RnoINT0147529 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000025394 | Tanc1
Description
tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 [Source:RGD Symbol;Acc:1302949]
Coordinates
chr3:45832486-45843890:+
Coord C1 exon
chr3:45832486-45832590
Coord A exon
chr3:45832591-45843759
Coord C2 exon
chr3:45843760-45843890
Length
11169 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTAAGA
5' ss Score
9.45
3' ss Seq
GTTTTCTTTCTTTGTTCCAGAAG
3' ss Score
10.3
Exon sequences
Seq C1 exon
GTCCCGTCAGGAAGCCCAAGTATGTGGAAAGCCCCAGGGTACCAGGAGATCCAGTTATGATTCCCTTCAGAGAAGGGTCCAAGCCCGCAGAGCCCATCGAGACTG
Seq A exon
GTAAGAGTACCTTTTCCATGATGTCTGTCTCTTTCCCTAAGACTGTGCATAGTAAGTAGCACTCTCCATTTCTGAAGGAAACCTGAGAGTATCTTGAAAGAATGCTTCACTGAACCAAATATATTTGGGAGGATTTTTCCCCCTTTGGGCGGTTGACAGATTCGTTTAGCTAATGTGAATTCTTGAAATTGTATACAAGTGGCAGGAATAGTTGAGTTGGGTGTATTTGCATTGTTTAAGGTTTGGGTCTTTTATCCTCTGAATTGTGACCTTCCTGGGTTTGGGACACAAGCAAAGCCAGCCGGTTGACTTTGTTTTTATTTGTTTTTGTTTTATATAAACACATTACCCTTCCAGAATATTTAAGAGCAGGCTTTGGCTGAGAATCTGAGACTTGCACTAGACAAACTCACTTAAGAGCACATGGTGACTTTGGAAAGCTTTTTAGAAGTTAAACATCTGTGATTTTCTTTAGGGGGGATTGGATTAGGGACAAAGAAAAGAAAATCCGAACTGATTGAAGCCTCTTTCTTTTTGCCATAAAGTCACTTCTAAGTTAAAGTGTAAGAACACCATATGTTTATGCTTGTAGTGTTTAATAGATACATTAATAGTTTGCTTTTGTTGTTCGTGGAGACAGGGCTTCTCTGTACAGCTTTGGCTTTTCTGGAATTCATTCTGTAGACCAGGCTGGCTTTGAACTCCTAGAGATCCGCCTACCTCTGCCTCCCAAGTGCTTGGATCAAAGGTGTGCACCACCACCACCACCTGGCTAGTTTGCTTATTTTTAATCGACCCAAGAATTCACTCATTTGTTCTTGTCTGGGATTTGGTTTGTCCACAGGATGTCCTAAACTCGTAGTGCGTTTCTCTGCACAAATATGAGAGTAAAACTCTTAGCCTGAAGAAGCTCGTTCTGTCTTCTGTGTGAACACAAGCTTCTAATAAGTCCTAACATTAAAGATGCTCACCCATGGAAAGAACACTCAGCCAGATTTCCACTGTGGAATGCCTATGGCTGGTCCTCTTCTACCTCCCTCGTGGTGAAGAGGAGAATCCCTTCCTCTTTTGTTGTAGCCACTGTTTGTATTCTGTGTTTGGGGAGACACAGGAGGGAGTAGGGTATGGCCAGGCAGTAGAGTGCATGATGCTGAGTGTATATACCTGAAAATGAACTGAAAGGCAGAAGCTGGAATGGGTCAAAGGGAGATGGTCCAGAACGCACTAGACAGACACTAAGTGCTGCCGCAGGCTTCTGACACGAGGAGGCTACCCTGTTCTTTGGGTCCGGGTACCATTTGTGGAGTAGAAGGAGCTCACATTGAAGATTCGTGACTAGGGGGACAAAGAAGTGGCTGTGTGTGTTGAAGGTGGAGGGTTCATTGGTAGTGACCACTTAGGTCAGATGGCTATCGGTGAGGGTACGGGGACACCACTGAACTGACCACTCCATGGATAGAAAGGAAGGTTTATTGGGGATCAAACCAGGACTATCTCTGGCGGTTGGGGAGGCACAGAGAGAAGGGTCAGTGGCAGAGAAGCGAACAGATTTCTATGACGGTCAACAGGGTGGTGTCTTTGAGCTGATACTGGCTATTCAATTGAGTGACAACTAGATGCCCTTGCCCCTTTGGGGTAAATTAAGGGAGCTTCCTGTTTCTGTTACCTAATAAAAATCCTTTACCTGGCCAAAGTCCTTCTGTTTAGGACTTGTCACAGCACTGCCATTTGGGGGGGGGGGCGCACTTTGGACCTAACAGAGGCTATAACATATAGAGACACACCCCCCCTTTTTCTTCTATGTGTTGAAGGGAAAACAAAAATATTCTTCAAACATGAGTACTAGTCATCATATTTCCAAGTTCTCTCTCTGCTTAATTCAGACTAATTCTGTCACCCCAAACCAGAATCTCCAACTGACCACAGTCCTGGCTTGGTTAAAGTCCCGGAGTTTTGACTGTTTTAGACATGGATACCATTGGGAAGATTCATGGGGTTCTAGGTTGGATTCTTCTGATGTGAGACGAGGAGACAGACTTAGAATTTTTATTGGACTAAGAAAAGTGGTTACAAATGATTCTCATTGTCAACTTTTCTCCTCTGGCTGGAGGCAGATTTGGACGCCTTTCCTGGCAGTAGGAGGTGTGTGTGCACTTGACTATGAGCCAAGCTAAACTTGAGAGCAGCCATTGGTCTTGCTAGAGTGGCCAAACCTTGCACGTGTGCTCATTCCTAAGATCCCAGCTGTCTGATTCAGCTTCCCCCAGACCCCGTCAGGACCCAAATCACCACACACATATGTCGCAGATGCGAGCCCCGAGACATTTACACTTGGCTGATTTTAAGAAACAGGGTGTTCTCCTTTCTGTGGGCGTGGGATAGGGGTATGGCTCTGTTTCTGGGTGCATAATCATGTGTAGAGATAGCCACCGTGCGGCCCGAGCCCCAGGAGTTACTCTGTTGGCTTATGGCGAGGCAGTCGCCTAGCGAAATTGAACTTGACAAGTAGCAGAGGGCGGTGTGATTTGTAACAGTCGTGGAATCTTTCAGGTTTCAGCGGAGTGAGTTAAGACAGCCATATCAAAGCGTAAATGAACCTAAAGCAGGCGGTTATGCTGAGTGGAACCCACTAAGGTTTGAATCGTAAGCTGAGCACGTACAGTGGCATGATGGGTAAACTCTAATTTCCAGAGTGTAATATCAGCATCGCCACTCAAGTTCCACTGGAAGGTTCGACCTCCTCTCCTCCCATGCTTCCTGTGACCCCCTGGGCTGCTGTTGTAGTGACATGACAGTTCATGGCGCTTGGCTCCTCCTGAGATGCCTTGAAATTTCACATACACTTGTGTCAATTTATTCCATGTGTTTGAGCCACACTCTCCTGGACCGCCTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTAAAGATTTATTTATTTATTATATATGAGTGCACTGTAGCTGTCCTCAGACACACCAGAGGAGGGCATCGGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGTTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTTGTTTTGTTTTAATGGCCACACAACTCGATTAATTCTTGTCCCCCCTGCCCCACTGTTTGGAATTTTTTTTTTCTTTTTTTCCGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCACTGAGCTAAATCCCCAACCCCCACTGTTTGGAATTTAAGTCACAAGACAGTAAGACCCATGTGCATGTATATTTTGTTTATTAAGTTATCCGTCTGGGAAATAGGTTCAACCAGATGACCTGTTTTTGATAAGCAAAGAACTTTTTTTTATTATTAAAGTTTACACAAGCCTGTAAACATCTGTTAGGAAAGATGTACTGTATTTTTTAATATTTTGGAATACGTTTGAAACACACATTTTTTTCTTTTTTACTCTGGCAAAAACAGTGGCTTGATGGATAGAGGAAACGACACTTCTCTCATTCTTCCCCCACTTGCCTCTGTCAAGTGGTCCTCATAACCTATGTACCACATAGAATAGGCGTGTCCCTCCCCCGCCCCCCAAACAATGCCTCTTCCTCTACAGGGGAAGGAAACTCAGAGGAATTACAAGGGATTACTAAACTGTAATAAATAGCTTTATTTCTCCAGACTGGGAACAATCATATTTAGGCGAGTGTTGTTCTACTCAGTCGTTTAGCAAAGGATGCTGTGTGATAGGGAGGGGTGAGAAAGCTCCTGATCTAATGAGTCATTGCTCAGTGACGATCGGTCTCCAGATAGGACGAACCCTTTTCCTCAGCAGCTTGGTTTGCAGAGAAAAGCAACATGGATACATACTAGATGTGTGATCAGTGCGTGACTGTAATCTCAGCACGCTGTAGAGAGGAAGTTTAAGGCTAGCCTGGTTTACATAGTGAGTCGCAAGCTAGCCTAGGCTACATAGCAAGACCTCGTCTTAAAATCCAAGACAAACGAAGAATAAAACACCATGCATGAAGCAGCAGTTAACTAAGCACAAAACTATCCTATGGAGAGCAGAGGTCGTCTTCTGGGATAAATGTGTCTGGTCTTATTTATTGAATCCTTTATTTTTTAAATTATTTTTACATACATTTGAAATGATGTAAGGAAGAAAGGAGACCAAAGAATAATGGCATCTGTCTATTCCCTCCCTCGTTTTAGAAATAAAAATCACCGTATTTCCCCCAATTATATTCTCCTTCCTTTCCCGAGGAGGTAACACCCAGCCTGGTGTATCTTTAATTTTCAGCTTTTTAGATGGCAGTGCACCCGTTCTAATGGTTGGTTGAGATTTTGGTGGACATGTCGAAGTGGACTTGCCTAAGGAAGAGAGACTGGGAGTAGAGGAGCTGTTCATTTTGTTTCCTTCAGTAGATTTTCATTTGTGAAAGCCCTTTGCTAGGTGCTGTTTGAGATGAGTTATCAAGTATGCATGGGGTCCTCTCTCATTGACCGTTGGTGTCTAGAAGGGGATTAAAGGCCTGTGTACAAAGTGACTGTAATTCAGAGTGTGAATAGCAATGATTATAAATTGGTGAATTGGTGGTTGAGGAGGTAGAGATGCTGAGCACAGGAAAGGCTTAATCGATGCACTGTGCCTTAGGGTTTACCTGGTAGTCTCTCTAGGGTACTATGTCAGAAACACTACTCACCTCAGTAGTTTATCCACAACAGAAACCGATTCCCTCCCTCTCACCCCCACGGTATTTGAGGCCCAGAAGGTAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGTTTGCAGGCTCCTTCCTGGCTCTTCGGGTAATCATCTTTGTCCTATGATCTCATGCTGCAGAGAGCGATCGCCAAAGTCTTTCTTTTATACTCGACATGAATCTCATTGAGGGGGGCTGTGCATTTCCAATCCCCAATCACCTCCCAAAGGCCCCTATTCTAGCTCTGTCACACTGAGGGTTGGGTTTTAACTTAGGAATGGGGGGCTTATTTTTCTTAAGTAGATACTTACTCCTCGACAGTTTTACACATGCATATGATAAAGTTTTGCTCACCACCTGCTAAACCTCTAAGAAGTCCCTTCCTGTTTTTGTAAAGTATATGCGTGTGTCGAGTACACGCACCTCTGTGTCCTCTCTAGTTAGCTTTTAGTGTCAGCTCAACACAGCTTGCAGTCACCTGAGAAGGAAGTCTCAGTTGAGCAGCTGCCCAGATCAGATTGGCCACGGGCCTCTCTGTGGAGGCTTGTCTTGATGTTTCATTGATGTAGGATTGCCTTGCCCACTGTGGGTGGCATCCATCCCTACTCAGGCAGTCCTGGGTTCTGGGTAAGAAAGCCAGCTAAGCAAGTGAGTAGTGTTCCGTTGTTTCTGCTTCCAGTTTCTGTTCTGGCTTCCCTCAGTAGTAGGCCATGACCCGAAAGACAGCATAAACCCTTCCCTCCACTGAGTTGCTTTTGGTTGTTATTGTGTCACAGCAATGGCAAGAAAACCAGAACAGTGAGGCTGGGAACTCTCCCTAACAATTAAAACTGTTCCTCAGCAGAACTTCAGCACCTCTTGTCAAAGCCGCCTCTTGAGCATCCTGATACCCTTCAGTGCTGCACACTTGCATTCGCAGGACTGAACATACACTTCAGCACTCCCCCGATAAGACACTGAAAATAATTAGTGTTATTAAATCCTGACCCTCGAGTACCTATCTTTTTAGTATTCTGGGTGGTGAAGTAAGAGACTCACACAAAGCATTTCTCCCGCCCGCGCTGTCTGATAGCCGTCTTCAGGTAAAGCATTTTACCGTCATTTGAATTGCAAGCCAGACTAGCAGCTTTTCGAATGAAACATAACATTTATTTGAAGTAATGATTGGCAAACCGTGATTGTTCACAGTTGAGCATTTATCACACACTCTATTCCAAAGGGATGAAACAAGTAAGAAATAAGCCTGTCACTTCAATTAAAGAAACAAACAAAACAGAAAGACACCTCCCGGATTAGCCATCACACTGAAGCTCGACCTTTTAAATGAAAGTTAATTTTTGGGGGGAACTTGGCGCCTGTCACATTGTGCTTGGTAGCTTCTCGGGATTTTTCAGTTAAGAGCTCATGTAATATTAATGATTACGATGGTTTGATATTGTGTAATAAAATGTGCCAACGTTTTTAAGATTTGCAAAACCAGCGTTTTCCCAGTTGGCCCAATCTATGATGTTACAAAATCTTGCATGGCTAAACGATCCCGTTAAAGCATGAGCAGGCCAGGGGGTAGCTCTCTGGTAGAGCGCCAGCCCATTTAGTATGCATAGTGCCTTGGGTTAATTCTCCAGCACAAAACAGAACAAAACCCATAAAACAGATCATTGGATTTTACAGGACCAGAGCACAGAAAGTTAATTGGTACACATTAAAGTCTGCGCTGGAATTTACCTTTAAGAAATTGCTATTCGTCAGGGCTTGGTGAGGGGTAGGAGAATGGCTGCACTTAGTTTAAAAGGGTCCTCTGTTTCTGAGGTTACAGCTCTTCAAGACTGCATGTACCTCAGCAGGACAGTGAGAGCTTGGTTCTGTGTTCAGTTCCCAGCACTGACAGAGCCAGAAACGTATCTCCGCAGGTTGAGTGTGGGAGGGAGGTCAATGGGAGCAAACTACAGGGGTGAACGAGTTGACGAGCTTAAAGCTACCTTGTAGGTAAGCATTCTTTAACTGGTATGGCCTGAAACAGCGAATTAGCACACAGGTGAGCTGTTGGCAACATACTAGTTTTGGGAAATGAAGAGGGAATTGTGGTGGCTCAGGAGAATTAACGAGAAAGAAATTCAAAGTTTAACCCAGGCCTCGTGGCGCACACCTCTAGTCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAGTTAGAGGCCAGCTAGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAACCAGGGCTACACGGAGAAACCCTGTCTCAAAAACCAAAGCAAGCAAACACACCAAAAAGCAAGAACAAACAAACAGACAAGAAAAAAAAAAAAGAAATTGAAATGCTCGGTGTAAGGCCATGGGTTGACGTGTCTAAGATTAGGAAAAAAAGGCCTCCTGATGTCTGGTCCAGGGCCCATCTCACTTAACAGATACCGTAGGAATTGTGTGTATTTCAGTTGTTCAAGGTCACCTAGCTGGTGAGTGACCAAGAGTTGTCTTGCTTCTCTAAGGAATGAGCACCAAGGAGCTCAGGCGAGCCCCACATCGGAGAGGGCTTAAATAATGGACCTCAAAAGTCTGGGAAACAGGAACCAAGCAAACCCAAACACAGTAGACAGGAAGGAATAATTGAAACCAGTGCGGCAGAGGGGCCCGAAAGACAACACCAGGACTCACTGAGACAAGGAGTTGGTCCTTGAAAAGACAAGCTAGACTGACAGAACCTTAGCTGGGTTAACCCAAAGACAGAGGGAGACGATCCCCATTAGCAATCTTAATCCCAGCAGGCTTCTAACAGTGTCTGCTTCAAGGAGCAGGGGAGATTGTCTGGGAAATGAACCTTTATGTGTGGATCTTAGTGAGAACGTTTGGTGGGCACTAAACAGAGTTTTTCCTGGAATAGTGAGTTTAGAAGAAGCTATCCGGACCATGAAAATGATAGCCAGTCCTATTTGGGTAGGGGGGAGAGAAATATAAGCACATTTGAAAATACATGTGAATGTGTGAAACCAAAAGCTCAGACGCTAGCGGAGAAGTACAGCCCGGCTAGAAATGCTGGCAGGGCGCTAAGCATCCTGTGGTTTGGAAGGTATTTCTCGCATGTTGCTGGTTTTGAGGTTCGCAACCTACAGGAAGTGGGCATGGCCACGTCAGCAATCTGGATATTGAAGTTCTGAGAGACAGTCATGACCAGAAGAGGTCTCTAATAGCCTTGGTACAGAGGAGTTATCTGGCTCCAGGGATGCCAGGAAAGGAAGAAAAGGACAGTGAAGGACACCAAAGATTTGAAGCGATGGCAGCCATAACGGAGAGTCAGTGAACGGGCTGTTCTTTGATGTTTGCTTCAAATGCTAGGGGAGGCAGGAGGGAAGAGACCCATGAACTTCCCTTCTGACTCTCCGCGTGGGCTAACTTTCCACAAGGGTTCCACACTGAGGGTTCCGTGAGTGTGTTAATGATAAGAGCGTCACTGTTCATTTGCTTAGTGGGGGTTATGTGAGGCCAGCTCACGCAATTCTACATCTGTGCATCATAAAGTCCTTGCATATTTAAATCTGAGACACTCAGCTGAAATTAGGTGTTTTCCCGCTCCGGTCTTTACTCCACAGATACTGGGTAAAGTATCCCCATGATGAGTGAAGGAACTAATATTAGCTGTAAGATTGAGAAGAGACTCTTTGTTCCGAGACGTTCCGTAGGATGCAGTTTGGATCACTCTGGAGCACAAAGAAACTTCAAGGACAATCCTAACCTTACAGCTTAGTGGAGCTGCACCGCATGGGCTTCCAGACCTCTGCTCTCCCAGACTGCACTGTTACTCCACTTGGGTAACTCTGCCAGAGTGGAAGTCTGGGTGAAGAAGATGCTGTGAGCTAGGCCAGAGAGATGAACGGCTTAGTGAGCATTAAGGAGCTCTGTCTGAAGTGGACCCTCTAAGGAGATGGTCACTCCGATGAAGTTTAGAAAAAACAGTGTTTCCCTCACCACCCCACCCCCAAATAAATAAAACAGTTGGGAAGCCTCTGGAAGGAAACGGAATTTTGGTGATGTTATGGATACAAAATGAAATAAGGAATGTGTGTCTCTTCATCTTCAACCCTAGTAGGCTTTCAGAACTTTGGTAAGAGCCACGCCGATGTTTATCATGAATTGTAATGTGTCTTTTCAACTCAGCCATTAGGCTTAGAGTTCCACAGTTCTCCAAGTCATTTGAACATGGAGATTCGAATGACTAGTTTTGTTTTAGGGGTGGGTTTGAGACAGGTGTCTTGCTGTGTAGTCCTAACTGTCCTGCATTTCCTATGTAGCCTGGGTGCTGGTCTCAGCCCCACACCAACAGTCCTTTTTCTTCAGCCTAAGTTCTGGAATTATAGGCCTTTACCACCATGCCTGATTGACTGGTTGTTTTAGATTTTTGTGGGTTTCTCCTTTGTTTTTCTGTATGAAAATTTGGGGTGTCTATCTGCAGGTTCAGTGTAGAGGTGGCCGTGACTATGCCATGGAGCAGTAGTGTCCGTCTTCTAAGTACAGATCCCGCACAGGATCTAGAACTTTCAGACGAGTCCCAAGCAAGCCATAGTCTATGTTGTCAGCAGGGTAACTTTTGTAGCAGTCAAGCAAGCAAGCATGTACAGCTGCTTTCGGCCTCTATACCAGCTGCCAACAGGGCGGAGTTTCTGGCTTTTTTCCCAGAGTGTTTCAGGTTGAACCAGAAGCCAAACTTTCTGGGGCTGGGACACAGTCACAGTGTAGAGACTGTTTTGAGGAGAGAGAGAGAGGTGTGGAGTGGAGAAGCCGCTGAGGCCTGCCCCCTCACCCACTTAGTTCCCTTTCCATCTTCATCTGGTCCCCTGTCCCCCAGTCATCTTGCCACCTAAGATAAGGAGCTCTCTGAGCCCTGAAGCAACTGCACAAGGGTGAGGTTTGGAGGATGAAGGTTGTGTGTGGGGGTGAGGGGAGAACCTATAGAACCTGTTTTCTCAATTCAGCCCTTGGGTGTGCCTGGGTTGTGTTGATTTGATTTGGTTTCCCCCCTCCTTTCCCAAGTGCCATCTCCCTTAAGTCTTGGTCTATGAGTTGAAGTTTCTAGTGGGAAGGGACTTTTTCTAGGGTTGTGGTAGGGGTGCGGTTCACCTGGCCTGGGGTGTTTCCCTTCTCCTGTGTTGGAATGGGCCCGTGGATATTATGAGTTTAACCCAAATGATCTAGAGACATCAGGACTCTAGACACAGAGCGGTCTCACTATTGTAGTTCTAGAGTGACTCAAAAATATCTACCTTGCTAACATTCTTCATGCCCCGAACAGGGAGGTTTTCAAGAGCAAGCAAGTGGTGTGTACCTTTTCTTTCATGAAGATGTCACCAGCTTGGTCTCTCTCACAGCTGCCGTTCTGGGTACATGGCATGGCAAAGGGTAACCAGGAATAACCCATATGGTTTTCACACAACTTTTGCCCACCTACACTCTGCAGTTGCTTACAAAAGATGAAGTTAGAGCTGAACATGGTGGCGGCGATGTTAGCCCACAGCGTGGCTGTTATCCGCCCTCATTCTTCTCCATTTACTCTCGTCTGTCGGCTTCCACATGCTGGCAAAAGAGGTTCAGACGTGTGTAGGTTTCTATGTATTGACAAGTCGAAGAGCAAACAAAGCAAGTTGTTCTTGAGTTCTAGCTTTGGTTAGCCTCTGTATATAATCCTATGGATGCCTTAAGCTGTGACAGAGGAGTTAGAATAATGTCGAAAATAATTACGCACCAGCCATAATTGACAAAATCTAAGTGCCCTTAGGTTTTGGTTTCGAGGTTAGTCTCTAGCTCGGTGTGTAAGTAAATTTCAACATGAACATTCTCTCTGGTACAGAAATCCAGATGACCAGCCTTAGCGACACCATGCTTCCTATCCTTATGTGCAGCTTGCTGAGAACCTTTCTCACGGGGCATGAACAGTTTGTGTGCCACGAACAGCAGGGCATTAGGTCCTGAAATGGTGACTTTTTTCACTGTCTCTGATGCAGGTGGATTCTTAGAATCGGCACCTGAGTGGGAACTGGGCTTTGAATCTCACTGCTATGGAAGTTTTCTACCTAAATCCTGATGGAGCACACCATTTGGGTTTTAACATTGGTCTCCTGTGGCATTCGATATTGTGCTCTCTGAGGATAAGGAGAAGCAGAAACCCCCATCTGTGGTTCTGTTTTCACGTGACATAGGCGCCGCATGCTGTCGGAATCTTCTTTTTCAGATCAAATATTTCACCTCTTGCATTTGGAGTTTCTCTGTGACGGGTTTCTCGGCCTGTCGCAGCCTCTTTATTAGAACGTACTGCTGGAGGACAGGCCAGGCTTGGTGTGCGTCTTACGAGGGTGCACGAAAGCTCCAGACAAGCAGCCGGAGGGCTAGCTCATCCAGATGCGAAGCCGGAACCCCCCAGATCTCATGTTTTCTTTCTTTGTTCCAG
Seq C2 exon
AAGCAAAGGTGGATAATGAACCGAGCTGCTCTCCAGCAGCACAGGAACTGTTGACAAGACTGGGATTTTTACTGGGAGAGGGGATCCCAAGTGCCACACACATAACCATCGAAGACAAAAATGAAGCCATG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000025394:ENSRNOT00000038983:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.500
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]