BtaINT0051352 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000014319 | DNM3
Description
dynamin 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29125]
Coordinates
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Length
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Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
GTGATTCGCAAGGGATGGCTAACCATCAGCAATATTGGCATCATGAAAGGAGGCTCTAAGGGATACTGGTTTGTCCTTACTGCTGAGAGTTTGTCCTGGTACAAAGATGATGAGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000014319:ENSBTAT00000017776:14
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NA
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development