DreINT0156611 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000039220 | st6galnac5a
Description
ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5a [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-070705-488]
Coordinates
chr2:9367483-9389366:-
Coord C1 exon
chr2:9388954-9389366
Coord A exon
chr2:9367591-9388953
Coord C2 exon
chr2:9367483-9367590
Length
21363 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAATG
5' ss Score
9.43
3' ss Seq
CTCTCTGTTTCTCTCTTCAGGAG
3' ss Score
12.9
Exon sequences
Seq C1 exon
CCTTTGAAGATGCACTGCAGGAGCTGTGCGCTGGTCACTAGCTCTGGTCATCTAACCGGTGGGGGTCGCGGAAAAGAGATCGATCAGGCAGAGTGCGTCATCCGAATGAATGACGCGCCCATAGCTCGTGGCTATGGGGCGGACGTGGGTCACCGCACGAGCCTGAGGGTCATTGCTCATTCCAGCATGCAGAGAGTGCTGCGCAGCCGCCATGAACTTCTCAACTCCAGCCAGGAAACAGTCTTCATATTTTGGGGACCCAGCAGTTACATGCGACGGGACGGGAAAGGCCTGGTTTATAACAATCTGCGGCTTATGAACCAAGTGCTCCCCAAACTCAAGGTCTACATTATCTCCTGGCAGAAAATGCTCCAGTTTGATGATTTATTCAAGAGGGAGACTGGTAAAGACAG
Seq A exon
GTAATGGGCTCTTTATTACTGTATGTCTGAAATTGAATAGTTTGATAAGAAGCAAGTGTTAGGCAATGTAATGATACAGTCTAGGGCTGTGCAATATGACAGTGTACAGTTAGGTCCATAAATATTTGGACATCGACACAATTCTAACATATTTGGCTCTGTACACCAACACAATGGATTTGAAATGAAATGAAACTACTATATATGCTTTACCTGCAGACTGTCAGCTTTAATTTAAGGGTATTTACATCCAAATCAGGTGATTGGTATAGGAATTACGACAGTTTTCATATGTGCCTCCCACTTGTAAAGGGTCCAAAAGTAATTAGACAGATTAGTAATCATTAATTAAACTTTCACTTTTTAATACTTGGTTGCAAATCCTTTGAAGTCAATTACAGCCTGAAGTCTAGAACACATAGACATCACCAGATGCTTGGTTTCTGTCCTGGTGGTGCTCTGCCAGGTCTCTACAGCAACTTTCTTTAGTTCCTGCTTGTTCTTGGGGTATTTCCCTTCAGTTTTGTCTTCAGCAAGTAAAATGCATGCTCAATTGGATTCAAATCAGGTGATCGACTTGGCCATTGCATAACATTATACTTTTTCCCTACAAATCTCTTTGGTTGCTTTTGCAGTATGCTTTGGGTATGGGTAAAGCTGACAGTCTGCAGTTAAAACACATGTTGTTCAGTTAATTTCAAATCGATTTGATGTTGGTGTATAGAGTGATAAATTTTAGAATTGTGTCGATGTCCAAATATTTATGGACCTAATGGTATATTGAATAGACAAAATAAAAAGTCTGTTGTTTCATATCGTAGTTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATAAAAATAAATAAATAAGAAAACTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATAATATATTTAATAATAATAATATTCATAAATATTAAATATTAAATTAAATATTTAATATTTATATAATATATTATATAAAATATTTAATAATTATCATTACGAAATTATATATATTACTGGATGTCTTTTTATAATGATAATTATTAAATATGTTTTTACAATCCATTTAGGAATATCATTTTTTAATCACATCTCTTACGTCTTAACATAAACAAAAGTGTCAAAGAGACTTCTAAACTTGATAAATAAAATGTTACAAAGTGTGTGCTATGGTAAAGTGTAAACGCTGAACCAAGGGCGTGGATTTGCTCTTAAAATTGGTGGGAACATACATTTTTTGAGCTGCACTGAACAGCAAAAATTCAGTTTTGCACTTTTAAAAACATGAATAAAGTACTTAATATTATAAAATAAGTGAAGTTTCACAAACTAATTTCGAGAGGAGCAAGTGATATGATTGACTGCTGCTGGTCACCCATTTACAATCATTATTTAACCAATCAGATTAATCCAAACTCACTATAAATAGCCTAGCTAGAACTACTCCCTTAACAAACAATACTCAAACAATATCTAAGTGTGAACTGTTGAAACAATAATGTCCCATGCTGCAAAAGTCAATTTACGTGATTTTACTCCAGTCAGGCTTTGAGGAGATATAAATGTAGAGAAACTTAGAGAGGTATGTGATGCAATTTAACTGTTTTATCCCAATTATTGTTTCTCTTAATCAAAAAAATCAAAACCGACCTTCGATTAATTACAAAGCCTTAATTAATAGTATTACGGTGAACTCGTAACGAACTTGATGAAGCATTATTTTATTTTGAAGTTGATTCAGTTATTGTTAGGGACATTTTAAGTAATTGGTGGATATTGGTAGGGACATGTCCCCTTCATCCATGCCAATTCTACCCCATTGCGCTGAACAATCAAAGCAAACTTAGATCAACATCTGTAAGATGTTGATAATAATCATACAGTAAACCTCAAACTTTGTCAACAACACAACTTCTTCAAGTAAAGGAACTAACCATAATTATTTAAATACATATTGCAACATTACAAATTGTGAAGTTGAATGACTATATTACTCCCTATGCTAAAAAAACTCTTTTAGATGGGGTGCTAGTGGCTGGATGCACAAGAAAAGGAACTAAAAATCCACTCTGGCAACATGCATATCTTGATGTGAGATTTGTGTAATATCGCACAGCCCTAATACGTTCTAGGGCTACACATTATATCATTTTAGGTGTGATGGGAGATAAACTATAATTTGCTATATGCTGGTAAAAATTTAACACACAATTAAAAAAAAATAGTCTTATAATACGAATAATAAACCCTACGATCAGTTGTTGATGATCCTGTTTCCAAACAGATTTTATGAGATATATAATCTATAATCTATGCTTGTAAATGATTACATTTCATCCAGGATTTACTTCCCTACAGAATCCTCCCTATCAATCTAACATAATAAATTCTTTGCAAATAGACTTATTCAATCTATATTTGTGAAATAGTATTCATATCAAAATTTACAGTATATTGCAGAAAAAAAAACTATGTTCCAATATTGTGCAGCCCTAATACAGTCCAGAATATAATGTGCTGATACCTGCTTTGATCTTACACTGTATAAAGCTTCATATTTTCAGGTGTAATTTTTGAGCTGAGATGGGTCTGCAAAACATGATTAACCAACAGCTTCCATTTACATGATTGTGATACCAGATGTTTTCATCAACGTGCCAATGTTATTATGCATGGGTCATGGCCTAATTTTGATGACCTATTTAAAAAGGTGTTTAAAAAAGGGAAAAGATTATGCGTCCTAGAATAGAGTCTGCAGAGACTATTCTTATTCCGCATTTACAGCTCCCTGAGAAGACCAGACTTTTTTTCCCCTCCTTTCAACTAAAGGATCGCATGGGAAATCAGTTTGTGCGGGATTCCAGATTTGAACATTAAGCCAAGATCTACACTTAATCAGAACAAAAAGAAGCTTAGTGTGTATTCTCTACATGATTCCATATATTATGGCGACCGATTTTCCCCACACAAATAGTAATACCAGTAGCTTTGACCTTCCCAATTACAAATCATAAAGACTGAGGTAAATAAAAATAGTGTACAATGTTTTGTGTGAGGGTTGTGTTTAGAGGTAGGCTTAGAGTAAGGGATAATTATGTCTATAGGAAGTGTACACATTATAAGAGTGTGTATGTATATACTCGTTTATCTGGATTACGTTTAGGGGTTGGGTAAGGCCATATAATAAGCATTTTTAAAGGATAAACTACATTCTACTATGGAGTTCTTGCAAACCTTATTATTCAAGTGTGTGTGTGCATTTCTGTGGATCAAGTGAGGCAGGATATAGTCCACAGAATACAATTGAAACCAGAAGTTTACATACACTATGAAATTGGCACAAAACCATTTAAAAAACTCAGATGTTATTGTGAGTAAACTTTTTCTCTTTTAGGTAAGTTAGGGTTAACAAATGCGTTTCTGTTATGCTTAATAGCAAAATAATGAGAGATTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGAAATTTTTATAACTTCTCTTGAAAGTCAAGTTTACATACAATAAGATTATAATGCCTCTGAAAAAGCTCAGATGATGGTCTCAAGGTTTTGGAAGATTTTGATTGGCTAATTGGCAACATTTGAGTTAATTGGAGGCACAACTGTAGAATAGTATTTAAGTAAAACCTCAAACACGCTGCTTCCTTGTGTGTCAACATGGTAAAATCAACAAGCCAGAATCAACAAAAAAGCCAGATTACAAGTAGCTAAACTACACTGAGAAAAGGAATAATTTTTAAAGACATGTCCTGTTGTTTGATGGAACTAAGATTGAACTGTTTGGCCATAATGACCAGTGTTACATTTGGAGGACAAAGGGGAAAGCTTACAAGCCTAGGAACACCATCCCAACTGTGAAGTATGGGGATGGCAGCATCAGGTTGTGGGGCCGTTTTGCTGCAGGAGGGACTGGTCCACTTCAGAGCATAGATGGCATCATGAAGAAAGAACATTATGTAGAAAAACTGAAGCAACATCTCAAGACATCAGCCAGGAAATTAAAACTTGGCCACAAATGGGTCTTCCAAACAGACCATGACCCTAAGCATACTGCAAAATTAGTTCAAATGTGCTTTAAGGACAACACAATAAATGTTTTGGTGAGGCCATCACAAAGCCCTGATCTCAATCCTATAGAAAATTTGTGGGCAGAGTTGAAAGCTTGTGCGAGCAAGACAAAACAAAAATCTGACTCAGTTACACCAACTCTATCAGGAGGAATGGGATAAAATTCTTTCAAACTATTGTGAGAAGCTTGTGGAAGGATACCCAACACATTTACCAAAGTTAAACAGTTTAAAAGCAAAGCTAAAAAAATACCAAGGAAATGTATGTAAACTTTTGACTGTCTAGAAATTAATCAATTTTTAAAAAATGATCTCATTATTCTGGTATTTAGCAAATGTAAATCATTTAGGTAATCCTAACGGACCTAAAATAGTAAACATTTAGTATGATTGCATCAGACATTTAAAAAAATGGTTATGTTCCTTTTTTTAGAGTGTATGTAAACCTCTGGTTTCACCTGTATTTATTTGTCCACAGAACATGAATTTGTCATGGTTTATCTCAGAAATAAAGGTTCTGTTTTTACAAGAAGAATATTTCTACTGTGGAAAAAGTTATTTATGGTGGAAAAGGAAATTTTGATTAATAAAATCCCAGTAAGAAAAGTAATTTTTAAAAAGTACTGTTTAGTAGCTTCGTTTAAAAACCAAAACTGGTTGATCTACTGTATGGCATCACCGTGAAAGTTTCCACAAAACTTTAATTTGACTTAACTTAATTTATTATAATTTGAACTACAGTTCTTTTTGACAACAGTGTTTTCATAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTACATCCTTAGAATTTAAAAAAAAATATCATAAAATGGGTATAAATGTTCTCCAGATAAAAGAAAAATATAATGCAATTGCTCTGCAAGTGAAAAAACAACAACTTTATATATAACAGAAGGTGTTTGTGATACAACTTACTGTAGTTTTGTAAGGGGTCTTCATTGTTATCTGTTTTATTCACAGAATGCTTACTCAGCTAGGGTCTAAGAAACACTTAAGGTCAGATTTACTAGCTTGCATCACTGTAAAACATATTTTGGCGTAAAAACCACTTTCAGGATTTAGACATACACTGAAATTTCAGCAATGAACAAGCAAGCATGGACAGTTATGTTTGTGAATGACTTTACTGCATATGTACAATATTTAACATTTGAAGTATTTTAAACCCATAATCAAAATTGTTATGGATTTAAACTCAAAATTGTTATGGTTTAAAATCTTCTGATGGCTACTTCCAGCAGGATAACGCGCCATGTCAAAAAGCACAAATCATCTCAGACTGGATTCTTGAACATGACATTAAGTTCAATGTACTCAAACAACCTCCCCAGTCACCAGATCTAAATCCAATAGAGCACCTTTGGGATGTGGTGGAATGGAAGATTCGCATAATTGATATGCAGCAGACAAATGTGATGCTATCATGTCAATATGGACCAAAATCTCTGAGGAATATTTCCAGTCCTTTATTGAATCTATGCCACAAAGGATAAGGCAGTTCTGATGGCAAAAGCGAGTCCAACCTGGTACTAGTAAAGTGTACCTAATAAAGTGTGCACATTTTAAATTTACACAATGATCTTTCTAACGAGCCCTAAAATTTTTATTGTGATGTGTCATTCTGCAGATCTCATTAGTGGATGTCTTTTCATGTTGGTTTTATCGTAAAACAGTCATCTGCTGTTCTCCTTAAAACTCTTTGGAGGCTCATTAGTAAGAAATGCAAATATTACCACTGATGAACTGGCTTAGAGGGTTCCAGGAATGTTTTGTAGCTGCTGTGCTTTATTACCACCGCACTTTTAGTGCAGCACATCAAAGTGTGACTTTTATCTTGTATCTGTTTCTTTGGTGCTATTCTCCAAAGTGCCAAAAGAAAAAAGACAAGACAAAAGATTACAGTGGCATGACACCAACCACAAGCAACAAACATCGCTCTCTGTTAGATGTCACACGGGATTAGAGAAGCATGGCTGCTGTTGTTTTCTTGGTTTCATCAGCGTTTCCTTAAAGTTGTTTGCATATAGAATTTTAAAGAGGTGGTCTTTGAAATTTCATTCATTCATTTTCCTTCAGCTTGGTCTCTTTATTTATCAGGGGTCGCCACAGCGGAATGAACTGCAAACTTATCAAGCATATGTTTCACGCAGCGAATGACCTTCCAGATGCAACCCAGTACTGGAAAAACATCCATACACTCTCACATGCACACACATACACTACAGCCAATTTAGTTTATTCAATTTACGTATAGCGCATGTCTTTGGACTGTGCCAGCAACCTTCTTGCTGTGAGACGAGAGTGCTAACCACTGAGCCACCGTGTCACTCCTCTGCATTTACACTACATGGTTGAAGTGACTAAACTCATTTTTTCTTCCACTCATGTGGCACAGATTGGATATGGCCCACATACATGTGGGAAAAAAACACATGGATTCTGAAATACTTGGAGTTATAAGGTTCTATCTGCGTTCTGAATGATTTAGAGATATTGAGCTTCAAAGTTTTTGCATTCTATAGCAAACAGTATGTGTGTAATATTATTATTTATTTTTTTAATAAAAGGTCGTAAAATGTAAACAACATTAAAAATAACATCCCGTAATGTAAATAAGTTGTGATTTAATACGAATATGTCAATTTTAACAAAAATGTCAGATAGAACCTTATAATACTAAGGTGATGATATATATATATACAGTTGAAGTCAGAATTATTAGCCCCCCTGAATTATTAGCGCCCCTGTTTATTTTTTTTTACCAATTTCTGTTTAACGGAGGGAAGATTGTTTCAGCACATTTCTAAGCATAATAGTTTTAAAAACTTATTTCTAATAACAGATTTATTTTATCTTTGACATGATGACAGTAAATAATATTTGACTTGATATTTTTTAAGACACTTTTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGACTTAACTAGGTTAACAAGGTAAACCAAGGCAGGTTAGGGTAATTAGTCAAGTTATTATATAACGAAAGTTTGTTCTGTAGATTATTTTAAAAAATTAGCTTAAAGGGGCTAATAATTTTGTCCCAAAATGGTTTTTAAAAAAATAACAACTGCTTTTAATCTAGCCAAAATAAAACAAATAAGACTTTCTCCAGAAGAAAAAATATTATCAGACATACCGTGAAAATTTCCTTGCTCTGTTAAACATCATTTGGGAAATATTTATAAAAATCAAATCAAATCAAAAGGGGGCTAATAATTCTGACTTTAACTATATATATATATATACAGTATACATACATACAAACATACAGTTGAAGTCAAAATTATTCACCTTCCTGCAAATTTCTTTTTTAGATTTTTCCCAAATGATGTTTAATAAAGCGAGAGCAAAGAATTTTTCACAGTATTTGCTATAATATTTTTTCTTCTTTTAAAAATCTTATATGTTGTCCGTAGTGTATGAGTGTGAGTGTGAATGTGTGTGTGGATGTTTCCCAGAGATGGGTTGTGGCTGGAAAACTAAGTCTGGGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCAGATTAATAAAGGGACTAAGCCGACAAGAAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAAACAATCGTTAATGATTTGCCAAATTACACTAACTTGCCAAATTAACCTGGTTAAGCCTTTAAATGTGACATTAAGCTGAATACTGGTATACTGAAAAATATCTAGTGAAATATTATGTACTGTCATCATGGCAAAGATATGTGTTGTGCAAATAAAATCTTCTTTCTGTCAAACAGAAATTGGGGGAAAATATATAGTAATAATTCTGACTTAATATTTATTATTTTTATTTTAAAAAATAATGTTTAAACTTTATATTTTTTAAGGTTAACGGTGTGAATGACTTATAGTTATACTGTTAAACAGCAGATCCTTTAGTTTCTATTAATAAGGTTCAAATTGGCATTATTTTAAAACTTACCACTGTATTTTTTCCAAGTTGGAGCTGGAATTCATGTATATGTTGCAATGTCGATTCGATGTACAGCGTGTATAACTACTTTTGTTGAAATCTTGAACTGAATACAAAAAAGACTGAACTTAAGACTGAGGATGACCTGGTCCAATGACCTGGTTCGATAAACTCACTGCACAGACAGCGTGACTGTCTTTCTCAGAACCACAGAAAGCCATGGTGTTACGGCACTCACGACAGTATTAACTCGCACATCATCCTCGAGTCATCATTCCAAGATGACTAAATAAGCGGGAGACTCGTCTCGTCTCTATAGCAACCTCTCGCGAAACAACCTCTTCAATGCGGCGCCTCACGATGTTTGCAAACAAAACATATGGAAAGTATCTATTATCATTCCAGAGTAACGGAGGAACACAGCCAAATGTAATGAAGTAACAGTACTGATTTTTCTCAAATAATTTACTTGAGTAAAAGTACTCAAAAATTAAACACACTCAAAAAGAACATTACCCAACAATTGTACTCAAGTAAATTTTTTTAAGTAAATGTAATTCGTTACTACCCACCTCTGATATACTGTACTGTACATGAGAAAAATTAAACCCTGCAAACAGATTAAATACTGGAATGGGGAAAAGGCCGTTCTTTTTTATCACAGCTGTCACTCAGTGCCTGCTCATTTTTTCCGGGTCAGTGCATCTTTGCTGTGTGCAGTGTTAATGTGTACATCGAATACAGTCACTTTTGAAAGAAGATGTAAGCAGGTCATCAAAAAAATCAGATACGGTGCTCAGCATAACTGAGTACACCCCATAGATTTAATAAAATAATATTTCTGTCGTCAAAGTTATTTACAAAATTAAATTCAAGCTAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACCTACACATTTTTCTATTGTTTAAATTTGTATATAATATTTTTCTATAACATAAATTTGTCAGTACTAGTTTTTTTGGACAATTATCTTAAGTCATTTTGTTAGATAAGCTCCAGATTTGGCTTCAGTACTGACTTATTTGATGTATATGCACAAATATAATATTGTATAGCTTCTTATTAAACATATTAATTGAAAAGAGAGATTTGTGAGGGGTGTACTTATATATGCTGAGCACTGTACAGTCACAAATTCAGAATTGATCATGAAGATCTGCAGTGCGAATGCAGCTTAAATCTCCTCTGAGCAGTAAAGAAATGGCCATTGAATATTTTGAAGCGTTATGCATCACTATCCCAAACATATAGGTTTATAAGGGGCCAATCATGCTCCATTCAATCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCAATTCAATTCAATTCAATTCAATTCTTGTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTTTTTTGCTAGACCTCCATTTACTACCTCCTGAGTTACTCTCATCCCTGCGCATCAGTAAATCAGCCAGCCTGACAGGAGGTGGCCATCGGTGACTGTGTAAACAGAACAGGAAGCTCAATCTGCATCATGCTAACATCTTCCATGCTAATGTATGAAACCAAGCAAATAAGATGGATTGGTCACCACTAGGTTTTCACGAAAGCTTGGCTCATCAGTACTACAACAGTCTAGCTTGATTGGATATGGCCTGAATACCTGCCCGTGTACATGCCCAGGTTCAGGGACCAGGTGGTGAACTTGCAAACACAGCCCTCATAGGTGGCAGAGCCAGCCTTGGCATTGCTGTTTCCCATCTGCAACTTGCGCGTTTATATGGACAGCACCAGGAGCAAATCTTTGTCTGTTTTGGAGATCAGCAGAATGCAAAATGTTACCTTCAAGCGGAAGTTGGCCCACTAGCTAGTGGATGTCATTGCTTTGGTAATTCAGGCTCAAAGTCAGCCATGCCCCCTGGGAGTGAAAGTGCATTTCTTTCCCCTTTTGTTAGGATCTACCATAGAGACTTGTTTTAAATGATACTGAAATCCAAGGGCCTCATGTACAAAGACTTTAGTTGAATTAAAACTAAAGCATTGTGTATGGACAAAGCTGTAAATGTGCGTACGCTGTAAAAAATCTGATGGATGAAACACTTCGTATGCAGAATCCCACGCATAGTCTTTTGTACATCCGAATTAATGTGAAATTGAGCGCAACATGCACTAGTGCAAAACCTCTCCATGCCCCTCCCCTGTATGAATATGCTAATGACTCCACTTTGGCAAAACCAAACGAAAAAGCAATGGCGAAAGCAAGCAAGAAGAGAAACTCTGAGGTAGTCCAGATAAAAACTGTGTTTTTTTCAAGTTTGTCCTCCGTGATTAATAAAAATAAATAAATAAATAAAAATAGAGTGGGAAAGTTTAGCTGACGCGAACGCAGTGGGGTTTGAAAATCGCACTATAAATGAATTAAAAATGAAATGGTCCGATGTAAAGGTTAAGGGCAGAACAGTTTAAACGGGTTCATGTGGCTCTCGGTTCCGTCCACACTGCACACAGCTACCAAGTGTACCAATCACAAAGCTTGCGTTGCGCATCGTTGCGACTTGTGGTAACTTTTTTTGAGAGGTGCGTGTCAACGTCAGCTTCAGCCATGGCAATGACTATGTGACCACAATAACCATGCGTTTGACGCAGAAGTATAAATCAGTCTTTAGTACCCTGATTTATCAGGGATCACCACAGCTGACTGAACCACCTAGGAGTAGGACTGTTTTAAGTAAAATATTTCTAACTTAAAGCATTGTAGTACAATTTCACGAGTTCACACTTGCATTAGTTTAAGTATAAAGCATATTTGGCGTGCTGTCCGGGGGGAGGGCTCTGAGCTCGAGGAGACACCCCAACTCGAGTTATTCCCCTTAAAAAGAAACAAAGAGGAGTTGGGATTCGAGCGAAGTATCTAGCCCGGCCCCAGAACGCTCCCCCCGGGAATGCAATGCAAGAGGTGAGGTGACGGGGTGGTGGAGGGGTGCTAAAATCGTGAGAAGCTGCAGGTAAGACAGCTTTGGTATATATAGGGGTTGCTCAAGAACTGATTTGATGATAGGGATAATTGTCAATGTCCTATTCGATACTGAAACTTCTGCGCATGGTCCTCCCGAAATTTGTTTACAAAACATCACGTCAAAGCTTATTTTTTACTACGCCATTTTAAATTTTAAATTTAAGTCAAATGAGAAAAATCACAAATTTAGCAACACATTTTGTTGTAATTTTGATATAACAAAATGTAACTAACTTAAACAGTACAGTAGCATTTCCTCAACAAAAAAGTGTGACATATGTCTCCATTTTGGTTAGAAATTACATTCAAGCCCTTACCTGACATTCTTCATGTTAATTTCTAACTTTCCAACACTGTTCATCCTAAAGGTATTCAATCGGGTTAAGGTCAGGACTTGGTGCAGTCCAGTCACACCACACATAATCTGATGTCCTGTTCAAAAGCACAGCCCTGTCCATTTTACCAGCTTCCAGCAATTCCATTTCAATGTTCGAATGTAATTTAAGTGTTTAAGTGTCATTTATGGCCCGTTTCCACTGAGTGATATGTTACGGTACGGTACGGTACGGTACAGCTCAGTATGCTTTTATAGCCATTTCCATTATCAAAGGGTACCTAAAGGCAAACTGTACCGTACCACTATTGGCCTGTTTCCACTGAGTGGTATGATGCAGTATGGTTCGGTGCACTTTTATGGCCGTTTCCACTGTCAAAGCGTACCGCAAACCGCAAACCGTTCTGTACCACTATTTGGTCACCCTTTGCAAAGGGTACCAAGGGTACCAAAAGGTGGATCTAGACGTGCAGCTGAATGCTATTGGCTTAAATAGATATGTCATTCGCTCCCGCAACAAACCAGAATGAAAACATTCTGAAACAAGGAACTGCCATGTTTTAAACACACAGTCGAGAGACTTCACCTTAATAATATAAACATGTAATAATGAGCCATGGTCGACCTGAGCTTAAACAAACCTTATCAGCCACAAAGCCAAGAGAGAGCAGATTTACCCTGTGCCCTGTAGTATTGCATGCGTGCGCGTCTATATTTGAAATAACAAACTTCTTGAGCTGATGATAATAACGTGCGCTTGATTATTGACCTGCTTTTGAAACATGATCTTTTCAGAAACTGAAAAACTCAAGAGTGAGCCGCGAAAAAACAAAGAAGAAGCCGGAAAAAAAGGAGCAACCAATTTTTTCCAGAAAACCCGAACAAACTGCCATGTTTAACTATCATCTTCACCGTTTAGACTATTATGAACTCAGAATGACAGAAGTACTTTCTAACAAGAAGTCACATGTGCTGGTGACTGTGGTCATCAGGTTTGCTCTGACTGTGAACTGTATATCGTGTTGTTTTTGTACCTAAATAAGGACTATATGTGGTGTGTAGTTTATCTGTAATTGGTAACATATCGGACACTGCAAGCGTCTGTATGTTTTCATATAAATGTTGCATTTATTTATTTATTTATTATAACAATGTTCATAGAAAAGTTAGTGATAAACATTTATACAAAGTATTTGTGTGCATACAGCATCTGTTTTGTGCTTCTCAAATGATATGTGAACAACCCATACAGCTTTACTGTAGACACTTTCTCAACCGACCTACACAGTACCGTACTGTACCTCTCCTTGCAAATGGGCCATAAGTGTTTCTTTCAAATAATATTTTGGGAAAAATATTTATTTTGGGATGGTTTTTTGAGTGGTGTCCTAATGCCTAATTAAAGTGAGGGAGCCACTAAACTGTCAGTAAGCGCTGTCTTTCGTATAAGACGTTAAACCGAGGTCCTGACTCTCTGTGATCATTAAAAATCCCATGCCACTTCTCGTAAAGAGTAGGACTGTAACCCCGGTGTCCTGGCTGAATTCCCTCCACCGTATTGACCTTATTCTAAAATGCGGAAGTGCGCCTGTTTTCGCGATTGTCTTAGAACTTCCGATTCAGTCGCCTAAGGGAGAAATGACAAGGAATAATAAACGGCACAAAATGGCCAAACTACTTGCTCAACAAACAAATGTTTGCATGACTACACAGATCAAGTAGCATAATATAATAAGAAAATATTAAATTGCAACATCAAGCAGCGTATCGAGCAGTAGTTAACGTCAAAAAATGAATGGAAGTGAATGTGACCGGAAGTCGCGAGACAAAAAGATTCAAATGGCAGCGCCCACTCGTCAGCTGAGGATAAGGTGAATATAGCTCATTATCATTTAAACATACACATAGCTAAATGAGCTGCTAAAGACACAAAGGATTATACTAATTTCTAGGAAGTCGGCATCTGATTTCCACTTTAAACTTGCGGTCACACTGGGCTTTTCCTCCCATAGACTTCCATTTATACGAACGTGAATGTGCAGACCGGAAACGCGGGGTCATGCGTCAAGTTTCGCAGGTTGCTGCTGTGCAAAGTTCAAGCTTGGTGAACTCTGACCTGCGAAATCACATCACTTGACTGTGTGAGACCAATCGAGGATCAAAACATGACCTCTCTGAACAGAAATTTTAAACATGGAGCAATCACTCACTTTTTAAAATATCTAATAAGCTTCCTGCCCCTTTTCGCAGCGCCAGACGACAAAATTTTGCACACACAAACTCTTGTGTGACCGCAGCTTAACTCTTGAATGGTCATGCAGGCACTAATGCCTAGTTCAGACTGCGTGATTTTAACCCCGATTTTGGCTCGACGACAGGTTTTGAGAAATCGCCGACAAATGCATGAAATCACAGGAAAATCGCTGCTCGTGCACGTGAGTGACAATCACACAGTATGAACGATCAAAAACGCGATCTGAGAGAATCGCAGATGAGTCGCCGATGCCTGTGAGATATTTGGCGTGCTGAATATCTGGAGCTGTCGGCGATTCAAATCATGCCGTGTGAATTGAGTTTTGACTGAAAATAACATAAGCGATCGCCTACAGCCAATGAGAGAGCAGCATTCACTTGTGTGTGCGTGTGTGTATAACTGCTGCAGGCCAGCGGGAGGCTGGGGGAGAAGTTAACAGCGCTCTTTTTCGGTTTATTTGGACCCACGAAATGGAGGAAAAACTAGTGCAGGTTTGAAAGGACTCAGGAGCAACCGTGTCTGTTTGACGTTTCATACAGAAAGAAATTAGTTTATTATCAACGTTGAGGAGAAATGGCTAATTCCCTTTAAACCCAGGTGAGCAAAAATGTACATGTTCTACCCCATTAAAGGCTTCTTTCTCATTATGTAGTTAATAACAAAAGATATACTATATGTTTTTGGCTGTGAGACGTAGTTTGGACGAAGTTGTTGGCGATTCTCCCTATAGTAAAGTCATGCAATGTGAATGTCCATGTCGCCGAACCATCTTGCAGTGTAAACAAAGCAGGGACGAAACGCTAGCCCAGATAGTCAAGCAGTGTGAAAACATCTGTGACACGACTAGTTTGAAAATCATGCAGTCTGAACTCGGCATTAGGAGGAACAGAGAAGCAGTTATTTACAACATTTTCACGATAGATTAAACTCTAAAACAAAAAAAAAAAGACTGGATTCAAGTATCAGAATGAAAAAGTGTATTTCCACAATTTACGCTATGGTTAAGGCTGAGCTCATTAATAGCAGTGTCATGTAGAGCCCACAGGGATTTATATAACAATAGCTTCCTTACTACTGAAACTTCTTTTATCATTAACTCACCCTCCAATCCTGTTTGACTTTCTTGCTTTTGTTGAAAACAGCAAGAAAATTTAAATGAACGTCTGTAAAATGGAGCATGAATGACCAAGGATTCAAGGACAAAATAACACCAAGCACACCATATGACTTTATTTTTTCAAATCAGTTCATAAGAATTTGAGTCTTTTAGACTAATACATACAGTCAGTGCTTAATCTGAGCCGGATCTTGCCGGATCCTGTTCTGGGAAATGTCAGATATATGTGTTTTGTTTACTGGTATTTATTTTAATGGATCTGGCATTAACTTGTGCATGGTGAATACCAGGTGAATACCTATGTTCGTGTGTGTGTTTGAGAGAGCATCAGAATGTGAATAAGCAAGATCGAAGGCTGTGTAGATTGTGTGTGTACATGATGCTAGTCACACACAAGTTAAAGCAAAAGTCAAGTTAACTTTTGGCCCTCATCCATATTTTCAGCCAATTGGCTTTCTTATGTTTACAATCGCTCTCAATGGTTGGTGATTGTTTTGCATGCAGAGAAAATAAATAATGGCATGTTGAAGATGAAACTGTGTTGAATGGATCAGGATAGTGGGAGACAGAAGCAAAGCGAAGTCAGACAGAAAATATGACAGAAGCAGTAATCAATTCAGCTTTTTTTCAATTCAGCTTTATTTGTATAGCGCTTTTACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTCACATAAATGGTCATAGTAACTGGAACAGTGTGGTTCAGGTTTTAGTGTTTAAGTTCAGTTCAGTTCAGTTTAGCTCTGTTCAGTGTGATTTAATCATTACTGAGAGTTCAAACACTGAAGAGCAAATTCATCGATGCGTAGCTCTACCAATCCTGAACCATGCGAGGCAGTGGCGACAGCGGAGAGGGAAAAAAAACTTCACCTGATGGGAGTGAAGAAAAAAAAAACCTTGAGAGAACCAGACTCAGTTGGGCACGACCATTTTAATTTCTCCGCTGGCCAAAAGTCTTGTGCAGTGAATCGACTAGACTGTGTCATTTAATTATTTGTTTCACTTCACAAAAGGTAAGTTCACTTAATAATGAAGTTAACCGAACAGTGATCGTTCATATGATTTGTGTTTGTAACTACATGTTTTTATTATCTGTGACTGACATATAACGTTATATGGCACAAAATAATTAAAGACTTAAATATTAAATATTTGACAAAATATTTGACAATTGCAGTATGTTGGGTATGCCATATGCTTTTGATTTCTAAATAAATAATTCGTCTGGGAACTTAAATAATTGCACTGTATGGAGTACTCTACTGAGCTCTTTTCTTGTTTAGAATTGGATTACGCAGTTTTTTTTTTTTGTGCAGTAACTTCACTGAACATGTTGTGCAGAAAATAGTAAAGGTAATAGAATATTTACTACAGTGTTCCACTTGCACAGAAGAACGCACAGGCTTGGAGCATCAATGTACATAAACTGTAGGAAATTTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGTTTATTTGGTTGATTGTTTGTTTGGTTGGCTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGATAGTTTGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTGTTTGTTTTTTATTTGTTTGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTGTTTGGTTGTTTGCTTTTTTTTGTTTGGTTGGTTGTTAGTTTGGTTGGTAAATTGTTTGGTTTGTTGATTGTTTGGGTGTTTATTTGGTTGGTTGTTTAGTTGTTTGCTTGGTTAATTGTTTGTTTGGTTAGTTGGGTGGTTGTTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGGTTGGTTGGTTGGTTGTTTGTTGGTTTGGTTGTTTGTTTTTTTGGTTGATTGCTTGTTTGTTTAGTTGCTTGGTTGTGTTTGTTTGTTTGATTGGTTGTTAGCTTGGTTGTTAGTTTGTTTTTTCTTTGGTTAGTTGTTTGTTTGTTTGGTAGTTTGGTAGGTTGTTTGTTTGGTTGTTTCTTTGGTTGTTTGTTGTTGGTTGGTTGGTTGTTAGTCTGGTAGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGTTGTTTGGTTGGTTAATTGGTTAATTGTTTGTGTGGTTGGTTGGTTCTTAGTTTGGTTGTTTGTTTGTTTGGTTGGCAAGGTGTTTTGTTTATGTGGATTATTTGACTTATAGCATTGATATTTGCCAGAATTGACAAGTAGATTTGAGCAGAGGGTTAATTTCTTCTGTTACTGTTTGCAAAATATAGTGTTTTCTACTCTAAATTACACATCTAATTTAATGGTTGCATTTTTTTATCTTAATTTTAGCCTTAGTCTGTTTTTTATTAGATTATAACAAAAATGCTTTCATAGCTTTGTTTCCTTTCCAGTCTGTCAGATGCTGAAGCCATTGTTGCCACCTACCTGTTTGAATGTTTAGCCTAAGTTGCAGTTGAATACTGTTTGTCTTAGATTAGATGCGCAAGTGCCACTTATCCAATACAATGACAGGGACACTCATTTTGGAACAGTTAGCCTAAGGAAATTGTATATTTTAAATTATGTTTTGCGAAAAATATTTTAGTCTTGTCTCGCTAGTTGTATAGTTGCTCATTTACTGACATAGTTGTAGCTTGTTGACATCTTATCTTAGTGATGGAATAAATCAACCCAGGCTCTTTAGTGATACATACCCCTGTATACATTTCTGGAGACCATGAAGTACTTCCCCGGAGGTAAGTTTTTTGCTGTTTTTATTTTCAAAAATACACTTAAGGTCACTTTGTACATTTATTTCAGATCTCAAATTTCTCTTGCGAGAACCATTTGTTCCCGCTGTTCTTGCATAAATCCACTAGAGGCTGCTGTCGACTGAATGACTGACCGACCGACCAATGTACTCATCCACCCCCTTCCCTAAACCCAACTGATAATGTTTTAAAAAGCACGGATTGACCCGATCACCCTCTTCCCTCAACCCAAACAACAGTGTTTTCAAAAGCAATCCAGAAAAAGAAAAGCCCTTGCAGCCGCCTTATTTTTACCACATTCTTACCCTGTTATTTACTTACATTATTTACTGAATTAATTGTTATTTACTGAATTACGTTCATTGCCAGATTGCAAACCCCAACGTTGCAGTCAACTCCTTTCTGTGTCTCAAGTCTGCCGACGTACATGGAGAGCTACTGGGCAAACTGGTAACAGAGGAAAAGCCGTCCACATGAAGATAAGCGGTCAGCTGGTAGTGTGAAAAGAAACAGAAGCTGTCAGCAGTGTCATACCGGCCTGTAGTGTTCATTTTAAAGATGGGGGTACATTTTCACAATGAGCCTGTGTTGGAATAAATGGTCGTCAACGAATATTATTCGTTGTTTTCTTTAACGAAATGAACACTGGTCTAGTCACCATGGATATGGATTAATTTTTCACAATGGTCCTGAGCTGTTTGGAATGCAATACAAATGCTTCAGTAGTTAGTAGGCTAGGTAACGCAAGTACAATATAAACAGTGTTCAGATGATGATCGGATAATTCTGTTTTTGGGATTCCTTTTTAACTTATTTTTACTTTGTTGAATAAGAGAAAAAGTGTGTTTCTGCTTGTTATACTTCTGTAGAGAAACTGGTAACCAGGCAACACACCACACACACATACACCACCAGCACTGCTCAGCATGGTTGTCAAATTCCTGGCTAAAAACTATTTGTAACATGCTGTACCAGGCTAAGGTGGAAGTACAACAGGAACTCTGCCACTCAAGTTGAAACAATAATAGCACTGTCGTGATAATTGTAATTTTGCAATACTGCACTATTGACAAGCCAACTTCAGAGGGACAAAAGAAACTGTTGCAAATCACGTATTATTTATGACCCTTCCAAATAAGATAAAAACAAAGCTTTTCATTCTAGGGGCTGTAAATATATACGTTTTTGGAGAACTACACTAAGCCACTTAGCTGTTTTAATACTTCGAAATGAAGTTTGAATCATTTTATACTTTGTATTTATTGTTATTTTATTTATTTTTGATATGTAATTATGACTAATTAATTCTATTTATGCATTTCTACAACAGTTCTGTCTGGATCTCAAATCTGATTGGCTGATAGCCGTGATATATTTAAGTAATATTAGCATATTACATCCTCTTTACCCTTTGTGTATTACTCCGCCCACATACAGCCAGTTACAAGCAGACACTAAAGTTTGACAAATATTGCTGCAGTTAGACAACAAAATATACTTTGAGGCTTTTTTAGTCAAGAGTGTAGTTGTTTAGATTGCAACTATCAGTTTATTTGCAAGAATAGTGCGTATTTTAAAATATTTACAATTTCTGAGAGACAGCTCGTACAATATGGCGACAGAACCACATAATAAGCCCTTACGCTTAGAAGATATAACAGTCTAATTTCTAACTATAGCAGATCAAATCAATATTAAACTGGTAAGCACTCCTGCCAATATTTCCGTTTTTCATGGGACTATCCCGTATTTCAGACCAGTCTCCCGCAAACATCCCGCTTTTATTTCTTCCTAAAAAAACTCCCGTAATTTCACCCAACCCCTCTTTGGTACAGTCTGTAAACTAAACACCCCCGGGTTGCCAACCTTGGTACAGTACCCGATCGAAGCGGCCACCCAAAACCCGCTGCATCCTGGTCTCAACCTCACCCCCGAACACTCCCCAACCCCCCCGCCCACGGTCTCCCGGGTTTTCAGAGACATGTTGGCAGGTTAGACGATCTCTCTTTTTTTATGTTGTAGTGCTGTATTTATACCGATTTGCTGGCATTTCAGGAATGTTTGTTGTGTTGGCAGATTAAACTAAGCAAAGTCTGCATGTGTTTAGCGTTTTTCTTTATCGCAAACACAACAGCAGTCTGGTAACGTTAATAGATTCGTTGTTATTTTCTGGGTTAATTATTGTGAAATCCCGATTGCAGCGGAGAAATACTGTAGACTAACACTGTTAGAAGATATCTCTGTAGATGGATGGCATTTTATGTCACGTTCAACTCTTAAAGTGTAAGCAAAATCAGCGGTGTTGTCATCACTTTAGACAGAGCCATTCAAACACTAGTTCTGAAGTGACGTTGGTGAATTAGTAACAACTTCTGCTGTTTTGACGTCACATGCAGATGTGAATGACTGGCGGAAGAAAGTAGTTCCTTATAAAAAAAGGGTTTTTTTCTCAACGTGTTTGATTTTCTTATTTATGTACAGGATTGTGATGTTGAACTGTTGTATAAATGCAATATCACACTCGTAGCAGTGCTGGTGTGACGCTATTGACCTTATTCTCCGCAGACGACCGGGCGCTGCCATTTGAATCTTTTTGGCACGAGACTTCCGGTCTCATTCAGTTCCATTCATTTTTAGACATTAAAAACTGCTCGTTTCGTTGTTTGATGTTGCAAACTGATATTTCCATGTTGTATTATTCTACTTGGTCTATATAGTCATGCAAATATTTGTTTTTAGAGCAAGTAGTTTGACCGTTTTTTGCCGTTTATTATTCCTTGTCATTTCTCCCATAGGCGACTGAAACGGAAGTTCTAAGACAATCGCGAAAACAGGCGCACTTCCGCATTTGAGAATAAGGTCAATATATATAAATATGATATTTAATAATGTATAAAGTATTTAACACACTCTTGTATGAGCTATCTTTATGATGATTTCCCATAGACATACTACATTATATACTGTATTGACTGTATATTATACCTCCCTACCCGTAAAAACCCTCATAGTTAACATTTTGCATTCCTACATTTTCAAAATACTTCATTAGGTATTTGAGTGAGCCGTTTTCCACATAGTTACCAACCAAAAATAAATAAATAAAGAATTTCACAAAAGATCAAATTGACTGGTTTTGCTATACTTGTGGGGACATTGTATGGACTGTAAAGCGCATTCCTTGTGAACCGTCCCTAACTGTACATAGGTTATAGTTTAGATGTTGATTAATTCAGTTGTTTATTCTACCGCATGCATCAGACATTATTTACACTGCATATGCCAGACAAGTCAATGCTCTGTTGTTAGAGGAAATTTAATAGCAATCAGAGGCTTCTAATGAATCACATATGGGCCGTCGTGAGCTAATGGTGTTTGTTTTCCCTTATTAATGTGTTATTTGTCAGAGAAATGCACAAGGGCTTTCATGTCAGACGGCAGGTTGGCAGAACTGATGAGCTGTTGATGATAACGTTCAGTAGTAGAAATGATCCTGACAGCTGGGCGGCACTCTAAACACAACAGAATCTTGGGCTTGCGTGTGTGGAATCACTAAAAGAAATATCTTCTGCAATGTTAACTACAGCATGTTTGGTATTCATTGTATTGTTTTCAGCAGATCGTCACTCTCTCTTTCTCTCTCTGTTTCTCTCTTCAG
Seq C2 exon
GAGAATCACTAACTCATGGTTAAGCACAGGCTGGTTCACAATGACTATTGCCTTAGAGCTCTGTGACAGGATCAATGTTTATGGCATGGTGCCTCCAGATTTCTGTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000039220:ENSDART00000133092:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.004 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0077713=Glyco_transf_29=FE(49.8=100)
A:
NA
C2:
PF0077713=Glyco_transf_29=FE(13.1=100)
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]