BtaINT0001356 @ bosTau6
Intron Retention
Description
Bos taurus matrin 3 (MATR3), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001102486]
Coordinates
chr7:52218128-52229511:+
Coord C1 exon
chr7:52218128-52218184
Coord A exon
chr7:52218185-52228419
Coord C2 exon
chr7:52228420-52229511
Length
10235 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAGGC
5' ss Score
10.08
3' ss Seq
AATTGCTTATTTTTCTACAGAGT
3' ss Score
7.97
Exon sequences
Seq C1 exon
ACCGCGTCCCGCTCGCTTGGAGAGGTACCTCTCGTTTTCCCTCTCCCTTTCTTCAAG
Seq A exon
GTAGGCGTGAAGCGGGTAAGAATCGGGGTGGGGTGGCCGGGGGCTCTCGGCGTCCGTCGGGAGGAGGCAGCGACAGCAACAGGGGCCGCGGGGAGCCGGCGGCGCGCCTTTCTTGCTCGCTCCCGTTCGCCTGCTCTGCCTCCCTCCGCGCTGCGTATGTGAGCCGCCTGATCGGCGGCCGCCATGTTAGGAGCTCAGTGGCGGCGCAACCAGCCTTCTCGGGTGGCGGAGGTGAGCGGTCCCGTAGGGAGACACGCGGCCAGCCAAGGGCCCAGAGTGCGGAGGCAGAGTCGGGGCGCGCCGAGGGCAGCTGATCGGCCGAGCTTCCTGCGTTCCGGGCTGTCTGTGGGCGGGGGCGGGACGACGAGCCCGTTACACGCGGGCTGCTGCTCTGAGGGAAAGGGAGGAGCGCTCGAGGCCTGAGGGACCGACTAACCATGAGGGGGTTGGCCTGCCGTTTGGGGAGGATAGTTAAGCTAAAACCAGCCCCAGATATATTTGCCTCCCCCCCCCCCCTTTTGCGCCTGAAAACGTTCCCCAAAATGGAGGATTCCGTAGACTCCGAAAAGCTTAGCCGTTTGAGCAGCGTTTCTTGGTGTCGCGGCCTTCGCTGCTTTCCTCGCCCATCGCTTCATAGCGCCCCCTAATACTCCCCTGTCCCCCGCCCACACACAGGCGCGCGCGGTTTTAGCCGGGCCTCAGAAACAATTCCCCCCTCCCCCCGCCATCGCGTAAAAATGGCCGAAAAATTAAACGTTAACGCTTGTTCATCGTGTTGCGTCGTGGATAAAGCCTTCTGCGGTACGCTGCGAAGGAGATTTGTTCTTGTTTAGAGAGTCACCTCACATTCCTTTCCTCTATATTAAAATACTATCAGTCTAAGCTTCTCTAGAGAGGATGGTGTGGTGTGGGGACCTTCCGGTTTCCAGACAAAGGGTTTATAGTAGCCTGGTGTAGTCGCGGCTTCGTTGTTCTTTTCATCGCCGGCGCTGTGCCACGTTCTGTGTTATACAAAGACTTTTCCCATATACAGTGGAGTAGTATTTCCTAGGTATTTATCCTGCTCTGTGGCGCTATTCTGTGTAATAGTCCTATTGGATCAGTTACGGTTTTCCAGCCAGATATTTCTAGAACGGTTATGGCGATTCCAAAATTCTAGTCTTTCACGAGCGCTGTAAAGTGTGCGAGTTGTTGATTTCCCAGGCCGTAGTGATGAGATTTTGCATTGATGCTGCGTTCTGCTCGATGAACAGAGCTTAGTTTAAGATTTTTAGATAGTCGACGAAACATTTTTCTCCCAGGTAGATTTAAACAGTTGTACTCTGCGGGCAAAAATTATATTTCAGGCTATTTTCATACGTGTTCAAAATTACCTTTTAAAAACGAAACGACTCGATCTTCGGAGTCTAGCGACATAATTGTTTAACATTAGTATTGTTTTGGAAATCAAGAATTCGGATCTCTTAGCTGTGTGTAAGTGGAGTTGCTTTTATGTAACATTTTGAACTAATTCGAAAGTATTTAATTACCCTTGACCTAAACATTCTGTATGTTAAAGAAGTCTTTAAACATACTTATTTTACTAATGGTTTTACGGAAGTGTAAACGCCAAATATTATTACAAGTCAGAGATATATAAAGACATTAACAACTGAAGAATGCAAAGAAAAAAATCTTCCTTGATTTTAGAAATAACAAGTAGCTCAAATTCCCAATTTTATAGAAAGAATTTGAGTCCAAGGAAGTGCTTGTTATGTAGGTAACCAATGGCAATGAAGCCAGTGTGTTTAGAACGCTTACATTTTGATTAGATATTTGATTCAGGCTCTGCCTGTTACAATAAATAGGCTTAAAATGGAAGAACTACGCTTATAGGAATTTATCCTGTAAATAAGGGAATAGTGTGTCAAAAGTATGTATATGTAAATGTTAATGTTGGTTACTAAGCATATTAAAAATCCAAAGGATTCAACATTTGGAGATCTGCTAATTATAGTGTGGCCATCAAGTGATAATCTATACAGCTATTTAGAAGTATTTAAGGAAATGGCAACCCACTCTAGTGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACAGGGTAGAGGGGGCGGGCATCCTGGTGGGCTGCCGTCTATGGGGTCGCACAGAGTCGGACACGACTGAAGTGACTCAGCAGCAGCAGATGGGAAAATTATAGTGGAATATAGTTCTAATTGGGGAGAAAGTAATAAAACTCTGCTGATACCAAATTTGATGACTTTTGTTTTTTGAAGGAACGTGTAAATAAGCGTAAAAAATATCCCTGAGTGTCGGCTTTATGGGTCATTTGTATTTCCTTTTTTCTTGAAATTTCCACAAGACGTTACACTTAATTTTGTAATGAAAAAACTGAAACATTTTTTGTAAATGCCAAAACTGCTGAGAAGGCGATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGCCCATGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTGCAGTCCATGGGGTCGCTGAGGGTTCAGACACGACTGAGTGACTTCACTTTGACTTTTCACATTGGGGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACTGGTGAGCCTGGTGAGCTGCCGTCTCTGGGGTTGCACAGAGTCGGACACGACTGAAGCAACTTAGCAGCAGCAGCAGCACTGCTGAAAAGACATTTTGTTTTTTTAGAATCTCACCTCTGTTTAAGGGAAATGGAGATGAAAATGAGCCAACTTCTTGAAATCTGAAGTGCAGTTTTCAAATGTGACAAAAAGAAGTGCTTGTGTAAGATATTCTTGTTATTATGTGTAGGCACATAGGAATCTGAAGGCATTCTCACATAAAATTAATATTGATAGGACTAATAATTATGAACTGCAGCCATTAGCTGTTTATAAATGATCGAAATCAAAGAATTAATTGGACAGTGGTTTGTTAAGTGGTGTTCTTAGCAAATCTTCTAGTTAAAAGTCTGTGTTTTGTTTTTATATACTTCTTTATTTTGTAACCTGATGATATTTGTCATGTCATTTTCTTTCTCTATTTCCTTGCTTCACTCTGGAATTTATCTCCTCCCCAGCCTCAGTTTATTAACCTTCAGGGTATGGTGTAATACTAAGCATTTCCTTAATTGAGTCATGTGAAGACGAGTGAGTTTTACTATCAAGTTTAACAATTTGCTATTTTGAAACTCTTGCTAGACCCACATTAAATGAGATGTTAGAGAATATTATGAAGAGTAAATTTCTCTTTTTACAGAAATAAAAATGTATTATTTTAATGTAAAAAAAAAAAAAGAATTGTATTAAAATTGTCCCACACTGTGGCAATAGGGTCTCAGTATACCTGATTGACTGAAGGTTTGGGGTGGACATTGCCAAATGCATGGTTAGTGAGGTGGAAGGGTTGTGGGCAGTGTAGTTTTGCAGTTTTATATATACGGTTTTTCCAAGGTTAACACTGTCCATGAAATTGCTTTAATTTAAAATTCGTTAACTATGTAGTGGGTCTTCTCATTGGACCATTAGGTTAAGGGTTCTGAACTATTTGATAAAAGGTTTTTAAATAGAAAAACTGTTTTGGTGTGGATAGTAAAAGGTAGAGCATAGAAGCCCAGTGGATTGAGAGAACTGTGACTATGAAGCCTTTTAAAGTACTTTAGCTTTTGGTTTGTTGCAGATCATATTGACTATAAGCTACAATAGAAGTTATATGATGAAGTGCTGTGTTCTCTCTCCTGACCTGAATATAATTTATTAGGTGGCACGTCTGAATGGATGCAGTATCTTTGATGTGTTGCAACCTCGATGTGATTGATTTTCCCAGTTGTAGGTCAAGCCCTAATATCTATCTAAAAAAAGGCTCAGGAGTTTCTGACATTGAAATTGATATGAAGTAGCAATTGAAACTTAGGTGTAAATTTTTGATTTAAAAATTTTAAGAGTTATTTTAAATTTTTGATTTTAAACTATTCCAGAACTTAAAGCTAATTGATATAAAAACTTGCTCTTTTTCTGGAAAGTTTTTTAAATGACAAATCTCTGCCTTTCTTTTATAGAGTACCAATAGCCTGTGGTTATTGGTGCCTGTCTTAAGGCAGAAACAGGTTAATAGAACAAAGAGGGTTGCCATGGTCCGGGGGTGGGATCATAGGTCTTCCCAGTTGTTGACATTGGAATAGCTGCTGGATAAGAAGAGCGAAGAGGAGGAAAATGTCTATAGAAGATGTCATGGTGAGCAGTAAATGCAAGTTGGAAAGGACTCTATTGATAATAGAATCTCAGTAGGATCTTTGATTTGTAGTAGTGTTAGTCGCTCAGTCATGTCCGACTCTTGGCAGCCCCATGGACTACAGAATCTTCTGTCCATGGGATTCTCCTGGCAAGAATACTGGAGTGGATTGCCATTACCTTCTCCAGGGGATCTTCCCAATCCAGGGATCGAACCCAGGTCTCCTGCATTGCTACAGATTCTTGACTGTCTGAGCTACAGGGAAGATCCACTGATTTGTAGTATCATTGGTTGTTAATGAAATAGATAATTTTCTGGTCTTTAAAGGTGATCTGTACATTTTTTTCCCTCTGGAAATTACTAGGATATTAAACATCTCTCTTTGGTACAGTCACCGATAGGAGAAGAGCTTTTATAGCATATGTGAAAGTGTTTGAACACCTGACTCACAGCAGTTGGGAAAGGAACAGTAATAGCAAAGAAATACAAACGTGTACTTAAAACATTCTCACTGTGAAAAGGTGTGAAGCAATAAAACAATTTTAATGCTTAACTGTGTATCCTTGTGTGCGTTATGATATCCTTGAGAACCACAGTGGAGGAGGGAATTTTATACTGAAGCATCAGGAGACCAAGAAATACTCATAACAGCATTCTTGGTAATGACAGGAAATGAGAAACAGTCTAAATGTTCATCTTCTGAAAAACAGATAAGTGTGTATGCCATAATGGTATCTATATAACAGTGAAAATGTAGTTTTAATTCATGTGTAAATCAGTTTTAAACAAGAGCAATATATATTAAGCCCATTTGTGTAAAATTAAGAAAAGTAAAATTAACACTGAAAAGATATGTCTGTTAAGTGGTAGGACTTAAAAACAAGAGACTCCATAAGGGAAGGAAGAATCATTGGAAATAAGTATCTAAGGTTTTATTGATGTTGTTTCTGACCTTTGGCATTTATATACACTGATTTGTAAAATACATGATGTGAAGGGGGGTGTTGGACCTTAAGAGAATTCCTAGTATTAAATGGAGAAAGGAGAGACACATTCTAGCTAATAATTATGTTTGAACAAGCAGTAAGCAGTCTGTATAATGGCTCATAAAATGAACTTTTTCTTAAGGTGTTGGCATGTGCCAGAAAATAGGTTTAGAGGAGAAGGATGCAACCAATATGAAGGGCATTGAAAACCATACTGAGGACTTCATGTGGTAAATAGTAGGGAGCAGTATGTTTTTGAATAGAGTAGAATGATTAGTGATGTTTTAGGTTTGTAGTCTTTTAAAGCTGACTTCTGACTTGGTAACAACCTTCAGGTTTTAAATCTGGCTTTGAATAGAATTGAATGAGATTATAGTTGATACATGAAATAGTCCAGTACAAGTGAAAAAGGTGTTTATGTCTCTGGGTCAGTCCTTTTACTTCTAGTTTGTTTTCTCATTGGTTGTGAGGATCAGAGTGCATAAAGTAGATGATTACTGTGGTGCTTACAATATGCCAGGCCCTGTGAAATGGATGTTATTTTTATTCTCATTTTACATATGAGGGAATAAACCCAGATGTTAAGTAATTTGCCCAGGTTCATGCAGCTATTCTGTAGAAGAGCTGGTTTTCAAATCCAGGCATTTGGGCTCTAAAAAAATCCCAATTTATATCAAATCAAAGAGTTGTACAGATGTTTGCGGAAACCAGGAGAGCAGATCATGAAGCAGAGGGGAATATCATAAGGGTGCAGAATGGTGCCTTGAGGAAAACCACAGACTTGCTTTTAAATAGAGAGTTAGCCAAGTTAGTGTCATAGGTCAGATCAAGAGTCAAAATTGTCAGTTAAATGGAGTAACTTTCTTTCCTGTAGTATGAATTTAGTTAAAGTCACTAGGGAAAAAACTTAGAAGAAAAATATTTTAAGTCTGAATAATAGGAATCTTTTCTGTGGATTACCATGAAGATTTTTTAGCAACTGAATCTGTTGTTAACCTAAGGATTAAGAAGTGGGTTAGAAGTTTAATCCAGATCAGTAATATATATGAATTGACACCAATAGTTTTAAAGCACTTCAGAATATTTTTTTTTTCAGCCTTCTTGGGCACTGCACTTTTTAGGGTTTTTTTGTTGTGTGGTGAGGCACATTGGTGTATACAAAGTTAATAGAGCTGGCTAAGCAACAGGAAATAATAGCTGTTATCTTCCATTATCTTACAATGGAGTGTAATATGCAAAAATACTGAATCCTATGTTGTACACCTGAAGCTCATATAGTATTATATATCAGTTATACTTCAGTTTAAAAAAAAAAAAAACCTTAAATGAAATACAATTTATAAAATATAGTAGAAAAAGATACAGTGATATAAACTAACATTAAGATGAAAATTTATTTAATACTCTAAAATGGAAGCCATGTTGAAGTTATTTATAAAGCCATTATAAGGTTAATAAGTGAGGAAATTTAAGGAATATTTACTTCAATTGAAGTACTCTGTACTTCAGTTGGAGATTGATTAGTTAAGTACTTCTTTAAATTAGTGAACTATCCCTGCCATCTGTTAGTGACATGATTAGGACATTTTTTATGCGTTTGTATTGTTGGTTGCCATGTATATTTGGCATATTTTCACATGAAAAAGTTAAATCACAAAGGTGTTTGACCTTGATAGAGATGGGAAAATCTCAAAATTTCTTTCACCCATTTGTGTTACAATTCAGAAGCTGTTTTCTAGCTGTTGTATGTTAAATTTTTATGTGAGATTAAAAGGTTATTATGTCAACGTGTGGATATTTCTTTCCTACGTATCTCTACATGCCTTTATGATTATACTATCTTAAAATCGGTTGTTTTTTAAAAGTAACTTATTTCACACAGTCAAAAAGTATAAAGATCCATATGGTGGTATTAGATACCTTTAAAACATAGTGTTTTTAACTTCAGACGCTGAAGGTTTCTTCTATGTCATCTTTTAAAGAACTGAAGTATGCTTATGTTCATTTTACTTCCTGCTAAGTAATCCTCTGAAATAATATATAATAGACTAATAGATAATCTTTATTTTACACAGGAAATTTGGATACAGAACACTGTTTTCTCCATTAACTTTGTGTGTGTTTAGCTTTCATTTGTTTTCTAAAATGTTTTAGTATTCCATTTCTTCTAATTATTGAAGAAGATAAAGGGTATCAGGTTTATGGAATATGGGGGTTGAATATTATTAACCGAAGCTTATTTCTTAACCATACATATTTGTTCAGATGTTGAATGTGAAGCTAACATCTTTAATAGAATTTATATCATGAACTTTGTTCACTGAGAATTTGAATATCAGAGTATAGTTAAATGGCATTTGTGAAGCCTTAGTTGTTTCTTAATGTTTTCTGATGGGAGAGGGTGGAGGCACTTTTTTTTTTGGAAGTGAAAGATTCTGTATTGTATAAAGTTAAATGAGTAAATTGGGTTTTAACATTACATTTTAGATGAGTTATCTCAAAGGAACTATTTTCAAACTTTATTAATCTCTATGAAAACGCAGCTTTATGCAGAAAAAAAACATGGAGTAAAAGAAGCTAATTTTTTTTTTTTAATCACTTTAGTAACTTGGTAAACTTCTCAGTATTGTGATGGTTTCATAGGCAGTAGGTCTGACTTAGAGCCTTTAAAGTGCTTTGTTCATCTTATGTTCATTGACCAAAGATAAGATACTAAAGGAACTTTTTAATAAATGTTCTTACATCAGTGCTATCTTGTCGAATTTTTCTTAATTTCTTTGTTCTAATAGAAAATTTTTAAGAAATTTGTTAAATTCAAAAATTTGACTTTTTCAGTACTGCTACTCTCATATCTTTGTGTGGGACTGAAGTTGAATCTGAGTCACAAAAATATTAAAGTTATTCTTAAATTACAAGTTGTCATGGGATTTACATGGTTGTCTTTCTCTTTTTCTTAGTTTTTCTGACATCCATTTTCTGTTTTGTCTTAAGGTTATCACCTTTTACCTTTACTTCTCTTAACCTTTCCTTTTTGCAGCTCCACCATTCATATATGTTGCAAAGAAAAGTAATTGAGATCTCTGTAATTCAACAATCATTTCCTTAAAATATCAATGTTAAAAATTTACACATGGTCATAATGCCATAGTATAATTTCCCTAAAGGGAAAGAATAGGTCTTTTGAAAGGCTGGCTTTTCAGTATATGAAGCTTTGACTCCCAAGTGAAAGGCAAAGCTGCAATTAATAGTAACTTAGATACTTTGAAATTTTGATTTCAAAAAAACCCTCTTAATGGTTTTGAGGTTTTTTTTTTTTTAAACAACGTATGAAAACGTAAGAGGGTACTACAAATGTTTCAACAGTATTTTAACCACCATTCTGTATGGTATTTAAAAGTCATATCAGAGAAACCTTCATCCAATAATGTTTACTTACTCTTGTCTTTATCTTATTAATCTTAAGGTCTAAGTAGTTTACATAATGGATCTCATCTGGAATGAGTTTCTTTGGTGTCTTTTCTCAAGTTCATCTTTCTTGGTGTGCAAAAACATCTGTAATTCCAGTCACCTCTGATAGCATTTCTATGTCTTTTTAACTTTGTTACATCTTTTTGTAAAATCTAACTTTAGTCTTGCCTGCAACTTTTTTTTTTACACTTCTTCTACCACTGTTTTCGTCTAGTGTTTCCTTAATCTGTCATTGGTGGAATCTGTCCCATAATTGACTTGTAACTATTAAATATTGCCTGGTTTTTATGTTGATAAAGTTTAAGTGCTTAGGTATATCGGTGATCAAACTTATGAGTTAACTGAACAGTGTCTCTACATAGTAGAGTTATGTAGCAAACAATTTAAGACCTAAACCTCTGTGTGTAATTGTGATTATAAAATTGTTTCACCAGGGACAGTTATGTACGTCATTTAATACGTTATGAGATCATTCATAAATGCTTTGTGAATTCTTATGTGAAAATTTTTGAGGTAAAATAAAAATGAAAGTAATTTCATTACTATCACATCTTGGAGGAAACACATCTTGAGGGGTTGTATTCACAATTTAAATTTTCTGGATGATGGGGCTATTCTTGTGAAAGAATCTGTTTACAGAAATCTATGTAAGCAAGATCTCGTTTTCATTTTCACCTGTTTTGAGCTCTAGAGGTGTTACAGCCCTGAGCATTAAATGAATGTTCACGGCTACTACCTTGTGGAGTTTCACTTCTTTAAATCACCTATACTTCCTGTACTTGTGGTTGTTCTTGGGGAGTCTCCTATTTCTGTACTGACCATATTTGATTCTCCTTACCTTTTAAGATTAGAAATGAAGTAAGCAACTGCCTGATAGAGGATGGAGAATGAGGCAGTTAATTATTTGGCTTAAATTTGTGCAGAAATCTATAAACTGTAGGGAGTCGCTTATTTTTCTTCACATCAGTCTTTACCTCAATTTGATTTTGCTGCATAAAGATCTCAACTGTAGCGTTTGGTCTTAGATCTTATGCTAGGTACTTGACACTTAAGCTTCGTTACTTGTGATTTTACTTGGTTCTTTCTGATAGTGTTAATAGGTCTCATTTTCTAAAACAATACAACTGATTCATCTTTGACTTGTTGACCTTGATTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAGTCTTCTGGAACTTAAGCATCATATTATAGGGTGTATTTTTCTTCTAAAAGAAGAGACACATCTATATTTTTATTGAAATTTTGATATATTCAGACATCTGACCCTTCAATTGAAATGTTTTTAAATTCCGTATGAAATTCCCTTTAATAGTTAAACTTTAGCATGAAAGACTACTTTTTAAGTATATGCAAGCTCTGCATACATCTGAAATCTGTTTAAGTTATGTAATTCCTTGTAAGTTTGAGATCTTAAATGTTTTTTTTTAATCAACATGATGCGTAAGTTTTTTTTTTCTTAAAAAAAAAACGGCATCTACTTAAAGGGATTTATGACTAAAATTGCTTATTTTTCTACAG
Seq C2 exon
AGTTGTCTGCTGGTTCTCAGCTTGAAGAAGATTCTACAGTCCTTATTGATCCTTTTTCTTGGCGTTACCATTTTTTGAAGCAAAGTTAACCTAGTTTTCTAGTTGAGCTTTCTTTTTGGCCATCTTTAAAAAAAAATTTTTTTTTTTTAATCTATAAACTAGACAAGAGATAGTTCTACAATGTCCAAGTCATTCCAGCAGTCATCTCTCGGTAGGGACTCACAGGGTCATGGGCGTGACCTGTCTGCAGCAGGAATAGGCCTTCTTGCTGCTGCTACCCAGTCTTTAAGTATGCCAGCATCTCTTGGAAGGATGAACCAGGGTACTGCACGCCTTGCTAGTTTAATGAATCTTGGAATGAGTTCTTCATTGAATCAACAAGGAGCTCATAGTGCACTGTCTTCTGCTAGTACTTCTTCCCATAATTTGCAGTCTATATTTAACATTGGAAGTAGAGGTCCGCTCCCTTTGTCTTCTCAACACCGTGGAGATGCAGACCAGGCCAGTAACATTTTGGCCAGCTTTGGTCTGTCTGCTAGAGACTTAGATGAACTGAGTCGTTATCCAGAGGACAAGATTACTCCTGAGAATTTGCCCCAGATCCTTCTGCAGCTTAAAAGGAGGAGAACTGAAGAAGGCCCTACATTGAGTTATGGTAGAGATGGCAGATCTGCTACACGGGAGCCACCATACAGAGTACCTAGGGACGATTGGGAAGAAAAAAGGCACTTTAGAAGAGATAGTTTTGATGATCGTGGTCCTAGTCTCAACCCAGTGCTTGATTATGACCATGGAAGTCGTTCTCAAGAATCTGGTTATTATGACAGAATGGATTATGAAGATGACAGATTAAGAGATGGAGAAAGGTGTAGGGATGATTCTTTTTTTGGTGAGACATCGCATAATTATCATAAATTTGACAGTGAGTATGAGAGAATGGGACGTGGTCCTGGCCCCTTACAAGAGAGATCTCTCTTTGAGAAAAAGAGGGGCGCTCCTCCAAGTAGCAATATTGAAGACTTCCATGGACTCTTACCGAAGGGTTATCCCCATCTGTGCTCTATATGTGATTTGCCAGTTCATTCTAATAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000006756:ENSBTAT00000057156:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.658
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]