BtaINT0157579 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000002084 | UNC5C
Description
unc-5 homolog C (C. elegans) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:12569]
Coordinates
chr6:30717111-30735381:+
Coord C1 exon
chr6:30717111-30717275
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chr6:30717276-30735189
Coord C2 exon
chr6:30735190-30735381
Length
17914 bp
Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000002084:ENSBTAT00000039753:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]