BtaINT0048652 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000019980 | DGKI
Description
diacylglycerol kinase, iota [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2855]
Coordinates
chr4:102104166-102114021:-
Coord C1 exon
chr4:102113905-102114021
Coord A exon
chr4:102104241-102113904
Coord C2 exon
chr4:102104166-102104240
Length
9664 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAACT
5' ss Score
8.63
3' ss Seq
GGTCCTTTCTTTCCCTACAGAAC
3' ss Score
11.56
Exon sequences
Seq C1 exon
TTTCACAATAAGGTGACCTGCTTCATGCTGCATCAGATTGAGGAACCCTGCTCCCTGGGGGCTCACGCTGCTGTTATTGTTCCGCCCACCTGGATCATTAAGGTGAAGAAACCTCAG
Seq A exon
GTAACTGCCGGGACCCTGGTGCTGCTGGGCCAGCTCAGAGAAAAAGGAACTGCTGCTTCTTGCTTTTCTCCCCCCTGACGAGGCTCTGGGTTCCTATGATCTCTGCTCACTCCTCCCCACAGGCCCATGCTTAGCTTCCCAGTTCATCCCCTTAGCCCATCCCAATACTGCTGTTGGGCTCTCTCATGGAACCAGCCTCTACTTCCTAAAGAAATCAGAGTTTCACAGCAGGAGTGCTTGCTCCCCATTCAGATGCTAATATGTATTCTCTCGCCCGGACGCTCTGCTGAGTTCCTTAAAGCCCTGTGGTGAGCGGTGCGTGCAGCTGATTCTTACACGACTCTCTTCTCTTGCAGCCTGGGCAACCCCAGGGAGTGACTGTGAGGGCCCACGGTGGTGCAGGCTTCAGTGTTGGGTTGCGATTCTCACCACTTCCAACCCCAACGCAGACTGTGGGTCATGACCTTCCCCAGTACACGAGGCCTGCTTAGAGAGCAACACTCTTTCCTTAAGGCAAAGTAGAATTTATCCTCTTAACAGCTAATCTCATTCTGTATTCAAGCCTCCTTGTACTTTCTGCATTGCAGGCTGATTCTTTAGGTCTGAGCCACCAAGAAGCTCTTTTGTACGTGTGTTTCCCCCTAAAATTCAGAACTCTCTCCAATTGTTTTATAGTAAACATTCAGTTAAATCAACACGTTTTCATCAAAAACCTTGATGGTATCAAGAAGGCTACTAAGCACTGTGAATGTAATACATGATCTTTGCTCTGAAGAACCATGTAATTACTTTGAGGAAAGATCAGGGAGAGCTTCATGAAGCAGGTGGGTTTTATTCTGCTTCCTTAAAGATGGATGGGATTTAGATCAGTGGAGAAGAGAATAACATGCAGGAGAATGTCAGGAGCAAGTATACTTTGTCCAAAAGTATATCCATGGGGCTGTGAGACTAGGTTGACTGCAGAGGAAGGTTTATGTAGGGGGTGAGTAAAAGGGAAGAGCATAAGATTGTTCAGGCCTGACTCCAAGGAGATTTTTGCTCCATGTAAACTTTGTCCTTTTAACAAAGGAATGATTGAATAAAATTATATATATATATATGTATATTTTAAAATATAATTGTTTAACTAGCATGAGTATGTGGGATGACCTAGTGATACGGGATTTTGGACGACTGAAGATAAAACAGGAAAACCAGAAGACACTATCACTCTGCAGAGAAACTCTAAGTTTACTTGTGTAAACTTTAAAAGATCTTGGGTTGTGGAAATTTGCACACAAGTGAAGAGAAAGAGATGATCATAATGAATTCTATAACCATGAACGTTTCTGCTACTGCTGTTGTTTCATCTGTCCCTTGCCACGCTGTATTGTTCTTTTCATAGTTAAATTTGTTTTGAGATTCCCATGCAGTTCTAAGAAAGGGCACAGAAGGAACCCATGTATCCATTACAGATTTTCTCCTCGTGGTACCATCTTGTAGTATCAGGGTATAACATGGGAACCAGGATGCCGACACCATCAGTGAAGAGCAGAACACTTCCATCACCGTCCGTGTCCTTATGTTACCTTTTCACTGCCACACCCGTGTTTCCTCTGGCCCCACCCCATTTACTCTGTCTTCTTGAAAGTGCAAGTCTCCCTTTTTCCCTTTTGCTAGGGTATTTTAAAGCGAAGTTTAGCATACCGTTTAATCTATAAACACTACCTTTTGTTTCCCAGAAAGATAATACTTCAGAAAGACAATTCCATACTATTACTTCACCCATCAAAATTAATTAATTTGAGGTGGCATCCTTAAATTATTTTCTGATTGTTTTAAATATATCTTTTTTACAATCATTTTTTCAAACTAAGATCCAAAGTCTACAACTTCCTTTTTGTGGACTGATCTCTTAAATCTCCTTTAATCTATAGCACTCTGCTCTCTTATTTTTCCTGCCATTTATTTATTGAATAAATTGGGTCACTTTACCTACAGCATAGCTCATATTTTAATTTTGACTGATTGTATCCTTATTGTGCTTTAAAATCATTTAAATCCTCATTTAAAATCATGACCCATATTTCTTATAAAAATATTTAGATGTAAGGACTGAGATTCAGGTTTAATTTCTTGGCAAAAGGACTATATGGGTATTGATGTCTTTTTCTGTAGTATTGCTTTTAATGGAACATAATACCAGATTGTTCACTGTTAATGGTGTTAGGATTCAGAAACTGTCATTCTAATCCATTTGTTATAAATTTGTCCCTCTGTCTTTCATCTATAATTTTATCCATTACAGATTGTTGCCTAAATCTTTTATTTCATTAGATTTTGTTAAAGGGTGATTTTCTAATTTTTACTCTTCAATTTTTAGCTACAGGTTTTCTATGAAGAGACCTTGACCTTATTACTAGCAAATATAATACATAACAGATGCCTTTGTGTTTGCCTTCATTTGTAAATTTTCATAATAATAAGTTAGTATCTTAGCAAAGCTGATTGGTGGGAATGGTTTTTGGAAAGTAGTTCAGAGTCAGGATGCTAACGTCCAAAATTTTTTAATAAGCCACCTTTTTATTCCCATCTATGATTCAGGACATTGTAATAATAAGAATGAAAGCTAACATTTATGAATGCTTTACATGTGTTGTGTATTTTAAGTACTATACATTTAGTATCTCATTGTTACAGTGCTCTTATTAGTCCCACTTTGCAGCTGAGGAAAGTGAGGAATAGAAAAGTCAAACAAATTAGCTGGGGCTATACAATTATTGGTATGAGATGTGTTTGAACCCACAAATTGTGATTCTGAAATCCAAGCTGTTAATGGTATATCATGCTACTTTACCATGTTGCTAAAACCAGCCTTGATGAATTAGATAACTTTAAAAATTTTGGTGGGCCCTTCTCCCCTGGGTCCCAAAGTCATCAAGTAATTTAACTAATTAAGTTCTGTATAAAAGGTGGTGTATAATGAGCCTGAGGGGACAGAGTGGCAATAGGGTAGCGGTGAAGCGCTCTGGTTTGCGAACCAGGCAGCCTGGACTCATAACTTTGCTCTGCCACTTAATAACTTGTTTCATCTCAACTTAATCTCTTCTACTTCAGTTTCTCCTCTGTAAAGGGTAAATAATACTCGTACCTATTTCATAGAGCCTTTTTGAGGACTGGTGAGCTAAAACATGTAAACTAACACACAAAGAACAGTACCTGGCTCATTGTAACCACTCAGATTGTAGCTCTTGCTATTTTCCTTCAGGTTGACTTTTAGGAGCACAAGGTGTCAGGTGAAGCTGTGCAACAACAGAAAACAATGGGACGGTCATACAGGGGTCAGGATAGAAGTTACTGACCCTGAACCTTCTGTGTTACAGCGAAAGCAGATGTAAAGAGGGTGAGAGAGAGACCCAGTGCAGGGGGTAGAAAGAGTCAAGAGTAGGGGCCATAGCATGGCATCTACAGTGTTTCCAAGTGTACCTAGAAGTATTACTGTAGCTGTTGTATTTCACACTGGAGTGGGATTGTATATTCACTAGCCCAATCCCTGTCCCAGGGGAGACCGTCAAGACCTGTTCATTTACTAAATAAAAGAATAGAAGGAGACAGGGAGAACATCCACACCTAGGAAATGGAAGGAGGAGGAGAATGTTTGCTAGACAGAGAACTATGGTAGGATGAAGTTTCAATATTAAAAAATGAAAAGAAAAATAGAGCAGTCATCAATGTTCAATTCTGTAGACATGAAAAAAATAACAAGGGTTGAGAGAAGTCCTTGTGTTTGGAACCAGATCATTGATAAGTCAAAGCTGTAGTTTACAGAGTATGGGGCATGGGTGGCAACCTGTTACAGATGCTGTGGAAGCAATAAGATTAGAGAATTTATTTGGAGACATTGGGTGGGAAATCTTTTTTTTTTTTAAAAAGGAAAATTTGGAAAGTAGATGGAAAACAGCAGATAAAATGCTTTCTGAGCATTTAGAGTTTATGTATCTTTCCACCTGTACCATATATTTCTATGTTTTTCCACTGGGGCTTCCCTGATGGCTCAGCAAGTAAAGAATCTGCCTGTAATGCAGGAGCTACAGGAGACACAGGTTCGATTCCTGGGTCAGGAACAATCCCCTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCTAGTATTCTTGCCTGAAAAATCCCATGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTACAGTCCAAAGAGTTGCAAAGAGGGAGACACAACTGAGTACAAGCACCTACCTACCTGTTTTTCTATGATACTGCTTAACAATGATAAAGGAGAAGAGGCTTAATTGAATTAAATAACTGTTTAATTAACCACATTCGAAGATGCTGTTACCTGCAGCAGGAGGTCCAAAGATGAACCAGATGTTCATTTGATGTCCACAAACAGTGTACTTCCCAGGGAGGAAAATAGACACAACAACCTAAATCATTGGTTGGAGTCTTTGTGAATTTGATTCTGGAGAGGAATTCAGCCACAAGTAAATCCTTAATAGGAGGTTGGCCAAAAAATTTGTTCAAGTTTTTTCCCTAACATCTTATGGAAAAACACAAATAAGCTTTTTGGCTAGCCCATTGAAAGAGTGGGAAGGGATATCTATTTGACTGGTGTGCATCTCATGGGAGAGACACACATATGAAGGTGAAAGGAAGGGGCCAGAGAGTTGGGTTGCATCAGCCATGGTCATTGAGATGCGTGCACATCTAAGGCGCAAAGGGGTAAATGCCACCTAAGATGTAGAAACACGGTGGGGATACGAAGCAGAATTGAGCTGCCTCCGTCGTGGAGAACAGCTTAGGCTCAATGGAAAATCTGCCCAGGGTGCTTGGTCTTGAAGGATGTGGACCACATCCCTGGCAAAAGGGATGGGAAGGGTGATGCGAGCCAATAGGATCTAACTGAGAACAGCAGTGAAGATGGGTCATGAAATAAAGTCGGCTTTATTTGTGATGTTTGTGTCTAAATAAATGGCTCTAAAGAAGAAGAGTAAAGGAAATTTACTGAAGTGTATTATGGTCTGAAAAAGTGAGTTGTAAAGAGGTAGAATTAAACCATATATTTTCGTTCTCTGTGGAAAGACGGCAGGTTCTGAGTGGATCATGACTCTGTGACCAGCTGTGGAGTTGGGCGCTGTGTGAAAACTTGCTGGATGATTTGCTAGGTTTCATCACCAAATTACTTGGTGAGACCTGGAAGTGAAAAGATGATGGAAGGCAGATAACTGAAAGGAGTTAAAACGAAAAAAAAAAAACAAACCCAAATTTTAGTGACAAAGCCTCAATCAGTTAATATAAAGTCCAAGTTATATTTGAAGTTACAAATTTTAGTGTTTGTCCTCTGGACTGAAAATGTTAGAGGATAATGCTTTGGATGAATGAATTAAAGATATTCAAATACTAGTACAGGCACTTGGAGCTGATGGAGCAAGACTCATGCGGCATGAACTTTTTGTGAGGTCAGATTTGTGGGGGGGACCCTAGAGGTGTGTGTTTTTAATAAATAAAATCATTCTCTACTTAATGCTTCAAAATTTGGCTTTTCTATTTGAAAAATCATAGGGAAAAGTCTATATTAATACATATATATTTGATTCCTTTTAAACTGCTATGGATATTTTATAGTTGATTTAAGCAAATTCCCTCCCAGTGGATATCTATATTATTTCTAGTGGTCTGTTTATAAAAACGTCACAATCAACTCCTACCTACCCTTGTATGGGCTTTCTCCATGCTAGTCCTTATTCCTTATGATGGGATTATCTTAAAATGCTAGGGATCCCATGGTATGTAATAGCAATGACCAACAGTCTCCCTCAATGCCCAATGCCAAAGACTTCCTTTGGCCAATCTAAATGTCACACTTGCTGTGTGAAACAAGTTGCTGTGATTTGGCCAAATATGCCTGAGAAGCTGCTGAGACCCCCTGTCCTTAACTTTTGGAGTAAGTTTTCTTGATTCTTCTGCTTGCCTGTCCTTATAACAACCGTTGCTGCAATGCTAAAGCTGGAGCAGGGCAGAGTGAGAATATCCTTTTATAGACAAAGTCCATGGAGCGCCCTCTTGTTATCCATCAGAGTTTTGTCCAGCATGTAAATGGAGGAAGACTTCATCTGGGATGATGAAGTAAGATATCGTATCTTTAGATTTTGTTATTATAATTGATCCTTTGTGATCCTGTCACCTGAGGAAATCCCAAGAGTTAATAAGAGTAGTAAGTTGGGTTTCATTCACAGTGGAGTGATTCACCTGTAGGATTTCATAACAGGCCAGGAAGGCGTCATAACTGTGATAAAGACTGTGTTGATAGGATTATTTTTGTGGCAAGGTAATCCTGTGCCACAATACCTGGGACAAGAAAACAAAAATCCTTTATCTTTTCTTAAGAATTTCACAAAAGAGTGGGCACAGAATGTACAGGGGTGAATGCTGTTGGAATCAGAAGAATGTAAAAATCCAGACAAGAGTGCTCACTACGTTTCGCTGTTTAGACAGTTGAACTTGTAGAGCGAACCCTTTGCATCACTGAGTTAGCTGCTTTTGATAACAGCGATGCTTTGTTTTAGAACCCAGGAAAAGTATTAAAGGTTTCTTGGCTGTTTTGTCAACAATTCTAGATAATAACGTCTCGGTATAATTTTTTCATTCTTGGGAACCATGTTTATTTAACTCTCACAAGACTGACCAGGCAGAGTAAGTGCTATTGTGGATTAGCAAGGCTTGAAGACTTGTCTTGGCCAAAACACAGCCTGAATCTGCCTTCGCATCCATCTGTTCCTCACTGAATTAAGCTGCCTTCTAAAAGAAGTGATGTACTGAGACAGAGATACATGTTTACACAAGGACAGAAAGAAGCCTGGGGAATTTGGAGGTGTGAAGCTCCGTAATGCTTATCGTTTGCTCTTTGGCCATCCGTAGGGAGGTAAGCTTACTCAGAGCTCACGTACGAGCGTCCAGGTACTGTAAGTCAACCACTGTGTGTGAGCTTTCCCCTTTCTTGTTCTGTGAGATGAAGGCCTCAGGTGCGTGTGGCTTGGTGAGGTTTGGAAGCATTTGCATCAGTGTTTAAAACAAAGGCTATTTTTGTCTGTCTGTTCCCTATGAGAGCTGAGTCCCCTGCCTGCTCCTTTTTCAGACATACAGCCTTATTTTGGTGTGTTTTTCTAACCCTCTTCTCAAACACACTTGATCAGCAGGATCACCTGAAGAACTGTGATTTCTGTGATCAAGCAAGTTGAGGAAACGTCTCTCAACTTGGTTCATGTGCCCTACCTCTTGGAGTTTAATTATTGAGTCCTGTCCAGAGCCAAAAGTGTTTGGTATCCCACATTGCTCTTGGCACTAAATCAACGAAAACAAAAGAAATTAGCAAACAGTCACCCACTTCCTAAGGACCCTTTTTGAAATCAGGGAAGACTCAGTCAGTGTCGTGAATTATAAAAATACTGACTTATTATTTCCACAATGATATGGGTGCCTACTGTGTGCCAAGCATTTGTGCTGGGGATATATAGCCATCAAGAGGCAACTGATAACATTGATCAAAGTGTTTCTCATGGGATGGATACTAGGTTAACTACATTACATACATTTTTTTTTTTTTTTCATTTAAACACCAAAACTCTCCTTTGAGGTAGGTATTATCACCTTCATTTGAAAATTAAGAAACTTATTTCAAAAGTTTGACTTGGCCAAGATTATGGAGCTAGTAACAGGGAGGTTCAGAATTCAGTCTGTCAAATCCCACACCTCACACTTCTTACCCCAGTGATTGGCTTTACTATACGTAGTACACACAGCTCCTCATTCTACCTTTTGTATTTCAGACAGAGGTTCTCAATTCTGGCTACACTAGAATTCCATAGGAGCTTTTATTATTTTATTTTATTCTATTTCATCCTGTCATAATCTATTCTATTCTGGGGAGCTTTTAAAAAGTATCTTTGCCTGGGCTTCACCCTAAACAAATTAAATAAGAATATTTGTTGGGGCCCAGGTACCAACACTCAAAGCATCATGAATTGCCATAAGTAATAGATACTACTTCTGCCAGTCTAATAGTTTTCAGCACTCTACTTGGAATATTCTACTGATTAAGCATTTAAAAGTTCTGAGTAATTGTTCTTCCCTTTTAATAAAATTGGAAGTAGTCAAAATATAGCAAATACTCAAAGAATGCAGAAGTTTCCCAAGAGGAACATGATGATAGATCCATTTAAAGAGGAATTTGGAAACTTGGAGATCTATTTGCAGGAGAAGTATAGTCTAGAGTGAGTGATGAGAAATCACCTGGCATCACGAACACCCATGAACTTCTGGATTTCTTTTCTGGTGAGATTCAGAAAACCTGAAGACTCTTAATATGATGGGGGAAGAAAACCTTGGGACAAATGGTGGTTCAAGAAAGTTTCCTTCATCCTTGGTGAGCACAGGCCACAAATCAACTTTTTTTTTCTTGGTCCAAATGCAAGTAAAATAAAAGCTAAATAGTTTCAGTCTTACTAACTTGGATGCATTCATATATGATGTGCTCTAGACTAAAAGGTTTATTTTGAATGCTCTAAGAAAAAATACAATGTTGAAAAATAGATATCTAAGTTTCTTCAAGCTGTTTGAAAACATTTAATTGCTCAAACAATGCATGTGTATATACTTATGTAAACTTTTAAGTTAAAAATTTTGTATTTCAAGCTTTCAACACTTTGTAAAACATCTATGTCATGATAGTAATAGCTTGTCTTTATGAAGATGGCCATCTAATTAATTATGGACTCTGCACTAATTAAATCTGATTTTGCCTTGCCTTCAGCCAGGGAGCTGTGACTGCTCCCAGAAAGAGGTTCTTCTCAAAGCATCTGTATCAAATATTAAGAGTAAATAGCTGAAATAATCAGAGTTGTGGTCCATACGTTCCCTAAAAAGAGAAAGACAGGGAAAGTAAATTCGGGGTCCATGTGTTTCAAGTTGGATGCACTCCTGTGAGAGGAAAAAGATCCAAGGTTGCCAAGGGAGGGAGGGCTTTTTTAAACCAATGGGTCCTTAGCCAGAAAAAGGAAGAGCAGTGACTGCCACTCTACTATCATAAGTAACTTGACTCTTTGCATTTTGAAAACTAAGCCATGAACGCTGATAGAAGACTTGGATCATAACATTTCAGTGGGGTTGAGTCATTTTATATGAACAGGTCATCTCCTATAAAAAGTAAACAGAGGGGGAAAAAAGAAAAAAGAAAAACATGAAAAAATGGCCTCCTTTTTTACATTTCCACATAGGTGATCTCCATACCAGGAGATGAACTTCTTGAACTTGGTTGGGCGGGAGACGGACCTGGTTGGGCGGGAGACTGGAGCCCCTCAGAGAATTTGGGATTCTTCCATTTTTACTGGGAGGGTTGGCAGGTATAACATGTGTTGTTATGTGAGTCCATGAGAGCCTCCAGGGTTCTAACTCCCTGCCTCTCCGTGGGGTGGGGAGTCAGTCGCTCGCTCTGAAGCACGCGACTGGGTTCTGTGTGTGGCTTCCCCATGAGCAGTGGCTTGGAAGTGTCAAAGCATGAGAAGCATGCCCTGCCGAACAGCATGCGCCGCCGTCACCTTCTACATGGTCCTGCATGGGTGCGCTCATGGGCCGTCGGCCTCCCGGCTTAGGGGTCCTTTCTTTCCCTACAG
Seq C2 exon
AACTCCCTGAAGGCATCCAATCGGAAAAAGAAGAGAACAAGCTTTAAAAGGAAAGCCAGCAAAAGAGGAACCGAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000019980:ENSBTAT00000026616:7
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.026 A=NA C2=0.880
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0013017=C1_1=PD(28.3=43.6)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]