RnoINT0097078 @ rn6
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Description
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Seq C2 exon
TGAGAAGCGCCACCTTCAAGTGAACGTCACCAACCCGGTGCAGTGCAGCCTGCATGGGAAGAAATGCACCGTATCCGTGGAGACCCGGCTTAACCAGCCACAGCCTGACTTCACCAAGAACCGCTCCGGCTTCATCCTCAGTGTGCCCGGGAATTGACTGCTGCACACCGGAGGCCTGGCCCAGGGGAGCAAGAGCCTGGGCCTGGCACACAGCAGGCCAGGTCCTCGGCCTCGCCATCCCCACATCTGTTCCACCTCGCTCAACATCCCAGGAGCTCGGCTAATCGCTGTTTGCCCTCTAATGCCACTAGAAATCAGCTTGCAAGGGCCTCCGCTGGGCAGGACTCCTCTGCCTTTTCTGTGGCCCTGCTCATGACCTGTCCTACCTGGCTTTCTGCCTCTGCCCTGCCTCTGCTCTCTCAACTTTCCATACTCCCTGCTCAGGAAACCAAAGACCCTCTTCAGCCTGCTGGGCTGACAGCTAGACCACTTCCCACCCCAAGCGACTGGATGGCTCCTGTAGTTGGCAGGAGTGCAGTGGCCACTGCTGACCCCAGCAGAGGGATGAGAGGCCCGGAGCCCAGGACGCAGTTTCTGGATCCAAAGCCACATTATCTTAGAGGTTTGGATCCAGCATCCGTGGGCAGAGGGATTGGCCCTGCTTTGTGACCCCTACCTGATGCCTCCTTCCACAACATGATTGCAGCCCTTAGAACCTAGCTCAGAGCCCCTCAGCACAAGCCCCGCCCCCAGCAGCCAGCCAAAGCCACTGGGTGAGCGGGTACATCTGCGGAGCCCATCCCTCAGCCTCGATCAACCAGGATCCCTCCTTCCCAGAGCCTGTCCCTGGGAGAGCTTTTGCCACCAAGGTTCTAGCCCTGGACTTTCTAACCACTTCTCTCATGGAGACACCCTGCTGCTACTCCAAGGACCAGTTTGCTTAACTCACAGCCCACATCCATGGTCATCTTAACCTTCTTTCCTGCAGATTGCCAGGTTGCTAATCTGCTGTCCCCTCTGCTGTAAGCACAGTGTCAGGACCTAGTGAGGAGGTACAAGGAGCAGGCCGTGCTTGGAGTGCCCATTCCCCCTAACCCTCTGGCTGCGCCTCCTCCTCACTGGAGACCCGGAACTCTGAGAGAGCCAAAGCACACAGGACCCAGCAGTGTGGGTTAGACAAAGCTGCAGCTAAGATCGGGGAGTCCTGGCACTGCAGGCCAGGCCAGGGTCCCCACCTAAGCCACATAATCTGCCTGCCGGAGCCTGGCCCCCGAGCCCCCTCCTGGGAAAGTGCTGCCCATTTGCCAGTGTCTGCCCAGGAGGAAGGGCATCTGCTTCAGAGGCCTTCCTGAGACCCCTGCTCCCAGCCTCAGCTGGTAAGGCCTCTGGGTGGCACAGGCTTGCTGTGGGGAAGCCCAACACGGAAAGTTTGCAAGAGGCGAGAGGTTTGTAGGAGGCGAGCGAGCCACAGCGCTTTCAGAGCCAGGCTCACATTTTCTTCACTTTTGACCCGACTCTGCTCCCTAATTCTCACCCTGCCACCCTAACCCACCAAGTGCCTATGCGCTACCTCCTGTGCCTTGGCCCGGGCCTGAGGGAGTCACCTGGCTGGCCACGGTGGTTCCAGCACCTGGTCTCCTAACCCTTTTGCAGAGCTGTGGGGACAGGGACGTTTACACTGCAGGCAGTTTGCAACAAAACTCCTGTTGCCATGCTGCCCTCGAGAGGCGTTCTCATCCCCCAAGCCTGGTGAGCTGCCAGTTGTGCGGACCTGACGGAACCACGTGACTGGAACCACGTGACTGGAACCACGTGACTGGAACTTCACCTTCCCACCCCACTTACCGCCCCAGCGTGTTGCGTTACACTAGACATGCTAAGTGTGTTCATACACACCAAAGCAGTTATGCCAAAAGAGTCGCGGGTCAGAAGGGATGGCTCCCCTCCCACCCTCTGATGTAGTCTGGGACCCCTGGCCCAGGCCAGCACCTCCCACTGAGGGCTGCCCTGTCCACGAGCACTTTCTTATGTCCTAAAAGTCAGCGTGTGGCCACTGAAGGACCTGGAATTAGAGGTGTGGATGATCACAGTAAGAGCTCGGGAGAGGACACAGTGATTGTATGCATGGAGTAGGGGTCTCTTGAGTTCATGAAATGCAGTTTATGGTTTGGTGCATATATTCCTATTTTCCATTAAATTAACTTTATTTCTAAAGCATATTTTGATTTACCATCAAGAGCAATAAAGCATTAAATCTT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000003276:ENSRNOT00000004609:21
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.058
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF060178=Myosin_TH1=FE(25.0=100)
A:
NA
C2:
PF060178=Myosin_TH1=PD(24.5=94.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]