTACTGTGGATGCCTCATAAATATTTGTGCATTGAATTCAGTGAGCCAGTTGAAAGCTGGCAGGGGCGACTTCTCCACCCCCGCAGGCGGGCAGGAAGCCTGCATGGCAGAGAGTTGCTGGCACATAGCACACATTCTATTACCATCCCCCCAGCTCACGAGGGACTGCCAGGCTGGAGTGCGGCTTGCCCTGGTCAGAGGGTCTGGCCCTGCCATAACCAGTGAGCGAGGCCAGCCACGGAGAGCAGCCAGTTCCCCTGGACCTGGTTCTCCTCCAGCACTCGCCTGCTGGCCACTTCACTTCTTCCCCTTACACCCGAGGGCTTGGGCCGGCTGGGCTGCTCTCCTCCTGGGTTCTTTGCCGGGACTGCCATTTCTCTGTCTTTCTCACTGTTACAGAAACAACACCCATCCTTCTCCAAACACCCACCACATCGCTCTTCATCTGTACTGGGTAGGAGTGTTTGGAATTAGTGCAAAGTTGGTCCAGCACAGACAGAAGGGCCTTGACGCCAGCCAGGGGGGTTGACCTTGACCACGGGGGAAGGGATTTGCTTAGTGAAATAAATGTACAGGGAACCAGGGGTTTCTGTTGCAGCAGCAGATAGCGCCTTCGATGTGACCTTCTCGTGCCTGAGGGAGGCGGACCGGGTGTGGAGACTTCAGATTGGGAGCACCTCCCTTCCCTTCCCTTGATCATTAGCACGGTGCAAGGGGGACTTAGGCTCCCATTGCTGTTCATTCCATTACCACTATTGATCACTTGCTTGTAGCCTAGACCCTTTGGGAGTCCTCAGGAGACTTTGATCAGGGTGTTCCCATCTAGAGACCTTGGACAGGTGCTTGTTCCCGTACTAGAACGGTGAGCGACTGCAGCCAGCAGCCATGCCGTGGCCACTGGGAGCTCACCCTGAACCAGTTTCCTCTTTTTCTGCGTTGAGATGAGTCCTCTCTGTGGTTTGTGCCTCTCTGTACCTTTAGTCCCTGTCAGGAAGTGTTTGCCCTTCGAGGTTGGTGGGTGGTCCGGGGTCTTTCCATTTGGCATTGCAGAACTTCACTGTATTTGGAAGTGTGGTGCATGAGCCCTGTTAGTTCCCTGGTGCAGAATTCAGCAGGGTTCATGGGTACAAAGAGTGCACCCAGGTGGCCCAGGGCACCATGGGCCCAGGTGTCGGGGAGATGAACTCAAAGTGCTTGGGTGAACTGAGACTTGTGGGTCTCTGGTCCATAGAGGAGTGGGGGTGGTGCACGGGGTGACTCGTTCACTTTGGAATGTGACACCTGACATTTGAGATGTCCAACACTTGGCAGAGGGCTGGGAATGAGGTCCCTGGCATCTGAAGCTCCTGAGACCTCAGGAGCTGCTGGGAAGAGGACGTTCTCCATCATGGGTCTCTTCTGTGAGGGCTTATAATTGGTTTCAAGAGATGGTTCAGAGGTGAGGAGCCTTCTAAGTCTCGCAGGGTGTGCGAGTTCAGTTCCCGCCAACACCAGGTGGCCTGCAACTTCCTGTAACTCCGGTTCCAGGAGATCTGAACTCTTGTTGGCACCCGTTCTCACATGAGTACACACAACACAAACACATACATGTAACCAAAAATAAAATGTTAAGGGTTTTGTAATTTGATTCATCTTCCTTCACAGAGATGTGGCCATTGAGATAGTTTTGTGATTTCTGTGTGTTTCCTGACCTCTGGAAGGTCATAGAGGTCAGACCAGCCTCTGGTCTGGTGGCTTTGGCTTCCTCTCTTTAAATATTCATCTGACCTCGTGCAGAACCAAAATAACTAGGAAGGACCTCGAGACAGTAGAGACCTTAGGCTTAGTTAGGGGTCGAGCTCTGTTAGGGCTTTAACACGCTCTGCCCCTTCATTGGGCCACAAGCAAGAAATTAGCTGAGGCTATATTCAACCATGTCAGAAAGATGGTCCATTTTTAAGGCTAGTCCACTGCTTACGTACCTGCCTCCCTCTCATCTAAAAGTTCTGTAGACTTGCCATGCCCAGTATTGCCCAGCTGATGGATCTGTGGCACAAGCGTTCTTCTGAGACAATGACAGATTTGATGCATACGGAGAGGAATCTCAAAGACCACTGAGCCCATCAGTGAGACCGCTGGGCCCATCCCAAAAGCAAGCAGCTGGATCTGAGAAAGGGAGATGTCATCACACAGATGGGGTGGGTAGTTAGGAGATCTCAATTTGGTTTGGATGGCATTCTCTGCGTTCATTGCTGCTGTAAATGGGGTGCTAAGAACTCTTCCTTGGAAGAGGACTCATGGCAGCAGACGCCTGGCCCTGACTGGATCTTTGGCAGAGTGTAGGTGGTCCAGACCCATGGGAAGGATTATGGGAGATGACTGGTGATGGTAAGGCTTTGTGATAGACTGGTCCAGACAGGTACCAGCTGTCCAGCAGTTAGCTTTTTGGAGTTGGACCATGGAAGGGTTCTGAAACCCTTTACGAGAGGAGCGAGCTGAGGAACTCTGCACCCTTCAAGCTCCCGGCAGCTCTTCAGGCTTCTGACAGAGAACTACAGGACAGCAGGGTGGCCTGGTGGAACGTCAGGTGTTAGCCCTCTCCCTTCCTTCTGTCCTGTTTCCTCCATCATAGCGGGTCTGTGAAGACCGGGTGTGAGCCCAGTTTGGAAGCCTCAGTTTTGAAATCTAGGCCCCAAATTACATATATGTATTCTTCCATGTATATGGAATTTAGTCACCAAGGGTTTTCACAGTGAACATCCCAGGTAACATGTAACAGTAAAAACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACACCACTAAGACACCAGTTGTTTATAAAACCTAGAAAAAGCAGAAGTCAAAATAACCAGAGTGTATTGGGCTTTACTTACTTAAAATACTGCCTGGGTATTTTCACAATCTGAGTGGTCAGGAAACTGAGGCAGGAAGATTGTCACGAATTTGAGGTCAGCTTGAGTTGGAACAAATTCCAAAATCTTCTTGACTTTTTTGTGTGTTGGGGGTGGTAGACAAGGCACTGGCCTTGAACTCACAGAGATCCGTCTGCCCTTGTCTCCCTGATGCTGGCATTATAGACGTGGGCGACCATGTTCAGTGCTCTTGACTTCTTAGTTTTAAAGTTTGCAGCTATTCTAAAAGCCATTGATTAGTCCTAGGACAGCCACACCCTTGATGGAGGGTGTGCCCCACTCGATTTTTATGCTTCTGCAGGCTAGGGTACTGACTCACCAGGCAGCCAGGGATTAAGTGGCCAGCTACAGAAGGGAGAACAGCTTGGGTTTGCCCTGCTGCTAAAGTCTTTTCCTGCTGGGAAGAGCTGAGTTGGTAGAATGCTTGCTTAGCATGAAGCCCTGGGTTTTGTCCCTAGCGTCTTATAAATCAGTCTCGGCGCTTGGGAGCTAGAGGTGAAGACCAGAGATCCAAGGTCATCGTAGGCTACACAGTAAGTTCAAACCGAGCCTGGGTTACATGGCCATGCCTACACACAACACAGCAACCAAGCTGAAAAAAACAGACCTTTCTCCCCAAATCATCCACACAGGTAACATAGTTTCTAGCAAAACAGACTTCTCACTTTAAGATTATGCCTCAAATTAAGGTTCAGTCTCCCCTATCTCAGTCCTTTTCAGCATGTGCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCCCTACCCCCTTCCCTCTTCCTTTTATTCTTCATGAGGTTTTGTTGTTTGCTTGTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCATGTAGCCCTAGTTAGCCTCAGACTTGGTGTGTAGCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGTCCTCTGCCTGAGTGTGGGGAGTGCCGCTGAGATTCTCTTATCCGTATTTCTTTACTGTATAAACATCAGTACCGATGAAAATGAAAAGTGCTTCTGTGATCTGCCCATTTTGTCCTAGTGCAGACAAAATTGTGTTTCTGCCCACTCTTACCTCCCGCCCCTTTCTACCCCACCCCTGTGCAGAGTGTTCGTGTGCATGCTAGGCAGGTGTTTTACCACTGAACTAAGCCAGACCCTTGCCTTTATAGCATAAATGCCTTGGGATTCTGCTTAGTCTGCCTGTTTGCTGTGAGAGATAGTTTTCTTATGGTTTAGGTTTACCAGATTGTAAGGTTATATTATTAGAGAATGCGGCATGCATCTCTTATGACTTCCCCCTTTCTTCTGAGCTACTTTTTCTTTTAAAATTTATTTTATATGCATTGGTGTTTTGCCCGTATGTATGTCTGTGTGATCCCCTACAACTGGAATTATGGACAGTTGTAGCTAACATGAGTTGCTGGGAAATAAACCCAGGTCCTCTGGAAGAGCATCCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCCATCTGTCCGGCCTGGAGCATTTTATTATGATAGAAGTCTTCTGCTGGGCGGTGGTGGCACATGCCTTTATTCCCAGTACTCGGGAGGCAGAGGCAGAGGCAGAAGGATCTGTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTGCAGAGAGGGTTCTAGGACATTGAGGGCTACACAGAAAAACCCTGGCTCAAAAACTATAATAAATAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGGAGAAGAAGGAGTCCTCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTCCTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGGGTTCAGGGAAAGTGCATTCAGGATACTAGGAAGGAAGTTAGGTAGATAGTATAGATTAAGAGGGTGGTGACCCTGTAGAAGACAAACCTCGTCATTCCGAACATGGCGCTGGACTGGAGAAGGTGAGATTGGAGAGTCCGGCCAGCCGAGCACCACGGTGCCTTTTCGAGGGAACCTGTTAGACCTTTGTCGCAAGCGGCAACCGGATTGACTCCGCATGTGACTCACTCGCGTGTCTCATGATTCTGGTGTCGATCCTCGCATGACGGCACAAGGAGAGTGTTTGACTCACGGGCGAGTGCTTTCCTACCACATTCAGGCCAAGGAGGGAACGGCATTGATATTGGCTGGGGTTGATTGCTTGGACACCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTCTTTTTAATATGCCAACCTTAGTTCACAACAAGTCTGGGTGACAAGAGCTTCCTTCTGTCAAACCTCTTAGTCCTCACAAGGCATTTGGATCAGGATTACCCCTGCCTCCACTTTCCGACAGTGAAGATGGAGTGCAGAGTTCCAGGCCCTACCCTGATGGCTGCCTGCTTTTTCTTTCCTCTCCACCCAG
Seq C2 exon
TACTTTGGCAACCCACGGTCCATCATCTCTCGGTGTGACCTGAAGGCAAACCTCATCCGAAATGGCTGTGGAGGTGAGATTGAGAGTCCGGCCAGCAGCACCCACGTCCTTCGGAACCTGCCTCTCAGCAGCAAGGGTTCCAGTGCCATGGGCTCTGACGTCATCCAGATGACGCCACAGGAGATTGCAGTGAGCCTCCGTCCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000001795:ENSRNOT00000049974:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
NonCoding
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NA
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]