BtaINT0017829 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000014051 | ANGPT1
Description
angiopoietin-1 precursor [Source:RefSeq peptide;Acc:NP_001070265]
Coordinates
chr14:59354932-59375492:+
Coord C1 exon
chr14:59354932-59355161
Coord A exon
chr14:59355162-59375364
Coord C2 exon
chr14:59375365-59375492
Length
20203 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAGTA
5' ss Score
5.69
3' ss Seq
TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGTTT
3' ss Score
11.02
Exon sequences
Seq C1 exon
TTTATTAGAACACAAAATCTTTGAAATGGAGGGAAAGCACAAGGAAGAATTGGACACCTTAAAGGAAGAGAAAGAGAATCTTCAAGGCTTGGTTACTCGTCAGACGTACATAATCCAGGAACTGGAGAAACAGTTGAACAGAGCCACCACCAATAACAGTGTCCTTCAGAAGCAGCAGCTGGAGCTCATGGACACAGTGCACAACCTCGTCAACCTCTGCACTAAAGAAG
Seq A exon
GTAGTAAGAATTTCTTCCTTACTTTGGTTATACTAAATATTTTATTCAATACAGAGCAAGTAAATATCCAATATAACTTTCTAAGTTGCATTGATTGCTAGTATAGAAGCAGCAAAAGAACTTTGTTCTTAGAAGCATTTAATGAAGTTTGCACTGACAATTTTCTCATGTTTTTAACTTCAGAGAAATTATTCATAAGCTTGGGTTCATGAATTCACCATATCTTTCTAATTTCTCCTTTTTTATTGGCCTTTTGGCCTTAAATAAAATCTATTAGGTTCTCATAGATAAATATCTAGTACTGTAATGTTAGACACTTAACTACACAGGACAGAATTTAGACTCTATTAAAGATTAGTTCAGAGTGCTGAGAAGAATTTCAGGAGCGTTCCCATTTTAAAACTATTTCTTTTGCAGTGGAGGAGAGGGAAGAGTTACCTGCAGAGACAAAGAGGCAGAGAAGTTCCTAATAACTGTTATGAAAGAGGAGGAATATTTGTTATTAAAAACCTGTTTTAGGATTATTCATGTGGCCCTGTATGGAGAAGACCTAACAAGGGCATATGAGCAAACTTATTCTGGGCTATCTTCATGATAGTGAAAGTATAAACTTTTAATACCCACCAGAATATCTGGAGCCATTTAGCCATTGGAAATATTGTAGGCCTGTGTCTCTTTAGAAGACATCCATCCATCTGTCCACCTGCCCACCCATCAGTTATTGAAAAAATGTCTCTGTGTACACCTGTTCACTTCAAGCAGAACCTCACTTGAGCCACAGGAGAACGCTTCAAAGTTTGGAGTTTCTATAGTTCTGCTCACTAATCAGTCTTTCTATGAGTGAACATGGACAAGAAAACACCACTTATATCTGAAGGTCATGGTTATCATTAAGCTGTCGCTTATGTGATCATTCATGTAACGGTTCAGTGTTCATATGTAATGTACATAATTGGAGGCTCCTTTAATTTAACAGTGGACTTGAGCTATATTAAAAATAGCTCAGTTCCATAGTCTCATGTATACATATGAATACAGAGGATAACTCCATTTTAAGTGATCTTGTTTTAAAGACATTTAGCATTTCTCTATTACACTCCATTACCTTCGGTTCTATCTCCTTTAGATAGTCTAAACAAGTCCTTAATATACTTTTTGAAGAATATTTTTTAAACAGTGAGTTCCCAGGGCTCCGTTTGTGTGTGCTCAGAAATGTGATTGAGAAGGAAAAAACCTGCTAATCAGTCAGAGCCTGCCAAAACCTTGAGTTAGAGTCCACTGGAAGGAAAACATGATAGAATTTTGCCAGAGAATTTTAATAGAGCTCATGAGTATTTAGAAATTAAGTATTAATATGAGACATATCTATTCTCATATTGAACTGAATACATTAGGGGAAAAATTGGAAACATATTTTTCTTATCATCCTGAGACGTAATGCACATGGAGTTGAGTAGTTCTTTTTTTTTTATTAATGATGTTAGAAATATCAAGCCTTGGTGATTCTCACAAAGCTCATATGTCTGCCTACTTATCATAATTTCACTTCTTTTCTGAGTACTTGTCCAATAAATATGTCTTTAAACTTTTTCAGGCAGGAGGGTGACTTCAAAATTAAAATTCCTGGCTAGTTTTGGTCTTTGGGTGCAACATCAGGAATCAAACATCTGTTCAAGAAATGTAATTTATTGAACAATAACAATGGCACTCCTGATGGATGCTACCCACAACATCACTCAGTGTATGAGAAAAGTAACTATGCCTATTCTATTATAACTATGCCTATTCTATTATAGAGCACATCCAAAAAGTAATTGGAAAAGGAAGTGGCAACCCACACCAATGTTCTTGCCTGGGAAATCCCATGGACGGAGGAATCTGGCGGGTTACAGATCATGAGACAGAGTCGGATAGAACTGAGTGACTAACACTACAGAGGGAGATGGAAATTGTCTAATACTTCATACCTCTAGACATTTATTTTCTTTTTAATGATAAAATTATAAAACAAATCCTATTTAACTATATTTTATAATCCAACTTTCTCACACACACAATGTAAGCATATTAAGCTATTATCCAATGGATTCTATGCTCTCATAGTGTGTGAAAGTCACTCAGTCATGTCTGACTCTTTGCGACCCCATGGACTGTCCATGGAATTCTCTAGGCCAGAATACTGGAGTGGGTAGACTTTCCATTCTCCAGGGGATCTTCCCAACCCAGGAATCAAACCCAGGTCTCCCTCATTGCAGGCAGATTCTTTACCAGCTAGCCACAAGGGAAGCCCAAATAGTGAAAGTGAAAGTTGCTCAGTCGTGTTTGACTCTTTGTGATCCCATGGACTACACAGTCCATGTAATTCTCTAGGCCAGAATACTGGAGTGGGTAGTCTTTCCCTTCTCCAGAGGATCTTCCCAACCCAGGTATCGAACCCAGGTCTCCTGCATTGCAGGTGGATTCTTTACCAGCTGAGCCATAAGGGAAGCACAAGAACACTGGAGTGGGTAGCCTATCCCTTCTCCAGGGGATCTTCCCAACCCAGAAATTGAACCAGCATTTCCTGCATTGCAGGTGGATTCTTTACCAACTGAGCTATCAGGGAAGCCCATGCTCTCATAACCATAGATTTTATTTGTTTCTTATTATACTTTTTTTTTTCTCTCTAATCCCACAGTTAAGTATTCTACTAAGTATTTGGTGATTTAAGAATTCATGAGACACAAAAATGGAATGTGTTTCTCACTAAGTTTTCTACAAAGATTTCACTTCATTTTCACTGGCACCATAGCATTTGGTTACAGTGAATTTAAAACTTTAAATGACTAATTGCATAATACTAGATTAAATGCATGTTGCTAAATTGCTTCAATCGTGTCCGACTCTTTGCAACCCTGTGGGCTCCTCTGTCCATGGGATTCTCTGGACATTGGAGGGGTTGCCATACCCTCCTCCAGGGAATCTTCCTAACCCAGGGATCGAACCAATGTATCCTGCATTACAGGCAGATACTTTACCATCTGAACCACCAGGGAAGTCCACTAGATTAAATATCAGTTACTGAAACAAACTTATTTCATTCTAATTTCAAAATACATGAGTAAAATCTTTTCCTTCTTAAGACCAAAAATTCATTTATCAAGTAAATTTGTTATTTATCAAAGATTATACATAAATGTTCTCTCATTAAAAATAAATATATGTAAATAAGCCTAAATCAATATATTACAATAAATGTACCACTTTTCTAAAATGTATATTTCAAAAAAAAATGCAAAGAATAGTCTTCTGAGTTTCAAAAAATCTGTGTCATAATCCAAAAAGGCAAAAATTTTAATTGACCTAAGGTTCTTCTCACTCTAACTTGACTAAGTCAGTCATATGGATACAGCCTGAATAGAATACTACAAAACAGAAGAAAAAATTTCTACTGAGTTTTTTTCTGTCATTGGCAACTAATTTAATCTTTATGAAGCGTTTAATCATTTATAGGGGTTTCCCCAGTGGCACAGTGGTAAAGAATTCACCTGCAATGCAGGAGAAGCAGGAGACACAGGTTCAATCCCCACGTAGGGAATATCCCCTGGAGGAGGAAATGGCAGCCCACCTCAGTATTCTTGCGGGGAAAATCCCATAACAGATGAGTCTAGCGGGCTACAATCATGGGGAGGCAAAGAGTCGGATAGGACTGAGCTTGCTAATCATTTCTTATGTAGGATAATTATATCTACTTCACAATGATAGTGAGAACATTAGATACTTCATATTAAAACAAAAGTATGGGACATATTTGATTCATTAAACTTTAGTTCCTTCCTTTTCCTCCAAGTGACAAAATTCAGCTAAATGCAAATTTATTAAGTGCTAGTTATAAGTAAAATTTCTTTCACAGAAAATGTCTGAATACAGTGTTCTAGAGTGTCTGACTGTTGACAGTCATCCAAGTCCCTTCTTTTTAACTTGTTTCCAAATCACTAAAATGGAATCATGATATTCAATTCCTGGTGAGTAAGAATTAACAGAGATTTGTATAAAACTCATAGCATCAAGTGTTATGTAGTATTTTTTTTTTTCACTTTCACTTTTCATACTAAACCACTTAAGGTCATTTTCTAAAATAGTTTAGCAAACTTTCCTCTTGTCTTAACAGGCAATAGCAGTATCTTAGGCAAATAGTCATTGCAAACTGAATTGTGTCTGTTTTTTAAGACTTCTGGGTAACACACTTATTTTTGTCTAATCTTTGTCTGCAAACACTTGGTTGCATTTATTCTTAGAATTACCACTGAAGAAATAGTACTCTCAATGTTATCATAGTGTCAAACCTTAGCTGACTGCTTCAGGTTTTTGGCAATTCAAGTTATTCTGGGAATTAAACAGTTCACATTGATAACAGCATGGAAGCAAGGTTTAGAATTCTTTGGGGGAGGATAATCAGGTACTGTGACTGTCAACATCCAGCAGTCATCTCTGTTGAGAGGTGATTGAAGCATCATCACGTACCTTGGACACACACAAGACAAACATGATATTATGTGACCAAGAATTTAATTATTAACAAACCATAAAATATAGGAAAGAGAAATACAGAAAATAGTATTTAGGCTCCATTGTAAAATTACACTGACTGATTTTCTTACTGTCGAAATCAGTTTAGAACATACTCCTGTGATACCAAGATATGATTTATAAACTTGTCATTCATTCATTAAATAGTTATACAGTAACTATTTTGCTTCAGATTCTCTTCTGAGAATAAAGATATCCATCTATTTTTATTTAACAAATATTTGCTGAGTTCCTATAATATGCCAGGTACTATTCAGACCACTAGGGAGAGAGAAAAGTATACTGTCTGTGGCTTCAAGAAAACTAGAATTTGGTAGGGAAAGAGAGGTAAACAGACAATTGTATTTCATAAATATTTGCTAGACGTGAGGCCAGGGTGCCAGGGGACTAGTGAAACACACAGGAAGAATACTAGAATCATGACAGAGACAGAGGAATGAGGGCAGAATCCAGCATCTGCAGAGTCTTCTTAAGTAAGGCTTTTGTTGAATCCTTATTATGATTCAGGCATTGATTAAGCTTTATGTGTTTTAACTTAGTCCTCACAGTAACAGTATAAGGGAACTAATGTGGTTAGCCCCATTTTATAAATTCCACAAGCTATCAGTAATTTGCCTAAGGCTGCATAGCTGGAAAAGGTCAATCCAGGAATAAAACATAGGCAGGATGGTTCTGATGAGGAGACAGTGACTAAGTCTTCAAAATGAAGAAGACCGAGGGTACTCCAGAGAGCATAAACAACATGTATATTTGCCAGGAGTCATCAAAATGGGTGGGGGGTGTACACCTAAATGTACAACCTATTTCTCAGAATTGAAGGCAGGAGAACAATGAAAGATGAAGTTAGAAAGGTAAACAGAAGGAGATCAAAATAGCTGTGTGTGTTTTTTTTTTCCTTGAAAGCAATAAGAAGTCATTGTCAGTATATAAGGACAATAATGACATTATCATTTTAGAAAAATTACCCCAAGTCACAGTATAGGAACAACACATTGTTAAGTTGACAAGTCTGGAAGCAGAGGGGCCAGATGGATGCTTTGCCATTTATTAAAATATTAACAAATACTTAAGAGAGTATGAGCCAGTCTTCTTAGCCCCTTGCATATATTAACTCATTTAATTCTGACAACAACTCTGTAAACGAAGTGCTCTTATTAACCTTATCTGACGGACAAAGAAATTAAGCATATAAAGGTAAATAATTTTTAAATATTACACTGCTAGCAAGTGAGAAGGCTGAGATTTGAACCCACAGTCTAGATCTTGATTCTGTACGTTATCCACTATACTATGATTGAGAGAAAAGGTATATTGATGGTTTTCATCAGGTTCTCAAAAGGATCTTCTGGGAGAGAAATAATGAGGTCAGGATCAAACCAGGGCAAATGGAAAGGCAACTAGAGGGAAATTTTGTGAACAAAGAGTTAGAATCAACAAGAGATAACCACTTATTTAGAAGTAAACTCAAATATATTAGAAATTCTGGGTTGACTAATTTTGATATTTCTTAAAATCTGCAACATGAGAAAAGAAACAGGCTTAGGAGGCAAGATTTAGTTTGAGCATATGGACAGAGGTGACTACGGAAGGCAGGGGAATGAGTCTGGAGTTCAGTAGTGAAATCCTGAGGACCATATAGATTGATGTGTCCTCAGAGGAGACAGTTGGTAAAGCCATGCTGTTCAGTGGACTCACTGAACGTGTGTATAAAGCAATGACAAAACCATTTGGGGGTTATAAATCCATTCAAGAATCTGATAAAAACTAGTCTACCATTACTTAGTGCAACTACTTGGCACAAATCTGTGTACGATTTCAGGGGATAAACAGAGTGAATTACAGAAATCCATAAAATACAGAAATTACATAATATGAACTCCTTTTAAAATATTAAGAATGTGAATCAAATACAGAAAGTTGGGAGTTCTTTGAGGGACAGATAAAGGAGACCAAAATAGCAGTTATAAGCAGAGAGAAAAGACTGTTATGTAGGGTCTATTTTAGTGGCAAAAAAGCAGAAAGTTCAAACAAACAAACAGACTGAACTTTGAAACTGGGATGTCACCTTCCATAGGGAGAGTCTGAATGAACTGTAGAGCTCAACTGCATAGACTGCAGGCTAAAATGATAAGATGAATTAAAAGCAGAAACTGTTGTCTCGTGCTCATGCTCAGTTGCTTCAGTCAGGTCCCACTCTTAGTGACCCTGTGGGCTTAGCTCACCAGGTTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGTTTGCCATTTCCTCCTCCAGGGGATCTTCCCAACCTAGGGATAGAACCCACATCTCCTGTGGCTCCTGCATTGCAGGCAGATTCTTTACCACTGAGCCATGAGGGAAGCCCCAAATAGTACTGGAGTGGATTGCCATTTCCTTCTCTAAAATGTTGTCCACCCCCATCCAAATGTTGAATGTGAAAGGGTGGATAGCAGTTTCAGGTAGAGAAGCACTCAGGGTAGAGAGGAATAAAAAGAAACTTAAAAATAAATACCAAGAGACAAGAGCATATTTATATGCTTAGCTCCTTAATATGAAGTATAAAAATTTCAAATCATAAGAAGCTTCTCCTGAAGTTTATTTTAAAAGTTTCTTTCATATAATCTGAAAGAGATAATGACTGATACTACAAATTTTTAAGCGATCTCAATTATTTGGTTTAATGTGTCTTTCCCAGGGGCTGATTGCAATGGTACGGAACGTTTGATCATTATTTTCAGGCTTCTGGCCTTCTGAAAAGGGGAAATGAGGCATTTGCTTCCTTTGCAGTGCTGAGGGGACATTTGGCTCTGTTCTCAGAATAATTCTACCATCTGAAAAGAATTTACCTCCCGTGCAGTGTCTATTGAGTTTGTGAAGTAAATCATTCAGTCAAGGGATGAGACAGCTTGAACTCCTGCAAGTCCCTTGAGTTAAGAACAACTCTTAAAAACATCACAAGCGATGGGAGGAAATTAAAACTTTTTGAATGTCACTCATATAAACATTTATAAAAAATAGAAAATATCATTTTTATTGACTTAGTAAAATATTTGGTTTCTCGTTGACTACTTGTAATGCACAATTTAACATTAGGTAGAAAGAGAAAGAAAAATACAGGAAGTCATCTGCTGAACACTACAGTGAGCGCTTGTTTCCATTTAATGAGGGGAATGCTTTATCTTGACAGAAAATTACATGTCAAACATTTACAATTTCCTTAAAATGAACCACACTTCTAGCACTTCCTTTCACAAAACCTAATGGCTTAAGGGGAAAGTGACTATTTATTTTTGGAAATGGTATGTTTCTCCTTTTTGGTGGAGCATGTTATCAGCCTTCTGAAAAGTCATAATTTCTGTTAAAAAAAATTGTGTGAATAGAAGATAGCCAAAATAATGATAACAGAATAAGAAATAATACAGTCCTTGACCTCTCCCATGAACTATTACTAAATCACATCTTTTGGGGGAAATTTGAAATTTTGTGGTTAATTCTCTTTTGGAATTACAGTTTCAGTTTCAGAAAACAAACTCTCTAAAATGCAGAGGGGTATCCCTTAACTCCAGCTGGGCCTGGAAGTTACCAGGGTGAAAGGCCATGAAAAAAGTGTTGCCTTGATGTTCTAACATTGCTATGAACAAACTCCATTCCGTCTTCTCTTGTACTTTAATGACCTGGTTGGCTAAAACAAAGAAGCACAAAATATTTTTAATAGAATTTTAACTAAATCATTTCCCTGGGTTCATCCATACTGAAGTCAAATTCAAGTTTTTTCCCTAAAGTCCAGGGACAAAATGGGTCAGTGGATACCAGTTACAAATAAGCTATGGTACTTTATACTAAGCCAAATAGCACCTATAATAACTCAGAAAGTAAGGAAAAATATTCTGTTAACATCATTCAGTATGCATGCATCACAGCAACCATAGAATGAAACCTTTATCAAAAAATCTCATATGCTTTGCATAGGTGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCTGACTCTTTTCAAACCTTGGACTATAGTCTGTCAGTCTCCTCTGTCCATGGGATGGTCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGGTTCCCATTCCCTACTCCTGGGGATCTTTGTTCCAAACCCTCAGCGGTTCTTACATCTCCTGAATTGGCAGGCAGGTTCTTTACCACTAACACCACTGGGGAAGCCACTTATGCTTTAAGAAGGGAGACAAAATAAACCTTGAAAAATGTTGCAACTAAACAGTTAGGTTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTCGCTCAGTTGTGTCTGACTCTTTGCGACCCCATGAATCACAGCACTCCAGGCCTCCCTGTCCATCACAAACTCCGGAGTTCACTCAGACTCACGTCCACCGAGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTCAGCCTCTGTCGTCCCCTTCTCCTCCTGCCCCCAATCCCTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCCAATAAGTCAACTCTTCGCATGAAGTGGCCAAAGTACTGGAGTTTCAGCTTCAGCATCATTCCCGCCAAAGAAATCCCAGGGCTGATCTCCTTCAGAATGGACTGGCTGGATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACCCTCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTTGGTGCTCAGCCTTCTTCACAGTCCAACTCTCACATCCATACATGACCACAGGAAAAACCATAGCCTTGACTAGACGAACCTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTCAATATGCTATCTAGGTTGGTCATAACTTTCCTTCTAAGGGGTAAGCGTCTTTTAATTTCATGGCTGCAGTCACCATCTGCAGTGATTTTGGAGCCCAGAAAAATAAAGTCTGACACTGTTGCCACTGTTTCCCCATCTATTTCCCATGAAGTGATGGGACCAGATGCCATGATCTTCGTTTTCTGAATGTTGAGCTTTAAGCCAACTTTTTCACTCTCCACTTTCACTTTCATCAAGAGGCTTTTGAGTTCCTCTTCACTTTCTGCCATAAGGGTGGTGTCATCTGCATATCTGAGGTTATTGATATTTCAGTTTGGTTTATCTATAAACAAAATATTGATTTTTTTTTGTTAGCAGAAGATTTTTCTAAAAGTCAAGTGCAAAGAAACTTTAATTTGTTGTTGTTGTTCAGTCGCTCAGTCGTGTCTGACTCTTTGTGACCCCACGGACTGCGGCTTGCCCGGCTTCCCGTCCTTCACCATCTCGCAGAGCCTGCTCAAACCCATATCCATTGAGTCGGTAATGCAATCCAACTGTCTCATCCTCTGTCATCCCATGTATATCATGGCTTGTAAAGTAGTACTCAAGTGTATCTCACAACAAGACTCAAAGTGACACAACTCTGGTGTCAGCCTTTGTTTATTTAAAACTTCAAAGTGACAGGCTTTGGGGTTTTTGTTGTTGTCAATTTTCATAAGCATGTGGCAACTGCTCTCTATGTTTACAGCATTGCCCAAGCACTTTCATTCCATTTCTAATGGCTTTTGCTGAAATTATTTGTCTACTCAAAGCACAAAAGATGCCCTTTAAGTCTTCCCACATGCGTGAGGAATGTTTTGTTGAAAATCAATATATTCCAGCCAGACTGAAAACATTACATGGGAAATTAACACACATGAAACACCTGAGATATATTTGTTAATGAAATGACCTTCTGAACAAATAACAAGGATCCTGTAGCACTCGTAACTGCCCATCAGGGTGCCTAAAGGGAAAACACAGGAATGAATTTTATAAAAAATGGATGCTCATTTGATTAAACAAAGATTGTGTGTAAATCCATTTTCAACTTTTAGTAATTTTTTTATTCTTAGTTGCTCTAAGTGTAATATGCATTGGATATACATTGAGTCACTTCACATTAGCAGTGTTCAAAAATTTATTTAAATATACTAATCAAATTAAAATAATATTATATAGAATTACTTCACATTTCGTTATTCCATACTGAAAAAAGCACCATAAAATTAGCAATCCATCTGTGACATAAGGTACTATGCATGTCCACATGGATTTAATCTTTTCTGTACATTATGCATGTCTCAATATTATTAAAATGTATATATTTACCTACAGTTATATATAATGAGTAATATATTGTTAAATGGAGAAGGAAGTGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTAGAGAATCCCGTGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTGCTGTCCATGGGGTTGCACAGAGTTGATGTGACTGAAGTGACTTAGCATGCATGCATGTATTGGAGAAGAACCTGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTAGAGAATCCCAGGGACGGAGGAGCTTGGTGGGCTGCCATCTCTGGTGTCACACAGAGTTGGACACGACTGAATCAACTTAGCATCAGCAGCAGCAGCAATATATTCTTAAATAATGTGTCTCTTTAAGTAATAAAATTTTAAGAAAATTTTAAAATATTATGATGGCAAATTTTGTGCAATATTTTCATCCTCTTCTCTGTTTTTCCTGTAATAATACTAAATAAAATGAAGGCTTTTTAAAATAATTTAATTATCATCAGCATATAATTTGTACCATATTACTATGATGCCTTTTTAAATGTATATAATTTATCCCTTGTATTATATACTGCCTAAACTATAATCATTTCTTATTTTTGCCTACTTTAGAAAATTGATATTGTTTCCTCATAAGAACAAAAAGAACTTTGAATTATCAATTTTATCATTGTTCCTTGGCCTAATTCTAGAAGATGAGCACAAACACACACACATGCCCATTCTCAACTTCCCAACCAGCCTTCCTCTAAACTTGTAGCTTCTAGCAAATGGTCCATAGACTGGAGGATCAAGTAATTAGGCTTTATAATGTGTAAGACTAATGGGGAAAAATCCTGATCAGCATGACTTGTAGGGTACGGACATTATTACATTCAGTATGGCTGCTCAGGGACCTCTTACTTCCTAATCCTCTGCTTTTGAAGTTGAGGGCCATCACTGCTTCACATTTCTGCTGAGAGCTCCCCTCTCACAGAAAGTTCTGCTACCTATACCTCTCTTCTATCTTGATCTCAACATATCTTCATCTTCTTTCTTGTCATTTCTGCATCCTGTCATTCTTTCCGTATTTCCTGCTTCCATGAGATGAGCTTGTACCCATTCATAATTAAGGCATGTGCTTATTCATGACCCACCTAAGACCTAGGTGGGACCTTTGCAGTTAAGATACGTATTGCTGGGTAAGCACCCTGTGACAAATGATGTATTAGAGTTCTATCTGAGTCTGAGATTACTTTAGAAGTCAGTAAGAAGTAGTTAAGATTTTTGGCTTTACAGTTAAAGACTTACACTACTTACAAGTTTTGGCGAGGTTAGCATCTCAAAACCTCAGTTTTCTCATATATAAAATGACATGTTAATAAATCCATCTCATAAGATGTTTATGAGTATGAAAAGAAACATATAAAGCATACTTAGTGCGAGAAATTCAGAGTTAAGCACATAGTATCAAAGCTGATTGATTTGATCACAATTATTAAAGTTCCACCAAGATGATAGTTAAGATTTTATACATTATCTACAAAATATATACATGTAAAGAAGTGAGAGTAAAAACAGTTTTTTTAAATAAAAATTTAATTAAAATTATCATGCAGCAAGTAAAAAATATTCAAATGTTCCCTTATACCACAGTTAACAGACCGTGAGTAAAAGGAGTAGTAGATTCTCCAAAAGGAAGCCTTTAGCTACTTAACTGAAGACTTCAAAGTATTTATAAATGTATGCTTGTTATTTTGTGACATAGCAATTTATATTACATATGTATTAGACTGCTGCTACTGCTACTGCTAAGTCGCTTCAGTTGTGTCAGACTCTGTGCGACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCCGTCCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAATGTATTAGACTAACCATAGGTAATTGCATTTTTGTAGGTTGAAAACAATCATGTAGATATCAACCCACAAATATTAGGTTCATATGCATATATATTTTATGAAATAAGACCAATTTTGAAGCTTTTAATTTATAAGCTTAACAATCTTATGTGTTTATATAGCTATACACATGTGATGTATATTTATGAAATCATTGGGAAGTCATCCTCACCCACCCACAAAATATTGAAATATTGAATATTGCCTACAAACCTTTAAAAAATGTCTACACCCTTGAATTTTAAAATATTGCCTTCTCCCACTTCTCAAAGTCCTTTCAAATTAATTAGGATATCAGGGAATTTCTTCAGATGGCTTTTCCACAAAATGCCCCCACACCTGAAGAGTAAAGAATCTAATCAGTCTTGCTTGTTTGCACCTTGCCAAACTGCCAAAGAAGCAGTTTTACTCATTGTATGTTCAGTTACCTTCAATGACCTGTTGTGTTGAAAATCACAGGCTAAAGGTCAGTTCCTAGTACTACCATCTCTTTAATGCTAATAGCCAAAAATGTACCACAAGGAATATCCTTAAACCAATAATGTGATCTACATACATTCTGATGTTTTCTAAATACTAGAGAGATATGAATAACTAGCCACATGTAAGATTTTAAAAGAATAGTTGAAGAATTGATCCCTTTATAGCAACTTAGAAAATAAGTAGGATCAAGGGCTCCTGTTTTTGATATTGTCTCTGGTAGCAAGGCTAATTAATTGTCTTCTGTGTTCTCTGCTAGGTTTTTTGAGACTCAGAATTACCAGTTCCACATTCCAGGAAGTTTTCTCTTGAGGGTTCATCTGAATTGAAGTGACCCTCTGCCTTAGCTTTCACACTTCTTCCTTGAAATTGGCCTGGTGGCAGACATGCCATCTGATTGAAATTGGTTGAGCAAATGAAAGGGAAGGACCAGATAAAGTTAACAGCTGCTAGAGTCAGTGTCTCATATTGCTTATTGACTCAGTGTTGGCTGGTGAAAGACAGACATGCACCTGCTTGTGTCTCTGTTAAATCACAGAGATTTGGTTGTATAGATAAGGAATGAATAATGATTCCTTTGTCAGGCTTTTCTAGATTTATTTACTGATATTGGTATGGGTAAAGCTCTTAAATTTTAGTTCAGAGAGCTTTTTTACATGTTTTAGTCATTCAGATGTTATCTCTTCTGAACAGCCTTCCCCAAGTCTACTTGTCAGAAATAGCCTGTAGTCTCTGTGCCTACTGTCAATGCACTTGATGCTTACCTGCAAAACAGTAATTGTGTGCATTATCTGTGTTTGGTATTATATTTGAACTGGTAACATTAGACTGAGAAGCTGTTTCTAGCCATCTTGTAACCAGGTAGAGAGCCAACAACAAATCAAGAAAAAGATAAGGAAACCAGTTCTTGATCACACTGAAACCTGATCATGCTTTCCCTAAAGCTCTGTCCTAGATTGTTCAGTTACATGATTCAGTAAATTATCTTTTTACTTAAGCAAGCTTGAGTTGGGTTTTCCGTATCGTGGAGGATACTACCCATGGTTATAGCTATTTTGAGATATCATGGAAGACCTACAAATGGGTCTTCCTCTCATCAGACAGTGATCACATTAAGGGCAGGTTGTGGTTTTCTTATGTCTATATCGCCATTGTCTAGAAAAAGTCATGCAAATAGCAGATGTTTAATCAGTATTTACTGAAACTGTCAATATAGGATGGGTTAAACTAAGAAGGAATAACACGCAGTCTTTTTATTTGAGAAACCAATTTAAAAACCTCAGTCTACTTGTCTTGTATTTGTTGTTGTTTAGTTGCTAAGTCATGTCCTAGTCTTTTGCAATCCCATTAACTGTAGCCTGCCAGGCCTGGGATTTCCCGGGCAAGAATACCCAGGGATTGAACATGTGTCTCCTGAATTGGCAGGCAGATTCTTTACCACTGAGCCACTTGGGAAGCCCATTTTATGTTTAGGCTTTTAGTAATTTTTAATGATGACAACAGAGGGAAGATAGTGGGATCAATAAGAGAAGAAGAGAACATCGGTTTTGGAGAAAATATTAGGTGACATTAAACAAATGAAGTTGGAGTAGCATTAGGAACTGCTCAGTGTAGAAATGTGAATCTGGAAGTCATGAGGGCCGCAAACACAGTGTCAGAAATGCTTGTATCTTACAAATCTGTGTAAAAGTCTGAAGCCATGGAAGATGGTTTGCAAAAAGAGCAAATTAAAAAGGAACAGAGATCCAAGAATAGAATGTTGGGGAACATCTATTGGTAGGTGAAGAGAGGAACAGAACCCAATGAAGAGGAAAGAGAAAGGACAACTAGAGAAATAGAAAAAGGGACTAAGAGAGTCAACAAAAAAGGCAAGGGGAAAGATAGGCAAAGGAGACTTATTTCAAATGTCTTAAATCTTCATGGCAAAGCATTAAAAAAGTCACATATAAATAGTGAGAGAAGACAGGAGTAAGATTTAGTCTTGAAAAAAGTACAAAGATTTGAAATTCACTTTTCAAGAAATGTAATAGAAAAAATGTCTGTTAGAAATGACCAAGGTTTTGGCTGAGCAGCATAGAGAACACAGCTGAGGTTAGAAAGCATGCGTTTGAATGGCATTAAACAGCTTCACTTTAGTGTTTGCAATCTAGAAGTGGAGGTGAGAACTTGAATAAACATCCTCCCTGGGGTCAGGATTTACCCATACAAGGTAGGGCTACTGGCTGAAAGGACAGTGGAAGGAAAGCACTAGCAGTTCCACCTGAACCGTTCCCTCATGTCTCACTCTCAGCCTGAATATAGGAAGAAAGAAAAAGGAGGTTAGGAGGAGGCAGATAGTAACAGTGGGGATCTAGACCCTAAAAAGAAAGACAAACTCATTAAGAATTAAAGAATGGGAGAAGAAATACAAGAGTATGTGGTCAAAGAAGGAACTTTCAGAGGTAAAAATCATTTTTAAAAAAATGTATGCTTTAAACCAGTGTATTATTATAACAAGTTAAACTACGTTTTCAGAAATTAAAACACCATATCATATGTCCAGATCACCCCTCCCTGCTCTGTCCAGCTGATGCTTCTTTTATCTTCTTCCATCAGGTTTTTCATGTTTGTCTCTTGCCATTTATCTTATATTCCTCCAGGCATTATCTTCCATCTTATTGAATCTCAAGACCTCCTACAAAAATTTATCCTTGTTTCTGATCATTTATCCTGTTCAGTTAATTCATCTTTGTTATGGTCTTTCTATGTTTTAAAATGTTTACTATCTCTAGTTTTACAATATCTGATAATAACATTAAATTTTGTATTCTCCAATATTTGACAAAGAAAATAGTCATGAAAATTGGAGTTATAAGATTAAAATTTCTACAAGCAGCATCAGATCAAATCAGATCAGTCGCTCAGTCATGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGAATCACAGCACGCCAGGCCTCCCTGTCCATCACCAACTCCCGAAGTTCACTCAGACTCACGTCCATCGAGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTCATTCTCTGTCATCCCCTTCTCCTCCTGCCCCCAATCCTTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCCAGTGAGTCAACTCTCCGCATGAGGTGGCCAAAGTACTGGAATTTCAGCTTTAGCATCATTCCTTCCAAAGAAATCCCAGGGCTGATCTCCTTCAGAATGGACTGGTTGGATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCTCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAGTTCTTCAGCGCTCAGCCTTCTTCACAGTCCAACTCTCACATCCATACATGACCACAGGGAAAACCATAGCCTTGACTAGACGAACCTTTGTCAGCCAAGTAATGTCTCTGCTTTTGAATATGCTATCTAGGTTGGTCATAACTTTCTTTCCAAGGAGTAAGCGTCTTTTAATTTCATGGCTGCAGTCACCATCTGTAGTGATTTTGGAGCCTAGAAAAACACGCAGCATATTGGTATACATATCATATATCATTTCATCTGAAATAATTTTTAATTCTTAATAGATAAAGCTCACATTATATAGCAAGATTGGGCTTTCCTGGTGGCTCAGACAGTAAAGGATCTGCCTGCAATGCAGGAGACCTGGGTTCAGTCCTTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGCATGGCAGTCACTCCAGGATTCTTGCCTGGAGAATCCCCATGGACAGAGGAGCCTAGTGGGCTACAGTCCATGTGGTTGCAAAGAGTCAGACATGACTGAGTGACTATGCACATATAGAAAGATTAGATTACTGGGTTTCTTTGACTTAGTAGTGATATAACCTGGTGTAGTCAATGAATGAAATAATGCAGTTACCCAACTCTGACAGGGAGGGGCCAACTTGATATAGTCCTAAATGTAACCAAATACAACTTCCCTGCATTTAGTCAGCTGCAGTATTTGGATTTGAGGATGAAAGACAGTAGCATCCACCACTCCACTGAACATCCATCCTATCCAACTTTTCCTTTTTTTTCTATGTTGTTGAAAATATGTGTGAAACAGCTTCCCTCTTCCCACACAATAGCCTTCACCCACATGTGTGGTAGATTGGCTAGCCTTCCACAGCCTAAATGTCTTTTCCATAAGAAAGAAAAAATAGTGTTGCCATCAATGATATTATTACCATAACACTAACTACCATTTCTTGGTACTTACCATAATTCAGTCACTCTGTTATATAATTCACATACTTGCCTCATAAGTACCCCACTTTATACACTAAAAGGAAAGCAAAAGGAACTGAAAATCAATCTACTCCTATAGAAGGGGTCATCAGACCATAGACTATTATACAGATGTAAAGGTAAGCTCTGAATGAAACTTTTAAATTGCTTTTAAATGCTGTAGTATTCTAAGTGTAGTCTGGATCAAAATTTCAAGGATTCTGTTACTAATAAGTGAGTAAGTAAAAACAAGCAGTCTAATCTTTCTGGAAATAATGTGTTTCGATTTTTCAAAAACACCAGACTGTATTTCAAGAAAATGAAATATCTATATTAGATATGGTGCCATAACTACAACATGTCCATAGTATTGTACCCCACCGTTAATCTGTCTCCTCCTAACCTCCTTTTTCTTTCTTCCTATCTTCAGGCTGAGAGTGAGACATGAGGGAACGGTTCAGGTGGACCTGCTAGTGCCTTCCTTCCACCGTCCTTTCAGCCAGTAGCCCCTTGTATGGGTAAATCCTGACCCAAGGGAGGATGTTTATTCAAGTTCTCACCCCCACTTCTAGACTGCAAACACTAAAGTGAAGCTGTTTAATGCCATTCAAATGCATGCTTTCTAACCTCAGTTGTGTTCTCTATGCTGCTCAGTCAAAACCTTGGTCATTTCAAATAGGCTTTTCTTTTCTATTACATTTCTTGAAAAGTATATTTCAATTCTTTGTACTTTTTTCAAGATACTACTTGTACCTTTTATGGTAGACTCCTCAAACCATCTTTCTAGTTATAAGACTTACATTCAGAGCTTGAACATCATTTTATAAATTAGTTTCCAGAAAATAAGACAATATCTAACTTTTTATTTTTTCTGTGTTATTGAAAATGTGTGTGAAATAACTTCCCTCTTCCCATACAACCTTCACCCGCATCATCCTGAAGAGGAAAAGAAAAGGGGAAGGGAAGTGGCAGAGAAGTGGGAAAGGAATGTATTCGCCTTGCATAACTAAATAAGGGAGGGCAGGAAGTGGTACATTTAACAAGGAAGAATTTTCTCTTTCTTTGAAGAAACGATTTTCTCCATCTCTAACCCAAAAAAGAAAAATGGGTTTACCGTTAAATTCCTCTTGACCACATCTTCCTGTGCTGTGGATGCTCTCACGGGATTATAAATTTTAGTTAATATTTCTTTACATCCCTTTTTTATTGCATCTGTTTTGGTTATTTTTAATTTTTCAACAGAAGAACAAGCATTTACAATTTAGGAAAGTTTACTTTAGAAAAATAATAGTCCAGTTAGCTTAAAGTAAGTAAAGCACAAATGAAATGCACTGATGTTTTTAAAAAAAAGGCCTTTGTATAATCCATTGACACGCCCAATGCCATTAAAGATGGCTTTTGAGTACATAAATGCTCATTTTCAATTGCTATCTGCATGCATTCTGTGCAATACTTCTTTACTAGCATATGAACTGTTAGTCCTCTGATTACTTATTTTGTGTTGATACTGCAGTTGTGATGATGATATTTAGAGGTACTTTTTAGTATAAGTAAGCAAAATCATTAGTGTAAACATGAGCTATGTAGAGAACTATAATGCTATTAAATGTTATAATTCTGTATTTTTGTTATGGCAACATATCTGACATGGATATTTCATTTACTTGAATCATAGTTATTTTTGAAAATTTGAAAAGTTTATATTGAGATAGTCATTCTTTATATAAAGATTAGACTGTTCATTTTTAATTACATATAAAGTAGTAACATTGTGTGTCAAATTGAAATCAGATTAAGTATTTTAGATTGTTAGAATGTTTAAAATCAATTTAAAAGCATTAATTCATAGTTTACCTTTGATGTTATTATTTTAAAATATCATTGTGATGCAGAGTGATTTAAAGCAGATAATGATTAAATAACTAGAGACTTTAAGGGCAAAATTATAAAATATTCTGAATCTTAACTTCAAGAAAAGGGTAATGAAGCAAATTGCTAGAATAATGTATATTTATTAGAAAATACTAAATCATAAATAATTTGTATATATGCTGCATATATTTTTAGCTAAAAACTATTAAATGAATCATCTTTGTATTTTGATCTCATAATAAGAACTTAATAATGGATGAAGATCAGTGAATGAAATAAAGTTCCTCCCAGTAGAGACTATCTCTAATTAAATTTATTTTTCTATTAGACTTCCAGCCCCTATTTAGCTCTTCCACTTATATAACTTAATTTCAAATCTTACTGATTTTTGTTCTTCTATTTTTATGTCATCTACCTGATAGCTTAACTTCAGGCCATTAAATAAAAATCAAAATTCACTTCCCTTTCACTCTAGATACTCAAATTGGATCAGAGACTTCTATTTTTTATTTTGAGAGTTTTCTAAAACTAAAAAATTCTAGAACTTCAATATAAAGCCCCAGAAAAATAGTAAATCCTTCTTTTAGCATATTAAACCTTTATATTGTATTTTTATATCTGAATTTATCTTCAACTCTTCCTGCTCCAAAAATGGTAGCATTTTTCAAACTCTCCTATAAAATGTAGCTAAGAAGGTTTTAAAAATATTGCAGAAACATTGACATAATTGTTACCAATTGTCAGTATTTCAGGATCAGATTATCTAACTATTGAGTTGATGTTCTGAAAGTGATAGAGAAAAACAAGATTTAAGAAATTAAGCCAAACATGAAAAAATACTCAGTTATGAATTAATCATGTTTTTCTTATAGTTTTATAATTCTGTCACTTCAAAATCTAGCATTGTTCCTATGATTGATTTTTCAATAAATGCAACATTGACATTTGTTTGGAGGAAATGAAGACTCACTTGGCTATACTTGAAGTCCATTTGGGAACTAATGGTACTGATATTCACATATTGTGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAG
Seq C2 exon
TTTTACTAAAGGGAGGAAAAAAAGAGGAAGAAAAGCCATTTAGAGACTGTGCAGATGTATATCAAGCTGGTTTTAATAAAAGTGGAATCTACACTATTTATATTAATAATATGCCAGAACCCAAAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000014051:ENSBTAT00000018675:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.192 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF089195=F_actin_bind=PU(96.1=62.8)
A:
NA
C2:
PF089195=F_actin_bind=PD(2.0=2.3),PF0014713=Fibrinogen_C=PU(14.0=69.8)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development