RnoINT0076622 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000007104 | Itpr1
Description
inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 1 [Source:RGD Symbol;Acc:2933]
Coordinates
chr4:140379368-140396777:+
Coord C1 exon
chr4:140379368-140379514
Coord A exon
chr4:140379515-140396681
Coord C2 exon
chr4:140396682-140396777
Length
17167 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAAGG
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
AACCATCTCTGCTCTTGCAGGTA
3' ss Score
10.37
Exon sequences
Seq C1 exon
GGTGATGTGGTAAGACTCTTCCATGCTGAGCAAGAGAAGTTTCTCACGTGCGATGAGCACAGGAAGAAGCAGCACGTCTTCCTGAGGACAACCGGCAGACAGTCAGCCACGTCGGCCACCAGCTCCAAAGCCCTGTGGGAAGTGGAG
Seq A exon
GTAAGGAGTCAGCCGGGAGAGGTGAGGGAAGCGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCGCGTGTGTGTGTGCGTGCGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTCGGGGGTCGTTGGTGGGGGTTCAGATTTAAACCTCTCTGCAGCTGTGTTTCTAAATCAAACCAAATATTCATAAAAATAAGTAGACATGGCCCAGGGAAGCAAACACACCATGATGTACCAGGTCGATGTTGCGTGGTCTGATGGCGAAAGATAACAGCTACATATTCTTTCCCCGAGCCACCAGAAATGGCTTTTCTTACCTTCCCCCTTCCTCTTTTGTTTTTTTCTTCTCTTTCCTTTCTCTTGCTCGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTCTGTATATGCCGGGTAAGCTGCACTCATGAAATCTCAACAATATGTTTACCTAAACAAGAACTGAAGAAACACCCCCAGCAGCTGACATACCTTTGGGGGTGGGGGTGGGGATTTCACATGACCCTACCCCTTGATGAAGAGCTATGAGAGGGAGAATCAGTCTTCTCCACTGATAGGTTATCTAGTCCTACGTGGTTAGCCGTAAGCATTTATATCTATGAGCAACATGGAATTAACTCATCAGCTTAATTATAACAATAAAATATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGACTTAAAATAGACAAGGCCATGAATTTGAGAAGAGAGGAGAGAAATCATGTAATTTCAATACTCAAGCATGAAATTCTCAAAAAATAAATCAGAATGGAAAGCAGCAAGCATCCAGATAGAAGGTATCCTCAGCAGGAGGGCCTAGGTGCCAGGATGGGTGTTCCTTATGTTCTGGAGGTTTGGGATGATAGGAGAGGTGTTCTGCATGCTCTGGAGGTTTTAGTAAGGGAGGATGAACTGGTGGGCTGAGGATTAAAAGTTCCTAAATGGCAATGAGTGGTCCCAATCCACTGAAAAGACCCTGGATGAATCGTGTCACAAAGCAATAGCGAAAGTTATGATGTGGGAAGGCGGAAGGCAGAGAGAAAGGGTAAAGGTTGATAATGAAGATGCGGAGATTAGAGAGCCGGCTGGAACGAGTAAAGAGAAGGTATTAGATACAAGTACAAAACTGTCAAGAAAGAGCTTCAAAGATTGAAGAGTTAGCACTGGACTGTTTCCTAGATGATCTGCATTTTGGGAGGGAGAGACGAGGGAGTTTCTGTAGTATAAGGGAAAGACTTGGAAAATGACCACACTGGAGACCAGAGCCTCAAGTCGCACCTGCCAAGGCTGCAGGGCATGAGGAATGTCCCTCACAGGCAGGGGCAACGTCTGGAAAGGTGTTTTGGGTAACAAGTTGGCACAGTCAGTGTGCTGTGTCCAGAAAGCAATGATTCTGTCCTGAGGAATAGGCTTGCAAGACCAAGGAAGAAGCCGATAGGAGGGTTTGACTATAAGGATTCTGAGAGCATGAAGGAGGGCAGGGCTGTCCTCTCCACTGTCCCCCATTGAGTGGCGTGCATTTCTCTCTCTACTTGTTACCTTTGCCACTTCTCCCACCTTCTCCCCTTGGCAAACATGGCAGAATGCCCAAGTCAGAAACACAGAGTTGTGTGTTTCTCTACATTCCACTCAGCCAAGAACCAGCACCTAGATCAAGAACCAGAAGAATAGTAGCCCTTAAGAAGTGCTCCAGCATGTTCCTGAGTACTTCCTGTTTTCTCCTGGTTAGGTGACCTCTGATAGGTGGCCAGCCTCTTCCTTGAATGGCACGGAGCAGCCTTCGGCCTAGGCAGCCTTATCTGTGTTGTTGTGTGTGTCAGACAGTATGTTTCTTTGTCTTGCCTCATGGTGTTGTTTTGTTCACGTCCTATGCAGTCTATGAATTTGCCGCTTGTTGATGGCATTTGAGCTGTTTCTAATTTGGAGCGGTTGTGGGTAAAGCTTCAGGGACACTTGTGCTTAGACATAAGCTTAACAGATACGTAACAGTGGGATAACCGAAGCCTTTATTGGGTATAGGATTAACATTATAAGAAATTGCCCATCCAAATCCAGGTGTGATGACATGTTGCTAATTTCGGCATTTGGGAGCCAAGGCAGAAGGATTACCACGAGTTCAGGATCAAGCTACTCTATCTATAGACACCCTGACCCAAAACAAAACAAAAAGGAAACAGAGAAGAATGAAGTTGCCCAACTCTCTTCTGAAGTGGAGGGGATATTTTCAAAGTCTCCCCAGGAGCATTTAATATGGTCGTCCTTCTCCATGGTGGCCACTGAAGTAGATATGAAGATGGTGCTCCTAGCGACCTATGCCCTCCCTTGTGATGCTGCTAATTTCCTTTGTACTCATGTTTTATTTGTGAAGCTTTTCTGGTATAATATCTGCTCAAAAGCTTTGCCCACTTAAAATCTCCTTTGTCTTTTACCTGGATGAAGAAATAGGCTCATCCCAGCACTGCATGGATGAGTTCCTGCAGTTGTTTGCTTTTTCTTCTTTTGTTAGCTTCTCCATCAGTTCTCTGCTTCTTCCTCTCCAGTATCTGTAGCATTTCTTCTTTGGCCATTCATATGTCTTTAGGGCCAGTCAGTCCGTTTAGCTTGTTCCATTTAGGGAGTTCCCTGAGAACTAGAATTTTGTCTTTGGTCACTGACATGCTCCTTGTTCACAAACCCTAATTTGTGTTTGTTCTTCCTTTTGTATTCAAAATAGTGTCTAAGAAGAAAGTGGGTAGAGGAAGCAGAGAGGATACAGGAAGAGGAAATCAGGCAGTGGGAGAGGGAAGCAAAGAGGATACAGGAAGAGGAAGTCAGGGAGTGGGAAAGGGAAGCAGAGAGGATACAAGAAGAGGAAGTCAGGCAGTGGGGGCAGGAAGCAGAGAGGATATAGGAAGAGGAAGTCAGGAGGGGGAGAGAAGCAAGAAGGAAGCAAGAGAAGGAAACAGGGCAGTAGCAGTCTCCCAGGATAACTAGAAGTGGGAAATACAAAGTAAGGAAAAACCAAACATGTAGGAAGTAGAGGAAATGCAGACTGTCTCCTGGCTTAACTACTTCCGTTGAGCCATTTTTCACTGGACAGGATAGTTTTATATAGTTGGCACTTCATAAACAGATTCTCACTCTGCTGGGACATGGTTAAAACATGTAAGCCTACAGAAGTCAGGGCGTCTTGACTCCAGTGTCTTAAAGCCATTTGCCAAGCCCTCCTCATTCAAAGTTGATTGAGATTAATAAAAGATGATGACTTTCTGAGGGGATTTAACTTGAAAGTTGCCTTTGAGGGAACTTTTTTGCTCCGAGGACAACCAGCTATCAATTTCTTGCTTTATTAAAATCTCTCTCCTGCCAGTTTGTTTGTTTGTTTGTTCTTGTTGTCTCTTCTGAATTTCCTATGAAAATGTTTAGTGTTTCTTTAAATTGTTTAAAAGTTTCTGCTTTACTGGGAAACTTAACTGTTCTTTCAAAATAAAAGAAAAGGAAAACAGGACCATGTGTTTTTATGGATTTAAAACACTAGATTTAGGGGTGCTAGAGAGAAGAGCACTAGCCGCTCTTATAGAGAACCAAAGCTTAATTCTTAGCACCCACAAGGCAGATAGCAACTGTCTGTAATGCCAGTCACAGGGCATCAGAAGTCTGCTTCTGGCCCCCATGGGCTTTGCATGCACACAGTGCACAGATACAAAACCAGGCGAAAACACCCATGCACATAAAATAAAAATTCAAGGAAAAATCAGAAGAGCTCTTGAGGTTCTTACGTATTAGCATAGCCACCAGCTTTAGTTAACATGATGTGTTGGCAATGTGCTACAGTAGTTTCCTCTCCTCTATTCTTTGTGTTATTGTGCTCATATATTTTTGTCTCTACATGGGCCATAAACCTCAGTTCCCTTTATTATATGTCTTGCTCCCAGGGGTTTGTAGCCAGTAGCCGTTAGATCTTCATATAAGCATTGTATGCCCTTGTAACCTACAAGCTGTGTATTGGAACCCTTTGCATGGTGTGGCTCAGAGATGCCGGAACTCTGGACACCCAAGGAAGAAGTTGTGTGTTTCTAAGCCACACTGATAGGATCTTCCGTGTTTGCTTGCACAGTTACATCCTAAACTCTGTGTTACTTCATAGAGATCCAAGTTTGCACAGAGGATTTCATTCTTCAGAAGAACTTCCCATGTTTATTATAGTTCTGGTCTGCCATGGACAAATTGTATTCTCATTTGTGTGGAAATAACTTAGTTTTACTGTCATCTAAAAAGGTTTTTTTCCTTCTTTTAATTAATAGCTTTATTGGGATGCAATCCGTACACTGTGTATTCACACTGAAAACGCTACAATTCAATAATTTCTAATAGATTTGTGGGGCTGTGCAATTACTGGCCCTATACATTTTTTAAAATCATCTCTGAGGAAACCCTTTCCCTATTAGCAGTCACTGGTCATCCCCACCCCAGCCTCCATCCCATCCCAGCCTCCTGGGACGACATCAATTCTTCCACGGATGCTCCCTGTAAGCAATTCTTGGTGCATGGCTTCTCTTACACAGGGGAGTCTTTCACTGTGACCCAAAGATTGGACCTTGATTTCTAAATGTCATTGCATGGCACAGTGAGTTAGGGAGCTCTCTGGGGTCCTTTGCTTGACGGTGTAAATCTCTTCTAAAGGCTCTGACCCTTTAGCTTTGGGGGTGAGATGTGAACACAGGAATCGAGGGAAGGGGCATACACATTCAGATGTTGCAGATACTGTCTTCAGAGTTCATCCATGTTGGCATATATGAGAGCTTTATCTCCCTTAGATCCAGTAATATTGCATTATATGAGTAAAGCCTTTTCTGTATTTATTTATCACTTTAGAACTTTTGGATCATTTTTACATTTTGGCTTCCATGAAGAATGCAACTATGAACATTGGGTGAGAAAATTATTTTCATG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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTCTTTGTTTGTTTGTGTTGTAGTGTTGTGCAGGCTCAGTGAGCCTCAGCTGTGATTTCAAGGCTGCTAGAACATGTGTTCTCTTCTGTTTGCCTTGTTCTTAAAAGCCTGGACGTTACCAGGCAAGGCTTAGCCTCTAGGAATGTTGGAAGCCTGACTTTAGCAAGCTCTGTTCTTAAGGTCTGTCACCCAAGCTGCTGGGAAGGACTTTGGTTTACTTTGCACGGTGGAACGAACTCTGGCCAAGACGTGCTTGAAGTAGTCATCTCTAAGCCAACCGAGGAGCCGGCACGAAGCTGATGAGGGGAACAGAATATTCTCAAGCGAGGCAGCTGAGCGCTTGATTGTGCTTTGGCGTGGGCTCTGTAAGAAGCCTGTGGGATCCCAGCTCGTACAAAGAGACATGGGATGGGTTCTCAACCCGAAAACTTACAGTTTGGTTTTTATTTAAAGTACTGATTCTTAGAGTAGTTTTAAGTGGTGTAGCAAAGGTAAGTGGCAGGGGAATAGTTGTCCTGCGTCCTTTTGCCGCCAGGGTCAACATTCTGCAGCAGAATGGAGCATTTTGTTGCAGGGGAGTGACCATAGATAATACTGTCACTATTACTCAAGGGTCCCTATTTTATGGAGGTGTATGTGATTTGGTTTTGACAGGTATATAATGGCCTGCATGCACCATCACAATATCATTGCCTAAAAATCCAAAAATCTCTGCCCCCAGATTCTTTGCTTCACCCACTCACTCATCCATCGTTCTTCACCATGCCTTACAACTACTCCTCTTTTCAGTGTTCTGCCTTGTTCGGACTGCCGTATTGGTGGCATTATGTAGCTTGCAGCCTTTTCAGATCTGCAAGGCTCTCCATGTCTTCTCACAGCTCAATGCCTCAGTCCAGTTGACAGGTACCACGCTTGCTGAACATGAGTCAAGGTACTGCTAGGTACCCTAGGAGTGTTCAGGTGACACCTTTATGTTCTTCAAAAATAATATAATGTGCCCTGTGTCCCTATGGTTGCTTCAGATGTTTAGGGAATTTGTAGTTTGGCCAAACTCAGAAGGCCTGTATTAGCTCTTATGGACAGCTCCGTGATCACTTCTAAATATTGTCATAATTATGGAGTTTATAGGAAGCATCTAGAACACATTTGGCCTTATAGAAGTCAGTTTTCTGTCACTGTGACAACACAACTGGAAAAAAATAGTCTTATAGAGAAAAGGTCTTTTGCGACTCCCGGCTACAACAGTTTCAGTCTGGGGCCACTCTCAGCCTTTGGTACATGATGGTGGGGAACCTGTGGTCTGCTAATCCCTGCATGGAGGAAGCAGAGAAGCGCTTGCTCCTGTGGCCATGCCTCTACTACGTAACCCATTCGGCTATGAGTCTGTGGTGGCTAGGACTCACATCTCAACACTGCCGTCTCAGAAACCAGACTTTTACCATGAGCTTTTAGAGACCTTTAAGATTCTGAGTATGGACAGTGTTAACTTCAGTAAGTGGACAACTTAGAGGGAGAAGCATGACAAATCCAGGTGGAGGACGCACTCTGAGCATGCACCATGTACTTCTGTGTAAAGCTGTGGGAGGCTTGCTTAGTTATTCCTTGGAACTTCCTGGTGACCAAAATGACAAGAGAGACGAGTTCCCATGAGAATTTGGCATGTGGAAATCCTTCTTCCTGTTGGGGCTGTGATAGACGAAATTCATATTTCAACAAGGTTTGAAGTCCAAGAATGAATTACACCCAGATGTTTCATGTGTTGAAAGCCAGATTAGAATTCTTGCTTATTGTCCTTGTTCATCCCCACAATAGCCATCCCTTGAGGGGTTCAAGCGGTGTTGGTCACTCTAATATGGAGCTGTACTTCCGTTTGCAACTGCTATCTGTTTAATCCTCAGAGAACTTACGGATGTTAGATAGTGTGTTTTGTCTTCTCCCATTGAGAGGACATGTTTACTTTGGACACGGTCCGCACTGTTACCCAGTGTTCCTGAGATCCAGTTCATCTGCTTGATAGCAAACAATCACATTCATTTTGGTCTTACTAGGATTGTAGTCCAGGAGGCATCAAATCCAGCAGCCCTCTGAGAGCACTGTCAACTTTTCCAAGATGATAGCTGTTTTTATAGCTTAATCCACAAGCAGGCTGGCTGATTACATCCTGTTCGTGAAGACTTGTGGTCGGTGTGGCCAAGGTCACATTGCCTTATAGGAAAAGGGTTGAATAGTCTCATGAAACTCAGCAGATAGTTCTCAAACTGTTACAAAACCAACCGAATCTCCTCCCGAGGGTTACAGGTCAGCTCGGTGTTTGAGGTCAGCCTACACCTGTGTGTGCTTGCAAAGACAGCTGAGTTCAAAAGGTGAACTGTGGACATGTTTGACACCTTAACAAGTCCTCACAACTTCAGTTTCAGTGCCCGGATCAATGCTAATCTGATTTTTGTCCCTGCTAGAAGTCATAATTTCAACCTAAATCCTTCCCTGCATGCTGCTAAAAAATGCTGCCATTTGTCTGGGCACCGATAAACAAGTGGGTGCCCAATTCAGCTGACTGACAGATTCAGGTGTCCGTTTCCTGATCCGTTTGGATAGAAAAACCTTTTCATTGAATCCTGCTACCTCTCTAGGTGTGGCCCTTCCTGGAAAGAGAGTTAGAGTTTAAAACACACAGTGATGGCTGCCCGCTCTTTCTTTTTACAAACAGATCTTCAAGCTTTTGCAGGCCCCCTTCACGGACTGCGGGGATGGCCCAATGCTTCGGCTGGAGGAGCTGGGGGACCAGCGGCACGCTCCTTTCAGACACATTTGCCGACTCTGCTACAGGGTCCTGAGACACTCACAGCAAGACTACAGGAAGAACCAGGTGGGGATTAAAATGGACAGGAAGCGATCGAGTTTTACTCGTTAATGTTACTTACTCATGAGTTTTACCTGTTAATGTACCAGTGAATTTAATGGATAGAGAATAGTACACTGTTAAATTTGCCCGTAAAAAGGAAAGAGTTGGTTGGCAAGCCTGGGAAGAACATGTATTGCAGAATCCCTGAGGAAGATACTGGAAAAGGATGTCAATTTAAAAAAAAAAATAAGAAATGTAAAAGGCACCGAGAAATCCCTCTTGTAAATATATTTCAATGAAATTCCTATTTTTAAGGTTGATGTTACATTTGCAGTGTATGTGGGGTTGTGTGTGTTTGGCACACATGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTCCAACAATGGACATGGGCGTCATTATTTCTCAGGGAAGTTTTCGACGTTTGACAATAAGCTGGAGCATTTCTGTCATCTTGACTTGAGTTACTGCATCACCTCCTCTACTGGCTTGACAGTGCGGCAAAGAGTTAATTCTTTGAAGGACTCTTCTGTGTTAGCTTTATTTGGTGTGAAGATTTGTTCTTAACTTCTTAGGAGAAAGCAGTTTTTTTTTTAAAAGATTTATTCATTCTATCATATATAAGTGCACCTGTAGCTGGTCTTGAGGCAGATTTACCAGATGGTGTGAGGCCACCTANNTATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGTAGTCGGGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCAGGAAAAAGCAGTTTTCTTTGTTGGAGTCACATTCCTGTAAATCAGTTTAGTCTTGTGCATTGCTAGGTCGAGGCAGAACAGTCTATATTGTGAGGCTCCCTTATTAATGGTCAGTGCCCAACGTGGTCCACAGGATCCCTCTGCAAGGTTTGTCAGTCAGAACCATTCCCAGCCCCATGGGAACTCTGGGAGTATTGACATTCCAGCTGTGTTTATGTGTGAGGCACATTCATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATATGGGTGTGTAGCTGGGGTGTAAACAAAGCATGGACTTTGTGTGTGGTAGGCAAGTGCTCTGCCACTGAACTATATTCCTCTGCCAATCTTAATCATTTGAGCCATCTTGTGGGGTCTTTAGGTATTGGTGGTTTGATAGTCAGTTAAAAGTGTATGCAAACATCTGAACTCTCTGTGTGTAGCATTATCTCTAGAGGTCTTCCTCCCAACTCTGACCTTCTCCGTTACCCCATAGACCTAGTACTTAGATACATTCTCACTGGGCTACTCCACCTATTGTAAGAGACCACAGAGATGCACCACTTCCTGTCTAGCAAATACATGTGTTCCATAATCCGTCCCCATTTTCTCCTTCACTGTGGCACTGCCTTCTGTATGTCAGGTGCATTATCATAGCTGAAAAGTGAAGTTTCAGAGTAAATTACCCACCTCTCCTCGCTCTTACATTTGAGAGCACACAAGTACACGTAGGAGAAAGATCTCTGAAATTTTATTTTATCAACTTTTGCATTTTGTGGGTGAATTTCAGAATCTTTTTATTCGGGGTAAGGGAAGTGGCTCAATACTTGCCATCCCAGCATGAGGACCCAAGTTTGCAGCTCTGTTTCCACATAAGGGCTGGCGCAGTGGCAGACAGGCAGACTCTCGGATGCCTCCTGGCCAGCCAATCCAGCCGAACGGAAGTCTCCAGGTTCAGAGAGCACAATGGAGCAGATACCTGAAGTCATCCTCTGGCTTCTACATGTGCAAGCACAAGATGAAGGCATGCATGTGTGTGCACACAAAGGCACATAGGCATACACAACAAGCAAATGAGCTTTATGCTTCATTAGTATTAAGACAGAGATTTAAATAGTGTTTCAGTTCTTATTCCAGACATTTTGTTAACTAGGAGACACTCCCTTCTATAGAGAAACATCATTTTAATGATTCTGTATCTCTAAATTGAGATGGTGCTTGGTGCAGCTTTATAGAAGGGTGCTGACCCCCTAGTAATACCACTAGTGGACTGTGACTTGTTGGTGTCTCCAGTTCGGTGGCATTTCATTGTGGGCTGACAATTCTTCCACACCCATTAACCATCTCTGCTCTTGCAG
Seq C2 exon
GTAGTCCAGCATGACCCATGTCGGGGTGGAGCTGGGTACTGGAATAGCCTCTTCCGGTTCAAGCACCTGGCTACAGGGCATTACTTGGCAGCAGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000007104:ENSRNOT00000040255:11
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.045 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0281514=MIR=FE(23.8=100)
A:
NA
C2:
PF0281514=MIR=FE(15.3=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]