HsaINT0008118 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000145362 | ANK2
Description
ankyrin 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:493]
Coordinates
chr4:113373285-113383740:+
Coord C1 exon
chr4:113373285-113373449
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr4:113381457-113383740
Length
8007 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGA
5' ss Score
7.66
3' ss Seq
TCTTGTCTGCTTTTCTCCAGGAC
3' ss Score
11.01
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000145362:ENST00000357077:45
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.666 A=NA C2=0.623
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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INCLUSION PATTERN[edit]
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- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development