RnoINT0132855 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000007202 | Sema3d
Description
semaphorin 3D [Source:RGD Symbol;Acc:727939]
Coordinates
chr4:19309587-19330235:-
Coord C1 exon
chr4:19330075-19330235
Coord A exon
chr4:19309650-19330074
Coord C2 exon
chr4:19309587-19309649
Length
20425 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTCAGT
5' ss Score
8.68
3' ss Seq
CACCTTTAAATGTTTTGCAGATT
3' ss Score
9.18
Exon sequences
Seq C1 exon
ACTTGCTGCTCTCAAACACCTGCATTCCCTTTTTGGGTTCATCAGAAGGACTGGATTTCCAGACTCTTCTTTTGGATGAGGAGAGGGGCATACTGCTCCTAGGAGCCAAAGACCATGTCTTCCTGCTCAATCTGGTAGACTTGAACAAGAACTTTAAGAAG
Seq A exon
GTCAGTTTATCTGTGTACATCTTTGGTGGATTCACTGAATTTCTTCTGTGCCCTTTGTCTGCTTTATGTTAATTGACACAGTGTCAATCAGGAGGACATATAGATGAGTTTATATTAAATTCTTTTCATACAAATTTATTAAGGTAGAAGCCACATTTTAAAAGTTACATGCATCGTATAGCCTACATATTATTTAGAGTAGTTAATAAACGGTTGATTATGTACTAGAATTTAAGGTGTGCCATCCAGTTTGATACTGTGGCTCCATTCTATTTGTCCCTAAGGTTATATTTTTTAATTATTCAGGAACTTATTAAAAATATTTATGCTCCTGGAAGAGATAGATGATATTGAGTGATATTTCATTTATCAGTAAACACCTCAGCAGAACATGACACTTTCTACAAATGAGGCTAAAGAAAATGTTTTAATTCTGCAGTCTTGCTTTTATACTATCTGGCTTACAGTGCATTTTCCCAAATAAGTCTTGGTTTAGTATAATAACAATAAGTAATTCATGCTTTTAAGGGAATCTGTTCTTGCTCTCTTCTTTGCCTTCAGGGTTTGGAAGAAAAGGTTCATTTATCTGAACTGAGTGAATTAGATCATTGCTTAAAATAAGTTCTGATAGCACAAGTTCCTTGTGCGACTATTTTAAGCAGACATTTTTTGGTGATATTCCATGTTCAAACTATGCTAATATTTAGTAAAGTAAATGTTTATAAAATATCGATTTCGCTTATTACATTCTTGTACTGATTATTTGAATACTTTATGTAATTAGAGGTTTTCCACATAACTGAAATTTCTTTATACCTCTATAAAATGTGTGATTCACAAGAAAGTCACACATGGACTAGAAACGATTAGTGTCTATGTAGGTATCCACCCTTTCAAATTATATAAATCACTCCAGTGCTAAAAGGTACTTCACAGTAGCCAGTAAGTGTTGAGATATAGTACTTCAGCAGTGTTTAGACCTATGGTTTGCATTGGCTCAGTGCCCTCCGGCAAGGATCCAGACTACTCCATGAACGAAACCACACATGTTGGGACTTGGAGGTCTAAAGGGCATCCTTTGTGTTTTAAAGTTAAAGCAGCTACAACACACAATTGAGTTATGAGTGTCTGGATGTTAATATTTCCCCCAGGGAAATTAAAACATTTCTGTGCATAGTACTCAGTTGGAGTAAGCGTAATTTAGCATACGACTTGCATGTCGAACTCATATACTCCTAAGGTTGTGCCTGCTCACAGTAGCCATTGTCTTTCACACACACAGGCATAGTAGGAACAGAAAATGCATCAGGGTTATATACAAGATGAACTAGGAAATAAGTCCCTAATGATTCCTTTGAGTTATCACTACTGTTGGTCATGCTATCTTTTGAGTCTAGTATGGTGAATCATGCAGGTACAGACAGGCTTTTTGGAACATTTCTACTACTGAGGAAATACACGCTATGAACTGTTTCCCTTTTTAAAAAATGTCCAGACATTAAAAAAAAAGAAAACCTACATACCCTTACTTTTTTTTCATTGTTTGGGGAATTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTGTTTGGTTAGTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGTTTGGTGGGGAAAGGATTATCTCTATGGAAAATAAAATTCTGTGCAGGTGCAAATGTGTCAAGGATATGGGGTTTTATAGTAGAATCAGGATTTCCCCCACATTGATCCTTCAGTAAGGGGAAAGCCTGTGTACTCCTTCGGGAAAGGTTTTGAAACAGATAATGCACGTGGAGTTTTGCCTTGCCTTACTTCGACAACAGATCAAAATAGATAATTAGAACCACCCAAAAGTGACTCCATTACAAGGAAAGGACACAGAATTAGGTTACCCCAGACTCCAACGCTGAGGTAAAGGTTACTTTGTGAAATATTAGTGAGTGCTTCAATTCAGCACCTGGGAGAGGGAAGCCCACAAATGTCAGGAGCAAAGAGACAATTCAGTTCTAGCAAGAACATCAGCTGGCAGGCACAACTGCCTATGGCAAAACTTTCAATAAATCCCACTAATAATAGCGATATAAAATAACAATTAACTGAGATTCCTATTTTTCATACATGAAACCATTCACCAATTAACCAAGATTCCTATTTTTCATACATGAAACCATTCACAATGGTCATCAGAATTAAAATTAAAAAAAATAAATAATCCCATGCATCCTATCAGATCATCACACACTAAAACTGGTCTTCAATAATAACATTAATGAGAGAAAGCCCACATATACATGGAAGTTGAACAATGCTTTACTCAGTGACAACTTGGTCAAGGAAGAAATAAAGAAAGAAATAAAAGACTTCTTAGAATTTAATGAAAATGAAGATACAAGATTCCAAAACCTACGGGACACAATGAAAGCGGTACTAAGAGGAAAACTCATAGCTCTGAATGCCTGCAAAAAGAAACAGGAGAGAGCTTATGCCAGCAGCTTGACAACACACCTTAAAGCTCTAGAACAAAAAGAAATAAATCCAAGAGGAGTAGAAGGCAGGAAAAATCAAACTCAAAGCTGAAATCAACCAAGTAGAAATGAAAAGGACTATACAAAGAATCAACAAAACTAGGAGTTGGTTCTTTGAGAAAATCAGCAAGATAAATGAACCCTTAGCCAGACTAACCAGAGGTTACAGAAAGTGTATCCAAATTGACAAAATCAGAAATGAAAAGGGACACATAACAATAGAATCTGAAGAAACTAAAAAAAAATCAGATCCCACTACAAAAGCCTATATTCAACAAAACTAGAAAACCTGGAGGAAATGGAAAATTTTCTATACAGGTACTAGGTTCCAAAGTTAAATGAGGAGCAGATAAACCATTTAAACAACCTCATAACACATAAAAAAATATAGAAGCAGTTATTAAAAGTCTCCCAAACAAAAAGAGCCCAGGACCAGGTGGATTTAGTGCAGAATTCTATCAAAAGAAGACCTCATACCAATACTGTCCAAACTATTACACAAAATAGAAACAGAAATTCCTTCTATGAAGCCACAATTACTCTTACACCGAAACCACACAAAGACCCAACAAAAAAAGAGAACTTCAGACCAATTTCCCTTACGAATATTGATGCAAAAATTCTCAATAAAATTCATGCAAACCGAATCTAAGAACATGTCAAAATGATCACCCAACATGATAAAGTAGGCTTCATCCCAGGGATGGAGGGATGGTTTATTATATGGAAATCCATCAATGTAATCCACTATATAAACAAACTCAAAGATAAGAAGCACATGGTCATTTCATTAGATGCTGAGAAAGCATTTGACAAAATTCAACATCCCTTCATGATAAAAGTCTTGGAAAGATCAGGAATTCAAGGCCCATATCTAAACATAGTAAAAGCAATATACACCAAACCAGTAACATCAGACTAAATGGAGAGAAATTTGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTCTCTCCCTACTTATTCAGTATAGTACTCTAAGTCCTAGCCAGAGCAATCAGACAGCAAAAGGAGGTCAAAAGGATACAAATTGTAAGGGAAGAAATCAAAATATCACTATTTGCACATGAGATTATGCTGTACTTAAGCCACTCTAAAATTTCTACCAGAGAACTACTTAATCTGATAAACAACTTCAGCAAAGTGTCAGGATATATATAAAATTAACTCAAACCAATCGGTAGCCTTTCTCTCCTCAAAGGATAAACAGGCAGAGAAAGAAATTAAGGAAATGACAACCTTCACAATTGTCACAAATAATATAAAATATCTTGGTGTGACTTTAACCAAGCAAGTGAAAGATCTGCATGACAAGAACTTCAAGTCTCTAAAGAAAGAAATTGAGGAAGATCTCAGAAGACAAAAAGATCTTCCTTGCTCATGGATTAACAGGATTAATATAGTAAAGATGGCCATTTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCTACTCAATTCTTTATAGAGATAGAGAAAGGAATTTGCAAATTCATTTGGAATAACAAAAAAAACAAAAACAAACAAACAACAACAAAAAAAACAGGATAACAAAAACTATCCTCAACAATAAAAGAACTTCTGGGGGAATCACCATCCCTGACTTCAAGCAGTATTACAGAGCACTAGTCATATAAACTGTATGGTATTAGTACAGAGACAGGCAGGTAGATTAGTGGAACAGAATTGAATAACCAGAAATGAACCCACACACCTATAGTCACTTGATCTTTGACAAAGGAGCTAAAACCATCCAATGGAAGAAAGATAGCATTTTCAACAAGTGGTGCTTGGTCAACTGGAAGTCAGCATATAGAAGACTGCAAAATGATCCATTCTTACCACCATGTAAAAAGCTTAAATCCAAGGGGATCAAGGACCTCCACATCAAACCAGATACACGCAAACTAATAGAAGAAAAAGTGGGAAAGAGTCTCGAAGACATAGGCAATGGGGAAAATTTCCTGAACCAAACACCAATGGCTCATGCTCTAAGATCAAGAATCGACAAATGGGATCTCATAAAACCACAAGCTTTTGTAAAGCAAAAGACACTGTCATTAGGACAAAATGGCAACCAACAGATTGTGAAAAGATCTTTACCAATTCTACATCTGATGGAGGGCTAATATCCAAAATATACAAAGAACTCAAGAAGTTAGACTCCAGAGAGCCAAACAACCTATTAAAAATGGGGTACAGAGCTAAACAAAACATTCTCAGCGGAGGAATATCGAAAGGCCAAAAAGCACCTAAGAAATGTTCAACATCCTTAGTCATAAGGGAAATGCAAATCAAAACACCCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAAACTCAGGTGACAGAAGATGCTGTCGAGGATGTGGAGAAAGAGAAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGGTTGCAAACTGGTACAACCATTCTGGAAATCAGTCTGGAGGTTCCTCAGAAAATTGGACATTGAACTGCCTGAGGACCCAGCTATACCTCTCCTGGGCATATACCCAAAAGATGCTCCAACATACAACAAAGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAACAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCTTCAACTGAGGAATGGATTAAAAAATGTGGTACATCAACACAATGGAGTATACTCAGCTATCAAACACAATGAAATTCATAAGTAAGTGGAATGAACTAGAAAATATCATCCTGAGTGAGGTAACTCAATCACAGAAAAACACACTTGGTATGCACTCATTGATAAGTGGATATTAGCTAAAAAGCTCGAGTTACCCAAGATGCAACCCATAGACCACAGGAAGTTCAAGAAGAAGGATGACCAAAACACAGATACTACCACTCCTTCTTAAAAGGGGGTAAAATATCCATAGGAGTAGATATGGAAGCAAAGTTTAGAGCAGCGACTCAAGGAATGACCATTCAGAGCCTGACCACAAAACTAGATAAGATTGATGAAGCTAGAAGATGCATGCTGAAAGGGAACAGATATAGATCTCTCCTGAGAGACACATCCAGAGCATGTCCAATACAGAGGTCAATGCTAGCAGCAAACTACTGAACTGAGAATAGGACCCCCTTGGGGGGAATTTGAGGAAGTATTGAAAGAGTTGAAGGTGCTTGCAACCCCATAAAAACAGCAATGCCAACCAACCAGAACTTCTAGGGACTAAACCACTACCGAAAGACTATACATGGACTGACCCAGGGTTCCAACTACATACGTAGCAGAGAATAACCTTGTTGGGTCACCAGGGGAAGGGGAAGCCCTTGGTACTGTCAAGGTTGAACCCCAATTCAGGGGAATATGGGGGAAGCGATAAGGGGGATATATAAGGGAATACCTGTATGGAGGAGGGGGAGGAGAGGGAATTGAGGTTTATGGACAGGAAACCAGGAAGGGGAATAACGTTTGAAATGTAAGTAAAGAAATATATCTAATAAAAAATTAAAAAAACATAAATAGTACATTTTCTATTATATATTAAATAGGACATTTTTTCATTTCTTAAACTCATTGAGCTTAAAGTCTTAGCATGAAGAATGCTGCAGTAGAATATGAAATTTAGGTTTCATATAAATGCTTATGTGAACACCAACTTCATTATTTCTGGTTAAGGATGCAAGATATAGAAGTTATAGAACAAGTCAAAAATATTTGAATATCTAAAATGAAGAGACAGATCACATATCACATGATAAATACAGAGAACAGGATGAACCCTGTCATGCTTGGATTTGAACTAATTAAATGTAGATGAGAGATTTTTGAAATAATGGAAATTGTTTAATTGTAAGTGGATCACATTTGAAATTGAATCTTGATAAGTACTATTTTCTTTTATTCAGTTAGGATAAGGAAAACATGTTTTAGAAATAAAACAGCAAAACACCTTCTCTCTTTCATTAATAAACTTTTTATAGAGGAGTAATATAAGAGATTTCCTTCTCAAGATGTTAAGCCTACCCCATCTCTGCAGTCAGAAGGAAGTACATGTAAGAACGTCAGATGTATTTGGGACAGCTTGTCAACCACACACAGTCAATTTACTACTCTTTTCTAAAAGATGCAGTAAGAACATGTTCCACATAGACATGCCAATAATGACTATTGACATTTTTAAATAGAACTTAAAGAACTGTGGTTTCTAAACAAATGATTCTAAAGTGTATTATCTGTGATCTTGCAAATGAGCCCTGTTTTCCTCAGTCAAATTGAACTTGTAGTAGCAATGATTCATACAGAAGCTGGAACTCACTGTGTATAAACTTCAGCTGTAAAAATACACATCTAATTCCTTTCCTTCATTCCCATTGTTTTTATGTCATCATGTCTGACAGTAAACCGAAATATCTAAATTACTCTGTTTAGTTGTGTAACTTGATCAGACATCTATAAAGAACTTTGGGGATTGTTTATATCTAAGATATTACTTATTTTGGAAGCAGTTCAAGCCTAAAGGTGTCAAATGAGTCTTAGTCTAGATGTAGGTAAGTGTCAAAGAAGTGTCTATTTTATTGACACTACTCTAGATGCCACTTCTTGTCTTATGGCCTTGTCAGAAACTTAAAGCTGACTTTCCTTCTTAGGTACCTTTGTTTAGATTATGAGAGTTGGGTATTTCCTGTTCATGAAGTTATTTCTGCATGAGAATGACTGCATTGTTTCACTGAAGTATGAAGTTTCCCTATGAGATGGATTTTATTACAGCAAGACTTCACTTTTAGAGTCTTGAGTTGGTTTTCTTGAACTAGACCTAAGATCACCTCATTGTCAGTCCCCATGTACAAGACTTATTTATTCTTTATTTTAAAGTGTATGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTGTCTGTCTGTGTCTTTGAGGTCATGTGCCTGTGAATCCAGGTACTAAATAGGTCAGAAGAGTCAGATCCCCTGGAACTGGACTTAGGGACAATTGTGGATTGGTGGACACAGGTACTGGGAATTCAAATGGATTCCTCTGAAGGAGCAATATGTTCAGCTGAACCATATATCCAACCTAGACTTACAGTGTGCATCCCTCTCAGGGAAGAGAATGTCATCTCCTATATTATATGGGACATACAACATTACTATGAGAAGGAATATCACTTTCCCTCTTTCTGCTAAGATGGAGGCCAGTTTTATTTGACTTTAAGAAAAAAACAACAGGGTAGTCAAGTGGTACATCTCAGCAGCTTCCAGAAGCAGATGAAAAACAGAGAGAAAAAAGTTAACACCTCTTCAACTAGGGCCCCAAAAGGACTATATGGTCAGAAGTGGAGATTGACAAATAGCTGTATGGGAATTTGACTCAGGTTAGTACTTGTTGAGAATGAGTGATAAAGTCCAGAGTTTTGGGGCAAGTATGCTTCAGTTATTGGAAAAAGATAGAGAAAAGGAAAACGTGGGAAGGTACTAGAAGTGAAGATCTGTAAGCTCCCTGCCTCATTACTCGCTAGATCATGGCTTCTCTCTATCCCATGGGAAGCCTTATAGTATGACTCTGGTTGACCCCACAGGGCCATCATATGTCTGAGCACACTCTGGATGTGTAGGATAACACCAGCTTAGCCATCAAGCATGTCTGCTGATTGTTTTGTTCTTTACTGTCCTCTTGCTTTTGACATTAACTCACAGGAAAGCTGGAAAACAAGAATTTTTGGATGATCCCCAAGGCCGTTACTCGAACAAGCTCTCAAGGGGTCCTTGTAGCAGCAGAAGTGAGTTTGCTCAGACAAAAGCAAATTTCTCCAGGGGAAACAGCAAAACCGGATCTCCAATTTCCATATATGTTATTGTTGGACATGGAAGGAATAATAATCTAAATGTATTTCTCTTATCAAACTTGAAGATTTTTGCATCTTTGAGATACACTTCACTTCAAATTTTGCCTCAGTTAAATTTTCCTTTGATCATGTAATTATATCATCTAACCCATAAATAAAAATCTCAAAAGAATGCTGCTCTAACTCCAAAACTGTCATGGAAGAGTTACTTCCCATCATTCATAAAGTGTACCCATTGGAACCTTGTGGGTAAGAAAATACGAATAGCCTTGCTATTGCCCTCTGAGATATTAATAAAATCCACCAAACACATTTTTGTATTGTATCTTGTTTCTCAGTATTATTTTTGTTTTATTACAACAAAACTATAATTGAAATTTTTCTCTAAAAAGAAAATACTACATTCATTGAACCATTTTAAACAATCTCCAGAATTAAACTACAGGTTGCTTTTATTTTGAAATAATGCCTAATCATCTTTGTCCCTTTATCCAGTTCATTTAATTTCTTTTCTCTTGAAACCAAGGTTTTAAAATTAAACCTATGTAAAATTTTCAGTGAATGAATGCAGTAGTAATCTAAGAACCAATTATCCCTTGGCCCTTTTAGCTAAGATAATGTATAAATTTAAAAAAAAACAACAAAAAGGAGAAGAAAAGAAAAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGAGGACAAGGAAGAGGATGAGGGGGAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGAGGAGAAGAGTGAGGGAGAGGAAGGAGGAGGAGAGGAGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAAGAAGAAGAGGAAGTTGTTTTTCAGCAGGTTAAAATTCTATCACTAGGAAAGTTGGGAAGTGGAAGTGGAATCAGGATCAGGATTCTGGGTGAACCAGATCCAGCTTCAACTAAAAGTACCACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTTTTTAAGTAAAAGGGAGAATCTTGGTAACTGAATGCCCCCCCCCAAAAAAAGAAGACTTAAAGGCTTAAATCTTCACTTACAGGATTAAAGACAAACTCTTAGTATAGCGCTTAATTTTTCTTTGTAGAGCTCTTAAACTTATTTTTTAGATAAAATTACTTTTTCCCCTTTGTGACTAAAATTATTTGATGTGAAAAAATAATAAATATGTTCTAGATTTTAAAACAAGCTTTTCTGTTATTTTGATGACAATGCATCAAAACAACATAAAAATGTTAACCCTTCCTAACAGAACTTCTTTTCACTAAGCAACCTGAGATGATTTACTTTGCATAAAGCATGGAAATTATTTAAGAACCCTATCTTTATGGCTAGTGAACAACAAACAAAGAAAACCAGAATCCTTCAGAAGGAATAAATGGATTAAAGTTAAATATAAATTAATTAAGGCAAAACCTCTAAACACTAAGAAAATCTAGCATATTAATTAGACTATAAAATGATTCAAAGTTATCAATGCAAGGAATTTCATGTCCATATCCCAATAACAATGTAACTTTTTTCTAGTTTGCACTATCAAAACAGAGTGATTACAAGCGCACTTAATGTATTTGAAGCTCATCAAACTATATCTAATCTATTTTAGCACATATGAAATAACTGAGTCTACAACTGTCAATCCAGTACATTGCTGGAGTGCTTACGTACTCTTCTTTGCTAACATGGAAAGGCCTTTGTAATTTCCCTTTCCGTGGGAAGTCTACAACTAAATTCTAGATGTGAACTGCCCCATTTGTTTTATGCTGAGTGCAATCAAAAATCCCTTTATAAATAATGGCCTCTGACTGAAATCCTATTAACTCTGTGGCCAGGCAAAACTGCACACAATGCTTCATTCTGTGAAGCTCTTGTTTATAGAGAAGAGAATTGGAGTAAATATTTTCTTCATGTAAGGTTTCTACTGATAAAACAAAAATGCATTTAAAAAAACAATTAGTACATAAAATCAGGAGAATTTAAATGCTTGGAACCAAGCAGATACCGTAATAAATGAAGTTTTTATATGAGGCACCCTACTCAGTTTCATGCTGTTTAATCTTTCTCCGTTGCCTACTGTGCACATGCTGTCCTGTAATCAGAGCTGCAACACAATTGCCCTGTTCATGAACATACTGGCTGCTCAGTTCAGTGAAGGTTCCATCTGGTCGCTGTAATGGACTGTCAGGCTGGTGACAGACTACTCAGGCTCCTGCCAAATCTTTGGCCAAAATGCTTGAGCTCTCAAGTCTAAGGGAACCTTCCAAAAAAATTTTTTTTGACTTCTCAGTTACGTGTACACTGCCGGTCACAAGGAGGGTAGGGAAAAGCGATGCCCATTGCACTGGTCATCACTAGTTACCAAACTCCAGTAAGTCACATACCTAAGAAGGTATTGGAGTATCATAGTATGGCTCGAAGAAAGTGAACAAGAAAGGCTTAGGATAAAGGGATGATCAAGGATTGAATGCAAGTAATAGACTCACAGCCTTTGGATTGAACTGACTAGGATGACGGGAACTAAGGAATCTATAGACGTGCCTACATACAAACTGGGGGCTGGGTGGGCTGTGTGTTCTGACAGAGATACAGCAGCAGCCTGGTAACTCAGTCCATTTACTATATACAACTGAACAATCTAGCAGGGTAGCTAATCTCATTGGTTGTCTCTGTGGATGGAGCAGTCTCAGGCTTATGTGAGGATGAAGCTGTGGATGGTATTTTCTGCATGCAATGTCCAAATTAGAAATCTGATCAAGGAAAGGCCTTGTCGTTCTGTAGGTCTGACACTTTACAGTCCTTGGACACTAATCATGTCACAAATGCACATTCACTCATGACATTTCCTGCTCCAAAGTCATTGATATTTTGATTTTAGTGACAGACAGGTGCTTAAAGTATATTCACTACTGAAAATGTCAGATCTAATATGAAGGTAAACAGCTTCCGTTCTCAAGGGCTGTTCTCATTGCTTACCAGTTGAAAGAAAGTTGAATCTGGTTCACTTCGATGTATGATGGTTTTTATTTATTTAAAGGATTTTTAAAATAAAGATTATTAAAAAATATTAATTGATATATTAATTGAAATAATCTTAATGAAAAAGGTTTTAGTGAAGAGTATTAAAATTTTAGAAACTAAAAGGAAGGAAATGAAAGATACAAACAGTACTCTTTCCAGTTTCTTAAAGATGTATGGAAAAGAGTGATTGGGTCATAAATGGAACAATATCAAGCCATTAGTATATTTTTGTAATTTATTTTAATTTACTAGTGTACCTCTCCTTTCAATATATATTTCTGGTGAACTACTCTATTCTTCCTCTCTTCTGGATGCTGCAGGTATCATAAAGGCTAAATGGGTGAGACTCCCAGTGCTTCTTATTATAGAAGAAAATAATTGAGGAAGAAAAAGTTGCCTCCTGACCTTTGATAGAGATATCTGGTGTCTCTGAGGTTCTGGATTTTTGTCTCTAATTAGGTTTTATGAACACATCGCAGCTTCCTCTTTGGTGTCCTCTTCAGTCTTTTGGCATCTCTAAAGTAGGCCAAAGGGCATTGACAAACCTTGTGCTTGCTAACTTGAGTCAATTAAACTGCCTTTGAAAGATTAAACAAGGAGCAGATATAATTAGGACTTCCTTCGGATGTTGTCATAAGGACTTATCACTACTTTAATGTTTCCATAATTTCCCAAACATTAACTACTTAAAAATAAATTGAGTGACATTTTCACCTTAATAAATGATGCCTGTAAATGAATTATATGAGTTGTAAATAAAGAATACTAATTAATCTCCTAATTTATGAATGAAACAATAATTAAAGGGACCTTATAATATTTTATTTGTAAGTTTCTTGATTACATTTGTACAAAATGAAGAAAAAAGCTCAAAAAGTCAAAACTAAAACTACTGTTTTAAATTTTTATGATTTCAAAAAGAATTTGGAAAGAAATTAAAGTATATTTATTTATATATGACTGATAATATGCGTAAGTGACCATAAGTATTCCACTGGGAAACTCCTACAGCTGAGAAGCATTTTCATTGATGTTCCTGGATACAATATTAACTCACAAAACCCAATAGCTTTCCTACTTACAAATGACAGAGTAAAAAAGAATCAAGTAAACAACACCTTCACAATACCCTCAAGAATATAAAATATCTTGAGGTAACATTAACCAAGCAACTGGAAGACTTTTATTATAAAAAACTTTACAATGTGGAAGAAAGAAATGGAAGATTCCAGAACATGTAAATATGGTCCATGATCATGATTAGTAGGATTTTTTTCTTTTAATATTCCAACCAGTTTCTCCTCTCTCCAATCCTCCTAGATCCCCCTCATTCTCTTCTCCTATAGATCTACTTCCCCTCTGTTTTCTCTTCAGAAAAGAGCAGCTTTCTAAGAGACAAAAGCCAGACAGGATGAAACAACATAGAGTAAGACAAGGTGAAAGCTGTCATATCAAGGCTGGAGGCAACCCAGTAGGAGGAAAAGAGTCATCAGAACAGGCAAAAGAGTCAGAAATACAACCACTTCCCCAAAAATATTTTTTAAAATCATATTTATACAACTAGAGCATAGGTCATATTTTTGATTCATGAAGTGATTATTAGACTTCTTTTAAACATAATTTTATGGAGGTACTGATGATAATTTTAATTTAATAAAAATTGATCTTTATTCATATTGGTAATATATATTATATAAATGTAAAATTAAAACTATAGAAATATTTTAAATATCAATGTTTAATCTTTTAGATAGCATAAAGCACCATGAAAATTATAAGTTATGAAATATTGTAAAGGCTATGTTGGTGTAGTATCTTAAGATGGCTAAGTCAAATTGTTATAGAATATGAGTACTCATTTATCTTTTGATTTAAAAATGTTGAATTCCAAAAGGCAAGAAACTTTGTAAGTTTACTTCTGTTATTCAGTTTTCCGTTATCAAATACTGTATAATAATTACCACACATGTTTAAGCCAATTTCCAAATCCTAATTGTTCAGTGGTGGCTCTACCACTCATTACACTTCAGATGATTATCCAGATGAATCTAAAGTCCCATAAACCATCTCTGATTTTTTCTACCTTACTTTTAAAAGAAGAGTCATATATACATTTGCAATCAGTGATATAAAAGAAATCTACAGGTCTGAAGACCATTGAAGGGATGATAGCTGTAAATAGCTTGTGCATAATTCAAGTCACACTATTTCTTTGTGAGAATGTTCCAGGACAGTCAAGATAGAGAAAAGATGCTAAGCACAGCAGTGGTTCCCGTATGAGTCTTTGCTAAGTGACAGAAAATGTCTGTCAATGACTTTCTATGAGAGCCACCAATTTGTAAAACAGATGTGTGTGCTTTGTTTTAGCCTGCTTAATGCAATTTTTAGTATGCTATGGTTTTATGAGAGATTCTAAATATAAGAAATTATACAATATATTTTATTACTAAGAACATTACCAGGGGCCAGTCAGTATTTCAAAGTCATTCACATTGTTTAATTTTTGTAGAAATTATTTCATGTTAATCTGGGAGTTTCTACCCTGTCTTTGATCATTTAGTCCCTAGATTAAAGACGCTCAACTTTTGCTATTTACAATAAGCCTTAAACAGCACAAGAGATGGGCAGATATCTACCTTCTATTCTATTAGAATTTGCTTTCCTATCAATAATGTCAAGATTTTACTTACTATGTCCCATCTGAGCTGCTCTAAGTCCAACTGACCAGCCCTCAGGCCAGGTTTTCTTGACTCCTAAGTCATGGAGTCTTTCCCTTTCTCCTCACCTTCTTCTTCAGCTCCTTATTTTCCTACTACCCCAAAGTGCATGAACCATAACCCCTCCCATTGTCTCTTCTGCCCAGCTATTGGATATCTGCATTTTTATTCACCAATCAGAAATATCTTGAAGACAAGGTTATATAGTGACAATTGGGTCTACCTGCAGACTCTCTTGTCCCTGTGGCAACCAGGTCATGCCCCCTGCCCCCAATCAGCAATACAATACATAGCAAAAGACAAAACCTCAACACTAAATGATAAGAGAACTGAATTTTATAGATAACATAACTCCATTAAAATATAAAAACTTTATATATTCACCGAAGTATTTATTTTATCTAAGATTCTCACTGTATAAAATGTATATTATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTGTCTTTGGACTCAAATTCTATGTATTTTTGTGTTTCTTCCTCTATAACATGAAAGCTGAGATACATGTATGCACTACCATGACCGGTTTCATGCAGGACTGGAGATAGAACCAATGGTTTCATGATATTTGCAAACACACACACACGCATACACACACACACACACACACACACACACACAAAAGACACACACACAGGCACACACACACACTTAGAATAAAGAGTATAGATATTAGAGTCCTAGTTTATGTGTGTGTATGCATTTATGAATTAAATGTCACTTCAAATAATTATTCAGATACAAAATTATTAAGCATATTTTGCTATTACTATGTAAATGGGCTTGTTTAGTGTGCACTATTAGAGTATATATGGAAGTACTTTTGTGTTATTTTGTTTTCATATAGATTAGATTAAGATTATTTCTGTTCTTTAAATTATTTACTAATTACCACTCACACAAAACAGGTGTGGTAACACAGAACTTCAATCCCAGCACGTATGAGTCAGGAGCAGAAGGAGCAGGAGTTACAAATGCCCCTTTGCTAAATGCCAGTTTGGCTTACGTAATTTTAAAAATATAAACGTTAGATCCTAATAGCTACAAGATGAATAAAGAAAAATCTCACCTTAAACCACAGTAAAGATGCATCTCCGAAATATTGCCATAATGCAATTATTTCTTCTAAGAATATTTAGAGTGCAAAAGACAATCAAGTTCCTCATACATTTATTTGTAATTTGTATCTTTGTTAAAATAATTCTGTTTGTGAAACCAAAGTTATTGACATCATTTTTCTAGAATAAGCCAATTCATAATCCCAATAGATGCTCTTTTTTTTTTGAAAACTAGACTAATTCTTTAAAAAAAAAATCTTTTTCTTTGTAGACTTGTTAGGATCTTCGTGCCATTCTACAAATACCATCTATTGTGTCAAATCCTAAATGTCAGTCAGAAGGTGAATGAAGGATAGAACATGTGTGCTGAAACACTGTTACATTAGCAAAGATCAGAGGTTTTATACAAACATGGCTTGTGTGATTCAACAAATTACCAGGACTTGCATGACATACACCTGCAGGTCCGAAAACAATTCTTTATAAGTGGTAATTAGCTTTATTGCCCCACCAACTAAGATGAAACAACTCGATTTATAATTGTATGGTTCATATGTACTCACCAAAAATGTGTGATAAGGGTATTAAAACAGGTTTTAGAGATTTATCTCTATTGCAGAAGCCAAAAAAAAACAAAAAAAGGCAATTGCTTTATTGGTATTTAACTCCCAAACAAAGTAAAACTATTAAATTGTGCAAGACCAAAACAGGGTATTAGATATGAGACTATCAGGAACACCTATTTGAAACAATCACTCAAAGAATGGATTAAGAAAGACAGATCTCATCCTGAGTGAGTTAACCCAATCACAAAAAAGTACATACGGTATGCACTCACTGGTAAGAAGATGTTAGCCAAAAAGCTCAGGTTACCCAAGATACAATCCACAGACCACATGAAGTTCAAGAATGAGGACAACCAAAGTGAGGATGCTTCAGTACTTCTTAAAAGGGGGAACAAAAATGTTCATAGGAGGGGATATGGAGACAAAGTTTGAAGCAGAGACTGAATGAACGGCCATTCAGGGCCTGCCCCACCTGGGGATCCAGCCCGTATACATACAACCACCAAACCCCGACAATATTGCTGATGCCAAGTGTGCATGCCGACAGGAGCCTGATATAGCTGTCTCCTGAGAAGCTCAGCCAGAGCATGACAAATACAGAGATGAATGCTAGCAGCCAACCATTGAACTGAGAACAGGGTCCCCTTTGGAAGAGTTAGAGAAAGGATTGAAGGAGTTGAAGAGGCTTGCAACCCCATAAGATCAACAGTACCAACCAACCAGAGAATTCTCCCTTGGTTTAGTGGCTTCTTTCTGAATGCTTTCTTCTCACCTTTTGTCTCCCATGCAAATGGAGTAATTAGGTTTGAAGACTGACTTCCTGAGTAAATATGATAACTTTAATCCAGTACTTTGACTGACATGAACAGGGCCTTCACACATGTGCATCCTGTGTACAAACCAAACAGCAACTATTCCACAGAAGCATTTTAACTTTCATTAAGAGCACACAGAGACTAAGCAGGGTGTTTTAGCATTTTGTCATCCTTTAAATAATTTTTTAGTTTTAGACCTAACAATATTTTTACTTCATTTTAAGGTGTACTTTAATTCAAGATTTACAAACTCAGTCATTTCATTTACTGGTTGGATAAGAAGAAATAGAATTCCATGATGATCTTTGTGCTCTTTGGAACTCATGTAAATATTAAACGTATATATTTGCCTTTCTTTCTACTACAATATTAATATCATCACATGCTGAAAAGCTATGAATATTTGTAATCATTTCTTCCTAAATATCAATAAATCTAAATATTACTGAAATGAAAATAAGTACACTTTGATTTATTGAAATGACTGAAAGAAATATCAGTCTAAACTAATCACCAAATAAGAGTCAGGAATTATAAAATCAGATCATGGGTATATAATTCTATTAGCTCCATAATATGTTGACCTTTGAAAAATGATTATTATCTTTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTAACTTGAGTATTTCTTATTTACATTTCAAGTGTTATTCCCTTTCCCCGTTTACAGGCCAACATCCCCCTAATCCCTCCCCCTCCCCTTCTTTATGGGTGTTCCCCTCCCCATCCTCCCCCCATTGCCGCCCTCACCCCAACAGTCTAGAGGTCAGAGTCCAGGGTCAGTCCATGTATAGTCTTTAGGTAGTGGCTTAGTCCCAGTAACTTATATAACATTTCCTGGCTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGTTTGTTTGTTTTAACAATGTCTTCTCATATTGTCATGACCCGTCTGGAGCTCACTATATAGACCTCCATATAGTCTTTAATTCACAAATATCAGGCTCCCTATGCCTCCTAAGAGCTGGAGTTAAAGGTGTAAAACACCACGCTGGCTAGGACATTTTTGCTTGGTTATAAGAAGAAGTTTAAGCAAATATTGCATAGCAATGTGGATATAGTTAATACAACTGTAATACAGAGAAGTTGGTAATGAAACTGCAATGACTAAAAAAGTTCATAATCTGAGTTCATTAACACTAAAGTAAAACAAATGCTTTAAAATTTTAAGGTATTTTAAAGGAGAGAAAAATGTTTAGTACAGTGTTTTTCTACTAATGAATAAAACAAAAAGGAATTTAAATAAGGGTATAAAATTGCTTGCTATCTATCACCAGTGTTTTATTTTTTAACAACTTATTCATGTAATTAGAATGTCCTAATTCATTTGTTTTGATAGTCTATCTCCTATCTGTTCTCATGTTATACTTTGCGTCTATTCTCATTGAGATGCTTCTTTTAAATAGTGCAATTAAAAATAGGAAAACAGCTCGAAGGGGCTCGAGACCCCATATGTACAACAATGCCAAGCAACCAGAGCTTCCAGGGACTAAGCCACTACCTAAAGACTATACATGGACTGACCCTGGACTCTGACCTCATAGGTAGCAATGAATATCCTAGTAAGAGCACCAGTGGAAGGGGAAGCCCTGGGTCCTGCTAAGACTGAACCCCCAGTGAACTAGACTATGGGGGGAGGGCGGCAATGGGGGGAGGGTTGGGAGGGGAACACCCATAAGGAAGGGGAGGGAGGAGGGGGATGTTTGCTCGGAAACCGGGAAAGGGAATAACACTCGAAATGTATATAAGAAATACTCAAGTTAATAAAAAAAAATAGGAAAACAGCTTATCATCCCCACAATTTAGAAAACCCCACATATCTCTTCTAATGTTTATCTTTAATAAAGTATCTATTTAACCATCTATCTTTCTCTCTGCCTTAACTATCAGCTATCTATCCATCTATATTTTTCTCTCTTCTCTCCTTCCTACCTTCCCTCTTTCTCTTTTTCCACTACCCTCCTATGCTTCCTCTCTCTCTCCACCTCTCCCTCCCTCTCTTTTTTTTTTCCTTCTCCTTATCTTCTATTTCCCTTTCTCACCCTCATTCTCTTTTCTGTAAATGATATTTGGAAACAGTGTTTTGCAAAGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCACTGCCCTCTTACATGGACCTCCTTGATGTCGAGATTACAGCATGTAGCAACATTCCTGACTTGAATAACTTTTTTTTTCCACGTAGAAATCAAACCGTTTTGATTTCAGGCTACTTGTTTATATTTTATTGTCAGAGTCATGACTGTATAATTTGGAGCCTCTGCTTACAGAATAATATATCACTAAGCTTCTTCCATATTTCTTTTTATGGCTGTCATTCACTGATATTTGTTTGGCTTCTGGCTATTGGCTAAAGTTATATTAAAGGAAAATGGGATAATCTTAAAGCATTTCTGAGTAAGTGGCAGTGTAGACCCTTGTTGTGACTCCTTCATCGGGGTAAGCTTATCACCTGAGCACATAGTTGGCTGGCCACTGTGCTCCATATCTCATTCCTTTGTAGGGTACATAAACGGTCTCTAAATACAAAAGACTTACTTTGCTTTGCAATTTCTATAACATGATTGCATATGTCCATTAAGGGAAGGGTATGGATGGCCTCTTCTATTTTTCTTGACTCAGAGATATTATCTTCAATATCTCACTCTGAAGATCACATTATAAAACACTGATAACCTCTAAATAGTCCACATATTTCAGATTTAAACAGATTCTTTCACCATTAAGCCATAAAGTACATTTTTTTCTTCAGCTATTAAAATATTTTTTCTGGAGATATCAGTTTGAAACCTAATAAAAGTCTTTGGACACGAGTGGGACAGATGCTATCCTGCACCCACAGCGCATGCATTCTTGCCTGTTCTTTCTTGCCATTGCCAACAAAGAATGTCTGCTATAAATTACAATGGATTATCATAGCTCTTTGCATCTTGTATTGCAAACCTGTCCTGACAGAATACTAAGAATCTATTTTCAAAAGGGGAAAAAAAACAGATAAAAAGTAACAACATAAAATATTTTCTAAAACATAGTTAAGAGCAGCCCAACAAAGACAAAAATGGAGGGTCTCCTGCACCTTAGCCCTTTGCCCAAACTACGTTTGTTGCATAATGGCTAAGATTCTCAGACATAGTGACATCAAATTTGGTTCAGATGATCATGAGCTCATTTTGTGCTTGTAAGTTTTATTTAATGGCAATGCGACAAAGCTTTCTGATATGAAAATGGAGAAAGGAAGCACGGCTATGTTTTAGAGATTTTCTGATATTTAAGTAAGCTCTGTTTCTAAAATATTTAGGTATTTGTCATATGTGCCTGAGCTTCCTGTATGTGAAACATGGTGAAAACCCTGACTTAGTCCTTGGTTTAGTCTTTGCACTCTGTGCGAGTGACAAAGACCTGTTTCAACTGCCTCACTACACGTTTACCATGCCCCGCCGCCTGGACAAACCCAGAAACTCATGAAGAATGGAGCAAATGCTAACCTGAAGTTCTGCTGACGTCACATAAGACTGTGTGGCCCTCTGAAGGCCACACATATTTGTTGTTATATATCGTAAAAATCAAGAAAGTTAATAAAAATGGATGACTCTTCACAGTTTTCATTTAGAAGGTTTTCAGGGAGGTTTTGAGAAATATTTATGTCTGGATTCCCAAGCCATGGTCTATGTCTACTCTTCTGTACCATTTATTCTCATTTCTAGTCAGAATTGGATGTTTTAAATATGCCTATATTCTTATTCACCTTTAAATGTTTTGCAG
Seq C2 exon
ATTTATTGGCCTGCTGCAAAGGAACGAGTGGAACTATGTAAACTAGCTGGGAAAGATGCCAAT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000007202:ENSRNOT00000009489:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0140314=Sema=PU(7.6=63.0)
A:
NA
C2:
PF0140314=Sema=FE(4.5=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]