Special

BtaINT0079622 @ bosTau6

Intron Retention

Gene
Description
potassium channel, voltage gated eag related subfamily H, member 7 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:18863]
Coordinates
chr2:34086485-34104867:+
Coord C1 exon
chr2:34086485-34086910
Coord A exon
chr2:34086911-34104467
Coord C2 exon
chr2:34104468-34104867
Length
17557 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAAGA
5' ss Score
10.06
3' ss Seq
ATGCACATTTATTTCCACAGACA
3' ss Score
7.88
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTCTCTCTTTAGGAGCAGATGTTCTACCAGAATATAAACTGCAGACACCACGCATCAACAAGTTTACAATATTGCACTACAGCCCTTTCAAGGCCGTCTGGGATTGGCTTATCCTTCTGTTGGTCATATACACTGCTATATTCACTCCCTATTCTGCAGCCTTTCTCCTCAATGACAGAGAAGAACAGAAAAGACGAGAATGTGGCTATTCCTGCAGCCCTTTGAATGTGGTAGACTTGATTGTGGATATTATGTTTATCATAGATATTCTAATCAACTTCAGAACAACATATGTAAATCAGAATGAAGAAGTGGTAAGTGATCCAGCCAAAATAGCAATACACTACTTCAAAGGCTGGTTCCTGATTGACATGGTTGCAGCAATTCCTTTTGACTTGCTGATTTTTGGATCGGGTTCTGATGAG
Seq A exon
GTAAGAGCTGCTTAAGATTCTTATTTTCCAAAAGGTTGAAAATATAAAGTGAAGCTATTTTAACTACAAAATAAGCTATTGCTTTACAAATTTCTATATCTCACAGATAAAATTCATTTTCAACTGAAAATGCTATAAAATGAAATGAAACCTGTTTGCCACTGCAAATGATTAGCAATTTTTTCCTATTTTTGCTAAGAAACAGTAAAGACTATCCTTTAAAAAACAAATTAAACTTTGAGACAAGTGTTTCATTGTGCTTAGTCACTTATTCGTGTCCAACTCTTTGAAACCCCATGGACTATAGCCCACCAGACTACTCTGTCCATGGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTGAAATGGGTTGCCATTTCCTCCTTCAGGGTATCTCCCCAACCCAGGAATTGAACCCAGGTCTCCCGAATTGCAGGCAGGTTCTTTACCATCTGAGCCATCAGGGAAGACCATGGCATATTCCCAGGATGTATAATTTCTACATATTAACTTTATAGATATAAAACTATCTAAGATGAAGATGCATCTTTCTTTCTTAACTCATAATTGTGGTTTGTGAGAGGAGGGACTTGTTTTATGTTCAAGTTATGTGTAAGAGAAATCTTCTGAGATGTTTTATCCAAAACCCTTTCTCTTAAATAATATCTAGGTTTGAAAATACTTTTTGTGCGGCCAATATCTTATAAAGTTGGAAATTTTAAGGAAATTTGACAGTGGATGTGCATTTTCTGGATAGAAAGGCCATAATTTTAATCAGATTCTTCTCAAATGGTTCTTTGAACCAAAACAAATCATGTTCTCCTAAAATCTCTATTTTATTGCCACTGTGTGTGTTGTGCTGTGCTTAGTTGCTGAGTGAGTGAGTGAAAGTCACTCAGTCGTGTCCGACTCTTTGTGATTCTGTGGACTATACAATCCATGGAATTCTTCAGGCCAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCAAGGGGATCTTCCCAACCCAAGGATCGAACCCAGGTCTCCCACATTGCAGGCAGATTCTTTACTGTGCTTAGTTGCTAAGTTTTTGTAAATAAATTTCCTGGATTCTCTAATGGAAAGTTTTACAGAAGGTGTGAAAGTAGGACTAAGGGATTAGATTGAGAAAGATAAGCTTGGTGTTTGGAATTTTTAAGATTCAGTTTTGGGAATGCCCTGGTGGTCCAGTGGTTAGGACTGCATGCTTTCACTGCAGGCTGATGTCTAACCACTGTGGTCCCATGATCAATCCTTGGTCATGGTCAACTTAAAAAACATGCACAAGCTAGAAGCTGAGAGTTATGTTTTATGCAGTGGGAATTTTTAGGACTCCACATCATGCCCAAGAGACAGCATGTCAAGTAACCCTGAGAGAACTGCTCTGAGGAGGTGAGTGGAGAAGCCAGGTTATATAGTTTTACAAAAAGGGCAGGTAGCCTGAACATCAAAAGATTATTGTTAATTAAAGAAAACTAGATATTCCAAATTAAGGAGTTTGTTGTTGTTGTCACTCAGTCATGTTCTACTCTTTGCATCCTCATGAACTGCAGCACTCCAGGCTTCCTTGTTGTTCACTATTTCCTGGAGTTTGCACAAATTCATGTCTGTTGAGTCAGTGATACTATCCAACCATTGCATCCTTTTCCTGTCCTGTTGCCTTCTTCTCTTCCTGCCCACAATCTTTCCCAGGATCAGGGTCTTTTCAATTGAGTCAGCTCTTCCCATCAAGTGGCTAAAGTATTGGAGCTTCAGTTAAGGAATTTAGCACTTTTCTATGTATGGGAAGATGTAAGAGTCTGGGCTCACTGAAATCATTCCTTTCATATTCATCAAAGCTGTCTGGGGCCAGTATTCTGTGTGTTTCATATCCTGAGTCCCTCAGGGCTTTCCATAGGGATGGGCTGCAGCCTCATGGCTACTGATTACCATGGCAGTCTTGTTTATTGATATGGGAGGAAATATTCCAATTCTTAGTCAGGGAACTAAGATTCCACAAACCGCATAACATGGCCAAAAAGAAAAGATACAAAAGAAACTAAAATTCAGGGTCCTTTTCCACTTAAGAGGGTTTTCCCAATTGCTCAGCAGGTATAGAATCTGCCTGCAATGCAGAAACATAGGAGATAAGGGTTTGACTCCTGAAATCCCATGGACAGAGGAGCTTAGTGGGTTACAATTCAAAGGGTCACCAAGAGTCAAATATGACTCAGCAACTGAGCATGTTCCAAGTCCATCAGGACCTCACTATCTTTTTTTTCCCAAGAGGAGATCGGATATCATAAACAAACACCCTCTGTAGATGGTTGCTCCTGACCAATTAGGGCTTGATGGCAAGAGAATCCTCCTTAGCTAGGAGGACAATAGGTTTAGAGGTAAATTGTCTCCCATAGAACATGCCCATCAAACTGGATGAATAAAGAGCAGGTTCAGTTCAGTTCAGTTGCTCAGTCGAGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGAATCGCAGCACGCCAAGGCCTTCCTGTCCATCACCATCTCCCGGAGTTCACTCAAACTCATGTCCATCGAGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTTATCCCTGTTGTCCCCTTTTCCTCCTGCCCCCAATCCCTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCCAATAAGTAAACTTCGCATGAGGTGGCCAAAGTACTGGAGTTTCAGCTTTACCATCATTCCTTCCAAAGAACACCCAGGACTGATCTCCTTTAGGATGGACTGGTTGGATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCTCAAGAGTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAACATCAATTTTTCAGTGCTCAGCTTTCTTCACAGTCCAACTCTCACATCCATACATGACCACAGGAAAAACCATAGCCTTGACTAGATGGACCTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTCAATATGCTATCTAGGTTGGTCATAACTTTTCTTCCAGGGAGTAAGCGTCTTTTAATTTCATGGCTGCAGTCACCATCTGCAGTGATTTTGGAGCCCAAAAAGATAAAGTCTGACACTGTTTCCACTGTTTCCCCATCTATTTGCCATGAAGTGATGGGACCAGATGCCATCATCTTCGTTTTCTGAATGTTGAGCTTTAAGCCAACTTTTTCACTCTCCTCTTTCACTTCCATCAAGAGGCTTTTTAGTTCCTCTTCACTTTCTGCCATAAGGGTGGTGTCATCTGCATATCTGAGGTTATTGATATTTCTCCCGGCAATCTTGATTCCAGCTTGTGCTTCTTCCAGCCCAGCGTTTCTCATGATGTACTCTGCATATAAGTTAAATAAGCAGGATGACAATATACAGCCTTGACGTACTCGTTTTCCTATTTGGAACTAGTCTGTTGTTCCATGTCCAGTTCTAACTGTTGCTTCCTGACCTGCATACAGGTTTCTCAAGAGGCAGGTCAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTTCAGAATTTTCCACAGTTTCTTGTGATCCACACAGTCAAAGGCTTTGGCATAGTCAATAAAGCAGAAATAGATGTTTTTCTGGAACTCTCTTGCTTTTTCAATGATCCAGCGGATTTTGCCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGCATTTTCTAAAACCAGCTTGAACATCTGGAAGTTCATGGTTCATGTATTGCTGAAGCCTGGCTTGGAGAATTTTGAGCATTTCTTTCCTAGCGTGTGAGATGAGTGCAAGTGTGCGGTAGTTTGAGCATTCTTTGGCATTGCCTTTCTTTGGGAATACACAGAAGAACTGTACAAAAAAGATCTTCACAACCAAGATAATCATGATGGTATGATCATTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAGTCAAGTGGGCCTTAGAAAGCGTCACTACGAACAAAGCTAGTGGAGGTGATGGAATTCCAGTTGAGCTATTTCAAATCCTGAAAGATGATGCTGTGAAAGTGCTGCACTCAATATGCCAGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGGACTGGAAAAGGTCAGTTTTCATTCCAATCCCAAAGAAAGGCAATGTCAAAGAATGCTCAAAGAGCAGGTTAGTTAAACAATATATTCTTCCTGGATTCTACAAAACTTAGACAAAGTCTCAAACTTGACTCTCCTCATCTATAAGGATGATAATATTACTTCCCTTCTTAAGTTTTTTTTTTTAATTTGAGACTCTAATGAAATAATATATGTAAAACTCAGCAAACTACTCAAAATCAGCTGTTGTTAAACTAGTTGAAATTTTAATGTTAGATACTCCTAACTTTGTTTTTAACTAAAGGGCAAGAAAGCAAAATACTTCTTTATGAGTATTTATCTTTATGAACCTCTTATTATGGGTAAGTCCATGTAATTACACCAAATAAGTTCCTATTATAAAGAGTAAAATCTCACTCTTTCAAATTTTAAAATATGTACACCAACAGTAAATAAATTTCAGCTTAGTGAAATGAAAGAATGGGTAACAAATAAATAGACAAACAAGATTGTTATGGGAAGTTAATTTACTAATGATATTTCATCAGTAGCAATCAAACAAGTGAATATTAGAATATGCTGATTATTCTAGGATAATTTCTAGATTGCAACATGATCAGTTTAGCGTCAGTTACTATATTACTTGAAAATAAAGATTTCCTAAAATAAGTAATTCAGGTTATCACTGTTTCAGATAGAACTTCAAGTGAGCTGAAACAAGAGTAAATTTATGTGGTTCACGTTAGTATAGGATGAAATAATCTTGGGGGAAAAATGGTGTTTGAATAACCTTTCTCGTATAGTATCAGAGAGAAAGTGAAGTTTGCATCAAGAAAAGCAATGCCAGTTTCTTACTCTGTTAGATATTATTTCCTGGGTTCCCCCATGTCTCCAAACCTGCTCCTCACTCTTAAAATGTGATGTGATATGGCAAGGATTCTGGCTTTGGGGTCATACAGACCTGAGTTTGATTCACCTCTGTGCCACTTACTTGCTATATTTGAGCAAGATATTTACCTAAGACTTCATTTCTCTTCTGTTATATGATGAGAAATAGATTCTTGTGATATCTAAACGTAAAGCAGTGTATGTGAAAAGACTAGACCAGCACCAGGTACATAGTAATCGCTTGCCAAAGATTACTTTTTTATCCTTCCCATCCCTTTGGATTAAATCCCTGTTATTTTAATAAGTATTCCTTTTAAAACTTAAGTGTTACCACATTAATCCATAAATACCTTAATTATCCACTTATTCGACAAAGATTTATCAAGTGTCTACTATCGTATAGCAGTTATTAGATTAGCTAGTTGCAGTTAGGATTCCTGGAAAAATAGGAGACAGAAAGGAAATCTTTTGAGGACAGTTTTCCAGCAGGCTGCAGTCCATAAGATTGCAAAGAGTCCAACACAACTGCACACCCACACAAGCAACTCAAATTGTCTTGCAAAGCCCAGGAGCTCGGGGTGTGTGGTAGGGAGAAGTGTGTGGGCATCAAAACTAGCAAGTGGGAGCAGTGGTCTGAAAAGAGCATAAAGAATCAACTATGAAGGATAACAAGACCAGTGATGGATTGGACTGCATGATACATTTCTCAAGAGTGACAATGAAGATATTCCTTTCTATGCAGACTATATTTTATAACTATAATCAGGCCTTTCAAGATGTAGTGATATTTCAGAATGAAATTTTCCCCAAAGGGTATAATATACCATGTTGTTGTTGTTCAGTCATGTCCAACTCTTTGAGATCCCATGGACTGTAGCCCTCCAGGCTCCTCTGTCCATGGGTCTTAGATAAGAATACTAGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCTAGGCAACCTTCCTGACCCAGGGATCAAACCCACATCGCCAGCATTATTGGCAGATTCTTTACCATCTGAGCCACCAGGGAAAAAGAAATACTTTCAAAGTAAAAGATCTTACATTCACATGGGTTAATTGGGAAGTTTCATCATATGAAGGAAAAAACTTCTTTGGATTTTGGTCCCCAAATTGAATGACAAGATCTAAAATCACTAAGCTTGAGGTCATTCTGATGAGGGGTAATCTAGTTCAGTGTTTTTCAAACTGAGGATTCATGGAGGTGCCTGAGAGTCCGAGAGACCCTCAAGGATTGACAGCAAGACAGGCTGATAAGACTCAGAACCATCCACCTCCACCATACAAAGAGTAACCCAATTTTATCTGCTTTTGCTTTACTAATTACAGTTTCAAGTACATTTTAATAAGAATTAACTTCATTAATTTTTTCATTTCCAGGAGAGGGTACAGTAACTCCCTTCTCAAGTAGATTCATTCATTCTATCAGCATTTACTGGGAACCCTGCTTTCTGTTGTAGTTGTTTAGTCGATAAGTTGTGTGTAACTCTGTGACCCCATGAACTATAGCCCACGCAGCTCCTCTGTCCATGGGATTTCCCAGGCAAGAATACTGGAATGGGTTGCCATTTCTGAGTTTATAGGAAAGAGTGAGAAAAGACCCCTAGAGTGTTATCTGATGGCAGCTTTAATATTACTATGTATAGGAGGACATGTGAGCATGAAGGGGAAGTTTTTGATTACCAGAGGGAGTTTTCCGGGTAGAAGGGTCAGGCTAGTTAGAAGGGAAGCCCATTAGAGGCATAGAGGTACAAGGTGTTGGTTCCCAGCCCTATCAGAACCAACATAACAGATATTTTAATGACCCTTTCTACTATTGTTAAATAAAAGTCATAGATAATATAGCCTTCTTACACACACATAATTTCCTAAATATATAATACCCATTTTTGATATAAAGGAAAAACAAAAGAAATGTTCATTACAAAATACCTAGTTGATTATGTAAATGCTTCAGGCATGTCTGCATAAAAAGATACAGCGAAGTTATCAGAGGCTTGTTGTTCAGTTGCCAGGCCATGTCCAACTCTTCATGACCCCATGGACTGCAGCATGCCAGGCTTCTCTGTCCCTCTCCATCTCCCAGAGTTTGCCCAAGTTCATGTCCATTGAATCCGTGACGCCTTCCACCCATCTCATTCTCTTTCCCCATCTTCACCTTCTGCCTTCAATCTTTCCCAGCATCAGTGTCTTTTCCAATGAGTCAGTTGTTTGCATCAGGTGCCCAAACTATTGGAGCTTCAGCAACAGTCCTTCCAAAGAGTATTCAGGGTTGATTTCCTTTAAGATTGATTGGTTTAATCTCCTTGCTTTCCAAGGGACTCTCGACAGTCTTCTCCAGCACCACAGTTAGAAAGCATCAGGTCTTAGGTGTTCTGCCTTCTGTATTGTCCGGCTCTCACATGTCCGTACATGACTACGAGAAAGACCATAGCCTTGACAATATGAACCTTTGTAAGCAAAGTAATGTCTTTACTTTTTAACACATGTCCAGATTTGTCATAGCTTTCCTACCAGGAAGCAGTGGTCTTCTAATTCATGTTTGTACCTAGTGATAATGAGGAAGCCCATAATGAAACAATAAATTAAATATTAAACAAGATAATGTTAGTTTTCTTTAAATTTGCATTTTAATAAAGGTTTTCATAGCTATGTATGTATATTGCATACACATATATACATGCATTTATATAGATAATAGAAAATTTTATCTGCATATATTAATATTTATATACCTAAGAACACTGATAACTACAAATGTTGACTGATATAGCTGTGCTGTATGCCATGTATGTTGTATATAAATAACACAAGATCTATTGTCATGAAAATGAATAGTGGCAGTAACGGGGTTTGCCAGTGTCATTAATATCTTCCTAATGCTAACGCCATCCAGATATCAAGGAAAATATTCTCTATTTCTTAATTTTTGTATTATCAAACATCATGCAATCCATAGCAAATTACCTCAATATCATTGATGCAAAGGAAGAATATTACTCAGTCCAGTTCAGTCACACAGTCGTGTACGACTCTTTGCAACCCCATGGACTGCAGCATGCCAGGCTTCCCTGTCCATCACCAATTCCTGGAGATTGTTCAAACACATGTCCACCCAGTTGGTGATGCCATCCAACCATCTCATCTTCTGTTGTTCCCTTCTCCTCTTGCCTTCAGTCTTTCCCAGCATCAGGGTCTTTTCAAATGAGTCAGTTCTTCAAATCAGGTAGCCAAAGTACTGGAGTTTCAGCTTCAGCATCAGTCCTTCCAATGAATATTCAGGACTGATTTCCTTTAGGATTGACTGGTTGGATCTCCTTGAAGTCCAAGGGACTCTCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCTAAAGCATCAATTCTTTGGCGCTCAGCTTTCTTTATAGTCCAACTCACACCCATACATGACAACTGGAAAAAGCAACGCTTTGACTAGATGGACCTTTGTTGGAAGTAATGTCTCTGATTTTTAATATGCTGTCTAGGTTGGCCATAGCTTTTCTTCCAAGAAGCAAGTGGCTTTTAATTTCATGGCTGTAGTCACCATCTGCAGTGATTTTGGAGCCCAAGAAAATAAAGTCTCTCACTGTTTCCATTGCTTTCTATGTATTTGCCATGAAGTGATGGGACCAGATGCATGGTCTTAGTTTTTTGAATGTTGAGTTTTAAGCTAGCTTTTTCACTGTCCTCCTTCACTTTCATCAAGAGGCTCTTTAGTTTCTCTTTGCTTTCTGCCATAAAGGTTGTGTCATTTGCATATCTGAGGTTATTGATATTTCTCCCTGCTATCTTAATTTCAACTAGTGCTTCATCCAGCCCAGCATTTCACATGATGTACTCTGTATATAAGTTAAATAAGCAGGGTGACGATATACAGCCTCGATGTACTCCTTTCCCAATTTGGAACCAGTCCATTGTTCCATGCCTAGTTCTAACTCTTCCTTCTTGACCTGAATACAGATTTCTCAGGTAGCAGGTAAGGTGGTATGATATTCCCATCTCTTGAAGAATTTTTCAGTTTGTTGTGATCCACACAGTCAATAAAGCCAAAGTATATGTTTTTCTTGAACTCTTTTGAATTTTTGTTGATCCAACAGATGTTGGCAATTTGATCTCTTGTTCTCTGCCTTTTCTAAATCCAGCTTGAATATCTGGACATTCTCAGTTCACGTAATGTTGACACCTTCCTTGGAGAGCTTTGAGCATTACTTTGCTACCGTGTGAGATGAGTGCAATTGTGTGCTAGTTTCCACATTTTTTTGGCATTGCCTTTCTTTGGAATTGGGATAAAAACTGACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGAGTTTTCCAAATTTGCTGGTATATTGAATGCAGCACTTTCATAGCATCGTCTTTTAGGATTTGAAATAGTTCAACTGAAGTTCCATCACCTCCACTATCTTTGTTCGTAGTGATGCTTCCTAAGGCCCACTTGACTTCACATTCCAGGATGTCTGGCTCTAGAGGAGTGAGTACACCATCCTGGTTATCTGGGTCGTGAAGATCTTTTTTGTACAGTTCTTCTGTGTATTCCTGCCACCTCTTCTTAATATCTTCTGCTTCTATTAGGTCCATACAGTTTCTGTCCTTTATTGTACTTATCTTTGCATGAAATGTTGCCTTGGTATCTCTAATTTTCTTGAAGAGATCTCTAGTCTTTCCCATTCTATTGTTTCCCTCTGTTTCTCTGCATTGATCACTTAGGAAGGTTTTCTTATCTCTCTTTGCAGTTCTTTGGAACTCTGCATTCAGATGAGTATATCTTTCCTTTTCTCCTTTGCCTTTAGCTTCTCTTCTTTTTCAGCTGTTTGTAAGGCCTCCTCAGACAACCATTTTGCCTTTTTGCATTTCTTTTTTGAGGGGATGGTCTTGATTACTGCCTCCTGTACAATGTCACAAACCTCTGCCCATAGTTCTTCAGGCACTCTATTAGATTTAATCCCTTGAATCTATTTGTCACTTCCACTGTATAATCATAAGGGATTTTATTTATGTCATACCCAAATGGTCCAGTGGTTTCCCTACTTTCTTCAATTTAAGTCTGAATTTTGCAATAAGCAGTTTATGATCTGAGCCACAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGCTATTCCAGGTATCTCTTGACTTCCTACTTTTGCATTCCAGTCCTCTGTGATGAAAAGGACATCTTTTTTGGGTGTTAGTTCTAGAAGGTCTTGTAGGTCTTCATAGAACCATTCAACTTCAGCTTCTTCAGCATTACTTCTTGGGGCATAGACTTGGATTACTGTGATATGAAAGGTTTGCCTTGGAAAGGAACAGAGATCATTCTGTCGTTTTTGAGATTGCACCCAGGTACTGCATTCTGGACTCTTTTGTTGACTGTGATGGCTACTCCATTTCTTCTAAGGGATTCTTTCCCACAGTAGTAGATATAATGGTCATCTGAATTAAATTCACCCATTCAAATCCATTTTTGATCACTGATTCCTAAAATGTCGGTGTTCACTCTTGTCATCTCCTATTTGACCACTTCCAATTTACCTTGATTCATGGACCTAACATTCCATGTTTCTATGCAGTATTATTTTTATAGCATTGGACTTTATTTCCATCACCAGTCACATCCTCAACTGAGCATTGTTTTTGCTCTGTCTCTGTCTCTTCAATTTTCTGGAGTTATTTCAACAACAATATTATTGGTTGTCTCCAAAAAGTCAACTTTTCATTATCTGCTTCAAATGTTTCCATAGTTTGCTTCTCTTTGTTAAATGTTACTTTAGAGATATTAATAGTTAGACTCTAGAGCTCTCTGTTTAGTTACATGCTTCATTAAACTCTTACTCCCCTGAAAATTTGTAGTAGTATTTTGATTAATTAATTGACCTTTCACACTTCACTGTTATTTTTCATGAATTCTGAATGTAGGCAAGGCCTTTTGACAGGAAGTTTTAGCAGAGAGGAGGAGTTTCTGCTCACATTGATATGTTTGCTTCATTAGTGTGATAGATAAATCGTGGAATGGTTTACAAGGGAATGCAAAGCAGACCTCTGTTATAGAAACTTTGATCATTTTGTCAGTATTCCTTCTGAAGCTGATCTCTACAGTAGTTGTCATTAGTTTGTTTGAAATAAATTTCTAAAACATTAGACATACTCGTGTTCAAATTGAAATAACAATGAACATTTTGCAGCCCTGCATGTTTATATGTGTCTACACATAAAGTAACTATGTCTCTCATTAGGTAGTTTTTAGGAATTATAGCAGAAGTTTCAACTAATTGTATTTGAGGTTACAGGTCATGTTTCTAAAAGTCTGTGGCATGACAATTAAGAGACAAAGAATCTACAATGGAATAATTCTTGAACTAAGGAATAATAAGAGTATTCCATCAGTAAATGTTGCATTAAGTTCTTCACTTACTCATTACTTATATGTGATCCACTGACTAAAATTTGCTAAAGACAAAATAAGTTTTGGTTAAATGTTTCCAGAACAAGCCAAATTCCAAATATAAAAAGATAACATATTATTCATAATTGTTTATTTACTGCAGCATTTGCCTACTACTATTTAGAATCATTTGATGATCAGTTTTCTGTGTTACTATAACTAAAGAGAAAGTAAGATCAAAATGCAGCAAAATAGAATGTTAATTTTAAAACAAAATTAAAATAAACATATCTCGAGAGTAAAGGATGTTAAATATTGGAGATTGTAAAATCTTCTTTTTAAAAGCCTGTTTCTTGAGAAATTTATGAGGTTTGGTACAAATAAGGAAAGGCTAAGCTAGGTGCCCCCTCGCTATGGTTTTTTGCACACTCAAAATACAGCTCTTTGATTGTATTAGTGAGTGTGTTTTAGAGATATTAAAATGATATGACTCAAGCTGAACAAAAAAATAAAAATTAGTTTCAGTATTATTGTGTTTTATTGGGCAATTTATTGAATGATGTTTGCAAGTACTAGAACTTAATGGGAATAGAAATGAAATCTAAAAAAAAAACGTGAGTGTGGAATTATGAAATTTACTACTCATTAAGTGTTCCCTTTTCCACCTTGTGTGTGTTGGTCGCTTTGTCATGTCCAACTCTTGGGGATCCCATGGACTGTAGCCCACCAGGCTTCTCTGTCCATGGAATTCTCCAGGCAAGAGTCCTGGAGTGAGTTGCCAGTTCCTTCTCAGGGGATTTTCCCAACCCAGGTATCGTGCACAGGTCTCCTGCATTGCAGGCAGATTCTTTACCATCTGAGCCACCCAGGAACCCCCTTTTCCCATTTGAACCCAAATATTATGCTTCCCAGATTATGTAGGTAAAGGATCCGCCTATAATGCATGAGACACAGATTCAGCCCCTGGGTCAGGAAGATCCCCTGGAGGAGGAAATGGCAACCCAGTCCAGTGTTCTTGCCTGTAGAATCCCATGGACAAAGGAGCCAGGTGGGCTACAGTCCAGAGGTTGTAAAGAATTAGACACAACTGAGCGACTAAAAATATACATCACTTGATAAACAGGACAGAATGATGGATTAAGTAGCAAGTTTCAGTGACAATCATGTAACAACCATCAGCCAGAACCAAAGATCGCATATTTACATTTCCTCATTCATAAAAGAATGATTCTATCTACTTACAATAGGCAAGGATTATAGAGATTAAACCCTGAAATAAAGTATTTTAAAAGTAAGATTTTTTAAAATGCTTACTAAAGAGAATTATTTTTCAAAATTGTTTTGAAAAATGCTCAAACATGAGATTTCCTCCTATTGATGATGCTTTCTCAGTTTAACTGTAGCCAGACTTATTCATAAGCAGAGTTGTTAAATACTTCACCTATTTTAATTTTAAAATAACATTGTTTTTCTTCAAAAATAATTCTATTTACATTAAGAGAGAATGCCTGAACTACTGTAAAATATCTAGTAGAAAAAAATCTCATAGTTTTTTTTTAGTCTGGGCCTGTTATCTAACATATTGACAAAATTGCAGTTGTTTAAAGTATATATTCTTAATATAAAATTCAGTTAACAAAGTTGTACTTAATAAGGGAAAGTAGCTTTTATCTCAATATATATAAAATAAAATAAAAAGTATCTGGGGCTTTAATAAACTATGGATGTGGGTACATTTTTTAAAAAACTGAAATTGGATGATATTCATCAGCTACTCAGAAATTTGAAAAATTAAATTTCCAGGGGGAGAATCATTTTACATTTTTTAAAAATTGTGGCAAAATGAAAGTCTTAAGATCGTCTTTCTTTACCGTGGTATTCAGACAAAAATAGTTTGAGATGTTGTTCAATCAGGGTAAAGGAGTTGAATTCTGAACTGGCATAGGTACTGTTGAGGTGGAAAATTGACTTGTTAAAGTTTATTATATCTCTTTTGTTATATATTAATAGACAGTACTGGAAAACAGTGGACCTTGCTTTGACCTACTGCAAAACAGTTCACCTCTTTCTAGATCTTATTTCTTGTCTTTCTGTCTTTATATTACATCATAATGATTACTCTTACCTCTAGTGAACTTTTATATGCTTTTCACTCTCTACCAAAAGTAATAATAAACAAAGAATAGTTTTCTAAAACCAGTGAAAAATTCAAGATATACAACCTAAGAGAAACTTCTTTACCTCTACTATTTTAAAAGTTCTTGTCATTAGTTTCAAGATAGTTTTATTTCTATTTTCAAAAATTGAAAAAACACCCACTAAGGTAGATTTTCATAGTGTGTCTCAGTATTACATGAACTTAGATATACTGTGAGATAACTATGCATTCTGAAAATATTCTAATCAGCCAAAAAGTACCAATTATAAGGTAGTTGTTGGTCCCATTTTTGACTTGCCGATAATACAAAGATAGTTCATTGAACTAAACAATGGAAACTAATAGCCTGACAAATCAGAAAGAAGAGATTGATTTTTTTTTTTTTTTGGCCCATTTTTTCTGAGATTGTGGTGCAGTCACTTCTCTTTATTGTATTATCTGGGGAAAAACACCTTAAATCTTTAAAGAGATATTTAAAGAAAGAAAACAGAGTTATTGCTAGCCTAAATGTCATCTACAAGCTGTGCTGTACACAGCTGTAACTAAGGAAGAATGCCCAGGCATATTAGCAAGCATCTTGATAACTATAGAAAAGGCATTTGTCACTTGGTACAAGTTATAGAATCAAAAGAGAGTGGCTTTGACTGCTGAAGTCAGTACTCACTCATCCTCAAGACGCACCTGAAGGTTCTGTCTACCCCCAACACTTTCACTCTCCCCTCCCTCTTCCTCTCTGTCCTCCTCTCCTCCTGCAGTTCCTTTGTGCCAGCTCCTTTGGAACTTTATCATGTACCTTACTTTTTCAGCTTTTTTGGTACAGAAAATATGTCACTTGTGTGTTATTCTATTTATTTACCTTCTCAGGAAACTTACTGTCATCTAGATTTCACCTCATTTTGACATAATTGTAGAAGAAACACCAGAGGTTTCTTTTGAGAGGAGGGCAAAAAGGAAGCGGCATATACAGCAGATTTGATTCCTTTCCTTTTCATAGCATCATTTTGCTCCACCATCTTTGTAGCCAAAAGAGTTGCTAGTACTTTTTATCACAATATGTTATTAAAACAGCTCATTTATTCTGAAGCATTTCGCTTCATTAACAAAATACCTATACAAATTTCATTATATTTCATTTATCTTGAGTTTCAGAAATTGCTCCCCCAAAAAGGCAGTTTTGAACAATAGCCCTCAAATATTTCTTATTTCTCCACATAAGTAAATAGGAATCAAAACTGGAGGAAAAATAAATGTGCAAACTTAAGCTCTGAAGTGTAGAAATGGAGTTACACTGAAACAGGTTGATTTCTGTTAAAGAGTCTGAGCAGCCAGTGCAACTGGCTGATAGTCTTGTCTTTTAAAAATCCCTGCAGTTTCCCAGGGGAGCTGAAAGACCAGTGTTCAAAAGCTTCCACTCAAAATTCCCAATATCAGAGTAACAAGTTTGGGAAATATGTACCTCTAAAACTCATTTTACAATATAAAGTTACTGCTTAGTGATGGAAACAAAAGCAAATGAGATATCAAAATAAAAACACAGTTACAATGTACTGGATATTACCTACAATGCTAGAAGGAGGCATTATTATGCCCATTTACAAAAGAAGAAATTGACGCTTAAAGATTAAATAAGTAAATTGTCTGTGATGACACTGTTACAGAAGCAGAATTTCAAACCTAAGTTTGTTCCAAAGTTCTAACTCATAACTGCTACACTGAAACTTTGATAATATAAATAGTAGCAAGTTGTCTTTTCTCCCAGGAACCCACCTTATACTAATTTATTCTCCATTCATTCATTGAAGAGACATAATTTTAAAATTGTGATGAAAAAACACTGTTTCCCTTCGGATCAGATCAGATCAGTCGCTCAGGCGTGTCCGATTCTTTGCGACCCCATGAATCACAGCACGCCAGGCCTCCCTGTCCACCACCAACTCCCGGAGTTCACTCAGACTCACGTCCATCAAGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTCATCCTCTGTCGTCCCCTTCTCCTCCTGCCCCCAATCCCTCCCAGAATCAGAGTCTTTTCCAATGAGTCAACTCTTCGCATGAGGTGGCCAAAGTACTGGAGTTTCAGCTTTAGCATCATTCCTTCCAAAGAAATCCCAGGGCTGATCTCCTTCAGAATGGACTGATTGGATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCTCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTCAGCACTCAGCCTTCTTCACAGTCCAACTCTCACATCCATACATGACCACAGGAAAAACCATAGCCTTGACTAGACAAACGTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTGAATATGCTATCTAGGTTGGTCATAACTTTCCTTCCAAGGAGTAAGCGTCTTTTAATTTCATGGCTATTTCCCTTACTACACCCTAAAAAATAATAGCTCAGTTTTGGGAACAGAGAAGACTCACCTCTCCTCCCATTCCTAAGTGAGCAATGACCAGAATCCAAATTGTAATAAGACGACCATCACAACTACACAAACTCCTTTTTAGAAGATTCGAATACTAACTGAAAAGAATTCAGGGGAGACAGAAATCTTTCCTTCCCTTGTGACCACTCTGGCATAAGGAAAAAAAAAAATTGTAACCCTGATTTTAGAATGGTAATGAAAGTATTTTCTTGATATTTAGAGCTCTTTTCTCACCAAATCAATATGAAGATATAGGGTGATAGTTCTGCCACATGCTATTTCTTTAATTAAAATATGTGTTCTTAACAAAGATGGATGTACTTTGAGAAATAAACACCAACAATGAACACATAAAATGACTCAATAATTGATTGGTAAATACCATGTAACATGGAATAATTATATACCCTGTGAATTATATACTACTTATAGTTGACATTATTTAGGAAACCTAACAAATGAACTTGCAATTTGTTTACAAATTTCAAATCCAAATTTGTTTACAGATTTCAAATCCAAACAACCAGTTAAATATCCTGTTATTATTTAGAAGTGTCCTATCTTTAGATACCTGGTCAATAATAGTCATGCAATTAGTTACACATATCACATCCCAAAGCAAAATACATACTATCATTGGGATATCAAGAAACAATTTATCGATTCAACACATTTAAAAAGGAAAAACTGAATCTGAATATAGTACTTAATGCATGCATGCAATCATCCAGTAAGTTTCCCAGTTATCTGCTTGACTGGCTCCTCATTGAAACACGTCTAAACTCTAATGTCAGCTTGTCAGCAAGATTCTCTTTGGCCTTCCTTTCTAAAACGGTTCTTATCCCAACCCAAGCTCCTGAATACCCTCTATCATATCGCTCTGTTTTTATTATCATTGCACACTTTTCACTCTCTGAAATGATCTTATTATTTGTTTTAAAAATATTTATTTCCCCCCAATAGACAGTGGGCCTTGTTTCTCTTTATAAAAAGTGACACTTTGTCTAATAAATAAATATCTTTTTCTACTATAAAAATGACCACGTCCATTTGCTCTACACTATAATCCCACTTGCTAGGCCCACCAGTAACACACTGGGTTGTTTGTCAGTGAATGAATGATTTACTGAGTACCAATTATGTTCCAGGCAAATGGTTAAAGTGCAAAACAAAGCATGGTCCCTGTTCCAAAAGTATTACATGCCAAGATACTGAATTAATGTACCATACACTTTCAAAGTACTTTCCAAACAAATGTTAAAAAAAATAAAAAAAACTAACCTTGATGTTTAATTCAAATATGCAGTTATCTTCAGTGCTGCCATATTTTTGTAACCTATTTCTACTTACTTTGCTACACAGGAACACACACTGAATTGTTTACCAACTGTTTCTGATCATGCACATTTATTTCCACAG
Seq C2 exon
ACAACAACATTAATTGGTCTTTTGAAGACAGCTCGACTCCTGCGTCTTGTGAGAGTGGCCCGAAAACTTGATCGATACTCAGAATATGGGGCTGCAGTCCTAATGCTCTTAATGTGCATATTCGCCCTGATTGCTCACTGGCTGGCTTGCATTTGGTATGCCATTGGGAATGTAGAAAGGCCCTACCTGACTGACAAAATCGGCTGGTTGGATTCCTTAGGACAACAAATTGGGAAGCGTTACAATGACAGTGACTCAAGTTCTGGACCATCCATTAAAGATAAATACGTCACAGCACTTTATTTTACCTTCAGCAGTTTAACAAGTGTGGGATTTGGGAATGTGTCTCCTAACACCAATTCGGAGAAAATCTTTTCGATTTGTGTTATGTTGATTGGCT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000001899:ENSBTAT00000002469:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF084125=Ion_trans_N=WD(100=36.6),PF0052026=Ion_trans=PU(31.0=45.8)
A:
NA
C2:
PF0052026=Ion_trans=FE(63.3=100)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
ALTERNATIVE
Chicken
(galGal3)
ALTERNATIVE
Zebrafish
(danRer10)
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]