DreINT0049167 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000005762 | col14a1a
Description
collagen, type XIV, alpha 1a [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-030131-9889]
Coordinates
chr16:14933669-14946385:+
Coord C1 exon
chr16:14933669-14933808
Coord A exon
chr16:14933809-14946252
Coord C2 exon
chr16:14946253-14946385
Length
12444 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTCAGT
5' ss Score
7.7
3' ss Seq
GTGTTTGTATGTTTATGTAGGTT
3' ss Score
8.95
Exon sequences
Seq C1 exon
AGCTGGTGCCAGCGCCGTTCAGCCTGATGACATCAGATGTGACCTCAGAGAGTTTTCAAGTGAGTTGGTCACATCCGGCCAGAGATGTGGTGCTCTATAAGCTGATTTGGTCACCAACTGCTGGAAGAGATGAGAGAGAG
Seq A exon
GTCAGTCAGTTACAAATATAATGACTAGCTATAACTAATATTTTATATGTTATTATAATACAGTACTGTTCAAGGTGGGTGAGCAATTCTTTTGAAAGACAGCAAAACATTCTGTTCTTCAAAAATGAAAATAACAATATGAAAAGTAAAAGAAAAAATGTTGTTACAATAAAACTGTCTTTCAAACAAATGCTGCTATTTTAAAATGAAACATGTAACGTAGTATATGTGTGCAAACTGCACTAAATAAGCATAGTAAATATTTATTTTACACTTTTTTATTATAGCAATTGATTATTTAAAAATACAGGGTAAACACAAAACAAAAATGCATTTTCAAGCATTGAAAAAAATAAAAGTGTGATATTGTTTTATTTATTTATTTATTGTTTGTTTGTTGATAAAAGTTGGAAGCATTCAGTTAAATTGTAATATTTTACATAGCATTATTTAGATATAAAGACAAATTTTGTCAATTAGCCTCACAAAAATTTATATATTGTTATGTTTTTATATGTTCTGTGTCTCAAATGTTTCATGTGTTATAAACCCAGGAAACATGCTCATTGAGAAAGCACAGAGAAATGACCACTGATTGTTGGCTAAGTAACTCATTATATTGCAGTGAATGTATACTTTATTTTTCATAAATTAATTATTTATGTTCATTTTTGCAAGTAAAAATAAAACCTGTATTCCTTGATAAACGCTCTGGTTACTAAAGTAACCCTCGTTCCCCGAGGAGGGGAACGGAAGTGCTATTAGTGGATTTGATTTAGAAAATCCACGTATTGGGAGGATTCAGTTCAGAAGCCACTTGTCTGAAAGAGTATAAAACGGGCCAATGAATGCCAATGAATTGGAAGCGTAAGCTTGCGCAGGTGTGCTTCATTGCCAATTAACCCACCATATAAGCACAGGTGGAGCAAGCATATGCTATCCTTTTTAAGCTGAAGAGACTTTGCTAACAGCTAAGGGACATTCATTATGGCGATGGTAAATAGCATTCCCGTTCCCCTCCTCGGGGAACGAGGGTTACTTTAGTAACCATTGCGTTCCCCTTCGGGTGGGGAACTCCAATGCTATTAGTGGATTTGATTTAGAAAATCCACGTATTGGGAGAACTATGGAAAACGCCATAATGACTGCACCTTACCAACGCCTCCGATGAGAGGATTGTCAAGCAAGCGTGACGCACCCACATCATGGGAGGCGTGGTCATGGGGTGGCGCTCCTGGACCACTAGTGTGGACATCGTCCTCCCCAACGCACACGCAGCGGACTTAGCATAGTCGGATGCGGTGCGAAGCTCATAAGCCTGGGTTGGACCCACCCTCGTGCAGCTCGGTCAGCGCCTGCGCTTTGTAGCGCTGGTAGGTGGCTATCAGATGCAGGGCGGAAGCAGCCTGGCCCACAGCCTTGTAAGCTCTAGCTCCGAGGGAGGCAGATAACTTAAAGGCTTTGGATGGGGGACGAGGCTGACCCCGCCAAGAAGAGGCGCCACGCGGACAAAGATTGACCGCAGTCGCGCGCTCAACCTGAGGAATCGCCACATACCCCCTGGCCGCTCCACTGTCAAGAGTGGTGAGGGCGGAGGGACACGCAGCACGAGCAGAAAAAAGTGCTCTTCAAGACTGCGTGAGTCTACTGTGCACCTCTGGGAAGAAGGGGACGAGAGGCTTTGAAGGCTTTGCCCTCTGGTCCTCTACGTAGCACCCGTCTAGTTGGTCCGGCCGTGGAGCTGGGGGATAAACCATCTCCAATCCACGGCCGAAGCAGCCCGGGAAAGCACGGCTAACATGTCCGTTTCAGGATCCGTATTGACAGCGCTCACCTGCCCGGAGGGGGCGAGCGGGTCTGGATCATTATCGGACAATGAAAGCCCACCCTCCAATGCCGCAGACATCTGGTCTCCTGTATAATCGAGTGTAAGGGCTACCATCTGTTAGACGGATCGCTTCCCCTACTCAAAGCTTGGATGGAGCGCTTTGAGGAGCGGGAGGTCCGCGGGCCCGTGGGCGACGGATTATCTCTCATTTTCAGATTATTACCTCAGGGGACAACTGGGGTGGTTTGCCTTCTTGCAAAGGCTTGCAGCGATCTTTACTGCGCAACAGTCATGGCATCCCAATGACGACATGAACTGCCCACGAGCAGCACATTAACATGCTGGACCCCCCAGGCATCCAAAGCAGTGCCCGTGCCCATCATCAGAGGACAGGAAACCACCGTATCCAGAAACGCACAGTCGGAGCGCCATCCTGGAAAGGACGTGCTGCACGACTGTGTTGCTCTCTTTGTGAAGTTGCAACTTTATACGCACCGCTCTGGAGGTCCGGACCCAAAGAACGCCAGGCAAGGGAGAAACCCAGCTCGACCGTCTGCCAATGCGTGTACACTCTCTGGACCGGGAGAATGCTCTCATTCGATCGGAATAGCTGGATCACAGCAGGAAGAACCCTCATCGACTCGATCAGAAAGTCTCTGAAGCAAAAAAGATAGCGTCTGCTTGCTCCACGTGTGCTTATATGCTGGGTTAATTGGCAATGTAGCACACCTGCACAAGCTTGCACTGCCAATTCATTGGCATTCATGGCCCGTTCCATACTCTTTCAGACAAGTGGCTTCTGAACCGAATCCTCCCAATACGTGGATTTTCTAAATCAAATCCACTAATAGCTTTGGAGTTCCCCACCCGAAGGGGAACTTTAGTTTACCAATTATCTTTTGTCATTTGCTTCAGAATTAGTGGTCATGAGGATTTTCACATTATTTTGTAATAAATATTCTAGCCCACAATAATCTCAACTATTCATCAAAAAGGTTGCCAACTATCTTAATCAGGACTATGTAATACTGTATGTGTTTTATGGCCTTGTTTCTGATGCTGCGTTCACACCAGACGCGGAACGCATGTCAAGCGTGAGGGATTTACATGTTAAGTCAATGCAAACGTGCAAATAGACATCCTGCAGCGCAATACATGTGAATGGCGCGGCGCAAATGACGTGAATTGCGCAAATGGCGGGTGCGAAAGGCAAAATGCGAATTGAGCGTTTTCGAGTTTGATGTGCGTTTCGCGCAAATTGCTTGAGTTCGAAACTTCAGCGGACACTTGCGCTACTTTAACCAATCAGGAGCTTGCTTTTGTGGGGGCGTGATTGTGACGTACACCTGTTGTTGGAGTCCCGGAGGGAAATCCTCCAGCCGACACCGACAAAAAGTTCATCAAACTGGGCTGGGCTCAGTCAGAAGCACCGCTGAAAGCCTCCTTCATCCAGGTTAATTTTCTGGAGAAGTTTATGAGCTCACAGAGCTGGATGCACCTCTGAAATGATCTAGTGGACTCAGACACAGCCCTAAACGTGTCGACGCTGTTTTTCAGCCTTCATAAAACACATAAACACTTTTATTTTCTTCATAAAATCCATGTTAGCCATTTAGCAACAAAGCTAGAGTCACCGGGCAGACAGAAGCCTTTCCCATCACATGAATCCGCGTTTGTTCTGAAGTGAATTTGACGAGCCAATGAAGCGGATTTGATGCGCAAATGAAGCGGGGTTTGACGCGCGAATGAAGCGATTAAACTCAAATGTTCACAAGGCTATTTACGCGCGAATAGCGCATAATTCCGCGTCTGGTGTGAACGCAGCATAACTATTAAATCCCCCCCAATATAATTAGGCAAATCCTTATATAACAGGGGTTTGTTCTGTAGACTATTGATCGAAATAGCTTAAAAGGGCTTATTATTATTATTCCATTTTGACCTTAAAGTTCCATTTAAAAAAGCAAAACTGATTTTATTCTAGCTAAAATAAATCAAATAAGACTTTCTCTAGAGGAAAAAAAATATCAGACATACTGTGAACACTTTTTTGCTCTGTTAAAAATTGTTTGGGAAATATTTTAAAGGGGGAAAAAAATGAAAGGGGGGCTAATAATTCTGACTTTAACTGTATAGGCCAGTAGGGGCCTTCTGCACCTACTAGTAGGCTCAGATGGCTGGTATCATCCATCCACATGGTTAATCAGCTATACAAATAATGAAGACTCCAGATCCAGATCTGTTTTGACTGTTGGGCTTAGGGTTGGGGTAGGGGTAGACGTTAATAAAATACAATTAATGGGAAATTTAATTAATAATATAAATAATTCTTGTTAATTTTCCGGCTGCAGCCGTATCTGATCTATAGCTGATTAACCATGTGAATGGATTACTACTAGTAGATGCAAAAGACCCCTACTGGCCCATATCTATTAGCTGATAACCACTGATAACGCCCATTCAATTGAGTGATAACATTTGTATCAGTTTAACGGTAGGCTCTCTTACAAAGGCACAGAATGCCAGGAATTAATCAACTATATAGATTTATTTACAAACACTCACTCAAAAGACACTGGAGACTCAGGGTAGACATGGGTTGTTGACAATACATATAGACACGCAGGAATGACATATAGGACTTTTGATACCGGACAAGAGACTAAACCAATCTAAGGGGTATAAGTACACAATAACTAATTGAACTGATAACACACAGGGGAAGAACTAATGAACATCAAGAAACGGTGGGAAACAGAACAAAGGAGCACACGATCACAACAGAAGCACATGAAAAAACACAGGAGCACATGGGAATCATTGGGAGGTCACATGATGCAAACACAGGAGTCTGACTATTGGCTGGCTTAAAAAAGAGACAAGTTTGTATAAGATTAACACATTTTTAAACATAGTCTAATAACTCATTTCTGTTGTCTTTGCCATGATGACAGTACATAATATTATTCTAGTTATTTGGCATACTTTATTCAGCTTAAAGTTGAATTTACTTTAGGCAAGTCATTGGATAACCGTGTCTTGATCTGTAGCCAATCGGGAAAAAAATCGTATTCACACTATTTAATTTTATCTTAAAAAATTGTTAAAACATGAATATTAAAATGTATTTTATTGCAGAAAAACTAAAACTAGGAAGTACTATCAAAAAATTCCCTTCTTTGTTTACCATCACTTGGAAAATATTTCAAAAAGAATAATAACTTACCAGGAAGGCTAAATCTTTTAATGCATATTATTGTAGCACATTTAAAAAAAAAATGCATGTAAGCCAAGGTTATGATATAAGTACAATAAATAAGCACAAATATCCCAACATCTTAGGGGCTTTAGAATCACCCAAGACGCCAAAGGGTTAAAAACCCAAACCAAAATGTTTCTCCTATTTTCATAGTTTAATTACACATGCAAGGTCATTAAAAGCAAATAACTCATCCAGCATTACTTTTTGTAACTGCTATTATTAATAACTATACTTAAAAAAGCCCACTGACAAAGCATCTACTGTAATATAATGAAATATATCTGATGTGGCTTGCAAAAACATTTTTTTTCTGTCAGCAAAGAATTATATTTTGGCAGTTTACAATAGCCACCATGCCATCAACCAGCAGGGGCACATGCTAAGCAGCCAAACCCTCAACCCTCTGATCATTCTTTTCATTTTCAACAGTTTTTCTCCACTTGCTTGCTTTTTCAAAATGTCCATTTCTAGATGTTAGTTCCAGCAAACTCTACGTGCTGAAAAAGAGAAAGTGAAATATAATTTTTATGAGGTGCTTGAACATGATTTATGAGTCAATCAATACTTTCTCTAACCCGGAGCCAACTGTTACTCTCTATTAGAAATGACCAGTCACCAGCAGCATACTGAACATGTCCCGTCACCGCTCGAACCCACCACGCGTGACCACAGACACAAACTCATGTGTGTGTGTGATGGAGAAAGTTTTTTATTACTGGCCAGGAGTCAGTGCAGCTGTTTTTTATAGATAGCACTGCAGGTCGATATGTTTACCAAGAGCCACCAGAGCAGAAAATAATAACATGCTGCGAGGCAAACTGGAATGTGGCTTGAGCTTGATGTCCCGGAGCAGAGGGGAGGCAGTCCAGAAACACACATTATAGCGCATGGGTTTTCTGGGACAGCCCGGAGCTGACTGACATCCAAGACTCTCTCTTTATAGCAGGCCTTTTTGCTTTGTAATGCATGTTCTTGTTGTTGGCATAGAATGGCGGCATCGCTGGGAAAGCGCCAAAAGTTATGTGAGACAAAACAGGATTGTTTTCTGTGGTTGCTGTTCCTGCTGGTTTTTATGTCTTGCTGGAAAATAGACCTGTTGACTTTTATGTGCAATGACGTTCACGAAATATATAATTAAAATAAATAAATAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAATGGATATACAGTCAGTTGAAGTCAGATTTCTTAGCCTTCCTTAATTATTTCCTCCCTCCCCCTTTTTATTTATTTTCCCCCAATTTTCCCAAATAGAGAGCAGATTTTTTCAACACATTTCTTAACATAATAGTTCTAATAACTTTTTATTATGCAAGAAACATGTCATGGATGCATTTGGGACACATCATCAGTGATGTATCCTGGGAACATTAGGTGTTTCGGGTCTCTCAGCATCATACACTCTCACCCAGGTGACCCAGCCGGCATTGATCAAGTCCTTACTTGTGTCCCAGCAGCATTCCACGGATCTGCCCTCTTAATCCACAGCCACTTTGTGGCCTTCTCTGCGGCTTCACTTGTGGATGGAATGGCCCTTTACTTTGCCACCCCTGTAAGGCCCAAACGAATGAGGACTTTGCAAAGTGAACGCCCTGCAAAGCCTCTACATCCTATTTCTATGGGCTCATAGAAAGTTCTCCAGCCTCTCTCCCTGCACTCCTCCACTAATTCCTGGTACTTAGCATGCTTCCTCTCATTTGCTTCTTTAATACGTTCTTCCCAAGGCACTGTAAGCTTCAGAATAATTAGCTGTCTTGAAACTTCTGAGATATCTATAATGTCTGGGCGGAGACGTGTTTTTGCGATGTGATGAGGAAACCTCCAGCTGCCAGTCCGAGGCTTTGTGAAGGAGACCTGTTGTTAATTGTGGTGTTTTTGTCCAGCTTTGATAAAGTGGACTGCCTTCTTTGGAGCATGATGATTCTTGCCAGTGCTGATGGCTGAGGCTAAGCTCGCAGCAATTGCCTTAAGCACCTGGTCATGGTGCCAATGATTATGACCATCAGCCAGAGCCTTGGGGCAGCTGCTGAGGAGGGGTTCTGGAGAGCCTTTTCCAGAGCAAACAATGCAGGAAGGTGTCTCATTTTTTCCCCAAACATAAAGGTTCGATGGGCTTGGCAGTACAGCTTGTACCAGGAAACAGACTCGCTGGAAATCTGCCTGCAAAATGTTCGGCCAGGTGATCCTACGTTGCAGTGTATTCTCCCACCTAGTCCATGCTCCCTGCTTCCAGAGTCCTACCACCCTGCTGACTCTCTCTTCCTCCACACCAACTCAAATCTCTCCCTCGAGTAGGTGGTGTCTTTTCTTGCCGTGGACCTGGCTAACTAAGGTCTGTGGAAAATAGACCAAGCCCACTCTGCCTGTCGCCACAGTGCACACCAGAGCCTTTTGTCTCAGGCATGACTCTGCCACCTCCACTGCTTTCCCAGCATTCCATTTCCTGCCTGTCCTAACCTTAATGCAGGCTGATGACACCTTGCAGTCTCTAGAGTACCTGTACTGTAGGGCTTCCCTAGTGTGTACGACCATGAATTCTTCTGTGACGTCACTGAATGGCAGCTGCAAGGTGTTACTCATCCTGTATAGTGCAGCACTGGTAAGACTGCGTGGGAGGCCCAACCATTTTCGAAGAAAGCCACTGATCTTCCTTTCTAGGAACTCAACTGTTGACATTGGGACTGCATAGATCAACAGAGGCCACAAAACCCTTGGACAGAATTAAGTGCTGATAGATTCAGGCTTTAAATCTAGCAGGCAGGCTAGATTCGTCAAACTTTGTAAGCCAAGCTCCAAGTTCTTTTTTAGACTTCTGGATGGCTGCAGAGTCTTTTAGGCTAGAGTCACAGAGCTTCCCCAAACTCTTGACAGGTTGCTCCGTGATGGTTGGGATGACACTTCCTAAGATGAAAAAACGAAACTTATCAACTACTTTCCGCTTCTTCAGCACCATGGACCTAGACTTGGAGGGCTTAAAACTCTTCCTAGCCCTGGCAATGAGTCTCTCAAGTCCTTGTAACATCCACCTGCTCCCTGGGACCATTGTTGTTGTGATGGTAAGGTCATCCATATACACTCTAATAGGGGCTGTTGCACACCTGACTTAGTTAAGGACCCTCTGCATTTAACTTTGGCTGACTTGACCACTGTCTTCATGGCAAGAGCGAAAAGAATGATTGAGATGGTTCAGCCTATTATTATTCATTTCACGATGCAATGCCAGTTTGAAGTTTCTGACCCAGATGTGACACGCATCCTGAAATTATTGTAGCAATCCAGAATTAGATCCTTAATCTTACTAGGAACGTGATGGCGGTGTAGAGCGAGCTCGACCAGCTTGTGTGGTATGGACCCATAGGCATTTGCCGGGTCCAACCACAAGACAAGTAAGTCCCCTCTGTTCTCATGGACCTCTCTGGTAAGTTGTGTAACTACTCCAGTATGTTCCAAGCTGCCGGGAGCTTCAGGAATCCCTCCCTTCTGCACTGAAGGGTCAAAATAATTGTTCTTGAGGAGGAACTCTGTCTGTCTTTGTGAGACAATGCTGAAAAACACCTTCCCTTCAACGCTCAATAGAGAGATGGTTTGAAATTGGTTGATGTTTTTCTAGTTTTCCTCTTTAGGAATTCACACATCTTCGGCACACCTCCACTGCTCAGCAAGTCCTCCTCGTTGCCAAATCACCTTCAAGATCATCCACAGATGTTGGAGAAGCCCTGGGTAGCGATTATAGACCAAAGTATGCCACTAGGGCCTGGAGGGAAGGGGGGCTGATTAGCGCTTTGCTGGGTGCCAGCTCCTGCTCTCTCAGTGGATTGCTCACTGTGTTCTCAAGGAAGCGATTCACTTCCTCTACTGAGCACTCAAGTTGACTGCTCTGTTTGTCCCAGAGCAGCTGTTTTGTGAAGCTGAAAGGATTGGTGATGAAGGCCACTCGCTTCCTGGCTCTCTCTCGCCCCCGTCTCCGGTTCCACACTGCCCTGCGAAGGATCATCAGCTTCTTCCGCAAAATGTTTTTCAACTTCGCTAATGGTTGCTTCTCCTCATCAGTTGCTTTCTTATACAGTTTCTTAAGGGAGCGAAGGTCCTGACGCAGGTGATGTATCTGGGTATCCCTACGGTTCATAGTGTAGCAGGTGGGCTTGGTCTTTCCTTTCTCTACGCTATTAAATCTTTCTACAGCATAGCTGAAGATGATGGTAGTCATTGTTTTGAGTTAACGATCTGCATCTCCTTTGGCTATGGCTTGAATGATGTTGGACATATCTTCATCGGAATGCAGCCACTCCCTTCGTTTGCTTGCTGGGGGCCATTTAATCCGCTCTTGAACTACTTTGCTTGGAATTTGAGGCTCTGGCACATGGATGGACTTGGCTCTGTGGGTTGCCTCCTGGCTGGGCTCATCCTGCTTCTCACCAGGTTCAGGACCTGTGCGTTGCATCTTACTCTTCTGCTCCAAACATTTCATTCTGGCCTGATGAATTTTTAGGCACCAATGCTTCTTACATAGCTTTCCACGAGTGCATGTCACATATGTTTTGTTCGTCATCTGTTCGTTTGCATAGATCGTTAATCTTTGATCCATCCGATTGGAGATCTTATCTTCCCCCCCTCTCGCAATCTCCTGGGGGTATCTCTCTGTAGGGCTTTCCGTAGTTTGTTTGGGTTCTCTCCCACGAAAGACACAGGCTAGGGTGCTAACCCATATTGTCCCAGGTGCCGTCTTTCCGTGCTGTCAACTGTCTCTCCAGTAGTCGACCGAACTATTCTTGGTTGCCACCTAGTCTATTCCTAGGAGTCACCGGTTGCGCCAGGCTTGAATTTTGCAAGAAACATCTCATGGATGCATTTGGGACACTGATTTCTAATTACTGATTTATTTATTTTATCTTTGCCATGATGACAGTAAATAATATTTTACTAGATATTTTTAAGATACTAATATTCAGCTTAAAGTGACATTTAAAAGCTTAACTAGATTAATCAGGTAAACTAGGCAGGTTCGGGTAATTAGGCATTTTATTGCATAACGATGATTTGTTAGACTATCTAAAAATTATAGTTTAAAGGGTTTAATAATTTTAACCCTAAAATGTTTTTTTTTATGTAAAACTGCTTTTATTCTAGCCGAAATAAAACAAATAAGACTTTCTTCAGATGAAAAAAATATTATCAGGCATACTATGAAAATTTCTTTTCTCTGTTAAGCATCATTTGGGAATTATAACGTAATTTTTAAAAAGTATTGAGGTTATTGCACACATTTGAAAAAGTGCTTTAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCATACATTGCCTATAAACATTAAAATAGAAAGCATGGTCCACTTTCGCTTCATTTCTTTGAGACAACAATGCGGCCACCATCTAATGTCTATAGTTTCTGTTCAGAATTTGTTTACGTATGTGAATGTGTGGTGTCAAGCAATGTATCAAAGTTCCACTGATTTACTGAAATAAAATTTGCATTTGTTTGTAATGAGTTGAACTCTCGTTCATCTCTATGCAGTGTTGGAGGAACACAATATATAGCCTATTCTTCTTTCTTAAACTACTTTGGTGGGGAGAACAAAGTATTGCTGCTTAAATTGATTTCAAAATGTTTTTCTATAATGGATTAATTAATACACATTGGACATTGATTTGTTTACGTGATAATTTTTTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACTGAAAACTTCAGACTTCAGTGTGCAAAGACCTTTAGTATGATAAAAAGTGCTGTTCTTCTTCATCTAATCACCACCAGAAGAAATGGAAATGTTTTACTGTGATATAATAAAAGCTCTGCTGCTTGTCTCTCATTAGCAATAGGCTATATACATACAGACTTTTGATTTTCAGCCAGGCAGTCCAAGGGCTTCCTGTGAACTGTATTTCCATTACAAAACTGTTACATCTGATTTCTTTAAAAATCAGCGATCTTCGTTGCTTGTTAGATATACAATATGAAGTGGGTCTCAGATTGGACAAGAAGCCCTGCATTAAATTCCATTTCCCCCACCATATCTTTAAAATATGAATTAAGCTAATTTTACCCCAGTATTTTTAATAGAATTTCAACATACGCCTCTGTAACATAATTCAGTGACCCAGAGTTAGTTTTCTGCTCATACCACGGTTGCTATGTGCAAAAATATTCGTCAAATGTTTTTATTGCAAGACATTTGTCAGTTTTTTTTTCATAAAACGCTAGTTCTGCACTTGTGTAAGTACTTTACTAAGTTTTCTGTTGCTACTGTATGTTGCTATGCTTGTAAGAAAAGCTTGGGCCATTTATTTGCTGAGAAGCCACTCAGAGCACCCAAAGGGAACCCATGCGAACATGGGGACAACATGCAAACTTCCCTCAGAAATGCCAACTGGTCCAGCTGGGACTCGAACCAGCTACCTTCTTGCTGTAAGGCGACAGTGCTAACTACTGAGCCATCGTGCCACCTCTTTAATTAATTAATTAATTAATACCACAGCAGAATGAATGGCCAACTTATCCAGCACATGTTTCAAGCAGTGAATGCCCTTCCAAGTTGCAACCCATCCCTGGGAAACATCCACACACACTCATTCCCACTCATACACTATGGACAATTTAGCCTACCCAATTCACCTTTACCACATGTTTTTGGACTGTGGGGTAATCCGGAGCACCCGGAGGAAACCCACGCTAAAACAGGGAGACCATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAATTGACGCAGCCAAGGCTCAAACCAGCGACCTTCTTGCTGTGAGGCAACAGCACTACCTACTGCGCCACCACATTGCCCCTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTTTTATATTACATCTGCCAAACAGTCAAAAATGACCAATCAGCAGCCCTACAATTAATGATGGCTGCTGTGGGATTCTTCATCAGAACTGTCACACTTGGTCCCTTGGTCACAGTTTAGCAAATACAAATACAGGAATCAAATAATGTCACATTTGTCCCACTTTTCTTCATCATTACCCTCAAATTCAGGTAGGTCTGCATTTGTGAGTGAAGGTCATGCAATGATACGTCTTTGTTGTTGAGCGTGGTTTGCTCGATCTGTGACATCACTTACTTAATATTGGCTATTTTAAAAACACTTGTATTGTCCCAAGTAATGGGGTTTGATTTGGCTTTCAAACCACACATTAACTATTACCAAACTCAGTGTTTATCCAGACTGTTGCTGCTTCAGTTTCTGATTGAGTTCTTTTGTGTTTGTATGTTTATGTAG
Seq C2 exon
GTTATGCTGGCTGGAGACACGGACTCATATGTAATTCAAGACCTGAGTCCTTTTACAGAGTATAAGGTGTCACTGGCAGCCATCTATAAAGATGAAACCGAGAGCAGCCCTGTGGTTGTGCTGGAGTACACAT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000005762:ENSDART00000134087:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.022
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0004116=fn3=PU(53.1=91.5)
A:
NA
C2:
PF0004116=fn3=PD(44.4=80.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]