HsaINT0050694 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000197959 | DNM3
Description
dynamin 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29125]
Coordinates
chr1:172092824-172131288:+
Coord C1 exon
chr1:172092824-172092875
Coord A exon
chr1:172092876-172131174
Coord C2 exon
chr1:172131175-172131288
Length
38299 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGA
5' ss Score
9.79
3' ss Seq
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3' ss Score
9.02
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Vast-tools module Information
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Protein Impact
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Main Inclusion Isoform:
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development