Special

BtaINT0129695 @ bosTau6

Intron Retention

Gene
Description
Bos taurus secernin 1 (SCRN1), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001110803]
Coordinates
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Secondary ID
ENSBTAG00000016223:ENSBTAT00000021588:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.019 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0357710=Peptidase_C69=PU(13.0=52.8)
A:
NA
C2:
PF0357710=Peptidase_C69=FE(27.9=100)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]