DreINT0163687 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000100715 | tlk1b
Description
tousled-like kinase 1b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-030131-4933]
Coordinates
chr6:3746925-3763903:-
Coord C1 exon
chr6:3763588-3763903
Coord A exon
chr6:3747044-3763587
Coord C2 exon
chr6:3746925-3747043
Length
16544 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAAT
5' ss Score
8.88
3' ss Seq
TTGTGTGTGTGTGTTTGTAGGTA
3' ss Score
10.14
Exon sequences
Seq C1 exon
ACACTGAGAGTGAGTGAGGATCTCTGCGCAGTGCGGAGCTGAAAACATGAGCAGCGTTGCATTGATCATCGGTGTTTGTGCGTGATGCATTAAACACACACGCTCACACACACAGGTGTGATTTGACGGAGATCATGCGCGCGATGCGCTGGGCGTCTCTTCGCGGGGGAAAGTGTCTTCATGAGTGTCCAAAGTAACAGCAACAGCAGTGGAAGTTTGGACGGAGCGCCATCTTGCTCTCAGTTCTCGACTGGATCTCCGACCCCGGGCTCAGTTTCTCCGCTCGATATATTCGCTCCGCGGAGGCATAAAGAAG
Seq A exon
GTAAATCCGGCTCGAATGTCAATTTAAAGTTTGTTCATACGGAGTCGGTCGGGATTGTCTTCGATTGACGCGTAATTTTGCGTAAATCTGGCCTTTAATCGAAGCGGTCGTGTCGGAGGCCGCTGATCTCTCGTCTGCTTGCTGTGACTCTCTGTGTTTTATAAGCTGCATCGAGTCCTGCTGATGTGCTTGATGTGTTTTAAACAGTTTGCGACGTATTTCCGCCGCTTTTTGTGTTGGTTGCACGGTTAAATTGAAGCGAGGATGCCCGTGGTCACCTATTAGGAGACTCAGTCACTGGCCGCGTTTCAAAACCTAGCGAGATGTCTACCTAGACTGCATGTTTGGACATCATAGGTGCGTATGTTTTGTGCATGCCCTAAAATGTTGTCTTTGTGTCTAGGTTGGCACCTTGTTTCGTGTTGTAGTCAGTTTGATGTACGAGTTGAGGTCTAGCCTATATGTTTGTCTTCCATGCATGCAATGCAAAGGCTCTCAAATGAGATTCAGCCCGTACCTGATGATAAACATGAGTTGTTGTCTGTGTGCTTAAGAATGTTTATCACCCGTGCATGCAATGCAGCGGCCCGAAAATGCTGGATAGGTGAAGAAAACTCGCTGGATTTTAGGACACACTTGGTTATGAGATAAACACGAGTTTTATAAAGTGCCTGTTTAATGAAAACGGCACCTCGTGGGTCGTAATAACGTGTGTTTTGTGTAGGAAATGCATCATTAAGGCATCCAGTACGACACACATTTGTTGATATGTTAACAGTCGGCATTATAGCTTCGTTTGTGATTAATGCAAGCATGCAATGCCAGAAATTCCTTTTGCTTCCTTTTAGTATATGATCTAAATGAGTTTACCTTTTATTATATAGGCAGTTAAAGTTTTAAGAATGCAGTCAGTAGGGTGCAATACATGTGTTGAGATAGTGCCAGGACTTTAGAAACACTATTCAGTGTTTTAATGTTTAAAAGTATTGTTTATCTAGAACTCAATGCTTGAGGTAAAGTTGGTTGTATATTCACACATTCATACGTTCTCTTTAATAATATAATTACAGAAATGTATTTGCAAATACTAAATAGTGAAATCATATTAGCAGCCAATGACTACCAGACTACAACATTGTTTACAGTCAAATAAACAGAGGTTATGTTGTTTTGAAGTCATTCTTACATGTGATTTCAGACGCAACATTCAAAGTACCATGGTAAACAATCTAGGGAGTATGTCACAAGTTATCACTGAATGAATGTGCGAATTTAAAACTGACTTTACCTCAATATGTGATGGCTCAAATGCTGGCTAGGTAGACAGACTTAAGTTTTGCTGCTCATCTAATTGGTGGCATGATTATTCATCTGCTTGCAATGCAATAGCTTAGAAATGAAAGCTTTCTTGGTTGGCAAAACAAATCTGAAAAACAAAAATGAGTGTAATTGAGCATCAATTAATAATGCATACATTGTTAAATATTGTGCATATGCTGGAGAGGCGTCACATCTTAATGCTCATTGTTGTTTTTGGCGTTAGCCGGACAGTTTTGTCCATTAAATAATTGATGGGTTCAAACCTTTAATCTATTTGATTTAAATGGAAGTGTTTTTGAAAAACTTTAGTTTTGAAGCGGGTGTGAATATTTATTGAGTGCACCTCAGGCTGGTGTGTGTTGATGTGTGTTGTAAACACATGTATGTGCACTGATGAGTGTAATATCATATGTGTGTTAATGCATTACTCAGATTCTCATGTCCAAGAATAAGCTCTCCGCTGTGTAATGGCATGCTCTACCTTTAATTTATTTTATTAATGTTTTGAAATCATTGAAGCGTTTACATCTTGGCAATAATTCAAAGATATTCTGGACATGATACCAAGAAATTGCCATGTTTATATGGGCGTCTTTATTGGGGATTTTTCTCCAGATTTATTAGTAGCAGTACCATCATGTAAGTACAATTTTACATGAATGTTTGGGTTTATTATTTATACAAGAATGCATTAATAAACTGATCAGTAAAGACAATTATACATTTTTTGTTATCAAAGGAAACTAAAAAAATGTATCAGGGTTTCACAAAATATGAAGCATTACAACTGTTTGCAGCATTAATTACAATAATAAATATTATTGTGCAGCAAATCCGCATATTAGACTGATTTCTGAAGTAGCATGTGACTGATGAATAGAGCAATGACGCTTTAAATCATAAGCAATTGACATTTTAAACTGTACTTATTGTAATTACAAAATCTTTTAGCTGTTCTTTTGATAAAATGAAACTTTTTTTTTTTTTATTAAAATTGTATAATTCACCCAAAAAGGAAAGTTCTGCCATTATTTACTCACGTGTGATGTTCAAAACTGGTTTAGGTTTCTTTAATCTATTGAAATCAAACGAAGATATTTTGAAAAATGCTAGTAGCTTGCACCCATTGACTTCCATAGTATTTAGTTTTTTATGATGGAAGACAATATGTGCCAGAAACTAGCATTTAAAGTTATAATCTTTGTGTTTAACAGAATAAAGGAGCACTAAATTTATTATGTAATTTTAGTGTTAGGTTGAACTGTTTCTTTAAATTAAAACATAATTAGCATCTTCAAACTTGCAAATTGTGGTGTAAATTAAAGTAGAATGCTAAAATTCATTCATTTATTCATTTTCTTTTTGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCAGGGTTGCCACAGCGGAATGAACCGCTAACTTATCCAGCACATGTTTTACGCAGCGGATGCCTTTCCAACTGCAACCCATCTCTAGGAAACATTCATACACACTCATACACTACGGTCAAGTTAGCTTACCCAATTCACCTGTACCGCATGTCTTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCCACACGAACGCAGGGAGAACATGCAAACCCCAACTGACCCAGCTGAGGCTCAAACTAGCGACCTTCTTGCTGTGAGGCGACAGCACTACTACTGCGCCATTGTGTAGCCCATGCTAAAATTGAGTGCTGTTAAAGGTGCAGTAGGTGATTGTCTTCAGAAACACTTTTTGTTGTGCTGGTTGAAAGTCTCTTCACAGTCCAATAGTAATGATTACAGTAAATGATCTGAATGTGTTTATTTGTATTTTTATATTCAGGGTAAAGCATAAAACTAAAAAATGTTCATCCAATTAAATAGAGTCGGACCGACATCTCTCATAATTCCGATAGGCAGGTCAGACTGTCTGTCAACATATGTAGATTCAAACTTCTGCGCATCTGTTCACGCAGATCCGCCATTAGCGCGTGCCCATCTGATCACAAAAGCATGCGCGCGAGCGAGCTGCGGGCCATTTGCCGATGCCGAGTCAGAGCATTGGTTTCCAGCCATTTCCAGCCTGGTCTTAGCTGGTTAGGCTGGGAGATGACCAGCTTAAACCAGCTTGACCAGCCTAGCAGGCTGGGAGCCCAGCCAAAACCAGCTATGTCCAGCTTAAACCAGGCTGGTCAAGCTGGTTTTAGCTGGATTTAGCTGGTCATTTTAAACCTAGGCTGGTTGACTGGTTTTAGCTGGTCAACCAGGCTGGTTTAGAGGGGTTTTGGCCCTCTAAAACCAGCCTGGTTGACCAGCTAAAACCAGCCAACCAGCCTAGGCTGGTTTAAGCTGGATTTTTTAGCAGGGGAAGTATTACTGTTAGACAGCTAATGTTGTTTTAAAACTTAGTCAGGCTAAGCTTATGTTAGATTGTGTTGTTTTGAATGACTTATATGCACAGACGTGTTGTTCAACCACTAAAATCCCCCGGTGAAAAATTGATGTGATTATTTTCAGTTTCATAAGATTCTTTGACAGCATCTATAATAGATTTATATGTAGTTTAACAACAAAACACCAGTAAATAGCCCTATTTCGCCTAACCTGCTTTATTGAGCTGAAGTTGCTTTTATATTCACATTGGCTCATTTTTGAACAATGACAGCCTTCCTATTCTGTTTACCATGCTACTCTGAATATTCGCTCTGAAATAGCATGTACGTGTGGGTAAGTAATAAATGTAATTCCTGCACGGCTCTGGCACTAACTAACTGGCGAATGACATGAACTAGTGGGTTGTCTGTCTACTATTGTGATGCGGTGCGCACTCGCGATTTCAGGGCTGTGGCTTTAAATCACAGTCCCTCCCCGCCGTCCAAAGATAATATGCTAAGCTGTTAGCATTTTGGCAGATCACCTACTGCACCTTTAATAATTGCTACTGGATTTTAACTTTCAGGCATTTTCTTTTTAAAGATTTATGTTTGGCCTTTATTTGACAGGACAGTGGAATGATAAGAAGTGGGAGAGAGAGAGGGTGATTGGATCGGGAAATGTCCACAAGCCGGGATTCGAACTTAGGAGCACTGTTGAGCTATATGTTAGTGAACTAACCACTCAGCTATCACGCTGAACTTTTCAGGCATTTTTGAGCATAGAAAGCACTTGGTTTATCCATTTATTTGAAATATCGTCAAACGCTTGTATACATTAAAATCACTTCAACATACGATATGCAGCTACCTGTAAAGATGGATCATACCATGTCATTGTAAAGTGATTGTTCATGTTTTCACAATTACAGTCTCCAGTGCATTCAAATTGGAAAATAATTCAATATTTTATAATTTGTTGAGATATAAAATAAAAAATGTATACAGGGCTGAACAATATATGATTTGAGCTAGGCATGGGCCGGTATTGACCTTATTCTACAATGTAGAATTGTTTTAGAACTTCCGATTCAGTAGCCTATGGACGAAATGACTAGTAATAATATGTTGTATTATAATGTATTATATGTATTATAACTTTTCAAGATAAGGGGCTGGGCGATAAAATTGGTATCGATATTTATTGACCGAACACCATTGTCAATATCAATTAAAAAAAAAAAGATTCGGTATGAAGGCTATAGTTTTATTAAACATGTCTGCTGAGCGCGCACGTTAAAAGGAATGCCAATAAGCTTAGAGTGTAAGTTTGTTGTTCCCTATGAAGGTGCACAGCACGCACATGGGAGCGACGTGCACCTTTTGTCGAAGTGGTGCACACATACACACGTGACGCGCACCGGCGCACGCATTTTGCGGCCGCTCCTAGTTGAAAACATCTGAACTTTTCCGAATGTCGTGAGTGCTTCGCAATTCATGCAAGTAGAACAAACCAATCTGCTTCACACTTTGTATGGAATATACACATTTTAGTAATAACAGCAGACTTATTACCTCAGACAAACACAGCACATGCAAGCACTGCATCGCTTTTTACTTTTCTCCATAAACTTGCATCGGAACTGCTGCAATGATTTCTGTTTGTCATCCACTTGATGGTCACCTAATTACGAGAGACGACAGGGGAGTGTAAATAATGAAGGAATCCACGCACTTGCGCATGGCACTTTTGGTCAGAATAGCAACACATGAGAAAATGAGTAAGCAGTGAGGAGATTGCAAATAAAAAAGGATGCAAGGATGTCGCCAGAGTGGCTTTTTGGTTTCTTTTCTTGTGCATCCCAGCCACTAGCACCCCTCCTGAAAAAGTTTTTAGTATAGCGGGTAATGTAGTCATCCAACTTCACAATTTGTAATGTTGCTGTATGTATTTGAATAATGATGGCTGGTTCATTTACTTGAAAGCACAGATTTGTTTATCATAATTTGTTTACAGAGTTTGAGGTTTACTGTATCGTTATTATTGACCCCCTCCTTACAGATGTTGATCTACCTTAAAGGTTTCCGATTGTTCAGTATTTACGCTTTACCATTGCACACACTGGGTAACATTTTATTTATCAAGTTTAAAGGTCTCTTTAACACTTGTGTTTATTTCATTATAAAGAGATCAGGGGTCCATTCTTCGTACCTCGCTTAAATGATCTAAGATGATTTGGCAGATCCCGGATCTTTTAATTTTGATAACTGATCTCTCCCTAATTTGGTTCTTCAAACAAGTTCGTGAATCAGATTAGAATGTCTGGATGAACTGATCTGAGATCGCTGCGTGTGTTGTGAAGGACAGATCTATCGATCCTCGAAATCATGATCAGCAATGCAACGATTGGCTGACAGCACAGCAGCGTAATGACATCATCTGATTAATATTCAATTATCCATGTGAGCAAAATGACATCAAATTAGCAGTAAACAGTTTGTTAAATATGACACGCATTAACCTTTCACATTTGTTGTGAGCTGCAGGCTTTACACTTTCATGTGTCAAGAGTATTCATCATGTATTTCAATGCAAATCAATGTATTTGATTCTATATTTAGAGAAGATTTTCTTTATTATAGTAGCCGTTTTTTAATCGGTGTAAAGAATAACTGGTTGTTTACAAAAGCATTTTTATATTGGTAAAGGCGTCTGCAACTTGTGAAGCATCAAATCACTGGCATATTAACTATCAAAACATGTTTATGACTGCTGAAATGTATTATTGCTTTAAAAAAAGTCACATATTGTGCATTTCTATTATACACAATTTGTACTAAAGCGATCTAAAAAGTTCATATCAATAAGTTTTCTCTTTGGACCACCAGGTGGCAATCTTTGTACTTTCATTTCGAGGGTGCAGATTGCATACGTTATATTAATATGTATAACTTAATTTATTTTATTAATGACTATAACTTTATATATATATATATACATATATATATATATATATACATATATATAGTTAAAAAATATGTACCATTTTCCCAAGTGTATATAACTACTACTGTAAAAAAAATCAGAATTCGGAACATACTTTCTGTATTATCTTTGCTTGAACTAAGCCGATCTAATCCTGTTTATATAAATTGAACCTGCTCCCGATCAGGTTTGACCTAGCAGAACTGTTGCTATGACAACAACTCTCGGATCAGCTTTGAAGAACGAAACGATCCTGGATCGTGTCAAATCGTCAATATTCAAATCCAGCTAACTGAGTAATCCACGTACGAAGAACGGACCCCAGATGTTTTTGTTTACATATTTTTGACTAATAAAACTTGCCTTAGTAATGTTGGTAAATTAAAATAAAGTGGTTAAGTTAATAAATAGAACCTGATATTACTAAATGATGTAAAACACAATATCGTGATAATTCTTTTGCAACATCGCCCAGCCGTAAAATCCAGGTGACATCCAAATTAACATAAAATTAATTTGATGAAGCTTGAAACATCCACAAACTAGGATGTGGCTTGTTTGTTTTCTGGTCATTTGTATCACTCATTTCCACGTATGTTTAGTGCTCGTGTCAGGGAGGTGTCTTATTTAGCCAAGCGCATTTTTTTTTCCTGCCTACTTGGCTTTTATGCCAAACCCAACGTGGCCTTAGGTTTGTGTTTACTCATTCCTGGGGTTTTGATTTATCATCTGTGTCCTTTTATCTGGGCAGCTGTGCTCTTCCTGCCCTGCTGACCTTCATAATTTTCCACCCATCCACCATCTTGGGATCTCTTTGGCTTGAAGCTCGTTCTGGCACGAGTCTTATCATGGCAGTGAACGCATCCATCGCATTCTTGTTGATGGCCGGAGAACACAAGTGAACCCGGGCTGTTTTGTCTAGTCACCGTAATGGGCTTTTGAAGACCAGATGATACTTTTTTAGACAGGCTTTATAATGATGATTCATGCCGTTATTAGATGCTGGTTCTTATCGGCTGCTGATACTGTATTACTCTCTCGTGCTAAAGAAACGGGGCCATTTGGCGGCTGCATCGATGATGATGAATTCTGTCTTCAGGCATCTGGTGCCAGATCATGTCAGACATGTTCAACTAAGGCACGGTGTTTTTAATCATACAGTAACTTTGTGTGAGGATCGCATTTGCAAAATTTGTTTTAAGCTTTCGATCTGTACTGTCTTTTCAATGGCAATTAGGTATGCAACAATTAAAGACTTTGGTTGTACAATTATAGTCTGAGGAATAATCACGGTTTCATGGTTATTATGCATTCATTAATTTCAAAACACTACTAGTTTATATTTATATATGAGCAATTCCAGCGTTATGGATGTGACATTTGCAGTAAAAACTCAAAACATAATTTCACACAGAAAGTATATGTTGAAATTGTATCGAAACTTCTGTTTATATTTTCCAAAATAGCTCACCACAGAGTTATGGTAGCAGAAAAATATCAATATGTAAACATGTTTTATATTTTAAATTAGGAAAATAAACATGCGTTATGGATGTGACAAAAAAAGTTTGCGAATTTGCAATGGACAACAGATTATTTAGAAATTCTGACAGTTAAACTGCACAACCCAAAAGAAACAATGCTCATCAAACAGGTATGAATCGGCTCACTATAGAATTATAATGATTGATTTTATTTTATTTGACATTTTTGCATTTATGAAGAAAAAGTGTCGTTATGGATGTGACACATTTCCGTTATGGATGTGACAGCTGTGAAATAGCCACTTGTGTGATTTTGGCAAATTAAATATAATAGTTTGAAATACTGACAGATACATTTACGAGTATTTTTACAGTACTGTAAAATACTTGCTAACACAAAAAATGTAGAAACGGTTTGTCTATTTTGGTGAAAACTAAATTATTTTTTATGGCAAGGTTGACATTTGCATGGAATTGCCCATATACTTATAAAGTGGTATTGCTCCTCAGTAACTAATTAATACAGCAGAAAATATTCATAAAATATAACAAACACAAACAATAGTCCATTTCTCTTTGACTTAAAAATAAGTGAAAACATTTTTGGCATTTAAACATAATAATTTTACACTGAAAATAAATTATAGAACAACGAATAAATATAAATAACTAAATAAAATGAATGATTAAAAAATGTATTTAATGTAAATCTAAGCTAATATATCAGCTAAGTATTACTCTTTTAAAGACGGCAAATGTTTTCAAAGTCGGCTGAACCTCTGTCTAAATGTCGAATGTTGCCTGTTTGACGGTCCCAACATGCGCACGCAAGCAGGGCGCCACCATTGGAAATAACAAAAGTTGCACGCGCAAAAGACGCAATATTTAGATGACCCTTAGTTGATAGCCTCGGCCATAGTTAATCCAGTCTGCACGCGTATTAGCCTCAGTGTACAAACTCGGAACTTCAACTAGTGCACAGTTGGCATAAATTTGTTTAGTTGCAGCAGTTTTGAAAAGCCTTTACTATTCATTAACAATGTCGAACTATGGATCGTTGCATCCCTAATGTCAGTTGGATCTTTTTTAAGTATGTATATATAATAATTAGTGCTGGGCTAAAGTGTATTGCGTCTAAAATAAACGTTTGTTTTGACATAATTTAAGTGTTTTTACATATGTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATGTGTATATATCTAAAAATCAAAACAAACTTTTATTTTGGATTCGGGATTTAATCTTTGCCAAGCACTAAAAATAATAAAAAAATAAAAATCTAAAACTTATCTTGACAACTATATATTGGATAATTATTTAATTTTAATTCTGAGTAAATCTTCCCTCTGCGTTTTAATCCGATTATTTTTTTTAAAGTTAATTCAAATGTATGCATAGTTTTGGTGTTTTCTATTATTTCCTATCTAGCAAAAAAATCCATTTTGCTCAACTGGAACCAAGGCCTCCAACATTTGAGCTGTTCATACAACTCTTGAATGAAATGATGCTCTTGGAACAATATAGATACTACTAAAGAAACAAAGGGGATGTCTTTCAAAAAAATATGGATGCCTTTAATGAACCTCTGACTCTCAGAACACCTCTGATGTATTTTCATAATATGTGACTTTACTCAATCACAGCATAACTTTTATTACGATTTTTGTATTCTGTTTGTATGTTCATTTATTTTTAATTTTTCAAACAAATTTCTGACTTGCTGCTATACTTGTCTACTGATATCCTTGTCTTTGTTTTTTAGCCTATGTTTGTATGTTCATTAAAACCAATAAACACAAAAAAATACAATTCATATATATTCTGAAGACAATTCATTTATTCAAAACACAATACATAAATATGCAAAACACTATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATGTATTCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCGGATATTTAAAACAAAATTCATAAATATGCAAAATACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATGTATTCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCGTATATTTAAAACAAAATTCATAAATATGCAAAATACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATATATATTTAAAACACAATTCATATTTATTTAGAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAGAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTTATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAGAACACAATTCATATATTTAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATTTAAAACACAATTCATAAATATGCAAAATACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAGAACACAATTCATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAGAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATTTATTTAGAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTTATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAGAACACGATTCATATATATTCAAAACACGATTCATATATTTAAAACACAATTCATAAATATGCAAAATACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTTATATATATTCAAAACACAATTCATATATATTCAAAACACAATTCATAAATATGCAAAACACAATTCATATATATTCTAAACTAATTTAATTCATAATATTGATGCATCCATTCAATTCATTTTGGGAAATATTTATGATTTTTACTTGAAGATGTGAATTGATTTTGTGTATTTGTGAGCTGTGTTTTGGATTTACGAATCGGTTTTTCCGCATGTATGAGTTTTATTTTTTGCAAAGGTATTATCTTTAAAACTGATCTGGCTCCATAAATAACACATCCTGAAAAAAAGCACTTTGTCAGGTTTCTTTAAAGACTAGACGGTTACATTATTTTGCCACTTTTGATCAGTTTAATGCATCCTTCCTGAATAATGTTTTTTAAAGCACCTAAAGTGTTGTCATTATTTTCAGAGACTAAAATAAGATTTTGCTGTCAGTGGCATCAGCTGATAATGAGCAGGAAACGTCTCATAGTACTTCCTGTTTGTCATGCTGTCTCCTGCAGGAAAAAGCTCTGCAAAAGTTTGCAGAAAACATGACTAATAAGCATAGAGTTTGGTTTGAATGGCTGGTTCACCCCAAAATATTTTACTATGCTGTTAATTTACCCATTCAAGATGGACGTGACTTAATGTTTCTTTTCAGAAGGACATTTAAAAAAGGTTTGGGCTTAAACTGATCGTTAGTGATTCATAAACGTGAACATCTACTAACACAAAGAAACATCTGTAAAAAATTGCTGTCGATTATTTGCATCATTAGCAACTGTAATTCACAGTCTCTGGCAAATGGATGAATCTGAATCTTTTCAGCGAACTGATTCTTTCTGCTGTTTGATTGTTTTAGACATACGATTCACTGGTTCAATTTTGTAAACACGCCATGACATATATGATTACTTAAAGCACCCAATAATGAAATGAAACGTGAATATTATACATATTAAAAACATATAATGTGAATTAATTAGTCTAACATGAACCATGAAAAACCATTTACTTAAATTTCAGTTTTCTTCAAGTTCTGTTATGGCTCATCAGTTCTTCAGTCTGAATCACAGCTCTTTTGTTTTCAATTTAGTCACTGTTGGAGGAGCTGGGTTGGCGAATGAGATGTGAAACCAGGCACATTTTGATCATGTACACTGGAATTTGGGCTTGTTTCAACTAGGGGTGACTGTTGGGCAAGTCTGAAAGTGTGTAATGTGTTTGAGTAACTTGTTTGTATGAAGCGTTAACTTTTTTTAATGATTCAGTCTGATTTGCTGAATTGACTCATTAGGTTCTCAATCAAGGTCCTGGGGCCTCATGTATCAACGCTGCGTACGCACAAAAACTTTGCGTACGCCAGGTTTCACGCTCAGAATCGCTCACGTTTGGATTTACTAACAATGAACTGAACGTGGGAATGTGCGCAGGTTCACGGCAGCTTTCTGGCAGGCGTACGCACATTTTTTGTGCGTGTCTGTTTTATTTCCATTGGCGACTCCTAGAGGCAGTTGTGTTAAATTCTTCTCTACAAAGTGTCTGATCCTTGCAATGGCGTCTGTATGAGACGGGTTCATCTAGCAGGTATATAAGATTTCCATACCATACAGTTGACCAGCTAAACATTAAAGCACAATTTGCAGCAGTCGCCTGTTTTCCCAATGTAATCTGAGCTATCTACTGCACGCACATTGCTATAAAGACACTATGTGAAGATAAATTTGCATGCGTGAATCAGAAACATTTCCATTCAATAAATGTGCAAATAAAATATGATGCACAAACTTATTGATGATTCATACTTGTCTTTCTCGAGATAGTGGGCAAAATCTGATATGTAGCGGGGAAAAAAAGAAGAAAGAATTCATCAGACACTGGATTCGAGCCGAGTTTATGCTCGAACGTGTCAGTACATGATCACATGTTTCTTATGAGGTGCGCCACTGAGACTGCTAAGGGTACTGCAACATTTCACAGATATAAACCACACTATTTCTTTTTTAAATGCACTCAGTGCGATGTTCAGACCCAACTGTGTTAACCGTATCAGCTAAACTCTCCCACTCTATTTTTTTTCTTTTGTTGTTATTTCCGGAGAACAAACTTGCAAATAACACCGCTTTTCTCCGGTCTACCTCCGAAAGCAGCACCTCCAATTCAAATTCTGTTCAAAGTTTCTCTTTTTGCTTGATTTTGCCGTTGCTTTTTCGTTGGGTTTTGCCATTAGCATAGTCATTAGCATATTCATACGGGGGAGGAGGCAGGGAGGGGTTTTGTGCTCGTGCATGTTGCGCTCAGTTTCACGTTCATTTAGATGTACAAAAGAATATGCGTGAGATTCGGCGTATGCAGTGTTTCATACATCTGAATTTTTTTCTGCGTACGCACATTTACAGCTTTGTGCGTACGCAATGTTTTAGTAAGATTTCCACGCAAGTCTTCGTACATGAGGCCCCTGGTCTTAAGAAAGATTCTTTTGCAAGCCAAGTGCTGTTGTTTGAGATTATGGTTACAAGTAACAGTGTTGTAAATAATGTTCAGTTTCTGGTACTTCATGAGACCTAGCTGTGTCTCCATCTATTCATTCATTCATCAATTAAAGTTCTTTTCGCCTTAGTCCTTTTATTAATCAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCTTATGTTTTACACAGCGGAGGCCCTTCCAGCCTCAACACATCACTGAGAAACATACGCAGATTCTCGTTCACATGCATGCAAACACTATGGACAATTTAGCTTGCCCAATTCCCCTATAGCGCATGTCTTTGGACTTGTTGGGGAAACCTGAGCACCCGGAGTACAACCCACGCAAACACGCGGAGAACGTGCCAACTGACCCAGTCGAAGCTTGAACCAGTGACCTTCTTGCTATAAGACAACATCGCTAGCCACTGCGCCACCGTTCTGCCCTCTGTTTCCATTCAAAGATACGCATTAAACTTGTGCGCAACACTGAAACACAGCATATCAATTTTGTGCATATAGCACCGTTAACATCCAAAGAGAACAAAATCTTCACTTCCTGATGAACTGGCCCCAAATATTCAGTCATTCATTCAATCATTTTCTTTCTGCTTAGACCCTTTATTCATCAGGGGTCGCTACAGCGGAATGAACCGCCTACTTATCCAGCATATGTTTTACACAGCAAATGCTCTTCCAGCTGCAACCCAGTACTGAAAAACACCCACACACACAAACACACACAGCTAATTGATCTTATTAAACCGGAGCAATGACCTTCTTGCTGTGAGGTGACAGTGCTAACCACTGAACCACCGTGCCGCCCATCCATTTTCATTCATTCATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCGGGGTCGCCACAGCGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCAAGTTTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGCCACAACCCATCTCTGGGAAACATCCACACACCCATTCACACACACACTCATACACTACGGACAATTTAGCCTACCCAATTCACCTGTACCGCATGTCTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCCACGTGAAGGCAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGAGCCAAGGTTCGAACCAGCAACCCAGAGACCTTCTTGCTGTGAGGCGACAGCACTACCTACTGCGCCACTGCCTCGCCTATCCATTTTCATCCTCAACATAAATGCAAGTTCTTCCATTACCTCAAACCTCTGCTTACGTTTCAACATTGACTCTTGAAGCCAGTTCCTTGCTTTAGTCTTTTTGCATGCAACAAAAAGAATCTTATATAAATATTGGTCACCTCTTGGTACAATGTCCTTAATAACTCTCACAACAAATTTATTATAAAGTGTAGGTCTCCCAAAATGAGAAGTCATCATTTACTCACCCTAGTTACTTTACTCACACTAGTTTCTTTGTTCCGTTGAACACAATGTTGGAAAGCAGCACCCATTGACTTCCATAGCTTTTTTTGTTCCTACTATGCATGTCAATTTTCAGTAGGGGTGTCACGATTTCGAATCAAAAAATAGAATCGTCGATACTGCCACGCCCCATGTCACGTCAGCTTGGCTTGCCAAGCGGGAAAAAAACAGGCTTGTTGAAGTGCTTGTTAAACTGCAGAAGCAGGAGACCCGTCGACAGAGCTTAAACCCTCTCCTCTTTCATTGAAGTCGCCGGTGTGTAAGCATTTTGGATTTTTAGTGAGTTATGTTGACAATGTTTGTGTTGTCGACAAAAAAAAACACAGTTTTGCAAGCTCTGCTATGTACGTATTACGTACGGTTCGTCCGATAGACAACACCGGCATCGCGATCCTCCGCCCGCCCCTGTTGCAAATCCGCTCGCGAAAAGTACACACTCAGGCCCTGTTTACACTGTCTTTGTTTTTAAATGACATTTTAGAACAACAACGATTTGACATCCACAGTTGCGTGTAGCATTTCGGAGCAGCCCTCCTTCCTCACTACCTCTGAAAATGCACATCACGTGACCACACAGACGCACTCACAGCCATGCGCTCGAGACAGCAGGTCCAGGCAGTCAGAGGACTGCTTCAATCTTTCACTCACTTGTACTTAGTCATTTTAGCGAACACCTCAGTTACTGTTGGCTGGTTCCTGTTGGTTGTGCGTCTACCGACGCCATTATAACGACACAGATCACTGCCTATTCACGAGTTCCGCAGAAAAAGTGATTGACAGGTGGTAATTATGTGTGTATCTTGCCTTTATTCATTTACTGTATGATTTGTTTATGGGTAAAACAAAGACCATGCAGGTCAGGTGGTTTAAACGGTAGGCTACAAATAATTAATTGGTCATTAATTAATTAATTATTCATAATCGAAAATCGAATCAAATCGTGCCTTTAGAATCGAAAATGTAATCGAATCGAGGATTTGGAGAATCGTGACACCCTTAATTTTCAGAATAACTTTTGTGTTCAGCTGAATGAAATTTGTGGATGTTTAATAGCACCAAAGAGTAAGAAAATGGCAAGATTTTTAATTTTTGGTTTGAGCTATCTTTTAATGTTTTACTGAAGGAACAGAAACACCTACATATTAGATGGCCTACGGGTAAATTAATCTTTTTTTTAGGTGTGCTGTCTCTTTAAGATGCATAATAGTAGACCTATTTGTATGCACAATATACACACACACTATATACAAAGTAGTTTAGAGACTGCAAACCTGTACTTGGTGTGCCACTGAAATTGTAATACAAGTTGGTATTATCTTCAGGCTTTTTAGGGTGGTAGAGGATCAGAAAACAATGACTTGACGGTTTTGTAAGATTCCTGGAGGATTCGTCATCATGATCACACCCCTCCTGAACCTGAGCCTTGTTACCTGTGTGTGAATGACTGGAGATTGATATATATATGTTTGTGTGTGTGTGTTTGTAG
Seq C2 exon
GTATGGATGAGCTGCATTCTCTGGATCCACGCCGGCAGGAGCTTTTGGAGGCACGTTTCATTGGGGCTGTGAGTGGCAACACGGGAGGAAGCACAGGGAGCGCGAGCGGTGGACCTAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000100715:ENSDART00000171804:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]