DreINT0084864 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000001803 | kcnh6a
Description
potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 6a [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-040702-5]
Coordinates
chr3:31610143-31627385:-
Coord C1 exon
chr3:31627183-31627385
Coord A exon
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Length
16614 bp
Sequences
Splice sites
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000001803:ENSDART00000134201:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]