Special

BtaINT0081323 @ bosTau6

Intron Retention

Gene
ENSBTAG00000018061 | KIAA1715
Description
Bos taurus KIAA1715 (KIAA1715), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001075989]
Coordinates
chr2:20949319-20967842:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
18277 bp
Sequences
Splice sites
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Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
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Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
LOW PSI
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]