DreINT0018048 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000098654 | RFTN1 (2 of 2)
Description
raftlin, lipid raft linker 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30278]
Coordinates
chr16:48870137-48898897:-
Coord C1 exon
chr16:48898782-48898897
Coord A exon
chr16:48870241-48898781
Coord C2 exon
chr16:48870137-48870240
Length
28541 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GACGTGAGT
5' ss Score
9.22
3' ss Seq
AATATTTTTCTTTTTTTCAGGGT
3' ss Score
10.83
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Chicken
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]