RnoINT0168688 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000011697 | Zfp827
Description
zinc finger protein 827 [Source:NCBI gene;Acc:291940]
Coordinates
chr19:32450974-32470177:-
Coord C1 exon
chr19:32470120-32470177
Coord A exon
chr19:32451078-32470119
Coord C2 exon
chr19:32450974-32451077
Length
19042 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGC
5' ss Score
9.88
3' ss Seq
CCCTTCCTCCCTTACCCCAGCCC
3' ss Score
7.72
Exon sequences
Seq C1 exon
AAAAAGTGAGCAAAGAACACAATCACACGAAAGAAAACACCATGCGGACGACCACCAG
Seq A exon
GTAGGCCACTGCTGTGCGGTGTCACCTCGTGCCCTGCGGGGTCGTCAGACCTGCTTCTCTCATGCACTGGGCCTGTTCGCTATACCCTGTGGATTCAGAGGACTTATGGCTTTCCAGCATTTTCTCCCACAATTCTCATTTGGTGAAAACAAGTCAGACTAGTGGGATAAGCAGAGAGACAAACTTTAATATTTCCTAGACGTTGACAAGAAGGGATCAGCTTGCCCAGGTGGCATTGTTTTTCACTTCTTACAGTAATTTTGTGAAGTAGATGTTCGTATCACCTTTGTAAGAGTTTGTTTTTATCTACTCCCTTACCTTTCGGGACTTGGCTCTGAAGCCAAGACCTCTTTCATGGTGAGCCGTGTGCTCTGCCAGCTCTGAGAAGCATCTGACCCTGAGAGATTGAGTGGGAGGCACCGTGTGGAGGCTGAGCCTGGGCTCAGGATCCAAGGCTCTTACGGTCCCTGCTGCCCTAGCTCACTACTGCTACCACTAAAGCTACCTGAAGCATTTTCCAAAGGAAAGGATTTTTAAACAGAAGGAAGATAGTGCTTTTTAAAAGCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCGCGCGCGCGCTAGCTCAGCAGGTAAAGGCACCGACGGCTGCCAAGCCTGGCACCGAGCTCCATCCCGAGAACCCATATGACAGAGGAGAGCTGACTCTTCCAAGTTGTTCTCTGACCTCCACATGATGCTCTGACATGTCCCACCCCATAAACAATGAAATAAATACTTTTTTTTTTTAAGTTGCAAGAGCTGGGCACCCTGCTGTATTCTGTAGTCCTAACTCCCAGGAGCTAAGGCAGAAGAATTGCTTGTGCCTAAGAGGTTAGACAGCATAGTGAGACCAAGTCTTTAAAAAGAAAAGCAGGAAAATGGATCTGAGTTATATTGTAGGCAAGAACATTTTCCTCTGGGCAAGGAACACCCGACAAATCTGCAGAAAGAGAGCTTAGGGAAGACGTACTTTCCCCTGTGTGGGACCACTCTGCGCAAGTTAGCGCAAGACAGGAGCTGTGTGAAGGAGCCAGAGGGGCGTGAGTAGAGACAGACACAGGATCAGGATCAGGAGACTGGTGCAGACAGAAACCTTTCCTAGGCAGACAACGTTGGTTTCATCTGACTCTTAGGTTGACTCACTTTATAGTCTTGATTCTTTGTATGTATGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCTGTGCGACAACCTTGCAGTCATTCTTCAAGCACGGATCCACCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTCTCATTGGCTTAGGGCTCAACAAGTAGGCTTGGCTGGTTAGCAAGTGAGCCCCAGGGATTTCTCTGGACCCCCCTCCTCCACCCCCCAAGGTTCTGGAAGATTGAACTCAGGTCCTTAATGCAAGCATTTTGCAAGCTGAGCTATCTCTAAAGCCATGTGCTTGCAATTCTTGAAACAACTGATAAAAGAATGATTTACTTTTAGGTGTGCTATGAATTGACCACACTGTACCATCAGGTATAGACTGAATGCTGTTGCGGTAAAAAAGGATCGTTTGTTACCAGTTCCCTGAAGCCAGATCCTCTCACTCTGGCTGCTACTCTGCCACATGGTCTGCAAGCCACCCTCTCCTGGTTGTCTCCCTTTTAGCTACTGTCTCTGCGAGGTCCCCTAAGTGGTAGTTACCATGCCTGGCGCGCGCGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTCTCATTCCCTGTGTGCTCTCACTCCCCACGGGCAGCATAACCAGATCCACGTGCTCCAACTGCCTCTCAACCATTTCTTTCGCACACTGTCCTCTTTAGCCCAGTAAAATCAAAGTTCCAGAAACTTGTAATTTAGCAATTAGATTTATATGTTAAATTCTCAATCCACAATTCAGCTACACAGTAAATTCACTGCCAATTGATAACGATATAAGCCACCCACCTGGACAGGATAAAATCGATCAAGTTCACCTAAATCTGATCCATCCTCCTCTGTAGACTCCGTCTGGATCTCCTTGCTCCTCCTGCTCTCTCCTTCCTAGACTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCTTACCCTTCCTTCTCATCCAGTGATAGACTTCGCCTTATCCTGGACCCGCCTCACTATATAATGACATCATCCTACACATCACCCTTTTTGTTTAATTTAAAAAAACTTTTCATCAAATATAAGCTGTGCACAACTATTACCATTAGAAAATCATCTAGACAGCTACGTTTTCTCAAAGTTAATTAGCTTGAGTAGGCTATGAGGCTAATTAGTCCTCAACTCCATCAGAAATCTGAGAATGACTAGATATCTTTAAACATAGGAAGCCTAACGGCTTTCAGAACTGATACAGGTTGTAGAGACAAACCTCCACTAGCGCAGTCCCCTGTTAGTAACACGTGAGAGCAAGTCTTCTAGCCCAGGTCAACTGACAGACCTCTGAGAAGGAAGGGCTGGTAATTCTGGCTCAGCAAAGATGGTCAGTCGGCCGTTCTGCATAAGGTGTCCCTTTTGGTCAGCGTTAGTCTGTCAGTGAAACAGGCAGGGCTTGCGGAGTGGCCACAGTACATCACCTCACCTGGAGGTGGAGATGTTCAGTTTCTTTCTTTGAATCCACTAAAGAGGAGTTGTTAGGAGCAGACATGTCTCAACAACAGATAAAAAACATTAAATGTCAGATTTTTGTGGATTTCTGACGTTTTTGAAAACCATCTACCTATGAGGTAATCTGCACTGTTGTTGGTTAACTAGTCTCAGCTATTTCTATCGAGAATATTTTGAAAACACCCTAATGGTGAACTAAGATCCATAAATTTGTTATTTGGCCCCCAATTCCTATGTTTAATCAACTCTGAAGTTTGTAATGGCATCAATAGAAGGACAGGCTCCAAACCTTGTACTTTTAAAATTTTTTGTAACAAATAAGTTCTATACCAATGTAAAGATACAACTTTAGCTCAGTTACCAAATGAGATTATGGCTATGCAAATCAATTCTAGCTAATTCCTCCCTGTTAAATTATGACCATTTCTAAATTCCCCATAAAAACAACCTTAGGATAACCACCTTTAGCCCCCCAAAGTCCAGGGAATTGGGGCTATGGCTCTTCAATGGCTCTTCAAACTGTACATGGGCATTGAGATATCTGGGGGGCGGGGAGATGAGGAAGCTGGCCACACCAGCAGTTGTTGAGGTCTCTGTTGTGTGTCCTGACTGGACCTGGCTGAAAGTTCTCGAGAGCAGGAATCCAAGCAGATACATTCTGCAATATATAATTCTCAAAACAAGAGCTTAGAACCAAGATATATTTTTGTTTGATTTTCTTGAGTTTAGTTTCTCAGGAGTTCTACCTTTATCAAATCTAATCAGTGTAACTCTGGAAGGTATTCAAAGCCTAATCACCCTTTTTAAAAACACAAAGAAAAACCTTTCTCCCAAAATACCATGTTCTTTAGTTTGTAACCAGAAAAGCTTGTATCTTGCACTCTCTCCCAGAGAAATAATATAACAAGACATAAAATCACACCCATTATGAAAATTAAAACAATTTTAGAAAAAAAGAAGTAAGGTAAACAATAGTGTATGAGCTTTTTAAGGCTTTTCTAGTCTGTCACACCAGGAAATTAACCCAAAGTTCCCGTGGCCCCCACATGGAGAGAATATGAGCCTCCTGCCATGGTAAATGTCAAAATTAACCACAAACCCTTGCTAGCTGGCACCGTTGAGCCATATGGCGTTAGCGGGTTAATTCATAAAACAATTTGATCACCCTTTATTAATACCAATACCAATACTTAGACAACTTGTCCAACTAAGATTTTAGCCCAAAATCCATCTATCTGTTAAGCTCTCTACCCGGAGCGTCAGACTTTATTAATAACTCTATAAGATATGTCTGTATTCACTCTGCCTGGTGTTACAGACTTTTATTTATTTCTACCAAGTTCAGAATCCCCAGGATTTGGACGGACAAACTCTGTACTACTTTTCACAGCAGGGACCTAGAGTCTGTGAGCCGGCTCCCCTCTGTTCCTTTGTTTAAGGTTCCCACACTTGAGCCCTCACGTGACTCAACATATCGAGCCCCTTTCACTTAGAAAACAAAGCTTTCTCAGGCTGAAAAGCTTTAATTTTTAGTGGATTCTTGCCTAACACGTTGTTTCACCACTTGTGGAATCCTTAGTCTGTAACCAGAAAGGCTTGTATACTATCTGATAACTATCGAATTAAATATGTATTCTCAAAGTTAAGCAGCCTGTGTAGGCTATGAGAGATAATTAAATGTTCTGTTTAACTGATAAAATGTTGGACTGGGTGTTAAGAATATTTTATAGTTTTAAATTACAAAATGATAATTGTTGTGTTCAGCTTGTATTTGAGAGAAAAAAATTTTTAATTAGACAGAAAGGGTGAAGTATAGGTAGATATCAATATGCAGGTGACGGCTGGCACCAGTTTGGTCAAGGCCATGATTGGACAGTGAAAAATAAGGCAGGGACAAAGCTTTTGTAAGGCAGTAGAAAAGGAGAAGGAAAGAGAATCAAGATGGAGACGGAGAAGGACGACCCAGATCCGGGTGGTCCTGAATTGCCCAGGTAGCTGGGATGGATTTCTGTAGGCAAATTTATCTTATCTAGGTGGGCGGTTTATATCCTTGTCAATTGGTTATGAGTTTATTGTGTGGATGTATTGTGGATTGAGACTTTAACATATAAATCTGATTGTTGGGTTACAGTTTGTTGAGTCTTGATTTTACCGGGTAGCTGGGACCAGAGTTCCCGGCTGGCCAGGGCCACTAGCAATGGGAGCGGGGCTACAAGGCAGCTAGGCTAATGTGGCTGAGCATGTACAACCATCACATAAGAGAAACGAGCACTAAACCCGTCTGCTTCTCCCTGGGCTACACAGTTATAGGGAAAGCACCTTTGTGGTAGGACAGAAGACAGGCAGGCGATCTCTGAACACACAGACGGACAACTAGTCTCATGATGATGGCCCCTAGGTGGCCTGGGGGAATGAGTCTGGGTGGAAAGCCTATTTTGTCTGTGACCTTAGATGCCCAAGCCAGAGATCTGAACTTACACAAATGCTAGCTTGCCACCTCCATGCTTGTCACCCTAAATCTGTGGTCCACAAGCTGTGTCCCAGAGTCATTACCTCTGATGGAATGGGTTTGATCCATAGTCATGGGGCACAACAAACTAATGATAACACACTCATTTTACCTTGATTCCGTGGGGTTCTAGAAATCGATAGCTTAGGCTGCCTATGGTGGAGTGTGAGGTGGGGTTCTCTCAAGACACTTTCATAAGGAACGGCTTCTGCTTCTTTCCTATGGGAAGGGAGAAGTATACGGAGGTTGCAGTTTTAGCTAGTCTTGTTCTGCTTAATCCCCCAGGGAGTCCCGGAGTATGGTGTGCTCTATAGAGTCTAGGCTGCCTCCAGGTATGGGGCTAGCTCATTGAACCCCAAAAGCTATGTTTCCTACCGGAGGCTCCCATTGGGAAGGGTTTTCACTAATTATGAAGAGACCCAGAACAGCATTCCCATGGAAGTTTCTAGATCTCTAAGAGTAGACGATAAATGCTTACATTGGAGAAAGGTGTGTGAGCCCATGCAGAGTAGACGATAAATGCTTACATTGGAGAAAGGTGTGTGAGCCCATGTTCCGTTATGCTTTTCACATGGGAAGAGGGAAGAGGACTGAAATATGCTTCTAATCTGAATTGTGTTGGCTGGAACTGAAGCATGATTATAGGCTAGGAAGATTTTTATTTTTAAGCATTCAGCAAAAAATGAATCAATCGTGAATTCTTCCCTTGCTGGGAGATTATTATAAGGAAGAAAAATCCTATTCAGACCTGCCTGAAGCAGTGGACAAGTCACTTCCTGGGGGCCCAGACCAGACGCAGTGTTCAGAAACCAGGATTAGACCCCAAGGTTTATAATTCCACAAAATCCTGGGAGTGTAGACACCTTGGCCAAATCCACAAATTGATTTCTTTTTACCCATCACCTCACGGCTTGAAGTAGAGTCATGCTGGTCCAAGGCATTGTCTCCACCAAGGACAGTAGAAGATGCCAGCTCTCTGGACCCTCCCTTCTAACTATTTATTGCTTTAAAAGGACCTTCTTTTGTACATCCAAGGTCAGGATGTGGGTTCTCTTTCAGGTGATTGCAGTATCCTTCAGATAGATTTACGGTAGCTAGTCGTCTTCAGGACTCTGTTGTGTTTGTAAGAACTCAGTTGGATATTTGTTTAGTTAGGGCCTTCACCAGGTAGCTTAGTTTGGCTGGGAACTTTCAGTCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGATTACAGGGGTACAGCACTCCACTTGACTCAGTTACCCCGTTTCTAGTGTTTAGTTCCTGGAAGAGGCTGTTTGGAACGGTGGCCACTGGAGTTTCCACCTCTAAGAGTTATTAGGTAGTTTAATTATGAAGGAAGCCCTGGGGGCTCACCTGCCCACATGGTAGGAGATACAGCCTTTTCCCTGCCTCTTTCTTGCTGATGGATGGCCAAGCTCCTCTACTTGGAGTGTCTGCTGCTCCTGAGATTGGGTTGCTCACTGCCTTCCTGTCCTACATAAGGCCATAGCTCCCCATGGCTGTTTATCACTAGTGGTCTCTATGCTTGTTCTTTCCACCGGGCTTGTGGGAAAACTGTGGCTTGCCATTCTCACCAGCTCTGCCTGACACCTGGTGCTCAAGAGGCCCTGGGGCTGTGAGCCCTGCACTCTCTCCCTGTCAGGTTTTCCATCCCTCCAGCTGCAGAACTGCCCCTCATCCACACCACTGGTACAAAAGGTCAGATGTGGAGAGCAGAAAACAAGAGACAGGGTTTCTTGATGGCTGTTTAGATGAAACTAAAGGCTGAGGCTAATCCCTAGCAAGTTCCTGGTCCTGAGTTCTCCTCTGTGATGGAGGATTTCAGGGACAGGCAGGAGCAGAGAAGTGCCCCTCAGCATCTAAATGACTATGAGTTTGCAGCCTGGGTCATGTCTCTGTCCTCCCTTTGCTAAACCTCTCTGCAGACGTTACCTTGAGACAAATTCTAGGGATCAGAGTGTGTGTGTATTGTACACATGTGTGCATATGTGTGTACATGTGTGTTGGCTTGATCACGTGTGCATGTACGGCATCATGTTTCTACATCTATTATTCTCCACCCTAAGCTTTTGAGACAGTGTCTCTGACTGAATCTGGAGCTCGCCAGTCAATCTAGCTTAGCTGCCTGCACTGTGCCCAGGTGCTATCACATCCCGCTCTTGTTTGCCTGTTTGCTTGTTTGTGGACAGGGTCTTACTGTATAGCTTTTACTGACCTGGAACTCACAATGTAGTCCAGGCCTGGAACTCAGAGAGATCTACCTGCCTCTGCCTCCTCAGTGCTGTGATTAAAGGCTGTGCCTCTAGCTTGGCTTACTGGGCCCAGCTTTTACTTGGGAACTGGAAACAGGAACCTGAGTTTGTGCAAGCACTCGACCCACTGAGCCATCTCCCGACACCGTCAGACATCTTTTTAAGAACTGATTTGTTTGCTTTTGTTTTTATTTTGTTGTGGTGCTGCTATTGGAACCTGTTGCCCCAGGTGAGCTAAACTAGCCCTCTACAAGTTAGCCACATCCCCAGCGAGAACTGGTTTGAGAACTCCTACCCCTACCACCCGCCACACTTTTTTCAGAAAATTTCAAATCCTAAGAACTTAGAATCCACTGTATAAATTAGAATCATCTTTCCAAAAGTAAAGGCAAAAAATAACCCACAAAATTGTACCAGATAGCCAGGCAGAAAAATCAATTTACTTAGCAGCTGGAAAGAGTGGATCATGTGGTTCTGCCTTGCCCTTGCCCTTCTGCCCTTGTCTGGGTTCTTAGAAGGGCACGTGCACTGAATGCAGCCTGCAAATTCTGAAACCACCATCCTGTCAACTGTAAGGGTCTAGAAACCTCATGTGTAAAGAAGCCTGAGGTCTCCTTTGAGAAAGTGTCCTGGGTGTGCCCAGTGCTGTCTTCCTGATGCACACTGAGTGAGGTGAGAGTCCTTACCAGACTCAGGAGAACAGCAGACAGACCATGGATGGTTCAGTGAACCCTAATACCTTTAGTTCCTTTCCCAGCACAGGCCTGCTTTCTAAAGGGTGAAGATAACGTGCTATTATGGTCACTTACTAGGTGAAAACCCACCAGGCACCATACCATAACCAAATCCCAAAGTTTAGTAATAAAAAGAAGAACAGAATTTTCTGCCACAGCCCATCACCCAGCCAGATGCTGCGTAAGGTGGAAGTAGGGAAATGGAGCCCTAGAGTAAGCATCGAGAGCTCCCGGCACGTGAATTGGACAAGTTCAATGTTGTGTGACATCATGAACTTCAAACAGTGCCTGTGAAGGACCCTGTCTTATTGTTTATACCTTCTTCTCCCATTAATAATCCAGTGTCTGTAGAGGCAGGGTCAGATTGCAGGCCTGGAAGTCAGGACTGCACACACCTGTCTCATTTCGTTCAAAAACAGCTACAGGTGTGTCCATTCCTGGACAGAAAGTGGAAATCAGAGACAGACAGACAGACAGACTCGTACTGTGCCGTGCAGACCAACATTTAATTTGCCCAATTTTCCAAATCAGATTTCCAAATGAAGGCTATTTTCCTGTGATTTAGATAATGGCAGAAAACCTTGTTTACTAAAAAGACACATTCACTTGATAGTGTCCAATATAGCATTTTCCTGTGTGGCGGCTTCAATGTGTGCCCTTAAATATTTATGACTCAGTAATAGAAATTGCGCAGATTGGTAAAAAAGTGGCATGTGCTGCCTCCGCTCGTGCAATTTCCCCTCTCATTTCTTTGGAGAACCTAAGAGAATGATGGTGTTATAACTTTAGAAGTGAAAAATTACTTGGGGACACTGAGTGAGACAGAAGCAATTAAGAAAGAAACAGGAAACAGCAAATGAAACTGGTGAGTTTTGAGTCTCTGTTTATATCTTATGTACTGTTCATAGTTTGTGACATTCAAATTACACACACAGAGAACACCAGAGCATTTAATAGTGCATCAATATTAACTTCATGGAGTCCCAATTAATTAAGACACTAATTTATCTTTATTTTTTAGTGATGTCAATGTTTTTGAGGGGCCACACGGTTATCTCCATGAATTTTGAAGCTATTCTTCCTGTATACTGTCACCTTCTAGCATACTGTCCGAAGAAATATCTAGATTCTCGTTGTCCGTGATGCTGATTTTCCACCCCCTAACATGGTGCTTCTGTGCTGTGCACAGCCTGCGAGGTGGCCTCAACAGCCTTGGACACACACTAACTTGAGAGGCTTTCCGTTGCAGTGCCACCTGCGGCAGCCATGAGGTTATCTTTAAATCTTCATCTGTCAAAAGAAATTGAAATTGATTCTTGAAAATAGGTTATTATCGATACATGAACCTCTTGAAATACTTTGTGCAGAGTATGTGTGGGGGTGGGGGGTGGGGGGATTGTGTGTCTCTGAAGGGTTGACTCGAGAGTTCCTTTCAGGATCTGAAGAGGTCGCTGGTCTCCTTTCTTCCTTTCCCATGCACCAATGTGTTCTTCCTCCTGGCTGGCTGAAGACTCAGGGAGGAGTTAGTCAGAGTCTGTGACAACAGCTCGGAACCAAAGGGCAGGTGCAGTCTGGGTGCTGGCCACAGCCCTGCTCTTGTCTGGATTTTCTCTGGAGTGTCTCCAGAGCTGTTACTAGACGTCCAACAAATAAGCAGAAGGTGACCTTTCACAGTGGGACCGCTCTCCAGTGACAGCAGACCACAGGCATATCCGTGCTGCATGGATGTGGTCCATGGCATGGCCATGACCCTGCACCATTGCAGGGAGGACAGAGCCCCCTGGGTGGCTTTCCACAGAAAGCCCCTTGTCCTAGTTTCTGTGTGAAGTCACATTCTCCTGGGAGACCTGGCCGTCTAGGAGCTGACATTTCATGCATCCGGGTGTGCTGGGTTCCCTTCCTTGGTCTGTGGTGGCTTGGTTTGCCCTGATCTGGCCTCTTCACTTCAGCAGCCCTGACAAGGCCTGCATTGTGCTCCCTGCCTGCCCCGTGAAGTTTCTTGGCTCTTTGTGGATGAAGCTCAGCTCAGCTGCCAGAACTAGACCCTGAACTGGGAGTTAGCGTCTGTGTACTGGCCCGCCCTTAGATGCCACTGTACATTTCAAAGAAAGTAGAACCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCCTGAAATGCCAGGTTTTTCTACCGCCATATTCTGTTTGTTTTGCTGCAGCCTCCCCTCCTTGCATAGCCCTAGACTTAGGAAACCTGTGCTGAAGGTTACACTGTTGCCAGGTTGTTCCTGTTTGACTGTTTCAGTGGTTTGTCCCAACTGTCCCTCCATACTCGTGTTTTGAAAGGCCAAGTCTTTTTAAAAGTCAACAGTCTAAACAGTCAAACTGCAGAGTGTTAGTGGACAGTCTTGAAGTACCCGACTTCAGGAGTGTATAGAAATACACACTTAAATAATCATGGTCACTGATAAGCCCTCTACTCAGAGAGCCCACTTCTAAGTTGACAACGGGTGTATTTGCAGAATTTATTTTTATGTAGCACATTTTCTTAGGAAGACAGGATCCCACCATACATACAGCTTCATAATCTCAGTTAACCTAGACTGTTATACAGTGTGCTTGAGTTAGTTGGTGTGATTCAGTTTTTCTTTTGTGATTTGTGTAGTATCATTCACCCTTCAATAACCAGCCCCTGTTATTGGCTATCCAGAAGCCCACCCTCCTCCACATTGTTACCAATGTAACTAGTGTTACAAATGGTCTTGGGAGAGGAGAATGGGCTGAGGAGGAGAGCCTCTGTGCGAGCCATACCTCTCATGCCACCTTGGTGACTCCTAAGAGCAGTACCCCTCTGCAGCTCCAGTGTTGGGGACCCAAGTGGACTCCTGGGGCGTGCTGGTCAGCTGCAACTCTGAAGTGTAGGTTCAGAGGGCTAGCCTGCCTCAAAGGGCTAGCTGCCTCAAAAAATAATAAATATGGTCGAGAGCCCTGGAGGAAAACACCGAAAGTCACCTCCTGGCCTGCACACGTGTCACAGACAGGAAAAGAAAGCATTAACATTTTTCAGGCCTTTGTTATCAGTGGCCAAACTGACTTGCTAAAATTGTCTCCTGTCCTACCAGGCTGAGGGACAGGGTGGAGAGGTGGAGGCAGGCCAGGTCTGTGAGAGAGACTCGGGAAGTCAGTGCTTTCTACTTAACTTTTAGATTAATTAATTTGTTAGTGAGCGTGTATCACAGTGGATGCATGTGGAGGTCAGAGGGCAACTTTCAGGACTCATTTCTCACCTTATGCCATGTGGACTCCAAGGATTGAACTCAGAGCCTTAGGCATGGTGCCGACTGCCCCTCCCAGGTGAGCCATCTTCCTTGTTCCACTCCCTGCTTGTCAGAATGTATATCCCTTAAAAAAAATAAGGATGCTCCCACCACGCCATTTCACACCTTATAAAGTGAGCAAGCATTAGTTCTTCGTCGTTTAGAAGTTTCTGTTATGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGGTTAAGAGCACCCAACTGCTCTTCCAATGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTATAAAGAGATCCGATGCCCTCTTCTGGTGTATCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATAATAAATAAATAAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAGTTTAAAAAAAAAAGAAATGATTACTTAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGTTTCTGTTATTAGATGATCCGTCCCAGCCATAGCTTCTTCTTCACCTCCAAAAGCAGAAGCAGGACCTGGGGTGTATGTACTGTGAGTGAGATGACGGTGTGGCCATGGCTCCTGTCAGCCATGGGCCTGGAGCCCCCCTCTGCAGTGCCAGCCTCCGGTTTAAGGCAAATGTCCTCCCGACCTTTGCCCATGTAGAGATTGGCTCACGTCTTGCTCTCTTCAGTCTCTGTTTTTGACAGTGTATCCAACACGGTAGATGACAGGTTCTAGACCCTATCCTGAGGTCACAACGTGTCTCTGTTATACTTAAATTTTAGGTTTGAGTAAAAAAAAAAAATCAGTCTCATAGTGTCAGGGTGGAAAGAGCATTAAATCTTGGATGTTTTTCTCCTGGCTGCCCTGCAGGGCTCTTTTATAAGTGACTACATAGGTGAGCTCTCCCAGGAGGAGTGGTCCCCCTGTTTGAGGTCCTAAGAAGATATCGGGAGTCCCTCACTCCCACTAAACCCATGTTCTCTTTCATTTAAGGATTTTTTTTCCTCTTCCATCACTCATGAATATGTTACAAAACAAACATGCACATGATATGTCTATGTATATGCATATATTTATATACTAATCATCTCTTATTCTAAATTGTTAACAAATGCATTCATTAAAGAGTGTGGTAGTTAAGGAGAAGAACATATGCATTCCCTAAGATAAGACTGCAGTAACCATGAAAGTCAGTCGAGATCTCACTGTGCACATCTCCATGGGTGGAGGGCCTGCCGAGTATGCGTGATGCTCCGGGTTCCAGCCCCAGTATCACGACGGCTGGGTGTGATGGTGCTTGCCTGCAGTCCTGGTACTCCTGAACTGGAGGCAGGAGGACCAGAAGGTCACGGTCATCCTCAGTTACACAGAAGATACACAGAGATACCAGGCTATATGAGACCCTGTCTTGAGAAATAGTGTTAAGTTGAAAATGAAATACAAATTAGATAGTCCTAACTTTGAAACCTGGAATGTTTCAAAACTCAAAAGTTTTGTGTACCAACACAGCACCACAAATGGAAAATTCCATGTCTGTCTCCAGGTGAGAAAGGTCATCATCAAAACACAAGTGCACTAAAATTATTGTAGATGACTACCTTCCCATGTAGGATATACAGGACACAGGTGGATTTCCTGTCTAGATTTGGGTTCTGTCCCCAGGGTACCTCCCTCTCTCTGTGTGTACAAAGAAACTCTGAAGTGCACCCCTATTGCAGGCATTCCAGAATACACAGCCTGCAGGGTTACTTGATCCTTTTTAGTGGAAAAGCAAACAGGTGTGTCAGTGGTTTTGTTACCGTCAGTCAAGGGCATGCTTATGCATTGTTCTAGTATCACAGAATGGATGTCTCTCTTGCCCTTAAGCTCCTTGAGGGGCATTAACAGGAGTCTGATACTTTCCCTGGGCCTTATCTTCAAATAATCTCATCTTTCAGATATATTTAGGAAGCTTTTGGAAGAAAAGCTATTTTGTTCCTGCAGAGCCTAAAAAAAAACACAAAACTGGTATTCTAGCAAGCTGTGGTCTTCATTTGGACCTTCCTAAACAGTTCTTGTTTCTTCTGGTTTCCTTATGTAGACATGGCAATTCCATGAGCTACCCATGTTCACTTGCCTTTTGTCATGGCCACATTTCATGTGGTCAGAAAGTCTTTGAACTAGGATAACAACATCTTTGGGATAACCGTGGTCTTTCATCTGTCTTGTGTGCCTTTTGGGAACACTGAAGATTGTTTCTCAAGAATGTCAATCCAGTGTATGTGTAACTTGGAGGGTGTGCACTAACGGATTTGAAGAGCAGAGACTTTACAGTAGCAAACTCATGCTTTGAAGTGAATGTTTAATGTTTCAGATCTTCAAAAAATAATGTTGATCTGAAAATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCATGTGTGAGGGAGGCTCTGGGATAGATCCCCAGCACAGTAAAGAAGGGGAGCAGGGCATGAGTAAGCATGGCATATCAATAAATAAGGTAATCAATAGATGGGTGGATGGGTGGGTGAATGGATGGATGGGCCGGGTGGATGGATGGATGGGTGGAATGCGATATGGATGGATGGATGGGTGGATGAGATGGGTGAGGGTCGGATGGATGGGTGGGTCATGGATGGATGGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGGTAGGTGGGGTGGTACAATGGATGGGCAGGTGGATGAGGATGAATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGATGGGTGGGTTGGATGGATGGGTGGATGGATGGATGGGTGGATGAGATGGGTGAGGGTGGATGATGGATGGGTGGGTGTGGATGGATGATGGCCATTGGGGTGGGATGGATNNCCNGTGGATGGATGGATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGCAAGTAGATGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGGTGGGTGGGTGGATGGGTGGATGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGGTGGGTGGATGGGTGGATGGATGGGTGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGGCGGGTGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGATGGATGGGCGGGTGGATGGGTGGATGGATGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGGTGGATGGGTGGATGGATGGGTGGATGGGCAAGTAGATGGATGGGTGGGTGGATGGGCAAGTAGATGGGTGGGTGGGCAGGCAGATGGATGGGTGGGTGAGTGTATGGATGGATGAGAGGTTGAGTGGATGGATGGAGTTAGTGAGCACAGCATATCTGGGGCACTTTCCTAGCATGTGCACGGAAGGCCTTGGGATGGATCTCCAGCTCTGGTAAGGAAGGGAAATAGAGTGAGCACGGTGTATTAATACCTAAGGCAATGGGTGGATGGACAGATAGACAATAGAGAGAATGTCTTTTCAATGCGAGGGGTGGATAGACAGAAGATGGCTGGATGCTGGCTACATAAATGGACAGATAGAAGAGAATGTGGGATCTCATGGGTCAGAGTGGTTGGGAGGAAGGCAGTGTTGCCAGATGGAAGGAAGCCGTGGGATGAGATGGCGTGAGCTGGAGAAACAGTCACTGGCTTGCGAAGAGCTTTGCACCCAGGCTGGGCCTGCCATCTCTAGTCTGCAGCATTCAGCATAGAGAGAGCCGTAACGGGGAAGAACTCATTATGAGAGACCCTTCTCTCTGCCCAGTCTTTCTGTTCCCTGTCGTTCCTCATTCAGAGCTGAGATTGTGTCCATCTTTTTGGAGGAGCAACTGTGGTCTCTCTTTGTTATGCTCTTTTTAAAAGTTTACTTTTATTTATTCACGTGTCTATTCGTATGCACAGGTGTGTGTGGCATGTATGTGTGTTTATGTATGTGGGTATGTGTGCACTTGTGGGTATATATGCACGTGCTTGAATGTGTGTGGAGCTACATTGGTGAGGGGCAGCAGCCTGCGAGCTTTAGTGCCCCACCTGTCTCTGCCTCCCCAGTGCTGAGATCACAGATGGTTGCTGCCACACTGACTGCATGCAGCTGGATCTGACCTGCGGTCTCCAGCAGGCAGGCAGGCATTTGACGGCTGATCTCATGCCCAGCCCACGAGGCCTCTCCTAGTCTGCTCACCTCCATTCCCTTTCCTCCTTGTTTTGCTCTGTCGTTGCACTCAGAGTGGGAAGTCCTGTGCAGCTGGGCTCGGGGGTGAGGCCATGAGCCCACGAGCTTTCTGTTCTGCACGAAGACAAGCCCCTTGCTGGCCCTCAGCAAGGTGGAGATATTTGTGCCACAGCCCAGCACTTAGCGAAATGTATCACTGTTTAGAGCCATAATCTTTTATAGACTGCTTTATTATTTATTGTAAATCTTCCTTTTTGCAGGCCTGTGCTGTTGACCCCGTAGCCCGTGCTATCTGAGGTCTGGCATTGGCCCCTCTGGATGACAGAACTGCCACTTCTTATCTGAGCTCTTAGATTTGCTTCAGGGGAAAATACACATCAGCAACTATTCCACTTTTATCCAGAAGGGAAATTCAAAGAGATAAAAGTTTGGAAGATGTCTTTCCTAACTAACAGAACAGACAAGTAACAGGTGACTTGGTCCTGTTGGAAAGTCACACACTCCTGATGTCGGTGCTGAGTGTTTCTGAACCGTTTGATGAATTAACCAGGTAGCCTGCCAGCATTCAGGGTCAAAGCGAACACACTGATGGCTAGTGACACTGTTAAAGGAAAACTCCTGGTGACACGGCATCCACTGGGTACTAGTTACACCCACCTACCTCCCTTCCTGTCAGCACAGCCAATGCTGCCATCTTTTCTTTTTGCTTTTTCTCTTGCCCCCTTAGGTTTTTTCATTTTTTTTACCTGTTTGTTTGTTTTTACCTTCTTAAACTTTTTTTTTTTTCGGGGCTGGGGGAGGGTGCAGACTCCTATGTTGCCCAGGCTGGCATGCTCCATACAACTGCAAAACCTAGAAGGCTCTTTCCAGAGTGGAACAGCTGTGCCCACTTCTAGGAACCTTGGGGTTGTTGTAACAGTGCTGTGGTCTTCACCTGCTTTCCTTTATAAAGCCCTTCGTCCATCTGCACGGCCCTCTGCAGGCTTGCAACACTGCCCACCTACATCACCTTTTCCTCTCAGACCCTCCAGGCTGTCTGCTAGGCGGTGATTGAAACGCAAGTCTTGCCCTGCCGCCCACTTGCTGGAGACACTGCAGTGTGTCTGTTGCTAGGTCAGAGCCATGCTCCTAGCACTAGAGAGCACTCATCTCTCTCCATGTGGCTGTCCCCAAGCCATATGTGTGTGGTCTCTCGGGCTCCCCCACCCCCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGATAGGGATGGAGCCTAGAGAGGCTCGGGCATGCTAAACAATCTACCACTCCAGCCCAGCCTTAGGATCAGGAACCCTCATGTCCCCTGTGTGAGCAGCAGTCTCTCTAACTCCGTACATGCCCTGTGATCCTCAGTAGTCTTTATGCGAGGGCTAGGCATTAACCTCATCCTCACAGTTAACTTAAGACTTCCAAATCAGAAATGGCTTTTCCTTTGTTTGTTATAACGGCTTCTATACAAAGGGAACGTCCCTTTTTGTTACCTTGTGTGGAAAAGTTGATTAATTTATTCTCCTTCAGGCTACACATTAAGAAACAAACAAACCATAGTTCCCATATATTGAGCACTTGTCTGCACTGAAACTATGCAAAACACAGTCCCAGACTGACTCTTCTGTTTGGTCCTCCCAGCTCCTCGGTGGTGTGTGGATACTGCTGTCCCAACTAGAGACAAGAAATGGAGGCCCACACAAGTTAAGGACTTTGCAAGGTCACACAACCGCTAAGTAGTGTAGTGAGCTCTCGAGTTCTAGAGTACATGTGCCCATCCACCGTGATGTGTGACTTGCAGCTTTTATGGTGATTGGTTCTTATCTGCTGAGTAACCCACAGCTTGGACACTTTTAAAGCCCATTTAGATCGCTCGCTATTCACAATATAGAAACAAAGCAGGCCAGTCAGAGTCGGTCAGTGTGGCCAAACAGTTAAGGTAGAACTGTATGACCCAGTGATGTATACGTTCCTTTAAAAACAATTCTCTTCCACTTTTATCTGCATACTGTCTCTTTAATATGTTTTAATCACTGTAACCGTCATCTAGGACCAACCTTAGAAGGCTTCACCATGTGTAAGATTCTGGGGCTTCCATGCCCTGGGATCTGATCTTTGTCCTGCTTCTTCAGGCTACAGTCCTCCTGCCTTCAGGAAGGTCTGGTCAACCCCAGACCCTACTGGGAGGCAGGGGTAGGGCCCAGGGAAAGCATCCCCCTTTACGGGCTTCTGCTGTAGCTTCAGGTTTATCCAGCCTCCAACTTGCCTGAGGTAGGCCCAGCCAGGAGCTTCATTGCTGCCCACCTCATGCCCCATCTGGAGACCTTGTTATTGCCCGTGGCCTTGTTCCTCTGGTTGATTTTCTGTGATACATAAGTAGGGCTGCCCATTTCCCGGGAAGGACCCGGATGGATGCTATATAGCCCCTGTGACTGCAGTATTTTGTCTCGCCTTAAGACTTCACTGGGTTGGATGTGGTCACTGGGTTAGAGCCCCCGTGCTCACTGTGGCAATGCTGTGGGGGAAGATCCTGGAAGGAGTTCTATAACTGTACGGTGCTGCCAGCCGGGTCACTTGAGGCCCAGTCCTGCCCAGTTTGATCCTGTTCTTTTCTGCCATGCTACAGCTTGAGCTAAAGCTTCTGAGGGCCCAGCCAGTTGTGGTCTGCAGTTCATGGGCCTAGGCTCCAGTCTCGTGTGCCTCCTGGATGTGCTGTTGGTGTCTGGGAGAGTCAGGTGACAGGTTATGGAACAGGCAGGTGGTTCCATCTACAGAGAAAGCAGAGACATTCTTTCTGATTCTGAGCCAGCAGTTATCTTCCTTCAAACCAGAGATCATGTGAACAAGGGAAAGTCCATCCAGCCACTGAGCTGACCCTGGACGTGAGCTTTGCTGTGTTTCATGTCTGTTTTTGGGGCTGGAGGGAGGCTCAGTGGTTGCTAATGCTTGCTCTTGCAGAGGACAAGTTTGTGTCTCAGCACCCATGTCAGATGGCTCTCGGCCATCTGTAACTTCATCAGCCTCACTGTATCTGACACTGTCTTCTGGTCTCCACACGCATGCCTGCAGGCACACAATAAATCTATCCATAAAGGTAATGTTTTATATGTGGACCCTGAGGATAAAAACTGACCATGTGACACTTGCCTGTGACAACCTGCTCTCTTCCTGTTACAAGCATAGTCTCATATTTAAGTCTATAGCTTAAACATAATTGAAAAAACCTAAATGCAATGTATATTTTGTGTGTGTGCGTGTGTGCATGTGTGTGTGCATTTGGAGCAGGTGCTCTGGTTGTGTTGAGTAACTTTAATTTACTAACCCTTGCCCTTCCTCCCTTACCCCAG
Seq C2 exon
CCCTTTCTTTTCAGAAGATACATTTAGACAATCACCATTCACCTCCAATTCAAAAGATCTGCTGCCCGGTGAACCCGTGCTGCATGGGAGAGTCTCCGCTCCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000011697:ENSRNOT00000015929:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.950 A=NA C2=0.556
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]