GgaINT0050075 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000012449 | MBD5
Description
methyl-CpG binding domain protein 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:20444]
Coordinates
chr7:34169521-34183561:+
Coord C1 exon
chr7:34169521-34171659
Coord A exon
chr7:34171660-34182532
Coord C2 exon
chr7:34182533-34183561
Length
10873 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATGT
5' ss Score
9.8
3' ss Seq
TCTGTTCTTTTGCATTGCAGGGG
3' ss Score
10.15
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGCAACTCCGGTAGTTCCTACTCGAGCAGCAACTCCAAGATCAATGAGGAATAAATCACATGAAGGAATTACAAATTCTGTGATGCCAGAATGTAAGACTCCTTTCAAGTTGATGATAGGGGCATCTAATGCCATGGGTAGGCTTTATGTGCAAGAAATGGCTGGAAGCCAGCAACAAGAACTTCATTCTGTCTATCCTAGGCAGAGATTGGGTAGTAATGAACTTGGACAGAAGTCTCCATATCGTGGCAGTCATGGTGGGATGCCCAGTCCAGCTTCATCAGGATCACAGATATATGGAGACGGCTCAATCTCTCCTAGGACTGACCCACTTGGAAGCCCTGATGTTTTCACAAGGAACAATCCCAGTTTTCATGGAGCACCCAACTCAAGTCCTATTCATATGAACAGGACACCTCTGTCTCCGCCATCAGTAATGCTACATGGTTCTCCCATACAGTCATCCTGTGCAATGGCTGGAAGGACTAATATACCTCTTTCCCCAACCTTGACCACAAAAAGCCCTGTAATGAAAAAACCCATGTGTAATTTTTCAGCTGGTATGGAAATACCACGAGCAATGTTTCACCATAAACCACCCCAAGGTCCACCTCCACCTCCTCCACCGCCTTCTTGTGCTCTTCAGAAAAAGCCATTAACATCAGAAAAGGATCCACTTGGCATACTTGACCCTATTCCTAGCAAACCAGTCAATCAGAATCCTGTTATCATTAACCCAACTACTTTCCATTCAAATGTCCACTCTCAGGTACCCGTGATGAATGTAAGCATGCCTCCTGCTGTCGTCCCTTTGCCAAGTAATCTTCCTTTGCCAACTGTAAAACCTGGTCACGTGAACCATGGAAGTCATGTTCAAAGAGTTCAGCATTCAGCTTCTACTTCCCTATCTCCTTCACCAGTGACATCCCCAGTTCATATGATGGGATCCGGGATTGGAAGGATAGAGGCTTCTCCCCAAAGATCACGTTCTTCTTCCACATCATCAGATCATGGAAATTTCCTGCTGCCTCCAGTAGGACCGCAGTCATCTTGTACTGGTATTAAAGTTCCTCCCAGGTCCCCACGGTCAACAATAGGGTCGCCAAGACCGTCTATGCCATCTAGCCCCTCCACCAAGCATGATGGACTTAATCAATACAAGGACATCCCTAACCCATTAATTGCTGGAATGAGTAATGTATTAAATCCTCCAAACAATGCAGTTTTTTCTACTGCATCGGCTGGAAGTGGTTCTTTGAAGAGTCAGCCTGGTTTGCTGGGAATGCCTTTAAATCAGATCTTGAACCAGCACAATGCTGCCTCTTTTCCAGCAAGTAGTTTACTCTCAGCAGCAGCCAAAGCACAGCTAGCAAATCAAAATAAACTTGCTGGTAACAACAATAACAGCAGTAGCAATTCTGGACCTGTTGCCAGCGGTGGCAACAACGAAGGACATAGCACTTTAAATACCATGTTCCCTCCTGCTGCCAATGTGCTTCTACCAACGACTGAAGGGCAAAGTGGTCGAGCAGCACTGAGAGATAAACTGATGTCTCAGCAAAAAGATCCTCTGAGAAAAAGAAAGCAGCCAACCACCACAGTGTTGAGTTTGCTGAGGCAGTCTCAGTTGGAGAGTTCTGGAGTTTCCAAAGCTGGATCTGATTTAGTAAGAAAGCAAAGTCAAAGCTCTTTTCCCATCAGCTCTATGTCCCAATTACTTCAGTCCATGAGTTGTCAAAGCTCTCACATGAGCAGCAATAGTACTACCAGCTGTGGGAGCTCAAACACTGTTTTACCTTGCTCTGGTAACCAGATGCATTTTGCAGACACCAGTATGAACTCTGGCACTCTTCAGAACTCACTGGCACAGAGTTTACCATTACGAGGGGAAGGTATGCACTGCCAGAACACAAACACTAACTTTGTCCATGGTACTAGCCCTGCCACCACCAACCATCTCGCGGGTTTAATAAATCAGATGCAGGCTAGTGGGAACTGTGGGATGCTCAGTCAGTCAGGAATGGCTTTAGGAAATTCATTACATCCGAACCCACCTCAGCCAAGAATCCAGGCATCCTCCACTCCAGTGATACCAAACAGCATTGCTAGCAGCTGTAATCAAACAAGTCCTGAAGCAG
Seq A exon
GTATGTTTCCTTTTAAAAGGATACCCCTATGTTTGACTGTTTGGAAATAATATGATGACTGTTTTTAAATGGGTTCCTATTACTTATCTACTTTCTAAATTTGAGCTTACCAGTCTGAAAAGTATGCCTATTTCATGCTAATATCCAGATACTCAAAAATAAACCAAATAAGAAAAAACAGTGGTAGATTAAAATATATCTCCCTTTTTCTAAACCAAATCATCTTGACCACCTTCCTGTTACAACTCTTCCCGACTTCCATACACTCTTCACAAATAAAATCCATGCACGTTTGTACACACCTAGACTTCAGTTTTCGTCTCTTGCCCAAATACGTTTTTCTGCATCATGCTGAGCTACTTCAACCCTGGAAGGCTATAGCTAACCTGGTAGTTGGTGTCTAGGCCGTACACGTGTTCCTTACTGCTTCCATTAAATAGTTGAGTGTTGTCAGAGATTGGAGCAGATACTAGAAATATAAAAGTTTTCAAAATAACCTTTTTTGGAGGCAGAAAGGAGGCTGCCAAGTCTGTGTTTGCCTTTGTCATGGTAATTTTGCTATGCTGGTAATTAAATGGTTGAAGAAATTGTATGTGCAGTTGGAAGAGTGTAGCGAGATTTCCTGATTTATTCATCAGTGAAGACTTTGAGAGGAAGCAAGTCTGCCACTGTTACTAACTTCATCCTCTTTAATGGTGAAAGGGAGACAGCTCAAAAATGTTGATTGCGTTTAACTATTATTGACTGAACAAAGCATGAATTTTTGAAGGATGGTTCTATGTTAATTTCTTAAGCAGGAAAGAAAAACTATTTGATACTTCAGTATTTCAGCTTGGTTAACTGTCAGAGTGTGGGTTTGATGCAATCACAGCTAAACTACATCAGGTCAAATTAAACTGATGGTAAGCATGCAAGCTGTCTGTCTCGTTAACCCAAGAAAGCCTGATGTGTATTCCTGGTTTTCCTCTAAGAGAGCCACTTATTCTTTAAAATACAGAATGGAATTAAATATATAAACATTACTTTTAAAAACCATGCTAATTACAGTTTCTAATGACTTTGGAGGGTTTCTCTCCATTCCTGAGGAGATAAGGCATTTTTTTCCACAGCTATATCAGTGGTTTGTGTTGCAAGCAAGTATCCATTAATCCTTGCATGGCTGTTTTGCCTTGTCATGCTGACAAAGAAGGTTTCCTTGTATGCTGTCTGTTCCAAGACCTTGTACTCTTGCCAACAGAACAGAAGTCTCATTTTGCCCTAAGAGCTTTGCTCTGTGTCCCACTCAGCATTCCAGAAACTCCCTTTTCCAAGAACTCCTTGAGTTTCCACGTCTTTGATGGTCAGTGGGAATCAGCAGTATGGGTTTTCCTGCATTGTCACTGTCCACGCAGCTGAAGAAAGCTATGAGGTTGTTGCAACATTGGACTGCATTGCCTTACAGAGAACAGAAGACACTGTTATGTGAGATAAGAGTCTGTGTGCCAACAGTTACCATCAAGAAGCTGAGCTGTAGTAATTTGTCTCCTGGGAAAGGATTGAAATAGTTCAAGGTTCCTGAAGGAAATTCAGACTGGAACTGATCAACAGAAGTTTTGCACTGTATAAAAGTTACCAATAAAATGTTGTACAAAGGCTATTAATGTAGGCTTTCAGGCATCTAAATTCATCCCCATGTGGGATCTTGTTCCTACTCCACTGCTGCGACCCCAGCCCTGTGCCACAGCCTTGCCCCGCTAGGTATGGTAGTGGCAGGCACCACTCATGATAGCTGTCTTCGGGCTGATGACACATCAGCAGCAGCTAATCTGAGCCTTTCTTTGTCTTGCCAGTCTTGGTCCTCAGGCAGGCTGAATTCCTCCCAAGAAGACAGATGCTCTTGTGTCAGGAAAAACAATAGTAGTGTCTGCTCGCAAACTTCTGTGGGACAACAGCAACAGAACAAATCTGTGCAAGTGTCCTGAGCTGCACACTGCTTTTAGAGAGCTTGGGGCAAACCCCCATGAAAAAAGAGGCTTCAGCTTAAGCAGCTAATTCAGTTCTCATCTATAATATATAGAATTGTAGAATCATTAAGGTTGGAAAAGACCTCTAGGATCATCTAGTCCAACTGTCTACCTATCACCAATATTACCCACTAACCCATGTTCCTTAGTACCACGTTACACCTTTCTTGAGCACCTTCAGGGATGATGATCAGTAATAAATAGATAACTCCATGTGTGAACTTCAGATTTACGTGAAACCTTTCAAACTACCAAACTTGAATGAGAAAAGGATGATATTTCTAATACTTTAGGGATAACTGTTAGATTTCTAGCAGAATAATTATAAGGGCTTAAACTGACCCTTTTTTTCTAATCCAAATGGTAAATGGTAACCCTGCTTAGGCAAAGACTGCAGTTCTGTTCCTCACTGCTGACTGGTTTTGTTTCCTTAGTTTTGATGCTTGGGAAATACATACAACCTGCAGTTGTTTATGTGTTGTTATTGGTATCTGTGATGGCTAGAAACCTTGACAGCCTTTTTCTTTTTAAAGATGAAATTTCAGGATCTGGTGCCTTTGCATTATTCCCAGAGGCAGTGCCCTGAATCTGTACAGTCCTTCCACCCAGCCTCCTGCCTGAGTCATCGCAGAAGCATGTGGCTCAGATGTTAGATCTGAATGCAATCCATAGCCAGTGAAAATCCAGATAGGGGCATTTTGCTGTATTTGCAGTAGAATGGAAGTGTTCTTGCCTTGAAATGAGCATGAAACGTTGAGAATTTTGCGTTAATAGTAACCTTTAAAAATAGGAGTTTGTTTCCAGGCTGCTGTTTCAGTTACATAGAATGTGACAAAAATGGCAAGAGGTATAGTATGAATTATTCTGTATGAAGCTGTAGCAAGCTGATAATTGTGGTGTATGGAGTCGAACAGTGTCAAGCATGCAGAAGGAGCCATGTGTACAAGCTGAGTTTAGCTGTGTATGATGTCTTCAGGAAATTCATACATTCATCTTTTGAGTTTGTGGGTTGGTTTTTGTTGGTTTTTTTGTTGGGTTTTCTTTGCTTTATTTCTACATATTTTAATTGCTGGATCTGTTTTCTGTTTCTGTGCCAGTATTCAGAATAGCTACTAATCAGTTAATGGTTCCTGAGAGAAAATACCGAGAATCACCACAATTAAATCTCTGACTATTGCCCAAGCTTTTAGTTAGACTTTAATCACATGGACCAAATTTCATTATTTTGCCTTTTGTCAGCTTCTTCCAGAGGTAATACCCGTAGTTTCCAGGTTTCAGTATGAGTGTGATTGAATTAAAAATGAATAGGTATAAAAATGAACATTTTCATTTACACAGTGGAAAGATTTTTTACATTTCTAATTTTGAACCCTTAAAGCCTATTATACTTGTTTTTATTGACAACTTCCGTATCGCTTCTATAGTATTTAGGTTGCAAACATTTTATTTTAAAACAGTGGTCTTACATGAGGAGCTAGCATCAAATCCATGCGGATTGTTTACAGCTATTAATTCTGGAAGAAGTCTCCTTTTTTTGCCAAGAGTCGTGGTTCTGGACTCACTCTCTCTGCTGAGTGCTGTTAGTACTTCTGTTAACCTTTGACGCTGAATTTCTCATTATGAATCAAGCCCTCAGACTTCAGATGCAAACTGAAGGTAGTATCCAATTTGCTAATTTGGCAGCTTTACGGATTTATTCGTTAAGCCACTTTGCCTCCCAGAAGCAGTCTTTGTGTTTGTCTGTATTTTTGTAAAAAGAGCTGCATCACTGTGTCATAGATCTTATTGTAGAGTCTGCTTCATTTCTTATTTTCTTGCTGTTAGTCCAGGAGTTCAGTGGGTAGGAAATCTCTGTGCAAAGCATTGAATGTTTAGCATTGCAAATCCTGCTAAGAATGCCACTTGTATTACGGGATGCAGGAAAACAAGTGAAAAAATACCTGGAAGTAAAACCTACGTACGGCTGATAAGGGAGTGAACCGTAGCTAATAGGAATAAAGATAATAAGGTATCTGAAATATCAGAAATATGAGAAACTTCTAGAAGTTTACCAGTGACAATTAAAGGATAGGTTTGGCAAAAAAAAAATACTGAGACTATATCCCTTCCTTAGATGAAGAATAGTAAAATTTTACTGGTGAAATTTGCAGAACAGAAAATAGACAGATATAATTAATTGAAGAGGAGCACGCAAGACCAATGCCAATCAGTTAGGAGCTTCTATCCCACTCAAACAGAATTTATTTTAATGCAGTCAAGTCTGGTGTAATATAATTGGGAATGGAACATTGCCTTGGAAAACAGTGACTCAAAGATTTAATAGACTTAATGCAAGCTGTCAGATCAGTGATGTTGCGAAACAAAAAGAAGAAAAGAGAAGCTGGGGAGGTCCTTGGATGCATAAAAGAGCAATGCCCATGGAGCTTGGGCTGCTCCTGGCTCTGTGCATAGCTTGAGAAAACCAGAGCTTGGCTGTGGCATTCTGGTTAGTGGCCACTTCTCATGAAAGGTAAAGAAGTACTGGATTTCAGAGAACCACAAAACTGTGGTGGTGGTGGGTCAGACCTCAGGCTGTGAGCCTAGTGGTACCATTTCTGCTGTACCTGACAGGAGGTCATGGAGCCAGGCTCAGCCCATGCCGAGAACAGGTCAGCAGGTCAGGGAGTCAAGCTGGATGGTTTTCCAGCTGTTGGGAATGGCCTGCCATCTGCTTTTTTAAAAAATATGGGCATAGCCAAGGAATTGTATCGCTTGCTATAGGTATTCATACTTGGCAATATCTGGAAGGTGGAGAGCTGAATTGTTCAGGTGAGGGTGATGGTTGGACTCAATGATGTTGATGGACTTTTCCAGGTTGGATGATTCTGTGGCTCTCTGGTTTTTACTTTGTTAATAGATGTTCAATGACAACATCCAATGGCAAAATGCTGGTAAATTCAGCATCAAAGAAATAAATGGCTTCATTTTTTGAGGCTACTAAACGAGCTTGCAGAGGCCATGTTGAGCATACCAACTCAACCTAAGTGAAATTTCACAACCTAGGTTCTTTCTGAACAGTAATGGTAGTTGTGTCAGACCTTTGTATCCGTTCAGCTCAGATCTCCCCTCTTACTGCCCTCCCTTCTGAACTTAGGAAATCTCAGTGAAGAGCACTGCTTTCATACTGACTGCTCAGAATATTTGTCTGTGTTAACTGTTACAATAGTTCTCATCTACTCTCATCTGTTGGGATTTAATCCTGATAGAACCAGAACTCATGAAGGATTCTTTCCTGCCATGCTAACAGTTGGCTAGAGCTGTTCAGAGTGAAGCCGTCAGAGATCGTCTTTCCTTGGCAGAATCAGAAATTATCTTGCTGATCATCAGATCACCATTCAAAGAAAAATTGCCTTCAAATCAAACCGGTGTTCATTTTTCTTCTTCTTCATTGGCATGGGGTATGATCTTCAGGACACATCCCAGTTCTGTACCATTTGAACTGTGTTGCGTTCTCTTGCTTTTTGTCTGTACTGTAATGCTAAACCTCCTGAGGAATGAATTGCATTGGTCTGACTACAGGATTTGTCCTTAATCTATGTGAAAAATACCAATTGTTGTAAAAAAGTATGGGGTATACATATAGAATATACCATTTTGTATATCTTTAAGGTGTTACATCCTAAAGTAACCTAATACGAGAGCCTCTGTATTTGCTCCCCTGACTTTTATAAAGCACTGAAATATAAAAACAGAACTTTTCAACTTAAGATTTAGAAGAGTGGCTGGCTGGCGTCCTTTATGGGACTTGTTATGTCTGAGAAAAGTTTCTTTTTAAGCTGAAATAACCCCTAGACAGGATGCCAGACAGCTACTCTTCTAATTATAAAGCCAATTGAATTGTTCTATTGATTTTGGGTTTTGGTGTTTATATAAGCATGTAGAGAGACTTTCCTTGGGGGCAGGGGTGAGGCAGGGAAGTATCATTACAAGGAATTGCTGTTGTTTGAAATCTGGCATGGCTTTTCAACATTCTGCCCTATGTTCTCGTGTTGTTATCTTGGGGGAAAAAAAGTGAATATTTTCCTCTTCAGATAAGAACTGTAAAGAAAATCTTCTATATGAGCAATAAGATTTCCACAGATGAAAATGTATAGTACATCAAGTCTGCTTCCTACCCTGCCATTGAAATTTATTTGCTTTTTAACTCTGGAGAGAGATCTTATGCTCAAAACCACTCTTGTTCTCTGAACGTAGAAGAGTCACTGGCTTAATAGGCATAGGTGGTCGTATTAGGTAAACTGTAATTGTTAACAAGGGATTTTTATAGCATTGACATGAACATACATTCTACCATGAGGTTCAAAGTAGAGAAAGAATGTGGAAGTGGAATAGATATTGCCTTTCAAATTTTTGGATGTCTATCATTAGCAACTACGAGCAAGCAGGAAAAACTTAGGGAAAACTCAGTTCAAGCTCTGTTTAATTAACTCATTTGTTTAGTAGAGGGAGCTGAAATTGAGTAAACCTCCAATTCTAGTAGAAATGGAAAAAGGAAATTGAGTATTGTATTTGTATGTGTACCGGTTGTGCTGGGCTAGTTCTGTTTCGGCGAGTGAAGACCGGAAGTGCTGGCTTCTCCACACTCAGTCACTGCAGTGCTAGCATGATCCCACAGGTAGGAGCAGAAGAGCATACTCCTGTCCCTCGTACGTGACAGGAGGCCGGGCTCTTCCTGGTCCTGCTGGCCTGGGAAGAGCACTCCATTTATTGGCCCGGCGTTCGTTGTTCCTGTTGTCTCAAGGAAGCAAACGATCTTCATAAGGAACACAGCCGTCAGTGGTTTGTGGTTAACTGCTGAGCTATGGCTTCTTTGGAATTGAAAGCACTGGGATGGATGCGATAGCTGATAAATATCTTAAATGTTTTCCATTCTAAAGGAATACAGAGAATATAATTACAAGAATGTATAGCTGTTGGTTCTGAGTGTTTAGGTAAGTGATGAAATATGGAGTTAAAGCAGGAAAATGTCTCCAATTTCAAAGGAATATGAGATCACATTGCTTCCATTAGCAATGATCATTCTGTGAAAGTTAAACCTCCTAAAACTGCCTATTTAATAACATTACCTCTTATGCCAACTGTGTGCTTGTGTCTCTAGGCTGATAGTAGTCCTCACTTCCTATTGATGCAGCTTCTGGAGGCCTGGCACGTGGCTGGGTGGCCCTGAGGACACCCCTGAAACTTGCCATGCACCTCTCAGTATTGTTCCAATCTTAAATCTTAGCGCTGTTTAAAAAACAGGATTCACAACAAGACAGGCCTCTGACTACACTGTTCCATCCCTACAGCAGCACATGCACAGATGTGTGCCAGTGTTTTCATGGCGAAACAACGCTGATATGTAAACGATAAATATCTTCTAATGTCTTTAACTGGGCATGGAGTGAGTCTTCTCAGTGCCAATTGATTTCATTACGTGCTGCATCTGCTTGAGAATACCTCTCAAACAATACTTGAAAAAAAATAAAAAATTAAGGAGCAAAGATGAAATCCACATAGGAAAATCGACTTGCTTTCAAAAGAAAACAAAACAAGAATGTACACAAATAAACTACTGTATCCACAAAGGAATAATTTTAAAAATGTATATCTTATTCAATTTCAAATTCATTTATTCCCAAAGCATTTATCTGAACTTCTAGGAGAAGAATGGATATATATCTGTTTTAGCAATCTGGATATTTCTTCTCAGTGCATTACAAAGACAGTCCCTTTCTCTCAACCATAGGCAGAAGAAGTTCTGCAGACATCTGTGTCTGCAAGAGTTGAAAGTCTGCAGTCGTCCTGGGCTTTTATGACTTTTAGTGCAACTCTTCCATCTTTGTTTCATTATGTATTTACTCTTAAGAGCTTCTGCTTAACAAGGACTCCTGTTTCTGAGCTAACATTAATGATGCCCTGGGTATCTGGGATTCAGAATACCGTGTTTTTAGGAAACTTGTGACTTCCCTTTAGCTATGGACTCTCATTCACATTTCTCATCAGAACATCTTAATCCAGGCTGGATGTGGCTCTGGGCAGCCTGGTCTGCTGGTTGGCGACCCTGCACATAGCAGGGGGTTGAAACTCAATGATCACTGTGGTCCTTTTCTGGATTCTATGAACTGTCACTGGAATGTGGGTATAACACTAAGGCAGCATTTCATGTTGTTGCTCTGGGTTCTCTTCTCTCCGTTGGAGTTCTGTGTTGCAGTCACCTTTTCTTCTGTCTGTCCTGAATGGCTGAAGGGAATGGAATCAGTCCAGATTATTACAGCCCTGGTTTCCCAGCAGCTTTGCTGAGCGAGGCAGCTTGTATGCAAAGGGGCTTTTTTCAGCTGACATCTATGTCTGGTCTTCACTGTCAGCCTTCCCTCTTTGAAACTCCCAGCAAATACTGCATTTATATAGCCTACGTATCACTGTGGATGAGAGTTAGACCTCAAAGGACAGCTGAGTCAATTCTATATTACAGTTGCTACTGCCCAGCCAAAAGGGCAGACTTATTAGGACTTTGCTTCTGTCGTGCTGGCAGCACTTTCTACAGGCACTTTGATGAGGTACGTGGCTTTTTTCCTTGCTGCTTAGCTGACCTGTTCACACCTTCACTTGCGGTGTGAGCCATCGTTTTTTTCTCCTTGTGAGCCAAACAGGGCTGCTCATGTTTGTCCTGGGTCTTGGAGAGTCTGGTGTGTGGCTGGGGAGGGACAGGCTAGGATTATCCCTGACCTTGGTCCTCCCAAGGAAGATGTTCCTTCTTGCTGCAGTGCTGTGAATCGCAATTATGGAGGCTATCCGTCTTTTGGAAGGGAAAAAAATAACTCAGATGTTGTCTTTTGGTTTGGGGCCAAACATTGAGGAGCTGTCCAGCCGCACTAGGCTTTAATGAGGATGGGTATGCATGTATCCCTTCATTGAAATGTTGGCTCAGAGGAGAAGGTGTTTTGGAAGAGATCCAGAAACTCTCTTCTGGTGCTTCAGTCCATGCATGTGGATAGACCTGCCCCAGAAAGCAGTTCTAAATATTGCTTTAGCTGCTGTGCAGAACTCCCAACTGGAAGCCTTCCTGCCTGTCAGGGTGTCTGTCTGCTTGGGGCATGTTCCTTGGCTCCCCAACTTCTCAAGTCTGGGCTGCAGTACATGCACATCCCTCTCTTCTGCTTAGAATCCATCAAGATTTTTGTTCAGTAGTGATCAATTGCCTAATTAATCCAGAGAAAAGATAAGTGGTGCTCTGGACCTCTCAGATTAGATCTCCAGAAGCTTTATGAGGGATAGAAAGTAGACCAGTGCATGACAGAATCCTAAAGCAATAGTTTTCTGAGTCTGTGCTTTGCTTTCTTGCAGATGATTGTGTGATCAGTTACCTCAGTGGTATGAAAAATAAGATCATAAATAAAAAATAATTAGAAATAAGGATTAGGTCCATTTGAAAATACCAAATTAGATTTGATAGTCATGAAAGCACTGCATATAGAAGAGTTCCCACATGCCTGAATTAAAAGATATATCCATGTGATGCTTAACACGTGGTGTGGCTGTGAGTGGTAAGGGAAGCCTTTCTCATCTGCTGAGCAAAAACCTTGGGTGTGCGTGTCTGCCCTGCTGGGAAGTAAAGGGTTCCCCACAGAAGTGCTGAGATCTGGCATTTACCAGATCTTGGCTCAAGACACTATCTCCATTCCTGCGTCATCTGCAATTCTACATGCAAAGCCATAAGTGGGACTCCAGTGGGATATGTGTTTTCAGTGCATGGTTTGTTTTGTTATCATCAAGTGCTTATCGTTTTTGAGTTCCAAGCAGCTGCCCAGAGAGATGTGCTTGTCACAAAACTGGTTTCATTGCTTTGTTAACATGTTTCTCCTCACAGCAGAATAGGATAATTTGTGCTTTATGGTTACAATTTGTGCTTACTTCGTCTTTTGTTAATTTATTATCTAATTTCTTTATGGAAATATCATAGCAGTACCTGCAAGAGA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Seq C2 exon
GGGGTTCAGGACCATCATCATCAATAGCCATAGCTGGCACCAGCCAACCTGCCATCACAAAGACAACATCTGTTCTTCAAGATGGTGTTATAGTCACTACTGCAGCTGGAAACCCTCTTCAGAGCCAGCTGCCCATTGGGGGTGATTTCCCTTTCGCTGGCCACGAACACTCGCTTCATTTCCCGCAGAACAGCTCTTCAAACAACAATCTTCCACCTTCTTTGAATCAAAACCTCCTCAGTTCTCTACCTATCTCTTTGCCAGTGAATCAGCAACATCTCCTAAGCCAGAATCTATTAAATATACTGCAGCCTTCAGCAGGAGAAGGCAAGTCTGAGGTCAACCTCAACCCTTTAGGTTTTCTCAACCCGAATGTAAATGCTGCTTTAGCTTTTCTCTCCAGTGACGTGGATGGGCAGGTATTACAGCCTGTTCATTTTCAGCTTCTAGCAACCCTCCTCCAGAACCAAGCCCAAGCAGCTGCCATGCTTCCCCTACCATCTTTCAATCTGACCATCTCAGATTTGTTGCAACAGCAAAATAACCCTTTGCCCTCAGTAACACAGATGACAGCCCCACCTGACCATTTGCCAAGCAATCAGTCAGAAAGCAACAGGGTTGAGACCCTTTTAAGCAACCCCCTGGGGAACCCTTTACCAAGCTTTTCAGGCACTGACACTACTTCTAACCCCCTGCTCCTCCCAGCTGTCTCTGGGGCCTCAGCATTAATGGCCTTGAATCCCCAGCTGGTGGGAGGTGTCCTGAACTCTGCGTCGGGCAACACCGCTAATCATCCAGAGGTTTCCATAGCCACCTCCTCCCAAGCAACCACTACCACAACCACTACATCATCAGCAGTGGCAGCACTGTCTGTCTCTACCCTGGGTGGTGGGACAGCAGTGGTGTCAATGGCAGAAACATTGCTGAACATATCTAATAATGCTGGGAATACATCTGGTCCAGCTAAACTCAACAGTAACTCTGTGGTGCCACAGCTACTTAACCCTCTACTGGGGACAGGTCTGCTTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000012449:ENSGALT00000020351:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.909 A=NA C2=0.424
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]