MmuINT1022316 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000009207 | Lnpk
Description
lunapark, ER junction formation factor [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1918115]
Coordinates
chr2:74554988-74569128:-
Coord C1 exon
chr2:74568941-74569128
Coord A exon
chr2:74555047-74568940
Coord C2 exon
chr2:74554988-74555046
Length
13894 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GATGTAAGT
5' ss Score
9.11
3' ss Seq
GAACTTTGCTTCCTCTCTAGCAT
3' ss Score
7.06
Exon sequences
Seq C1 exon
GAAATTCAAGCATTGGAAGAATTTAGAGAAAAAAATCAGAGATTGCAAAAATTATGGGTTGGAAGATTAATTATCTATTCTTCAATTCTTTACCTGTTTACCTGTTTAATTGTGTACTTGTGGTATCTTCCTGATGAGTTTACAGCAAGACTTGTCATGACACTCCCATTTTTTGCTTTTCCTTTGAT
Seq A exon
GTAAGTATTATTTTTGTTGATCTTTTTCTTTTTTGACCAGATTTTAATTTTTTATTATAAAATATTAATGTCTCAGATTGAATAAATTCATTTTTGCAGTTTGATAATTTTTTTTAAATTGTAGGATAATTTCTACTTTATAGCCCAAAGGATATCACCATTGTTACTAGTAATGTATAGTTTTCTGATAGATGGCATGATTCCTGTAGGAATTGGGCATGGAGCAGGGGAGGTATTGAGTGGCAGAGGCTTGTAAAACTGAAATAGTAAGTGTTCAGATGACTCTAAATATGTATCTTTCACCCAAACTCCTTTCTTTAATTATTGTTACAATCAATAATTTCTTCCTTAAGTACTTCATAGTCTGGTATTTTATAGGAGGTATATCTCAACTGAAAATTTTGGGGAACAGGTTTTTCATTTAATTAGCAAACATTTATATGGATAACAGTTGTGTAGACATTGGGTTATAATTGTGTATTGTGAACAAAATTGAAAAATCTTTGACTATAGCTCTTAGGCTATGTGTAAAGTAATAAATATGCTATGAGAACAGGGGCCCCAACTCAGGCTTAGTGTGGGGGGTCTAGAAAGAGTCTTGATTGTAAGTTTTCAATTGGTCTGAAGCAGCTTAAAGCAACACTCATTATTATATCAGAGCTCTGAAGTTTGAAATTCAGGCAGCTTAACTGGGTCTTTGCTTAGAATCTCAGACTGGAGTCTCCAGGGATGAGACAGTGAGTGGTCTATTCAGAATCCCAGGAGGGAGGATCTATAGACCTAGGCTGTTGGTCAACTTCTGATGCTCTGATATACCTGGGTAATCTATGATAATCTCCCACTTTAAAATCAGTAACTTTGATCATAGCTGCACAGTCCTTCACAGCAGTTGCCTAGATTACTGTGTGATTGATTATATAACCAAAGGCTGCACTAAGAGGAAGGATCTCAGTGGAATTGTTTACTACAGACTTCTGAAGAATTGATGTCTGAATTTGAGACTTGCAGAATGGATTATGTATAAAGTAGTCTGACATGGTGGCAAGAACAGTGGTAGCTGTGACTGTAGGAGTGTCGTCACATTGCATTTGCAGTTGGGATACAGAGTAAGGTGAATGCTGTTGCTACACTTGTGTTTACCTTTTCATTAAGTCTGGGACCCAGCCCAGAGTGTGGGTCTGTCTACATTTAGTTAAGCCTCTTATACATGTCTGGATGTCTGTTTCCTGAGTGATTCTGAATCTAGCCAAATTGACAAGATTAACCATGGCGTTATTTTAGCCACTGAGAGTGTAGCTTCTAATAAATTAGAAGGAAGTAAGAGTGGATCTGGAGTAGGAAGCTGGAAGGATATTGTAGTTGATAAGGGAAATGATGAATGCTTTGTATTTGGTGGGTGGGAGAGGAGCAGATGGATTGAGTGAAATTGATGGATTGGAGATTTAGGAAGTAGAATTGAGAGACTTGGTAATTGGATATGGGGTGAAGAGGAGGAATCACTTCAAGGATAAAATTCAGGTTTATAGTTTGGAATATTTGGTTGAGGGCATTATCATTCATCAACATAGTGAATAACACAAGCGGGAGGAGGTTTGGTGAACCACTGTATCTTCCTATTGGAACTGTCAAATGAATGGCTAAGTATGAGTATGAGGTTTAGAGAAAATTCAGTAGCTAAAAGTCAGGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAAACCGAGGCAGAAGGATCACAAGATTAAGACCTGCCTGGACTGTAGGGGAATTGATTCAGGCTATGCAACCTACTGAGCACCTGTGTCAAAAACAGAAAATACAAAAGGTCTAGGGACTATAGTATATTAGTAGAACATTGCTAGTATATGTGAGGCTCTGGTTTTGGCTCCTAGTACCACTCACATGCACGCACACACACACACACACACGGTTACCAAAGCCATCATCTCTTTATTTATTAAGTATTAGGTATCTGCAATGTGTTAAGAAGTGATCCAGATCATAGTGATGTGAAAAGTAGTGGTAAGATTCTGCTCCATGTAACTTGAATTCCTGTGATTGGGCAGATAAAAATAGAGATAAGTTAACAAAGACATACAGTTAATTGGAGAGAAATATGTGCAATAAAGGATATCAAGTGATGTGATTTAAAATAGGTTTCTTTACAAGGGTCCTGGAAGGCCTCTTTTTAGGCAGTGGTATTTGAGTTGAGCATTGAGTGTGAAGAACAAGTACAGAAAAAGTTGAAGTTTATGAAGACTATATGGAGCATATAGTGGCACATATACCTAGAAAGTTCTATATAAGGTATTATTTAAAAAATACTAGTGGTAATTCTTTCTAATGGAGTGATTTTAAGTAGTTCTTTTATTCTATATGTTTTCTGGTAATGTTTTCATTTTTTTTAAACACCTGTGTATACTTTATATTGTTAAAAACAAGGTCTAGGATTTGAAGGATTTGCTTCTAAAACTAGAAAATAGAAAATGTGTAGACTGAGAATTTGAGTATATAGTTTTTGAGGGGCAAAGATGACAGGCATATTTGTAATGTGTGATGGAGAGATAAATGCTGAAGGGAGGTTATGGAAAATCAAGCCTGGGAGTATGAATCTCACAGTAGGTGACGTGGGAAGAAGCTTGATATATAGAAATTATAGCAAGAGGGCCACATATAGGCTGTTTTATGGAGACAAAAGTAGAATATCTAGGAAGCTGCTCTATAAGGTCTTTTGCTTGATTTCATTTTTGAGACTGGGTTTCACTATTTGACAGTGGTTGGCCTGAGACTCACAGTGTACACCAGGCTGACCTTAAACCTACAGAGATCTGCTTGTTTCTGCTTCCTGGTTGCTGGGATTAAAGGCTTGCACCATCATTGCTTGGCTTAATAAATTTAATCTAAAGATAAAGGTAAATTGGTCTGCCCAGTAATATCAGATGTTAATAGATAACTTAGAAATATTTTGAAAGTTAAAACTGGTAGGATATGACAGGAAGAAATGGGATATAGAAAAAGTATCAAGACTGCTAGGTCAGGTTTTGGTTTAATCTTTAGTGCAGGACATATTTCCAAATTTAAACTCCAAAACTCATAATCAACTTTGCATGTGTAGAGTGAACACATTTATGTGTGTGCTCTGTGAGACCTGAAGTTGAACTCAGGTCTAACATTGCAGTTAGTTTTCTGGTTGTTGGCCTTGAGCCTCATTATATGCTAGGCAAGAGCTCTGTCTCTGAGCTGTGCTGCCAGCCTCTCTCTTAACATCTTTATTTCCCTTTCTTAAAAAATCTTTTGGATTTTTTTAAAATTCCAAAGTAGAAATGATTTTATAATGCTAAGCTCTTTTACATTGCTTCCTTTCTATTTTTCACAAAAAGTAGGGAGAAAATAAGATTAAAAGTATGAGATACTTCATTGATTTAAATATTTTAATAAAAGTAGGAAAAATACTCGAACTTTACATTCAATTCGATATAGCAGTTTGATTTTCTGAATTTAAAATGTAATTTATAAATATCTCATTAGAACTTTGCTAATTCTAGTTGTTGCCCCAAGTTGTGCTTTGCTGGATCTGTTACTAAGTCACAAGAAATACTTTTGAGACAAATAAATCACTTATTATTATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTTGAGTCAGAAATTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGTCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTACCTCCCAAGTGTTGGGATTAAAGGTGTGCACCACCACTGCCTGGCTTTATTATTTGTGACATTGGGAATAGAATCAGTGGTCAAGTATTAAATGTTTCCTCTTAGCCAGAATCATTTTTTAGAGTTAGAAAAACTTTATTACATGTTCAAGTATATTTAATTATCAATTTGGCATAGCCCAGAGTCATCTGAGAAGTCTCATTTGAAGGATTGTCTGGATCGATTGGCCTACGGATTACACTCTGGGGTGATTATCTTGTTTGCCAATTGATTAAAAGGGCCCAGCCCACTGTTGGGGTATCTTCCTTAGGCAGGTGGTTCTGGACTGTATAAGAAGGCTGCTACGTGTTAGGTTAGGAGCAAGCCAGTAAACAGTTTCTCCATGCTTCCAACCTTCTTTGAGTTCTTGTTTGAGTTCGTGCCCTGACTTCCCTCAATGATGGATTGTGATATGTGACGTATAAACTAAGTAAAGCACTCCTGTCTTCTGTTACTTTTGGTTAGTGTTTTATCAGCTATACAGAGGAAACTAGAACAGTCACATTGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGGGTCAAGTGACTTCTTAAGGGTGGTGGTTTTTTTCTTCTACCGTGTGGGTTCTGGGGATTGAATTTGTGCTATCACGATCTATGCTAAGAGCCTCGGCCCAATGAATCATCTTTTGTGGGACAAAAAATGGGGTCCCGCATCGACTTGGGACTAGGGCCACTGGGTGAGGCAGACACAGGGAGTTTGACTGTGCAGACCCCAGGCCGCTGGCAGTGTTGGACTGTGAGAAGCCGCGGGATCCGGCTTTGGAATGGGGAAGGCACAGTCTGAGGTTCCCACGGACCCGCTGGAGTCGGGCTTATACTCTCAGGCACCACAGAAGAGCCGATTCTGGGGTCCCTGGTCTGCATGGAGGCCAGGGACGTCAGGTTCTCACTCTTGGACATCCCAGACGCCACTGTATGTCGTGGCAGAGCTGAGAACTGGTGGGGAACCTTGGGCGGACTCTGGCCTGGGGGCCTAAGGGAAAAGGGTAGGAGGAGAGCTCTGGCAGGTTACCGCGGGGAGTCCTAGGCAGGGCGGGTTGGTTTGGTGGAGACCTTGGCTGTAGTGCAGGGAGGCCTCCCTGTGGGAGGTTAGACATGCAGCTTGTTAGGGGAAGACCTCCATTGCTCCAGCACGTTGGGTCCGGATGAGAAGAGACAGTCCATGGTTTTAAGGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCAAGAAAGGCAGAGAGAGGAAGAAAGTAGGGAAGTAGAAGCCGGCCATGGCCACATAGAGAGAGGGGAGAAGGGAAGAGAGAGGGGAGAAGGGAAGAGAGAGGGGAGAAGGGAAGGTGGAGAGAGCGGGGAGCAAGGGAGCAAGAGTAAAAGCAAGAGGGTAAGAGGTAAGAGATCCAGGAGGGGGCAAGCAACTCCTTTTATAGTGGGCTGGGCTATCCTGGCTGTTGCCAGGTAACTGTGGGGAGGAGCATACCTGGCTGTTGCTCCCCAGAGGTCCAGACAGAATACCAGGAGCTTGGGGCATTGCCTTTGTGACTGATGGCCACACACCTCTGTGTGTGTTGGGGTGGGGAAGTGGGGAGGGGTTGTGGGAGGTGGGCCCAGGAGGCGTGGCTAGACACCTTCCTTCTCTTAAGGTCACCAGGGTTCCAGGCTCAACTGTGCACGGCTCACTGCCCCATAGTCGTCCCTGCCCATGAAGCATTTGAGTGTGTGTATGTAGTGATTTAACCCAGTGCCCATGCATGCTAGACAAGCACTCTTCTCGCTTAGTCACACCTTCGGCCTATTGTATCATTTATAAGCAGTCTTAGCTATTCTTTGTCTCTTTCTTTTCTACCCTCTTCTTCCCTCCCTCCATCCTTCACTTCATTTTTCCTTTCTCATCTTCATCTTCTTCTGTTTTGATTTTTGAGACAAGGTTTCTCTGTGTAACCCTGTCTGTTCTGGAATTCACTCTGAGGCAAGGCTGGCCTCTGACGCACAAAGATCCTCTTGCCTCTGCCTTCTAAGCACTGGGATCAAAGGTTGGTTTTCACCCCTCAACCCCCTAGTACTAAGACTCAAACTCCCTGGGCTTTTTCACATATGCTAGGCAAGTACTCTACCACCCTCTAGCCCCACTAAATTATAATCAAAATGCAACATTAGGTCATAGACATCATTAGGCTTTGTCACAGGGAGGGAAGGTCTGGGTATACTTAGACTTTTGTAACCATATTATGTTGACAGATATGTATTGCTTTAGGAATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTGAAATAGTGTCTCAGTATATAGTCCATGGGACCTCTAAGTAGTAGTCCTCTTGAGTGACAGGAATATAGGAGTGTACCACATGCCTGCCAGACTTGGCTACATAGACACACATACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACACACATACACACACATACACACACACACATATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTTTTTCCCAGTTGTTCTGTGTGTGTTAGACAATCATTCTATCTCTGAGTTACATCCCCAACCCTTTCTTTTTAGTTTTTATTTTGAGACAGGGTCTTGCTCAGTGAATCAGGCTGGCCTTGAAGTCATCCTGTAGCTTGGACAAATCCTGGAACTTTTGATTTTTCTACTTCAGCTTCCTACGTGGCTGGATTAAAGGCCTGTATCACACATATACATCATGTATGTGAGTGTCTTCTCCTCCTCCTTCAATTTTATGTGGTGTTTAAGATCAACTCAAGGCCTCATGCATGCTAGGTAAATAATTTACAGCTAAACTGCATTCAGTTCTAGTTGGTTTATTTTAAAGTGAACTCCTTTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGGGCCATGCATGCTAGACAAGCACTCTTCCACTTAGTTATACTTCCAGCCTATTATATCATTTATAAGCAGTCTTATGTATTCTTTGTCTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTCTCCTTCTCTTTCTTTTTTCTTTAGACATTTTATTCTCTATAATTTCAGAAATTAGTTACTATAAAAGTTGATATTCCCAGAGGAGTTACCATGGGTTTCCTCCATGGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTAAACTAAGATCTTTTTAAAATTGTTTTCTCTTACAATGGGACTCTGGGGAAGGAATTTAAGCAAGGGAATTGAGAAAGGTGCTCATGTTCCTGTTTCTTTTTTTATAGCCCTACTTTAATTGGAAGCTGTTAAGAATACTTTGATCTTAGTTACTTTTCTATTGAGGTGACAAAACACTATGACCAAGGTAATTTAGAAAGAACTTAATTTGGTGCTTATGGTTCCCAAGGTTAGAGTCCATGATGATCATGGCAGGGGGAACATGGTAGTGGGCAGGCAGGCAGGCATGCATGGTGCTGGAACAGTGGGTAAGAGAAAACAACCACAGGGCAGAGAGGGCACAGTGGAAATGACTGGGCTTTTTGAAACCTCAGAGCTCCCTCCACTGACACATCTCTAATAAGACCACACCTCCTAATCCCTTCTAAACAGTTCTACCAACTGGGGACCAAGTATTCAAATATATGAACTTATGGAGACCATTCTTGTTCAAACAACTACATACAAATTTCATTCTTTTTAGCTACTGGATATTTCCTGAGTTTAGTTAGAAGACTGGCAAACACAGCTTTTTGAAATAAGTTCAATCAGCCAACCTACTGTACCCTCCCTCCATCTCTCTCTCCCTCCTCCTTCCCTCTCTCTCTTTCTCTCCACGTAAACACCCAGGTGTAGAGATCAGAGGACAACTTGAAGGACTTGATCTCTCCTTCTACCATGTGGGGTCCTGGAGACTGTATTCCAGTCCTTAGGCTTGATGCAAGTGCCTTTCCCCACTGACCCATTTCAAGGGTCCCATAACAGAATGTTAATTTTTTCTTGTGATGAGATTCTATTTGTCATTTTTCTTTTTATGGATCTTGTTTTACTTGGCAAGTATAAGAACCTCTTGCTTAGTTATGTGCCCCAAAGCTTCCTTCTGTGTCTTTCCTTCTAAGCCTTTTAAAAGAAACACTTTACACTTAAGTTTGTAATGTATTTTTAATTGATTTTGTATAGGGATGAGGTGTTGGTTGAAGTCTCTTTAACCCCAGATACTGCCTAGTGGCTGATTTATTAGAAAGGAGCTGTACCTTTAAAAACAATTTTAATAGATCTTCTTAAAGTACAGTGTGTCCATATGTAAGGAAATGTTATAATGAAACCCATTATTTTATACAACTAACCTGTGGTAATAAAATTAAAACGATAAGTTCTCTTTCTCTAGTTGTCTTTTTTTTTGTGGTGTTAACATATGCACCTTCTATTTTATTTGTCCCTGGTCTGTTTCTTTTCATTATTTTCAGTCAGAAAAAACAGTTTCAAAGTCATCTTAAATTAATGATTATATTTTATGTTATGATCTAGTATGGCAGTCTCCCATTGAGTTTCTAGTTTTCAGTTGAGTGCACTTTCCTGATAGGAGTTAGGTTTAGTTTTGAAATATAATGTACTTTAAAAAGAAGTTTTTTAATAAAAGAAGACTTACCATATGTTTATTTTTGTGCCAGTTATTTGTGGGAGACTTATTTGGGATTAATGGAATGTGTTCTAGATTGACTGGAATTTTCTTTATTATCTAGATTTACATGTGAAATTTTATCTTTTCCCAGCTAGTGAAGTTAGGCAACTGTATTTTCTCATGGGTCAGAATCTCTTTTCTCCTTCCCTGTCATAGAAATACTGACTGCTCTTTAGAAATAGAGCACTTTTGAATAATTTATTTTTTTATCTCTTTCCTTTTCTTTAGTTATGTTTCTTATCATTTTGCTGACACCAGCTGTAGACTGTACACTTGGGAAGGTTTATCCTGCTGGCCTCTCTGTGACTATTCTGAAGTTCGGGTTTTATAGTTGCAACTCCATTCTTATCAGAAAAGGCGACTACAGTTTTATTCTTATCTTGTTTGAATGATTTCTAAGGCAGGAATTGGGTGAGAATGGAGAATGTGCTATTATTAGCCCTTTTACACACACACATACACACACATACACACACACACACACATACACACACATACACACACACACACACACACACACACATACACACACTTTCAAAACCATGTCTGTTTTTCCATAAATTTCATTTAATTACTAGGAGAGGAAAGCCTTAGATGGGATAAGTAGAGCATAGATCCCTGAATTACTGTAATTATGTTTCTAAATTCTATAATAAAATACAAAATAATTTCCTTTAACTTAGCCCTAGAGTAAGAACTTGTGTATGCATGAAAAATGGCAACAGAACATTTTTAAGAGCAAGGCCTTTGTTAATCTTGGAAAGTGGACACAAGAAGTATTGTTTGTTAGCTGATTTTTCTCAGGAGTAGTTCTGATAAAACCTGAAAGGATTGACTGTCCAGAAATGGGGGCAGTTTTGGTTTGAGGAGAATATATCCCAATTTTTATAGTTACATTTTAAAAGTTATGTATACGATTTAAAAAGTATATACTCATTTAAGAGAAATCTGTTTTTCCATCTTTACTGTCTCTGCAATCCCTTTCTGGTTTCATTTCCTCTCTGTACTTTTTTTTCCCTTCTAAATCTTTCTCAGAGTACAACTGTTACTCTTATCTATGATTTTGCTTTCTATGGCTTCAGTTGTCTACGGCTAACCACAATCTGAAAATAACTAAATGGAATATTCTATAAGTAAAAAAGGCACAACTTAAATTTGCTGGTCTGAGTAATGTGATGGCATTTATACCACACTGCCCTGCCCAGAATATCAGCCATCCCCTTGTTCAGTAGATCTATACTATAATATGTGACCTGTCAGTCTCTTAGTGGCGGCCCTCTTGGTTATCAGATCGATTGTCCACGATATCACAGTCTTTTAGCTAACTCTAATTTTTACTCTAATAATGAGCCCAAGCCACAAGAGTAGTACAGCAAAGAAAGCATCAAGGAGGCCAAGTTAACGCTGTTCAGGGTAGCAGTGCTCGATGGCATCTAAGAAAAACCATCTGTACGGTAGTTCTCAATCTGTGGGTCACAATTGCTTTTGTTCTTGCACACCAGGTATCCTGAATATCAGATATTTACATTATAATTCACAACAGCAAAATTACATTTATGAAGTAGCAACAAAGTAATTTTGTGATTGTGGGTCACCACAACATGAGGAACTATATTAAAGTGTCACAACATGAGTACATTAGTAAGGTAATGATGCAAAGGATTCAGTCCATCTGTGTTTCAGGTATCACTGGGGCGGGGGTTGTAGGATTTTGGGGAGCATATTTCTTGTAAATAAGAGGGGACTGTTTTCTGGGGATTCGCTGTGAATAAGTGGTGTTTAACTTTTCTCCTTATCTCTCTTCCCTTGAAAAAGACAATGCTTAATAGCTCTTCACTGCTTTGGTAGCTGCTGAAAGAATCATGTTGGAATCTAGTGTTAGTTATTTGGTGTATTCTTATCATAAAACTACATCATCACAGTTTAGAGGTGTGTATGAATTATCTATAGCTATGTAGCAAACTGCCCCAGAATTTAGTTGCTTAATAAGTCCCTTACAGTTGCTGAAGGACAAGAAATGTTGGGAGCAGCTTAGATGGGTGACTGTTTCAGAGTCCTTTGTTCTTATATAAATTACAGTTAAGCTGTTGGCTTGGGCTGCAGTCATCTAAAGGCCTAATTGTGTCTGCAGTCATAGCAGATAAAGTCATTGCAGAGTTTACGCCTGCCACCATCCAGTTTCTGGCTTACTTCATTTATTTTTGCCTTCGCTCGACTTCATTCTGTTTTTATATTTGTTTGCTTGTTTCCTGGAGATCTTTGTCTTTTTATTAGGCCATATCTTGTAAATCTATGCTTATGTGTGGATTTATTTTCCTTGCTGCAGTTATAAATCATGCCAGAGCTGATTGTTTTGCCACTTTCAAAGTAGATTCTGAACCTAAATACAATGAGGACATCTGGAATAGTTTTAGGCATTTTTTGGTAATCTTTTCAAATCTGATTTCAGTCTTGCACATTGCTTAGCAAGTTTCAGCCTTTCATTAGGTGTTTCTCACAGGCTCATTGACTTTCAAAGTCACTGATCCAAGAGAGAAAGACAAGGAGAGGGACCCAAATCTGAGCTCTGTCTGACTTTGTCTTCACTGTCACCTCTGTCACATCTAGTCAGTCATGGTTGTGAGAGGATCTGTTGAAGGTCTGAGTGTGAGGAGGCCCGACTGATAGGGCGCTGGGATTGGAGCTCCTTTTCTCCTGACAGAGCAGCCAGTGCTGTTAGCTACTAAGCCACCTCTCAGCTGTGTTGTTGGTTTCTTTTTTTTGTACAATGTGAGAAATAATTATCTAGTTTCCATTCTAACTTGAGGATGTTGAGTTTTTCCAGTGTCATTTGCTAAAAAGGCTGAATATTTTTGTCATCTTTGTCAAGTCAGGTGGTTGTCACTGTGGGTTTATATCTGGGTCTTCTCTATTACACTGATTTATGTGCTTTTTTCTTTTTTTTGGTGCCCGTTCAGTGATATTTTTATTACTATAGCTCCGTAGTTAACTTGGAATTAGGTAGGAGAGACCTCCAGTGCCTGTGCATGCATGCGTGTACACGCAGTGCACATGTATGCACACAGGCACACACACACACACATTTTTGTGAGGAATGATGTTGGAATTTTGGTAGGGATTGCATTGAATGAGTCTGTAGACTGCTTTTGGTAATATAGTCATTCTCACAGTCTTAATTCTTCTAGTCCATGAGCGTGGGTCTGGGAGATAGCATGTCTTTTAGTGTCTTAAATTTCTTCAGTTTTACAAAGTTTTCATTGTAGAAAACTTTTCATTACATTTCTTTGGCTAGGCTTAGTCTAAGTATTTAATTTTTTTCTTGAAGCAATCGTAAATGGGACTGTTTTCCCAATTGTTTGTCAGCTCCCTTCCTAAGAAGGCTGCTATTTAAAAGTTAATTTTGTATCCTGCTTCTTTGAGAATTTTTATCAGTTTATTGGGGGAGTTTTTAGGGTCTCTTATGTATAAAGTTCTATCAAATACAAATAAAGATACTTTGGCCTTTTCCTTTCCTATTTGTATCTTTTGTTTCCTTATCTTGTCTTAGTACTGTAGGTGGCTTTAAACAGTACTCGATTATATCAGAGTAGAGATAGTAGACAACTTTTCTTGCTCTTGATTTTAGGTAATGCTTTGTTTTCCTTCCTATAGTGTTGGCTATAGGTTTGTTTTATATAGCTTTATTATTTTTTTATTACTACTTTCCTCAGATTTTTAAAATCTTTCCATGAAAGGTTATTAGATTTTGTTAAAAGCTCTTCCTGTGTTTATTGAGATCACATGGTTTCTGTCTTAGAGTTCATTAATGTGGTGTATTATATTTATTGATTCTATATGTTCTTGCACTATCCTTACATTTATGGAACAAAATCAGCATGGCATGGCAGATGATCTTTTTGATACTTTCTTGAATTGTATTTTAAATATTTTGTGTAATTTTTATATTTCTGTGGTCTTTAGGGAGACTATGGCCTATAATTTTCTTGCTTTCTGCTTTTTGTATCAAGATAATACTGCCTTCATAAAAAAATTGGTAGTGTTATTTCCCACTCTATATGATGTAGTAGTCTAAGAAGCATTGGTGTTAGTTTTTTAAAAGTCAAATAGAATTTATTAGTAAATCCATCTGAGTCTCTTTGATTTGGGCGATTTTATTATTATTATTGACTCAATTTAATTGCCTGTTATGATCAATTTTTAATCTTTTCATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGGCAGACATGCCATGATATACTTATGAAGGACAGTGGACAGTTCTGTGGGTTGATTATATGTGGGTTCTGGTGGTTGATGTCAAGTTGTCAGGTTTTCACAGTACTTTGACAAGCAGAGCCATGTGGCTGGCCTATGGTTGCCTGTATTTATAGTAGAGATGACCTTGACAACCTTGTGATAGGATTGTTTTCTTAGTTTCTCTTAATTCTTTTAATATTATTGGATATATTTAGTAGTGCAAAGTCTAAAAAGTTAACTACCATAACATTTTAAAAGGAGTTATTTATTAGCTAAATTTTATTTATTATTTATTTGAAAGTAAGGCTTTTTTCCGCCTCTGAATTTCATTCTCCAGATAGCTTATTCTATTGAATAAAGATCTCTTCAATGTTAAATGGTAGGGATTTGTAATAATACTCTTGTTTGGAAAAGCAAAACATGCTTGCCTGTTAACACAAGGGAACAGATAGGAAACAGTTTTTGGAACTTATATTAGAAAGCATTCTTGGGGTTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCTTGTGCTGCTCTTTCAGAGAGCTTGAGTGCAGTTCCCAGCATCCATGTCAGTAGGCTTCCAACCCTAACTTCAGCTGCAGGGAGTTGCACATCTTCTGGCCTCTTTGAGCATCTCCACACATACGTACATACAGATGCACAGACTCATGCACATAAATACAATAGCATGGAATTAATAAAGCATTCTATAGTACTGTTCTTAATGCTTTGGGGGATTTATAGACCCTTTGGAAATTGGCAGAAGCAATGGTTTCTCTAGAGAAATGAATTCGATAGTTCCTGAGGAACTCCAGGGGGCCCCTGGGATTCAGGTTGAGAACTCACCTATTGGAATGTCAGTGATCCTCTGGTATTCTTAACAAAACAGTCAGGGTTTGATTTTTGATACATACAGAGAAATGTCTAACTCTAATTGAAACTTTATTTTTGCCTGTAGATTCTGATTTATCTCTTGTAATGATGGATTTTGTTTTGAACTTTGCTTCCTCTCTAG
Seq C2 exon
CATCTGGACATTAAGAACTGTACTTATTTTCTTCTTTTCCAAGAGAACAGAGAGAAATA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000009207:ENSMUST00000064503:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF136871=DUF4153=FE(60.2=100)
A:
NA
C2:
PF136871=DUF4153=FE(19.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types