HsaINT0186594 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000198169 | ZNF251
Description
zinc finger protein 251 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13045]
Coordinates
chr8:144721129-144753796:-
Coord C1 exon
chr8:144753683-144753796
Coord A exon
chr8:144723383-144753682
Coord C2 exon
chr8:144721129-144723382
Length
30300 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGA
5' ss Score
8.68
3' ss Seq
TTTATATTTTTCTTTAACAGATT
3' ss Score
11.07
Exon sequences
Seq C1 exon
GATTCCCTGTCCCTAAGCCGGAGTTGATCTCCCAGCTGGAGCAGGGGAAGGAACTTTGGGTCCTGAATCTTCTGGGAGCTGAGGAACCAGATATCTTGAAAAGCTGCCAGAAAG
Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
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Main Inclusion Isoform:
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Other Skipping Isoforms:
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains