Special

GgaINT0092986 @ galGal4

Intron Retention

Description
NA
Coordinates
chr2:40119797-40150300:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
30342 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACAGTAAGT
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
GGTGCTGTGATAACACCAACAATGGACCACACTATGTCAATGCAGCCAGCAAGCATGATGGGCCCACTGACCCAACAGATGAACCACCTTTCCTTGGGCACAACAGGAACG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000011439:ENSGALT00000037692:10
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.059 A=NA C2=0.703
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]