BtaINT0039275 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000010948 | CLIC2
Description
Bos taurus chloride intracellular channel 2 (CLIC2), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001081727]
Coordinates
chrX:38498587-38511897:+
Coord C1 exon
chrX:38498587-38498884
Coord A exon
chrX:38498885-38511787
Coord C2 exon
chrX:38511788-38511897
Length
12903 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGT
5' ss Score
11
3' ss Seq
GCCTTTCTTTATCTTAATAGGCT
3' ss Score
9.55
Exon sequences
Seq C1 exon
AAATGTTAGGTCAAGAGGAAGAAGGAAAACAAATTCAAGAGCCGCTCTCAACCATCTAGAATTTTCTGCACCCCTCCTCTTGAAGAGAGACTAGCCCAGTTCTGACTATTAGAAGCTGGATTTCCCTCTTAAAGCACAACCTGCATTTAAGCCTTTGGATAAAATTGGAAGAAACCAATCTGTGAGTACTGTGGACTGTGCAGAAGGCAGAGGGCTGACAACTGCCACTAAAAACAGACAGATGGCAGGCCCAAGGCCCAGCAGTGAAGCAGACCCTGAAATTGAGCTTTTTGTGAAG
Seq A exon
GTAAGTTTCTAGCTCTAATGACAGCATACAGAATGTATTTTTTCTTGACACTGGACCTCAGCTCCTTTTTAAAAAGTCAACATTTCAGCTAGAGATAGGAAATAAATTTGCGATTATGTACCTACTCTGAGTCCTTGAAAAATGCTTGGGTGTTTGGCTGCTCTTAGATAGCAATAGAAAAACATCCCATCTGAAAAACGCAAGAAGATATGGTGGAAAGACAACTAGACTGGTTAGTAGTCAGAACAACTAAATTGTATTCTCAGTGGCTTCCTTTGTAACCGTGGACCTCTTTGTTTCTCTATCTATACAATGAAGTATCCTGACAAAATGATCCTTAATTCTTTCCAGGTCTCACAATCTATGTTTTATTGGATAGATTTTCGAAGGCCTGAATGTGAGGAGAGGGCCAAAAATGGCCCAATAGCCTCATTCCCACCCATGATCCAAATAGAGCTTTCTAAAATTCTCTTACAATGGATGAACATCACAGCAGTGTCACATGAACACCATAGGAGGGAAAAGCCAGGAGTGTTTGTGTGCCTGTTATGTGAGCAGCAGGCATTTTGCCTTGGTTTTTTTTAAACATCTTAACTTTTAAGAAAAGCCCTTTGGAAAACCCCTAAAGCAGGAGAAAGGAACATGTGTTTCTAAATTAGCTCATCAAGAAAAAGAAACAATTTGTATGCGTTATTCCAAGTAGAAACTACATAGTTTCCTAAATCTTTGCCTATATTAACTATTTTCTATATATTTTCATTTACTATTGGAAGTATTCAGGATGATGATAATAATAACAAATTCATATTATGCTTGACCCTTTTCTAAACACTTTACATATATTATATCCTTTAGTTTAGGAGGATAGGTTAATAAAAGTAAAGTAGTATTATACGTAGTATTGGTAGTAATATCGTTCTCATGATTTCTAGATAAGTAAGCTAAGGAAACAAAGGTTAAGTAATTTGCCTCTAAAACTACATCTCCTCTTGATGGCCTACAAAGACACAAGTAAGGCGTGCTTATCAAATATTAGATTAAACACCTGTTAGCCAAAGTAATACTTTTATACCCTGGTGACTCAGACAGTAAAGAATCTGTCTGCAATGCAGGAGACATAAGAGATGCACATTAGATCCCTGGGTCAGGAAGATACCTTGGAGGAGGGAATGGCAACCCACTCCATTCTTCTTGCTTGGAGAATTCCACGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTATAGTCCATGGCGTCACAAAGAGTCAGACACGACTGAGAGACTAACACTTCTACTTTCACTTTTTTTTTTTTTAACATATATACACCAAGTACATAGTTAATCTGCCTTTTCAAAATTATGGGGGAGAGAGAGACTCTTGAATTCCTACACAGAAAAAGAATGCAACTAAGTGTTTGCTGGACTGTGGGGCATAAGAGCCACTTCTCCTACCTCTTGTTATTGCTGTTTAGTCACTCAGTTGTGTCCAACTCTTTGCAACCCCATGGAATATAGCCCGCCAGTCTCCTCTGTCCATGGGATTTCCCAGGCTAGAGCCTAGAGTACTGGAATGGATTGCCATTTCCTTCTCCATCTCCTACCTCTAGATTCCAGCAAATCTAAATAAGCCTTAACTTCCTAACTGGCTTTTTATACCTACCAATTTCAAACCAGAGGTAATAAGTCTCTTCATAGGGTAACTAGTGTCTTTTGTCTAAACTTATTTATTCAATCCAACAAAATTCCTCTAACCCATTGCTGGCACTGATCTGTGTGTTTATCTTCATAGACTTCCTATGATTTGCATGGTTATCTAGACAGTAGAAGTTAGGAAGTCACACGTTGGAGGAGCAAATGTTAAATTAAACAATAACTTTCAGGTTAAAAACTGATAACTTACTGAGTACTTACTATATGTCAGGGCCTGTGCTAAGTGGTTTATTATTAACTCTATTTTATGGGTACAGAAACTAAATAAAAGAGTAGCTAGGTGGTTTTGCCTAAGGTTACATAGCTAATAAATGGCTGGGTTAAAATTCCAGTCCTTTTAAATAGCTGTTTTGTGTGTGCATATTCAGTGGCTAAGTCATGTCCAACTCTTTGCAACCCCATGGACTGTAGCCTACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCTAGGGGATCTTCCAGACCCAGAGATCAAACCCACGTCTCTTGCATCTCATGCATTTGCATGCAGATTCTTTACCACTGTACCACCTGGGAAATTAAAATAGCTGTGCATAATCTTAATTATTTTCACTTGGGCACACTTTTTAGTAAAATTTCTCAGAATTTCATTAGATGAAATCCTCTAGATGTAAGCTTATCTAATGATGTTGACACAAGTCACAGATTTTCTGAAAGAACCTTGACTATCATCTGGTCTGGGTTTTTGTTTTGCTTTGCTTTACAAGTGGTGCCAGTGGTAAAGAATCTGCCTGTAATGCAGGAGACATTAGAGAGGTGGGTTCAATCCCTGGGTCGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGAATGGCAACCCACTCCAGTATTCTGGCCTGGAAAATCCCGTGGACAGAGGAGCCCAGCAGGCTACAGTCCATAGGGTCGCAGAGTTGGACATGACTGAGTGACTTAGCATGCACACATGCAAGATTGATTCCAAAGATCTCTAGAAATTCTGTAGAAGATACTATGAGGGAGAATAGGGATTGAGAGAAGTGAAAATGTTAATGACAAAGCTTAAAAAGCAACTGTATCTCATTTATACTGTGGTGTCTTTCCCAGGATTAAATAACTGCAGTTTTCCCAGCTACCTCTAGGAAACCTACCACAATTTCCCAATAGCATTGATGGGATCCCTAAAAGAAAGTAAGTTTTTTCCTATCACAATTAAGAATTCATATCACACACACCCCTGTGTTCCATGTAGCTAGTGAAAACATTGCCTTTCAGCTCTGAATGACTTGGGCAAGATTTATATCTGGGAACTAAGAAAGGATTTTCTAAAAGAACACATTTTATTTTTTCTAGATGCAGAGGTTGTCTTATTTGTTTGCTGTTCACTGATAAATGGAGTTTTTGTGTTCTCTACTCTACTGGTCTAATGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTAGAGAATCCCATGAATAGAGGAGCCTGTTGGACTGCTGTCCATGGGGTCACACAGAGTTGGACACGACTGAAGCAACTTAGTAGCAGCAGCAGCAGCTACCAGTCTAAAATTAAGTTTTCACAGATTTGTAGATAACATGTGTGCTATGCTTAGTCACTCAGTCATGTCTGACTCTTTGCAACCCCATGGACTATAGCCCTCCAGGCTCTTCTGTTCATAGAGATTGTCCAGGCAAGAATACTGGAATGGGTTACCTTTCCATTCCAGAAATGCCTTTCTCCAGGAGATCTTTCCAACCCAGAGATCAAACCCAGGTATCCCGCATTGCAGGCAGATTCTTTACCATCTGAACCACCAGCAAAGCCCAAGACTACTGAAGTGGGTAGCCTATCCCTTCTCCAGAGGATCTTCCCAACCCAGGAACTGAACCGAGGTCTCCTGCATTGCAGGCAGATTCTTTACCATCTGAGCCACGAGGGAAGCCCATAACATTATAGACTTTAACATTTGGGCCAAAATCCTGAATAAAATATTTTTGTCTTTATTGATAAATTTGAGATAGAAAATGATACTATTCTCTAACCAGACTGTTTTCAAATTAGAACTATTATAAAGACAATCATAAAGACTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCAGTTGCTCAGTCATGTCTGACTCTTTGCAACCCCCATAGACTGCAGCACGCCAAGCTTCCCTGTCCTTCACCATCTCCTGGAGTTTGCTCAAACTCATGTCCATTGACTCGGTAATGCCATCCAACCATTTCATCCTCTGTCATCCCTTTTACCTCATGCCTTCAACCTTTACCAGCACCAGAGTCTTTCCTAATGAGTCAGCTCTTGGCATCAGGTGGCCAAAGTTTTGGAGCTTCAGCTTCAGCATTAGTCCTTCCAGTGAAAATTCAGGGTTGATTTCCTTTAGGTTTGACTGGTTCAATCTCCTTACTGTCCAAGCGACTGTCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGCTTGAAAGCATCAATTCTTCGGTACTCAGCCTTCTTTAGGGTCCAACTCTCACATCCATACATGACTACAGGAAAAACCACAGATTTGACTCTACAAACATTTGTCAGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTTAATATGCTGCCTAGGTTTGTCATAGCTTTTCTTCAAGGAAGAAGCATTTTAATTTCATGGCTGCAGTCAGTGTCTGCAGTGATTTTGGAGCCCAAGAAAATAAAATCTTTCACTGTTTCCATTGTTTCCCCATCTATTTGCCATGAAATGATTGGACTGGATGCCATGATCTTAGTTTTTGGACTGTTGAGTTTTAAGCAAGCTTTTCCCCTCTCTTCTTTTACCTTCATCAAGATGCTCTTTAGTTCCTCTTCGCTTTCTGCCAAAAGGGTGGTGTCATTTCTTATCTGAGGTTATTGATAATTCTCCCAGAAACATTGATTCCAGCTTGTGATTCATCCAGCCTGGCATTTCACATGATATACTCTGCATAGAAGATAAATAAGCAGGGTGACAATATACAACCTTGGCATACTCCTTTCCCAATTTTGAACCAGTCCATTGTTCCATGTCCAGTTCTTCTTGACCTGCATACAGGTTTCTCAGGAAGCAGGTAAGGTGGTTTGGTATTTCCATCTCTAAGAATTTTCCACAGTTTCTTGTCATCCACACAGTCAAAGGCTTTAGCATAGTCAATGAAGCAGAAGTAGATGTTTTTTTCTGGGATTTTCTTGCTTTTTCTATGATTCAAAGGATGTTTGCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGCCTTTTCTGATTAATAACAAATCCAATAAAAATATTAATTTGGAGAAAGCAGGGTTTAAGGAGTGTGGGTTCTGCAGTAGATAGTAATGGATTTGCTACATGAGAAGAGTATATGTGTTCAACTCTTGTCTAGGTGAGAGTACTTGAGCAAGTCAGCTTCTCTGAGCCTCTTTCCGTATCTGTATGGAGTAATGATAGAACCTCCCTCACAGAACCATCTTCACTGTAAGGATTAAATCAAATAAATACGTAAGACACCATAGTTTTTAACATAGTAAACAATAAATGTCAGATGTTGCAGTTGTTGTTATTTTTTACACTTAGAAACTTAGATCACAAACACAAAGAGAAAATGTTCTGGTGAATGACCACATCCTGTCTTTGCCAGCTGGAAGTAGGTAATTTATCAATCAGGCTTCACAATTTGTGTGTGTATGTGCTCACTCACTTAGTCATGCCCAACTCTTTGTGACCCCATGGACTTCAGCCCGCCAGGCTCCTCTATCCATAGGATTCTCCAGGCAAGAATACTCAAGTGAGTTGACATGCCCTCCTCCAGTGGATCTTCTGGATGCAGGGATCTAACCTGGGTCTCTTGTGTCTCTTGCATTGACAAGTGGGTTCTTTACCACTAGTGCCACCTGGAAAGCCCAACATTTTGTGTAATGGCACTTTATTTTTTATTTAATTTTTATTTTATATTGGAGTAGAGTTGATTTAGTTTCAGGTATACAGCAAAGTGAATCAGTTATACATATACACATATTCATTTTTTTCAGATTCTTTTCCCATTTAGGTTGTTTATATAATTTTGACCAGTGTTTCCTGTGCTATACAGTAGGTCCTTACTGGTTATCCATTTTAATTTTGAAATTAATTTATTTATTATAATTGGAGGCTAATTACTTTACAATATTGTGGTGGTTTTTGACATACATTGACATGAATCAGCCATGGGTGTACATGTGTCCCCCTGTGCCAAACTCCCCTCCCACCTCCCTCTGCATCTTATCCCTCAGGGTTGTACCAGTGCATTGGTTTTGAGTGCCCTGTTTCATCGAACTGGGACTGGTCATCTATTTTACATATAGTATATACATGATTCAATGCTATTCTCTCAAATCATCCCACCCTGGCCTTCACCTGGTGGTGATTTAGTCGCTAAGTTGTGTCCAACTCTTATGACCCCATGGACAGAGGAGCCTGGCAGGCTACAGTTCATGGGATTCTCCAGGCAGGAATACTGGAGTGGGTAGCCATTTCCTTCTCCAGGTGATCTTTCCAACCCAGGAATCAAACCCGGGTTTCCTGCATTATAGGTGGATTCTTTACCAACTGAGCTACAAGGGAAGCCCTCGCCATCTCCCTCAGAGTCCAAAAGTCTGTTCTTTATATCTATGTCTCTTTTGCTGTCTAGCATATAGGGTCACCATTACCATCTTTCTAAATTCTGTATATATGCATTAATATACTGTATTGGTGTTATTCTTTCTGACATACCTTACTCTGTGTAATAGGCTCCAGTTTCATCCACCTCATTAGAACTAATTCAAATGCTTTTTAACAGCTGAGTAATATTCCATTGTGTTTATGTACCATGGCTTTCTTATCCATTTGTCTGCTGATGGACATCTAGGTTGCTTCTATGTCCTAGCTATTGTATACAGTGCTGCGATGAACATTGGGATACACATGTCCTTTCAATTCTGGTTTCCTCGGTGTGTATGCCCAGCAGTGGGATTGCTGGGTCATATGGCAGTTCTATTTCCAGTTTTTTAAGGAATCTCCACACTGTTCTCCATAGAGGCTGTACTAGTTTACATTCCCACCAACAGTGTAAGAGGGAGCCCTTTTCTCCACACCTTCTCCAGCATTTATTGTTTGTAGACTTTTTGAAAGCAGACATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCGTTTTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATAATGAGTGATGCTGAGCATCTTTCACGTGTTTGTTAGCCATCTGTATGTTTTCTTTGGAGAAATGTCTGTTTAGTTCTTTGGCCCATTTTCTGATTGGGTCATTTATTTTTCTGGAATTGAGCTGCAGGAGCTGTTTGTATATTTTTGAGATTAATTCTTTGTCAGTTGCTTCGTTTGCTATTATTTTCTCCCATTCTGAAGGCTGTCTTTTCACCTTGCTTATAGTTTCCTTTGTTGTGCAAAAGGTTTTAAGTTGAACTAGGTCCCATTTGTTTATTGTTGCTTTATTTCCATTACTCTGGGAGGTGGGTCATAGAGGATCCTGCTGTGGTTTATGTCGGAGAGTGTTTTGCTTATGTTTTCCTCTAGGAGTTTTATAGTTTCTGGTCTTATGTTTAGATCTTTAACCCATTTTGAGTTTATTTTTGTGTATGGTGTTAGAAAGTGTTCTAGTTTCATTCTTTTACAAGTGGTTGACCAGTTTTCCCAGCACCACTTGTTAAAGAGATTCTCTTTTCTCCATTGTATATTCTTGCCTCCTTTGTCAAAGATAAGGTGTCCATAGGTGCATGGATTTATCTCTGGGCTTTCTATTTTGTTCCAGTGATCTATATTTCTGTCTTTGTGCCAGTACCATACTGTCTCGATGACTGTAGCCTTGTTGTATAGTCTGAAGTCAGGCAGGTTGATTCCTCCGGTTCCATTCTTCTTTCCCAAGATTGCTTTGGCTATTTGAGGTTTTTTGTATTTCCATACAAATTGTGAGATTAATTGTTCTAGTTCTGTAAGAAATACCGTTGGCAGCTTGATAGGGATTGCATTGAATCTATAGATTGCTTTGGGTAGTATACTCATTTTCACCATATTGATTCTTCCAATCCATGAACATGGTATATTTCTCTATCTATTTGTGTTCTCTTTGATTTCTTTCATCAGCGTTTTATAGTGTTCTATATATGGGTCTTTTGTTTCTTTAGGTAGGTTTATTCCTAAATATTTCATTCTTTTTGTCACAATGGTGAGTGGGATTGTTTCTTTAATTTCTGTTTTCTCATTGTTAGTGTATAGGATGCAAGGGATTTCTGTGTATTAATTTTATATCCTTCAACTTTACTATATTCATTGATTAGCTCTAATAATTTTCTGGTGGTATCTTAGGGTTTTCTATGTAGAGGATCATGTCATTTGCAAACAGTGAGAGTTTTACTTCTTCTTTTCCAATCTGGATTCCTTTTATTTCTTTTTTCTTCGTTGATTGCTGTTGCTAAAACTTCCAAAACTATGTTGAATAGTAGTGGTGAGAGTGGGCACCCTTGTCTTGTTCCTGACTTTAGGGGAAATGCTTTCAATTTTTCACCATTGAGGATAATGTTTGCTGTGGGTTTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATATTCCTTCTATGTGTGTTTTCTGAGAAGGTTTATCTTAAATGGGTGTTGAATCTTGTCAAAGGCTTTCCCTGCATCTATTGAGAAAATCATATGGTTTTTATTTTTCAATTTGTTAATGTGGTGTATTACATTAATTGATTTGTGAATATTGAAGAATCCTTGCATCCCTGGATAAAGCCCACGTGGTCATGATGTATGATCTTTTAATGTGTTGTTGGATTCTGTTTGCTAGAATCTTGTTGAGGATTTTTGCATCTATGTTCATCAGTGATATTGGTCTGTAGTTTTCTTTTTTGGTGTCATCTTTGTCTGGTTTTGGTATCCGGGTGAAGGTGGCCTCATAGAATGATTTTGGAAGTTTGCCTTCCTCTGCAATTTTCTGGAAGAGTTTGAATAGGATAGGTGTTAGCTTTTCTCTAAATTTTTGGTAGAATTCAGCTGTGAAGCCGTCTGGACCTGGGCTTTTGTTTGCTGGAATTTTTTGATTACAGTTTCAATTTCTGTGCTTATGATGGGTCTGTTACAATTTTCTATTTCTTCCTGGTTCAGTTTTGGAAGGTTATACTTTTCTAAGAATTCGTCCATTTCTTCCAAGTTGTCCATCTTATTGTCATATAGTTGTTGATAGTAGTCTCTTATGATCCTTTGTATTTCTATGTTGTCTGCTGTAATTTCTGCATTTTCATTTTTGTTGATTTGATTCTTCTGCCTTTTTTCCCTGATGAGTCTGGCTAATGGTTTGTCTATGTTATTTATCTTCTTGAAAAACCAGCTTTTAGTTTTGTTGATTTTTGTTATAGTCTCTTTGTTTCTTTTTTACTTATTTTTGTCCTAATTTTTATGATTTCTTTCCTTCTACTAACCCTGGGGTTCTCATATCTTCTTTTCCTAGTTGCTTTAGGTGTAAAGTTAGGTTATTTATTTTATTTTTTTCTTCTTTCTTGAGGTAAGTTTGACCATCCCCTTAGCACTGCTTTTACTGAATCCCATAGGTTTGGGGTTGTCATGTTTTCACTTACATTTGTCTCTATGCATATTTTGATTTCCTTTTTTATTTCTTCTGTGATTTGTTGGTTATTCAGAAATTTGTTGTTTAGCCTCCATATGTTTGTATTTTGAATAGTTTTTTCCCTGTAGTTGACATCTAATCTTACCATTGCAATCAGAAAAGATTCTTGAAATGATTTCAATGTTTTTGAATTTACCAAGGATAGATTTATAGCCCAGGATGTGATCTATACTGGAGAATGTTCCATGTGCACTTGAGAAAAAGCTGAAATTCATTGTTTTGGAGTGAAATGTCCTATAGATATCAATTAGGTCGAACTGTTTGATTGTATCATTTAAAGTTTGGGTTATCCATTTGAAATATAGCAGTGTGTCAGTGTCCATCCCAATTTCCCAATTTATCCCTCCTCCCACCTTCCCCCTTGGTAACCATAAGTTTATTTTCTAAGTCTAAGTCTGTTTCTGTTTGGTAAATAAGTTAATTTCCATCATATTTAGATTCCACATATAAGTAATATCATATGATATTTGGCTTACTTCACTCAGTATGACAATCTCTAGGTCCATTCGTGTTGCTGCAAATGGCATTATTTCATTCCTTTTTATGGCTGAGTAATATTCCTTTGTGTATATATACCACATCTTCTTTATCCATTCATCTGTCAATGCACAATTAGGTTGGTTCCATGTATTGGCTATTGTAAACAATGCTGTAATGAACATTGAAGTGCATGTACCTTTTCAGATTATAGTCTTCTCTGAATATATGCTAAGGTCTGGGATTGCTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTTCAGTTTTTTCAGGAACTTCCATACTGTTCTCCATAGTAAATGCACAAACTTACATTCCCACCAACAATATAGGAAAGTGAAGTCGCTCAGTCGTGTCTGACTCTTTGCAACCCCATGGACTGTAGCCTATCAGGCTCCTCCGTCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTGCTGGAGTGGATTGCCATTTCCTTCTCCAGGGGATCTTCCCGACCCAGGAATCGAACCTGGGTCTCCCGCATTGCAGGCAGACACTTTACCGTCTGAGCCACCAGGGAATATAGGAGGGTTCCCTTTTCTTCATATCCTCTCCAGCATTTATTGTCTGTAGATTGGTTATGGCCTTTCTGGCCAGTGTGAGATAATACCTTGTTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATAATGAGAGATGTTGAACATCTTTTCATGTGATTATAAGCCACCTGTATATTTTCTTTGGACAAATGTCTATTTAGATCTTATGCCCACTTTTTGATTGGGCTGTTTGGTTTTTTTATACTGAGCTGTTTGGGCTATTTGTATATTTTGGAAATTAATCCCTTGTCAGTTGCTTCATTTGCAAGTATTTCCTCCCATTCTATGGGTTGTATTTTTCTCTGGTTTATGGTTTCCTCTGCTGTGCAAAAGTTTTTATATTTAATTATATCCCATTTGTTTATTTTTGCTTTTATTTTCATTACTCTAGGAGGTGGATCCAAAAAGATCTTGCTCCTATTTATGTCATAAAGTGTTTTGCTTAAGTTTTCCTCTAAGAGATTTATAGTATCTGGTCTTACATTTAGGTCTTTAATCCATTTTTAGTTTATTTTTGTTTATGGTTTTAGAGAATATTTTAATTTCATTATTTTACACGTAGCTGTCCAGTTTTCACAGCACCACTTATTGAAAGGAGACTGTCTTTTTCTCTATTGTATATTCATACATTTTGTGTAATGGCACTTTAAATCAGCATTATTATAAACAACAGAAAAAGTTTCAGTTTTCCTGTAAAATTGTACTGCATTTCCCCCACACCTCAGTGTTCTGCCTTTCCTTTTACCAAAAGCAACCCACCCTTCCTGCTGTAACTATTATCAGACTTTATTGTTCTTCCTGCCTCCCACCGGTAATCAAGATTCCATTCACTAACCCCATTTATGATTGGATCTTTAGTCTGACTTCTGTTACAAAAGAAGTTCAGACTGCCAAGACTGGTTGTCTCTTCCCATATCTCTTCACTCTCAGACGCCACAAAGAGCAACAATGAATGCTATTTCCTCTGTTGCAGTCACTGCCAAGAAAAAGAAAACTTACCAAAATATAAGAATTATGTCCAAGATCAAGGTTGCAGAATGGTCAGTTTCAGGTGAAAACGCTGTTCCTGTTTTATGATAGATAAGTGCCTTCTTTGCTTCAAACTTGTATGCATGGTTGTAGGGGAAAGTGAAGAAAGAGCAATCCAGGGGAGGGAGCTCTCTGATCCCTTCTTATATGGCCATTAATCCCATCATAAGGGTTCGACCTTAATGACTTCATCTAATAGTAATTTGCATCTGCTAATCCCAAACTCCCACTCCATCCCTCCCTCGACACCCTCCTTGGCAACCACAGTCCCTTCTCTACATCTGTAAGCCTTTTTCTGTTTTACAGATAAGTTCATTTGTGTCATATTTTAGTTTCCACATATGAGTGATATCTATATTTATCTTTGTCTGGCTTACTTCACTTAGGATGATAATCTCTAGGTTCATTCTTGTTGCTGCAAATGGTGTTGTTTCCTTCTTTTTATGGTTGAGTAGTATTCCATTGTATATACACACCATATCTTCTTAATCCATTCATCTGTCAATGTACATTTAAGTTGACTCCATATCTTGGCAATCATAAATAAGGCTGCAATGAACATACAGGTGCATGTATCTATTTGTAAAATAATAACAATAATAAAGCTGGAGTCCCAACACACTATTTATGTGAAAATAAATTCTAAATATTAATAGATGAAACAAATGTAAAAAGAAAACCCTAAAGGTAGTAGAAAAAAACACAAGAGGACATGTTTATAGTAAAACAAAATAAGAAAATATTTTTTCTTTGCAATTCTGATGTATATAACAGCTGTATACACATATCAGAAAAAAACAGATTTTACAAAGCAAAACAGTGTAAGATTTTATTTAAAATTTTAATTTTACATGAGACTTCAAAAAATTACGTGTAATGTATCAAAAAGAGTTAGTGTCTTTAGTAGACAAATAATTTTTCCAAACTAATAAGGAAAAAGTCATAATCTTAATAAAAAATATAAAATTGTCATGAGCAAACAGTTCACAGAATAAGGAAATCAAATATCCAATGAAAATATGGAACACATATTTCAAGAAAGAAATTTGGCAGGATTATCAAAATGGAAAATGCAGTTAATGTTTAGTCAGCATTCTGATTTTAAAGATGAATTCTAAATATATAATCTTAGAAATGGAACAAGTTGTATGCTTGGAAACATTTGTTACTGAAGTATTTAGAGTAACAAAATTTTGGAATATCTGAAATGGTTATATAAATATTGGTAATGTATAAAATTTATCATTATTATAAACTCATCACATATTTTATATACAATAAAATTATTTGCTTCATTAGCACTCTCTGCCCATAGATTGTAGAATCCTTGAGATTAAGGACTTCCAACTTTGTCTCTAACAACTTGCTCATTTCACAGTAAGCATTCAGTAAATATTTGTTGAGCGAATGAATGAAGGAAGCCTTTCTTTATCTTAATAG
Seq C2 exon
GCTGGAAGTGATGGGGAGAGTATTGGAAATTGTCCCTTTAGTCAACGCCTTTTTATGATCCTCTGGCTTAAAGGAGTTAAATTCAATGTGACTACTGTTGACATGACCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000010948:ENSBTAT00000014537:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.816 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134171=GST_N_3=PU(41.1=81.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]