GgaINT0048448 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000008479 | PLEKHM3
Description
NA
Coordinates
chr7:13130685-13142121:+
Coord C1 exon
chr7:13130685-13130878
Coord A exon
chr7:13130879-13142057
Coord C2 exon
chr7:13142058-13142121
Length
11179 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGA
5' ss Score
10.57
3' ss Seq
TATATTCTCCTCTTTTTCAGGAT
3' ss Score
11.69
Exon sequences
Seq C1 exon
GTATCAAAGCAAGCCAAAGAGTTTCTGGAATATGTGTATGAGGAGCCACTGATTGATATCCAGCAGGAAAATCCCATGTTGTACAAGCACGTTGAATCTCTGGCAACTGTTGTCCGCCTGAGACAGCAGTTAAAATCTCTGCGAGCCTATTTGTTCAGCTGCAGAGCAGCAGTGGCTGAAGATCTACGAAGAAG
Seq A exon
GTAAGAACCACAGACATCATGTAGCACAAAAGTATAGTTTCCCTGTTGTGGTGGTGTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTCCCTTCATAATCTAGTTCTGAAGATGTTACCCATTTAGAAAGGTGTTGTTCTTGGATCTGACTTTGCTGGGCAGCTGGGATATCTACCACCAAAGAAAATGGTTTCAGTAGGTTTTATAGGGTCTAAATATCTGGAGTTGCTCTCGACTGCTATTAGCCCAGGGGTCCCACGTTGTGGTGAGCATCTTTTACTCCTGCTCAGGCTTCTTGACTTTGCATGAATGTCTTTAAGTCAGGTATGATAAGTCATGCTCCCTTGCCACAGCATCTGTCTTTCAAGTTATCTAAGTATGGTAGCCACTGTCAAGAGTTTGAACCAGCTCAAAGTATAGCAAAGCTTAATCAGTGGTCGAGTACTTCTGCCCTCCTCTATGACATATATGATTTCACAAAAATGCAGAGGGAGATGCAGTCCCCTGCAAGTGAGTCAACTCATGAGTTATGCAATGCCAAAGTAGTCATGCTGTTGTTCAGTCACCATCTTTTCCATGCATCTCTTGGCTCTGCAGAGTGATTTGTTTATTGGAAAATAGATAGTCACAGCACAGCAGAAAATGTTTCTCAGCTTACTAGTTCTGAACTTTCCTTGAAGGAAACAAACTAAAAATGAACAATCTTCTTAAAACCTTCAAGACACAGTGGTGAATAAATAAACAAATAAAAACCAACCAACCAAACAAAAAAAACCCCACAAACCAACAAAAAAACTAGGTTCCTTTTGTCCTAGATTTCTTAAAGAGATTGGGAGATAGCTGTGGCTATGCTGTGTTGTGAGACAAGTGGTTACAGGTATATGTAGCTGACCCAGTGGTAAATACATCACTAAGCATTTGTGAGTGAGACAAGTCCACAAATAAGAAAGCCACTGCTTTGAAATTATCAACTTCTGAAGGATAAGAAAGCAGATGCCATCAGTGACTGTGCTTTGAGCATAATTCTTAGGGATGGTGGGGATCTGAATTCTCTGGGAGGAAGAGGAGACCAATCTGTCTTTATCCCATGTGAGTGTGAGGTGAAGCCTGCCATTCAGTGGACAACCGTGTTGTTTGAGTAACCACATCAAGAACGATGTAACAGCAGGTTTCTGGAGAAGGCACTACAAAGTTCTTGCATCAGACCTGCTGGACTGTCAGTATGTGTCTGTATATGTATTACTGCACAATCCCCATTATTTTATAGGGCAGCTCACAACATTTTAAGAATTAGGATGCTTTTTTTTCTGTTATTTCAGACTACAGTATTATCATGCAGAGCTGTCTTACTCTTCAGCTACAATTATTTTCCTATGTCATCCTCTTCAACTGCAATAAAACTAAAAGGAAAAGAAGATTTATGAAGGCTGCTCTTAAGGAAAAGTGGTAGAAAAGAAATTGTGTCCTCTGATTAATGCTGAAGAAAAGAATGCCCTGATTAAAATGGACAGGAGGAGGCAGAAGAGGCTGAAGGTACTTAAGTAGAAGAGCAAAAGAGGAGACATCAAAGGAGGTCTAAACAGAGAAGTCTATGACTTAGGGACAAAGGGATGATGGAAAGCCAGGAGAAGGAGATTTGAAGAGCCAGAGCGGAGGGTAGGAGATGATAAGGAAGAGATCTCAGGAAATGAAGAGTTAATAAAGAAATTGAGTCAAAGGGGGGGGGCCCGAAAACTTGCCTCCAAAAAGTAGAGGTGGCAAGTGCTGAAGAAATGGAGAGAAGACAGAACATACAAAAATTATCACAGAAATCTGTGCGTGATCTTTTCTTGGGGTGACAGGCTTGGGGAGAAACAGGAAAAAAATGTCACAGAAGTATTGTGATAAGCATTTAACACCAACTCTGATTAGGAAAAAAAGGAGAGAAGTAGCAGCAGTATGGGCAAATATGTCACATCCTGTTTTGTGGCTGTACCTGAGTGGTTGTATTTGGCTGGACATTACTGGAGGCTTGTTCCCTGTATCAGAATGAAACACCCAGGAAGGTAGGAGGGGAGGATGAAGCACATACTCTATTTTCTTATTTATGGGTTCCTTCACAATGTCTCAAATTAAAACTCTGTGGTGGAGAGAACCTCAGCCCAGGAAGGTTGGGAGTATTAAGGCATTGATTTTGTACAAAAGAAGCATCTCCAATTTGGTTGGATTTGTTAAAAGCACTGTAAAAGTCACTGGAGGAATGTTTCAAAAGCACAAATGCATCTTAGAGTTCAGCTTCTTCTCAGATTGTGAAGTCTCCATTGCAGTGAGTTTTGGTGCTCGGTTGATTCTTCAGATCTTCTGAAAGATGTTTGCAGAATTGGAAAGGTAGGGAAGTCCTTTTCCTAGAAGCATGTATCTTGCCAAGAACTGGTTCCTGTGTCTTTATTTGGTACGTGTAGTATCACAGCCTGCAGACCCTCACTACCAATGTAATGGCTTTACAGAGCACAACTGACAAGTAAATATGTCACTGTAATTTACCTTTGGTTCATCACGTGGGCCAGTTTTAAAAAAGGAGTTTAGAAACAACACGAAGAGACAGCATTCCTAAAAATAGTACCATTTCCGAGTTAGAAATGAAAGAAGGGAGGAGAAAATCCAGTTACCTATCTGGCTCTGAAAACATTATTTTTCTGCTTGGTCTTCACCTAGTATGTGAATGACTATTAATCACAAGCAAGTGAACACAGCATCTTGGAGACCTGTCAGGCCCATATAAACAGACTGAAACAAACTGTTAATATTGCTGTCTAGGGAGAACTAAAAACAGACTGATTAATTGTATTGGCACCTTGCTGCCTTTGAGACACTAATAGAGCCTGCCTTTTTAGGGAAAAGCATATCACTCTGAGGTTTCTTTTATTAATACTATTTGCATTATCATCATCTTTAAATCTATACCTTGCTCTTGAACTCAGATCGCAAAACGAAGATGGCAACGAAGTTGGAAACTCTTGATGTCCTCTGGGAAGACAAAACTGTTTACAGTGCTTACGAGTCATTTTTTTCTGAAGAATTCCAGATGGCTATAAACCAGGTTAACTTAGGATCCAGTTGGTTTAAAAGTAGAAATGTTATTTATAATGCCTTGTGTGCAAAGACAGGTACTTTGGCAACTTTGTGAATCTTGGCATCTGGTAGGGTACTTAGGGCTGGGCTTGGCAGAAGCAACTGGCTAAGAAAGACTGGAAGAGAATAAGGAAGGAAATAGGAAAAGAAGCAGAAGAAATCCTAGAAGTAGGTAGCAGGCTTACAGTAAAACAGTGGTCTTCATCATTTATAATGATTTGTTTTCACCTATTGCTTCTCCAGATTCTAAACTTTTCATATTTACGGGGAGTAAAAACAAAAAAAAACAAAACAAACAAACAAAAAAAAAAAACCAAACTTTGCTGGGAGGAGAAATAAGGCTTCCCACTGGTGCATATCAGCAGTGTTCCCCAAAGATTGGCCCGGTGATGAAATAAGCCAGTTGGTGAGCACCGTGTTGTTTTACAAGAGATGTTGTTATGCCTGGTATGTTGCAGCCATCACTTCAACATTGCGACAGACATAATTTGCCTCAAATGTCTTTACTCAACAAGTTCTCACTTGTTTTGGTTGCCTTCCTTGTGTTCAGACTGAAGCATATGAGACAAAACCTGGAACCAACATAGATTTAGTACAAGTGGAGCTATACAAATCCCACCACAGCCTGCTACTTCCAGGGTAGATGAATAAATAGCACAAGCAAATAAGATTACATCAATAAAGTGGATAGGTAGGAAAGAGAACAAGAATCCCAAAGTCCATTGAATGATTAGATTATTCTGTGAAGCTGTACTGAATGGTGTGTTATTCTGGTTTTGCTTTCTTCCTTTTGTTGCAGGGTGTGAAACAAGCTAACTGCTCCCATGCCATAGTCTGTCTTCCTCTGTTCTTGTAATTGTTGAAGTCTCTTCTGGGCAAAGACCCGCTAGAATGATTTTTTTGGGGGTGGTCTTCTGGTACTTCCACGTTTACTGTAGGGTAGTGTAACCTAGGTTTCCTTTGGATCACTTTATGAGCTCTCTTCCCTCTGAACTACACACCTGAACTTGCAGTGTTGCTAGCCCAGATGTCATAGACAGATGGCAGTGGAATGAGGTAAGATAGTCTGCAACAGATCCTGCAGTACGTTAGTGCTCATTCTAATGTCCTCTGTCGTAATCAGACATTCTGTGAAAGGTGGTGAGAAACTACATGGAAAAACTTCCCAGAGACCTGGATACGTTGCATAGTATGTTATAAGAAAGCCAGATTAGAGCTTGCAGTTGCAGGAGGAAGTTAAAGGTACTCCTCCAGTGCTGCAGCCCCATGGTCCTGGCTGAGCCTGCTGGTTTGTCAGCACAGAATGGAACAAGCCCAAATTCAGCTATGCTGAACAATGGAGTCCTGTCACTTCCTACAGTGTGGTCTTAGATGTATCACTTCTGACACAAGGATAGATTATTTTCAAAATATTTGTGTGGCAATTGGAGAACCTGTCTAAACACATCACACAATTCCTGATTGATCTTATGCAATCACTATACAACCAAATACCTCACATATGTGAAGCTGGGGCTATATCAGGTCGTCTTTCAGACCAAGAACAAGGGAAGGTCGTTAAGTCATATTCAGACAGTCAAAAGAGAGTGTTTTTCATCATTTTCTCTGCATTGGGTAAGCCATTTGGAGAGTGGTAAATCCCAAAGCAAGAGAACAAAGACACAGCTTGTGAAAGCAGTTGACTATAAGAAGAAAATTTGAGGAGAGCAACAGAAGGATGTGATTTCATAGCACAGGGCTCTGAGTTGAGAGAAAAAAAAAAAGGAAATATGTTGCACAGGTGATTAGGAGGAGGGAGGGAGAGAAATACATTCAAAGAAGATATCTGGATATCCTGAGAGGATCAAGTCTTAAGACCAAATGACACCTAAAAGGAAGGAAGGATGAGAAAACAAATGCAGAGAAGAATGCTTGTGCCACTATTTTACGTAGATACCGTGTGTATGTGATCATTGCACTAGCTAAAATGAAGCATGCCTGTTTGTGGAGCTCTTACAAATGGACCACCTCTTTGCTTCAATTCTTGCTTGTTTTATTTTGTTTTGAAAAAGTAACTGTGTTTGTGGGCTTCTTTCAAGTTAACACCATAAAAATACATTTGGCTAAAATTGTGGAGGGCTCAGTATGAAGTTAAAGTAGATTTTGAGCTTTCAATTCAACTTTCTGGAGCAACAAGACTGATGCCAGAGCAGCCGCAGGCAGAAGCAGTACTGCAACCTGTTTAAGTTAAGGGTAAATTGAAAGCACACAAGCCAGTGCTCTACCGTTGTAAGCATCCAGTTGAGGTATGTGCTGGGACACGACATATTTTCCAGTGGATCTTCAGGTTCATATTAGCATTTTCTGGTAGAGGGGCACCTCTGCACCTCCCGTCAAACAAACCAGTAGTACTAGATTTCTTTCAAAATGGTAGTTTTCATTCTCTTTTTTTGAGACTAGATTACTTTTAAAAATAATATACTGATTTAAACAGAAGTTCCTCTCACTTGTGCTCACTACATTAAATATTACTTGTGCCATTTTCATTCCAGTGTTTTTATATCAGAAGTTACAGTAGGGAACTTCTAGGATTCTTCTTAACTTGATTTCAAGATTATTTTCAAGCTGTTTTGAATTCGAGATGAAACTTGTGTCTCTAACTAAGTCTCTGCATCCTGCTTTTAGTATTGATGGTATTTGATTCCTGAGTTTGATCTGTAGTAATTTTTGCCTTTCACAATTTTACCTTAACCTTACTAAATAACAACAGAGGAAAGAGACTTACTACACTGCATTTTTGCTGAAAGTATATATCCTGATTTGGGATTGCTGATGAAAGATTAGCTGGTTTAGGAATGCTTATGGGGAATTTCATAACAACATGAAAAATTACTTTACCTGGACATGCTTGGTAATCAATCTAGCACTTAGTGTGGGCTAAAGTTATTTAGGGAACGGCTGCTCCCAGAAGAGTTCCCTTGTGAAATTGAAATGGTTCAGAAATGCTTTTTTAACCAAAGCCCTAGACTTGGGGGGGGAAGGAAGCAACAAACACAACAATCTGGTGTAAATACCTCAACAAGTAAATCAATGATACTTTATAAATTTTATTACTATTTTCATTTTCTGACTCAGCAGGTTTCCCGGGACCCTAATTCCCTGAGAAACCTTTTTGTTTGACTGGAAAGTTGGGGTTCTCTTCTCCCGGCGTACTCCTAGGAGCTGGGATTGCTAAGGAAATGCAATATAGCAGAAGCCTGAATAAAATTAGATGAATTAGCAATGCAAGGAAAACATTCTACTTTTTCCCCCTCATCTTTGTGGCTGTTCTGTAAGTTAAATTAACAGATCCATGTATTTGAGTTAACTGGCAAGTTGCTTCTATCCCTCTCCACTTCTTAAAGTAATTCTGAAAAATTTGAGGTGTGGTGAAAGAGATAAGAGCACGAGCTTCTCCTACCTGCATGCTGCATACACAATCACAGCTGTCAGAGGTGCACAATGCAAGGGTTTAAGAGGTTCTGTTGCCTCTTGTCCAGGAGGTGAAAAATGTGTTCAGTCTAGTGGGAATAGCAGAAATCAGTGTGCTGGCTTGCCTGCTGGTGCAGTAGCTTAAAAGTAAACTAGTGGTGATGTTTGTCAGCTGGTACAGTAGCTTAAAAGTAAACTGGTGGTGTGAGTCGCAGGGCCAGGCTATGAACAGTGCTGGCTGAGGAAATGGACTTGGTATCTGGGGTGCTGTGCCAGCTGTGGGTGTAGCAGCTTCCTGCAGAGGGGTGGAGAGAACTTTTGAATGTGGCTGTGTGCTAGTCTGGTGCATCTGCATCTCCCATGAATCAGAGCTCAGCCACGCAAATCTCAACCTGGCCAAACAAGACGCTCCTGGCTGGCATACGAAACCATGGTGCCAGCTTCCCCTTCCCTCCCTGCCCCCATCTCCGTTTTCAGCAGCCTTTTTGGTACAAAAGAGACTCTATTGTGCCCACCTGCCAGCTAACTTGATTTCTTTTGATTGTGGTGTAAAAAGAAGAGTTCGCTTTGCTTATCACATTTGTACTTTGGTTATAGTGTCAGGCTTGAGCAGATTAATTGGTTGAAGCTTTAGCCAAGCTGTCAGGGTATTTAACCCACTGGAGAAAAATGACCCAAGCAGATGATAAACAGGCTTTAAATGCAGAGCAATTACTTAGTGCTAACAAAGCACCATGACTACACACTTTGTCCAAATGCAAAAAGCAAAGCCTTATCGGTGATTCTGTTTGCAGGAGGACACTAAAAGATAACCTTTGTTTGTGCAAATACTTACAGGATAAGATCCTCTGAAAGGAAACAGTTGAAATTTCAAGTTCTATCTTGCCTGAAGGCTGATATATATCAAACGAGAAATAATAATAATCACAATCTGAGAATGCTTAATTCTCTGTTTTAGTTGGACCCAAAGTCTCAGAATGGTGTTTCTTTCCTGCTCACATTGATTGCTCTCTTTGCTAGCACGTTACAGTAAAGCAATTAAAAGACCAATGGGACTTTGGATTTCATTGTTCGTGGGGATTGGCAGAGCTAAAGGGCTGGTTGGCATTGAACTTAGTTTGTTCACTGCAGACTTAATTCTGACTGGTAGCCAGGGTTTACAGCACTGCAATCCTGTGACTCACAACTGTTCTGTTTTGCATCAGTGATGAAACTGGGCTGGCGGTTTCCAAACCTCGTGAAAGCTTAGGAGATGCTTTTAGTGGGACGTGCACTCGATACCATTTGCTTCTCAGGGGGTCACAGGTCACATTCTGAAGCAGCAGAAGTTTGAGTTTTTATTGTTATGAGTCCTAACATCTTGCATTTGACCTCTGCCTAGCTCACTCTGAGTTTTTTCTGTGCCTTAAGATTTGACTGAAAGGACACTGTTTATTGAATGCTTTTAATTGACTTCAGGAAAAAAAAAATTCTCATAGAGCATCAATCAAAAGATTTACAAAATGGACATATTTTCTTTTGCTTTCAAATGACTTGCAAGAGATTTCCCATTTGGTGTTTGTAAAGGACCTTTATGTCAAAGGAAAACCTTAAAAGTACTGAATGCAAACACGTTTTGTCTTTTCAGACAGAGGACTTAAATTAACCCAAGCATGTTCAAAGTTCCTTCTCATGTGGAAAGTAGAGATGTATTTTCCAGTGAACTGTTTCTGAGTGTAGTTACCCCATTCTGCTCTGCAGTCTGTGGTACAGTTTTAACCACAGATGTGATTCTAGGCTGATTTGGATGCCATGTAATACTTTGTCCAGATGCTAATGCAGTGGCACAGTGATTGTGTGAGTCCCATCTCACCTGCTGTACTCTGATGTCTGGTTTCCTGTGGTCAGTTTCAATTACTGTTGGCAGAAGGATGAAGATGAAAGACTTGAAGTCTGCATGAGAAGAAGTATCTTGAGACAAGAAGGGAGAGACATTGAATTATTAAATTATTCCTGTGTGCCCATACTGCAAAACACATTGTATATGCAGTCATTTCCCTAGGTTTAGAGAACCTTATGGAAGGCCTGTGGAAATGCTGGATGTTATTCATTTTCTTGTTCGGTGGACTGCTTAGTCAGCGTGGATTTCCTGCCCCAACTGATTTACCTGCATTTTATAGTATTTGTTTGGTTGTTGTTTTCTTTTAAATAGGCATTTGTGTCTGGTATTCTAGCTCTTTTTGCTCATGTTCTCTGCCTACTAGAGGCTGACAGCACTGGTGATAAACATGGATTTTGGAGCAGTGGCTTTCCAAGTTACAACGGTTGCTCTGAAAGTAATGTCTCCTACTTTATTATTTTGACCTACAGCGTCAGAGGCAGATGTTGATGGTATGGCAGTAAAGGTTGAACCTTCTCACCAATATTTCATAACGTTTTGTTGCTCAGCTCACAATAGTTGAGGCGATGGCACGTAATTTATATTTTAAAAGATCAGAGACTGAGCTTTTAGACCACTGAAGTGCTTTCATGTTTGTGCTCTACTTTTGGGGACATGAGCAGGTGGTGAAGGAGTGCTTTGCACCACTGCAGGTATTGGAACCAGGGACCAGTCTGGTTGCTTCCTAAAAAGTTTTGTAAACACTGTTATTGGTGGAAATTCTAACTTCTCAGCTGTTCTTCTGTGGCCTACTACAATCAGGATTTGATTTTTTTGAGTCCATAGGAAGATTGCAAATCAGAAACTCTTATCAGCTGTACTTACTGAGGGTTTTTTAATGCCTCTGTTTCCATATCATTGGAAGTAAGTATTCCTTTAGCTGGAGTGTCATTCATGTGTGTGTTTCTGTGCCTTAAGACTGAGAGAGTAGTGCCAACTTCTTTTCCTGGAAATGTTTCATTTTTCATGTTTCAGGAGGGGAGGTGGATGCAAGGAGAGGTTGACTGTCACCAGGGCCTGAGCTGGCTGAGATCTCTGGCAATGGTCATCACTTGATCCTTAGTTTGCTCTTTGTCAGCATGCTTTTTAGAGGTTAGAACTTGCAGGAAATAAAATGCAGTCCTTGAAGGCAGGGGAACGTGATGTTAGTCACCGATATTAGTCATTGACAGTTTCTGCCTTATGGGCTATTCAGGCTACAGACTTTCTGTAGCCTAGAAAAGGAAATCTTTCATTAGCTAATTATTTTCCTTAGCAGTACTGTAAGGGCGTCAGCAAATAATACACTTCCTGGCAAAGCTACCTTGCTGTATAGTGCCTGTGTGTGATCAGGGGAGAATAAAGGGGAAATTTTAATGAGAGAAATTGTATGAAAGCTAAAGAATACTAAAGGCTTTGAGATGCTGCTCAGAGTTAAATCTAAGCAATCAATTTTAATAATCTTCTACATGTAAATGAGGAATCCCAGTGTCACATGTTGTCTGATACCTGGATTTTTGACTGGTTTCTAGCTATCTTTGATACTGTGCCAAATGTATAATGATGGCATGATGCAGCAGAGCCGCTGAAACACATTCACCTCTGATTGAAGCAGCTGCATAGCATACAGAACTGAAAGGGGGAAAAGGCAATGGCCTAGCAAAACAGCGCCTGAGAAACAGCTGGGTAGGGCAGATGTGCTTGGTGAGTTAAAAAGGAGCAAGGGCATAATCTTGCTCCAGAAGAGTGCCATGAAATTAGCAGTGCCCAGATGTGAGTGCCTTGCTTTCAGAACTCTTTCCTTCCCACTTCAACAAAGATGAGGTTTTTTTTTCCAAAAACACAAAAAGGGTGATGGGATTTCATACCACTCACTTTAAAAGCAGTGAAAAGTCCTAATCCTTCTAAGACAGCTTTGAAAGCATCACCTTAAAATAGTTGTTTAAGGCACCTGATAAGCAGGATGAAACAGGGTGCTTCCATTATTTGTGAGATTCAGTGTTTTGTCCAAGATTGCTGTTGATGCTATTAGGCCTGCTGATTTGTGGTTGAGCTAATTGTGTTGTTCCAGTTTGTAAAATCTCTTGAGTTCCTGTGTACTTTGTCTTTAGTTTCATATTATCATCAAATTCATATTGATAGTTCAGTATCTTGACGGTTTCTTTTTGTTCATGTCCAATGGTCTTTCTCTTCATTTAGTTCTACCATTGCAAACTGATCTTCATCAGAGCTTTGTTCATGTGTTTAATAAGGTCAGTAATTTGGTTTCTGTGTTACCTGAAAACGACATGATTGTTATGATTGTAGTGTAGGAAAGTGAGTTCACAGTTTCTTCTCTAAACAACATCTATTGTAAAATAGTTGCTCTTCTAGACATACTTGGTTTCTTTTTTTTTCTTTTTCTGTTCCCAAGAGTGATGTGATTATCTTCTCAGTGGAATACCATGGTGTTAAGTTTGTTCTAGGCAGATGGAAAATAAAGCTCATTAGCTGGTTGTGCGTCTGTCTGTTTGCACACAGATAGACGTTTTCATTAGATACTTTTCTCGTCTGTGGAAATTCTGGAGTAGTTGTGTCCTTGAGGAATGTTGAAAATTTGTTAATGACAAATTCTGTCTCTAATGCCTTTGTTCTGCAGTCTTTTGGGGAAGAGAGAAAGTATTTGAGTTTCCCAGTCAAAAAACCCTATCTTTTAGAAGCATGTCAGTGCATATATTCTCCTCTTTTTCAG
Seq C2 exon
GATCTTTCCAAGAGAGTATCTTCTTCAGCAAATCCATCTTTATTCTCTGGCAGACCTCCAGCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000008479:ENSGALT00000013817:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF145671=SUKH_5=PD(18.6=24.6),PF139011=DUF4206=FE(43.8=100)
A:
NA
C2:
PF139011=DUF4206=FE(10.3=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]