RnoINT0167906 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000030308 | Zfp251
Description
zinc finger protein 251 [Source:RGD Symbol;Acc:1311138]
Coordinates
chr7:117909961-117938551:-
Coord C1 exon
chr7:117938438-117938551
Coord A exon
chr7:117912930-117938437
Coord C2 exon
chr7:117909961-117912929
Length
25508 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGC
5' ss Score
9.6
3' ss Seq
TTGTGCTTTGTGTTTAACAGATT
3' ss Score
10.37
Exon sequences
Seq C1 exon
GATTCCCAGGCCCTAAGCCAGAGCTGATCTCCCAGCTGGAGCAAGAGGAGGAGCTGTGGGTCCTGGATCTTCTCGGGGCTGAGGAACCAGAAGTCTTGAGAAGCTGCGGGACAG
Seq A exon
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]