HsaINT0049899 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000118997 | DNAH7
Description
dynein, axonemal, heavy chain 7 [Source:HGNC Symbol;Acc:18661]
Coordinates
chr2:196801323-196822171:-
Coord C1 exon
chr2:196821985-196822171
Coord A exon
chr2:196801517-196821984
Coord C2 exon
chr2:196801323-196801516
Length
20468 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
TTTTTTATTTTTATTTTTAGGAT
3' ss Score
12.22
Exon sequences
Seq C1 exon
AGAATGGGAGGGCAAGCTCCTACTGCTTCAGGAGATTCTGGATGAATGGCTCAAAGTCCAAGCCACGTGGCTGTATCTGGAGCCCATTTTCAGCTCTCCAGACATTATGTCTCAAATGCCTGAGGAAGGCAGACGATTTACAGCTGTGGATAAGACATGGAGAGATATAATGAGAAGTGTCATGCAG
Seq A exon
GTAGGTGAAAAAATCTCCAAAAATGTCATTATTTGGTTGAAGTGACATGATTTTTGTTTTCAGAAATCCATATAAGCCATTATTGTTTCCAATAAGCCATTATCTGTTTCATACATACATTGTCTTTTCAGCTATTATTTTAGAATGCCAGGAGCAGAAAATGTCGCAAGCAAAAGTAGGTATTTTGTCCTGATTACTCCTTGAGGTCCAAATTGGAATTTGCATTGTTTAACAACCTTTGGTTCTGTTATTGGTTCTTATCTGATGCACTGGAGGGAAGACACTGTACGAGGTACTTGCTGTCTCCGTCTATTCTGTGGCTCTCTTGTTATGGAATGCAACCCACTGAAACTCACTGTGGTGCACACATGTCAGTATGCCAACCTCTCAACACATGTTTCTGGTAGGGACCTAAAAAAAGATGAGTTGCAAGGATAAATATATCTAAAAAGTCCAATAAATGCAAATAAAATGCAATAAAGAAAGAAAAATACACAAATACTGTGGAGGAGAACTTAAAATTTAAGCTAAAGAGAGAATTTAATAAAAACCAGTAACACTAAAAAAAAGTACGTTTTTTGTTCAATTCAGAAGACTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTTACTGCAACCTTTGCCTCCCAGGCTCAAGTGATTCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTAACTGAGATTACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGACATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGATCTCTTGACCTCAAGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGACTGGCAGAATACATTTATTCACTGCCTCGGAAGCATGGTTGTGTGTCATTAAATATTAAAATAGAAAAAAGTTATTAAATCATATCATTAAATGAATATAAACTTCTGCATTGGTATTTTGATAAAATATAATACTATAAGGTAGGATAAGTATTATCTTAAAAATGTCTTACCCTGAAATAGAAATATGCATATCTTTATTGTTATTTAAACTTTAAGAGCTGTTACTATAATCCGAAATATTGATAATACTGTATTGACGTCAACTATATGATCTGATAGGAAAATATTCAGAAAGATGGACATGGTTTTATTTATTTAATCTTTACCTCATTTATGTAATAATACCTGAAACAAATCTTTTTATAAACCAAACTTCTGTAAAATTAATCACACTGGAATTAATTCCATATTTAAAGAACCTATTAGTAAGTTGCTTTGTAACACAATCATCTCTAATTAATTTATGTCATAAATTCAGTCTTTTATATATAGTTTCCTTACAACAGTGCAAAATCCTTATAATATGGATATATTTCCATTTAGAAGGTGATGAAGGAGAATTTTTTGTTGTTTTAAAAAGCAAAAAGTAGATACTTGTATTCTTTTAGTTAGTATATTTAAAAAATTAAATTCTTTTTAAATATGTAATCAAAATACTCTTCAAAATTCCATATTGCCAAGAAATTTTATAGATATCTCAGTTCCTTGAAAGGGCAGCTGTGTTGGGCCTTGTAAATAAAGGAGGCAAATTTTTATCCTATGAAACCACTGGAAACAAACAAAAACATTACTTACCCTAATTTCTAAATAAATAGGTATTTTCTGTTGGGGAGGGGAGAGTAACACTTCATTTACTTTTGCTTAAGACTTGATTGTCTTAATCCTAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCATGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAAGAGAGCCCTCAGAAATAATACCACACGTCTACAACCATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGAAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCATATGTAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATTAAGTCAAGATGGATTAAAGACTTAAGTGTTAGACCTAAAACCATAAAAACTGTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAAGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCCATGGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGGTATAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACGGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTACCCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGATTCTACAAAGAACTCCAACAAATTTACAAGAAAAAAACAACCCCATCAACAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAGGCACATGAAAAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATAACATCTCATGCCAGTTAGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGAGGATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTGAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAAACACATGCATATGTATGTTTATTGTGGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAGTGTCCATCAGTGATAGACTGGGTAAAGAAAATGTGGCACATATACACAATGGAATACTATGCAGCCATAAATAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATGATTCTCAGCAAACTATTGCAAGGACAGGAAACCAAACACCACATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAGTGAGAACACCTGGACACAGGAAGGGGAACATCACATACCAGGGCCTGTCGTGGGGTGGGGAGAGTGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGCATGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATTAATAAAATTTAAAAAAAAGACTCGATTGTCTTTCTCATCTGCTTTGCATTTTCTCTTTCTCCATATGTTAGTATTCAGGGAAGCTTTTGCTCATGCTCTCCAAAGAGCTGAAAATAAACATAAACCCATATTCTTTTAGGAAGTCTAATGACATGGTGTGTATAGTAGAGGCCACTGGATTAATTGCTTGGTACATCAGGTTATTGCCTTCATTCTTAGGAGTTCCTAATAAAGGTTCTTTTAAAAACCTCAGAGGTTGAAAATAGGATGTAAATACTGTTGTTAATATAACTGGCTTACAGTGTAAACAAAGCCGCTGGGAAGTTCCAACTGGGTAGAGCCCAGAACACTGCAGCTCAGCAAAGCTGCTGTAGACAGACTGTCTCTCTAGATTCCTCCTCTCTGGGCAGGGCATCTCTGAAAGAAAGGCAGCAGCCCCAGTCAGGGGCTTATAGATAAAACTCCCATCTCCCTGGGACAGACCACCCATGGGAAGGGGCGGCTGTGGGCACAGCTTCAGCAGACTTAAACGTTCCTACCTGCTGGCTCTGAAGAGAGCAGTGGATCACCCAGCACAGCGCTTGAGTTCTGCTAAGAGACAGACTGCCTTCTCAGGTGGGCCCCTGACCTCTGTGCCTCCTGACTGGGAAATACCTCCCAGCCAGGGTCAACAGACACCTCATACAGGAGAACTCCAGCTGGCATCTGGCGGGTGCCCCTCTGGGACGAAGCTTCCAGAGGAAGGAATAGGCAGCAATCTTTGCTGTTCTGCAGCCTCTGCTGGTGATACCCAGGCAAACAGGGTCTGGAGTGGACCTCCAGCACACTCCAGCAGACCTGCAGCAGAGGGGCCTGAGTATTAGAAGGAAAACCAACAAACAGAAAGGATTAGCATCAACATCAACAAAAAGGGCATCCACACAAAAACCCCATCCGAAGGTCACCAGCATCAAAGACCAAACGTAGATAAACCCACGAAGATGAGGAAAAACCAGGCAAAAAGGCTGAAAATTACAAAAACCAGAATGCCTCTTCTCCTCCAAAGGATTACAACTCCTTGCCAGCAAGGGAACAACACTGGACCGAGAATGAGTTTCACAAATTGACAGAAGTAGGCTTCAGAAGGTGGGTAATAACAAACTCCTCCAAGCTAAAGGAGCATGTTCTAACCCAATGCAAGGAAGCTAAGAACCTTGAAAAAAGGTTAGACGAATTGCTAACTAGAATAACCAGTGTAGAGAGGAACATAAATGACCTGATGGAGCTGAAAAACACAGCACGAGAACTTTGTGAACCATACACAAGTATCAATAGCCAAATTGATCTAGTAGAAGAAAGGGTATCAGAGATTGAAGAGCAACTTAATGAAATAAAGCATGAAGACAAGATGAGAGAGAAAAAGAATGAAAAGGAACGAACAAAGCCTTCAAGAAATATGGGACTATGTGAAAAGACCAAACCTGCATGTTTGATTGGTGTACCTGAAATTGACGGGGAGAATGGAACCAAGCTGGAAAACACTCTTCAGGATATTATCCAGGAGAACTTCCCCAGCCTAGCAAGACAGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATACAGAGAACACCACAGAGATACTCCTCGAGAAGAGCAACCCCAAGACACATAGTCGTCAGATTCACCAAGGTTGAAATGAAGGAAAAAATGTTAAGGGCAGCCAGAAAGGTCGGGTTACCCACAAAGGGAAGCCCATTGAACTAACAGCAGATCTCTCTGCAGAAGCCCTCCAAGCCAGAAAAGAGTAGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAATTTTCAACCTAGAATTTTATATCCAGCCAAACTAAGCTTCATAAGTGAAGGATAAATAAAATCCTTTACAGACAAACAAATCCTGAGAGATTTTGTCAACACCAGGCCTGCCTTACTAGAGCTCCTGAAGGAAGCACTAAACATGGAAAGAAACAACTAGCATCAGCCACTGCAAAAACATACCAAATTGTAAAGATCATTGACACTATGAAGAAACTGCATCAACTAATGGGCCAAATAACCAGCTAGCATCATAATGACAGGATCAAATTCACACATAACTATATTAACCTTAAATGTAAGCAGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACACAGACTGTCACATTGGATAAAGAGTCAAGCCCCATCGGTGTGCTGTATTCAGGAGACCCATCTCATGTGCAGGCACACACATAGGCTCAAAATGAAGGGATGGAGGAATATTTACCAAGCAAATGGAAAGAAAAAAAAAAGAGGTTGCAATCCTAGTCTCTGATAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAGAGACAAGGCCATTACATAATGGTAAAGGGATCAATACAACAAGAAGAGCTAACTATCCTAAATATACATGCACCCAACATAGGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTAAGAAGAGACTTGGACTCCCACACAATAATAGTGGGAGGCTTTAGCACCCCACAGTATTAGACAGATCAACGAGACAGAAAATTAACAAGGATATTCAGGACTTCAACCCAGCTGTGGACCAAGCAGGGCTAGTAGACATCTGCAGAATGCTCTGCCCCAAATCAACAGAATATACATTCTTCTCAGTACCATATCACAGTTACTCTAAATTTGGCCACATAATTGGAAGTAAAACACTCCTCAGCAAATGCAAAAGAACAGAAATCATAACAAACAGTCTCTCAGACCATGGTGCAATCAAATTAGAACTCAGAGTTAAGAAACTCACTCAAAACCACACAACTACATGGAAACTGAACAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTAAATAACTAAATTAAGGCAGAAATAAATAAGTTCTTTGAAGCCGATGAGAACAAAGACACAACATACCAGAATCTCTGGGATACAGGTAAAGCAGTGTTTAGAGGGAACTTTATAGCACTAAATGCTCACAGGAGAAAGTGGGAAAGATCTAAAATCGACAGACACCCTAACATCACAATTTAAAGAACTAGAGAACCAAGAGCAAACAAGTTCAAAAGCTAGCAGAAGACAAGAAATAACTTAGATCAGAGCAGAACTGAAGGAGATAGAGACACAAAAAACCTGTCAAAAAAAATCATTGAATCCAGGAGCTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGGTCTTGGCTCACTGCAAGCTTCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCCACCTTAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTGGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTTTCGATCCCTTGACCTTGTGATCTGCCCGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCTCAGCCAGGAGCTGGTTTTTTGGAAAGATTAACAAAATAGATAGACTGCTAGCCAGACTAATGAAGAAGAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGACACAATAAAAAAAATGATAAAGGGGATATCACCACCGGCCCCACAGAAATACAAACTACCATCACAGAGATTACTATAAACACCTCTGCATAAATAAACTACAAAACCTAGAAGAAATGGATAAATTCTTGGGCACATACACCCTCCCAAAACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATCCCTGAATAGACTAATAACAAGTTCTGAAATTGAGGCAGTAATTAATAGCCTACCAACCAAAAAAAAGCCCAGGACCAGAGAGATTCACAGCCGAATTCTACCAGAGGAGTGCAAAGAGGAGCTGGCACCATTCCTTTTGAAACTGTTCCAAAGAATAGAAAAAGAGAGGGACTCCTCCCTAACCCATTTATGAGGCCAGCATCATCCTGATACCAAAACCTGGCAGAGACACAACAAAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCCCTGATGGACATTGATGCGAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCAAATCTAGCAGCACATCAAAAAGCTTATCCAGCATGATCAAGTCAGTTTCATCCCTGGGATGCAAGGCTAGTTCAACATATACAAATCAGTAAACGTAATCCATCACATAAGCAGAACCAATGACAAAAACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAGACCTTTGATAAAATTCAACATCACATTATGCTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTTATGGAACGTATCTCAAAATAATAATGTATTTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAATGGGCAAAAGCTGGAAGCATTCCCTCTGAAAAACCGGCACAAGACAAAGATGCCCTCTCTCACCACTCCTATTCAACATAGTATTGGAAGTTCTGGCCAGGGCAATCAGGCAGGATAAAGAAATAAAGGGTAAGCCAGGCGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCTGAAGCAGGTGGATCACCTGTGGTCAGGAGTTCGAGACCGGCCTGACCAACAAGGTGAAACTCCATCTCTACTGAAAATACGAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGTGTGTGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCGAAGACAGGAGAATTGCTTGAACTCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAACTGAGGTTGTGCCACTGCACTCCAGCCAGGACAATGGAGTGAGACTCCATCTCAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGTGGTATTCAAAAAGGAAGAGAGGAAGTCAGATTGTCTCTGTTTGCAGATGACATGATTGCATATTTAGAAAACTCCATTGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGAAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGTGTGCAGAAATCACAAGCATTCCTATATACCAATAATAGACAAACAGCCAAATCATGAGCGAACTCCCATTCACAATTCCTACAAAAAGAATAAAATACCTAGGAATACAACTTACAAGGGATGTGAAGGACCTCTTCAAGGAGGACTACAAACCACTGCTCAAGGAAGTAAGAGAAGATACAAACAAATGGAAAAAGATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAGTATCGTGAAAATGGCCATACTGCCCAAAGTAATTAATAGATTCAGTGCTATCTTCATCAAGCTGCTATTGACTTTCTTCACAGAATTAGAAAAAAACCACTTTAAATTTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCTTATAGCCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCAAGAGGCATCACGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCGAAACAGCATGGTGCTGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGACCTCAGAAATCACACCACACATCTACAACCATCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAAGCAATGAGGAAGGCGTTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGAAAACTGGCTAGCCATAGGCAGAAAACTGAAACTGGACCCCTTCCTTACACCTTATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACGTAAGACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGATACAGGCATGGGCAAAGCCTTCAAGACTAAAACACCAAAAGCAATGGCAACACAAGCCAAAATTGACAAATGGGATATAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAATAAACTATCATCAGAGTAAACAGGCAGTCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGACTAATATCCAGAATCTACAATGAACTTAAGCCAATTTACAAGAAAAAAAACAACCCCATCAGAAAGTGGGCAAGGCATGTGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGTGGCCAACAAACCTATGAAAAAAAGCTCATTATCACTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTCATGCCAGTTAGAATGGTGATCACTAAAAAGTCAGGAAACAACAGATGCTGGAGGGGCTGTGAAGGAATAGGAACGTTTTTACAGTGTTGGTGGGAGCGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTCCTCAAGGATCTAGGACCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGGTATATACCCACAGGATTATAAATCATTCTGCTATAAAGACACATGCACACGTGTGTTTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAATACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAATGATAGACTGGATAAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATAATATGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTACAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTTTCAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAACACTACATGTTCTCACTCATAAATGGGAGTAGAACAATGAGCACACATGGACACAGGGAGGGGAACGTCACACACTGGGGCCTGTTGTGGGGTGAAGGGGTAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATGACTAGTTGATAGGGTCAGCAAACCACGATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACGTTCTGCACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAATCATAATTTAAAAAAATAAGACATGTGGCTCACGCCTGTGATCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGTGGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACTATATATATAAAAATAATATATAATTATGTAGATATATAATATATAATTATAATTATATATATTATAATTATATAAATATATATATAATTGGCTTTATTGAGATGTCTTGGTTTCCTTGAGGTGTAAACATGAAATAATCTTATAATTCATGCTACCAACTATACTCAACCAGTGACCTTTCTCACTCAGAGAGGCTCCCTTATTGATCTTTCAATCTAATTCCAGAATTTTTCAGTCACTTTTGCTTATTAAGAGAGTTTTGTACCTGTTTCAAATCCTCAGTCTTCTGTTCTACTCTGAGCTCTCCTCTTCCCCACAGTGCAAGTAAACATGAAGTTCCAGGGGTGGGGAGATATGGAGACTACTCTCCCACTCTACTTCTCTCCTCCTGTGCTTCTCATCTGGGTTTGGGACAAGGACCGGGTGAAGAGAAGGAGGAAGGGAGGGATGGGGAGAGAGAAAGTAAGAGGGAGAGAGAAAGAGAGAGAAAGAAAGAGAGAGTGAGGGTAAAAGAACATTTTCTGATATACCTGATCCTGCAAAATGGGCTGTTCTTTTTTGTCAGTGGTCATAAGGTAATTAACCTCCTGTCAGTGATGTGAAGGCCCTGTGCCTTTTCTGTTGGTCTTTGCAACTGGTCTAGCCTGTTGGAGAGTTGTGGGTATGTAATGAGCACAGATTAATCCGGGGTAGACAGGTGAAGATCCAACACAGGTCTGGCTGCTGAGGGACTTCATCTTGAGTATCTCCCCTAGGTTTGTTCGTTGTCTGGGAGATTTGGCTACATCTTCAAACTGACCTTCTGATGTTGTATTTTGCCATATTTTTGTTGTGTATGTCTCTTTACCCCATACTGTAGCAGTATTTCACAAATCTTCAGCCTTTAATTTCATATGCCTGCTTACTTTTAAGATTAGGTTATGGGAAAAAATTTTTCATCTGCCTGCCATAGCCCAAAAGTGGGGTCTGCAGAAGGGCACAATTCATCTTCCCTACCCACTTTGTTTGTATCCTTGAGCATATAGTTCTTGCCCCTTCTTCACTGGCCATTCCACCACACCATCTTCTCCCAGAGTTTTTTTCCTGTTCTAGTAGCATTGGAGCAGTTCAGCACACCGGGTGACTGACCAGATCTCCAGCTAGGAAAGATGTCAGTTTCCTCTCCTTTCAGGCCCTTAGAAAATTTATTAGGGACTCTCTTGGGCCCCCCTTCTTGAGATTCAGGGAATGGGAACTAGTTAATTACCCACCAGATGGAGATGAAGTAAGTGGATAATCCCTCTCTGCATGCTGCATTTCACCCCCAAACTTGGTTTTTGACTCATCCAAGTCTTTTGTATTTCATGCAAAGCAGACAAAAACACTCTTAAATTTTTTCCCAAACATTTTCCTTTTCTTGTCTAACCCCATCTCAATAAATATAACACTATTCTTTCTGTTGCTCAGGCCAAAAACTTAGTACTCATTCTTTATTTTCCTTGTTTTCTTTACTGTAGTAAATGTAATTTGGCAACAAGCATTTCACCTCTATCTAGTGAGCTGAAAAGCAGAAAAGATCATCTGCCAGGCTCTCTACATCTGACTTTCTGGAAGTGAATTAGATCTTGTCAGTTAGATACACTCATTTGGGATTTGGATGGAAAAAGTGAAAGTGACCAGCTTTCTGTCATTTTAGCTATTTCTGCTGTCAAGGAAGATCGTGAACACATGACTTTTTTTTCCAACAGGACTTATCTGGTTACCAGTTTTATAGGTATTATGAGGCAGTGATAATGGTGGCCTCCTGATCCCACCCAGTGAACTCTGGCATCAGAGCCACCATGATGGGTTGTTGAACTCAGTATTTCCAATGGTGTTATCCTTTAGTCCTGATTGGGGCAGAAGTAGTAAATCCTGAAAAGTCAGTTCTTATGTTTTAGTAGTCTGTCCTGGAAGTATGCTCCCCTAGGCTTTCCAGTGATTTTGTAATCACTTTATTCCCTGTGTTAAATTCCTTTTTGCTTAATATGTAGAAGGGTTCTGCACTGAACTTGAATAAACTATACCAGAACCTCAAGTATGAGATCTAGGATTGTTTATGACCCACTTGGGTTTTAGAGTAGTGAAGATCTAGTTATTGCTTGAAAATAGGACACTAGGAGTATCTGGTATGCAGTGTAAAAATCACTCAATCAATTATGTTCTTAGACTTCCAGAATGAACAATCTGTTGTACAGGGAAGTGTTTGGTGGACCATGAGGCTGCTTGAATAGGTCAATATGATAAGAATTTGAAGTACAAGGGAGGTGAGATGGGCTGAATTCTTTAAAAAGCACTGGAGAAATAAAAGACATGGTATAATTTGCAGTTTTAAATTCTCTGCTCAAGATGTGGTCAGAAAACTAAGAAACTTCTGTGATTTGCTAAAAGAGCCTTTTATTTCTCATAGCTACAAATTTGATATAGCCAAAAATGAGTTATAGAATCTGATTCAATAGGTCACCAAATTTCAATGTAATTTAATTCATGGCCTTTCTAGATCTGTTATGTGAAAGATAGTTTACTTATTGCAAAGCATGGGGTGGTGAAAACTGAAAATGGGGACACTTGGATGTAATTGACTCTGGGTACCCTGACCCTCAAACTCTGTTTAGCCTCACTTGCCAGAATCCTTGGCAGAGGTGTAGATAAATTAAGTGGCAATATATTGTAATGGTGCTTGTGTAGGGAGGAAAGAACATAAGTTAGATGTGGTCAAATGTGTTGATATGGGTGCACTTACCAGAGATCCTGTTTCAAGATGCTAGTCAAGGAGCTGTGAGTGGTTCTGTTTACTTGTTTTATTGACCAAACCTGGCTTCTGTAATGGCCTGTCTCAATTAGATAGAAATGGTAGAAAATCCTTGATTGGATTTAAAGAAATTAGAGAGTTGCTTGCAGATGTTTGTGCCGCATATGCTTGCACCATCCAGAAGTGGAAATTATAACTCCACTTAGGGGTGGACTTAACAATAGGAAAGAAATTCTTCTCATGGGCATAACTTCAATAATTATATTGGTTTTCTAACTTTCCTTGGAAAGAGTGCTTGGTCAGAAGTATGAATTTATGTTGATGATGGTCAGTAGCAAACAGTTATGCTGCATAATCAAGGACTTAGAAACAAGTTTGAAGGATTGGGAAAAAGGAAGACTGGGGAAGAGGTATGTAAGGAATCAGAGAATATACCTAAAAGCGAGCATATTTGTGTTCCATGTGATTGCTTAGTAGCAGGTGCAACTGCAAAAGGAGGAACTTAATTATATGGTTGACCAGTTGACCTAGTCTGTACATGTCAACCGGCATATGCCACTATGTGCACAGTGAGCTATGAAATAGAATAATCATTTAATATATTGTCCAAATTGGAGAACATTTGAGAGTTAAAGCAATTAATAATCTGAGAAAGCAAGCATGAACCAGAACTATCTTCATCAAACTGGGATACATGGCTAATGTAGCTATAAATGAAGAAGTCATGATGGCAGTGGTGGGAATTATGGAAGGAATTACTATCGGAGACTACCCCTCACCAACACTGCTGGGTGCACTCAAGCTGCCAACAGCAGAAATTAACATAATGCTTCTGATACAGCACTCATTTAGAGGGAATTGAATATTACATTGGCCCTCTTTCAATATGGAAGCCAGCAGTGTTGTGTCTGCACGAAATGAATTTTTGTTTTCCCACAGCAAGTTTCTGCCAATACTGTCATTCATTGACTTACTGAATGACTTACTCATTATCACAGTTTCCACACAACATTGCATATGCTAAGGAACTCACCTTATAAGGGAAATAAGACAGTTGACTGACATCGGTAATAGTAAAGGTCCTACTATGAATATTGACCTTAAACAAAGTGAATTGGCTTATATTGAAGATTAATTTGCTCTATCTGTGTATGTTCGTCTGTTCTCATGCTGCTAATAAAGACATGCCTGAGACCAGGTAATTTACAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTTACAGTTCCACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGTGGAAAGTAAATGAGAAGCAAAGTCACATCTTACATGGTGGCAAGCAAGAGAGCATGTGCAGGGGAACTCCCCTTTATAAAACCATCAGATCTCATGAGACTTATTCACTATCATGAGAACAGCACAGGAAAAACCCACCCCGATGATTCAATTACCTCCCACCAGGTCCCTCCTATGACACACAGGGGTTATTACAATTCAAGGTGAGATTTGGGTGGGGACAACAAACCATATCACTGTTGGAAGGTGATGGGAGTTTGGGCTGCAGTTCTAGAGTGTACATGGTATATGTTCTCTGTCCACTCCAGGGATATGATTTCTCTCATAGGTAGAGTACATGGATCTGGGAATTAAAGAGTAAAAATAGAAGTGACATGTCTCACCAATTAACCATGTAATCTGCTAACAACAATTTTGCTTCTCAACTTTTGGCTTTTCTAGATGAAATCTAGTAGAGATTATCCTAACTAGATTAAGTAATCTCAGTGTCCAGGGAAGAAATACTTCTATATGAGGGACATATTAATGATTTCATTAAATGGGAAGTTCTTGATCTGCTCATTCCACGCTTTTACCTCTCTGTCTTTATAACTTTTCACTGTACTTACTCTATTCCAGCCACACTGGCTATCTCCTCTTCTTCCTCCTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCTTCCTTTTTCCTCTTCCTCCTCTTCATCTTCTTCCTTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCATCTTCTTCCTTCTTCCTCTTCTCCTTCTCCTTCTTTTGCTTCCTCCCCACCCTTCCTTCTTCTCAAATAACAAACACACTGTATCCGAGGGCGTTTGCACTGGTTGGACCCTCTTCTGGAATGTGCTACCTCTAAATATCTGCGGTGTTAATGCTTTGCTTTCTTGATATATTTTCTCAAATATTACCTTTATAAAGAGGCTCACATCGAACATCCTATTTGAAATTAACCCACCTTTGACTTTTTTGGCACTTCTTATCACTTCTTTCTGTTTTGTAGCATCTATCATCTACCTTACTATATAATTTATCAATATGATGTTTGTTATTTATTGTCTGTCTCCCCCATGGAGGCTGGGATCTTTGTTTTGTCCACTGTTGTCACCCAAGCACTGAGAAAGGTCACTAACGTGTATTAGCCCTTGGTAAATGTTTGTTAAATGAGTAATAATTGAGATTGATGCTTGAATTATTGTTAATTCTAAGATTCTGAGTTTACTCTGGAAAACTTCTGAAAACTCAATTTTAGGCAAATGGGCCCTGAGATTTAGGTTAATCCTAGAAATACATTGAATCTAAATGAAAGAGTTTCTGCTCCTGATGAAGTCAAGGACTCTTAAAATTGTAAGAGGTTTTAAGTTCTACTCTGTCAACCTACATTTCCTTTCTTGAAGTGCAAAAGGTTTAATGAGGATCTTATCAATTTTCTGTTGTCCAGGGATTTTGCATTAGGAAATTTATGCTCCCAGAAATTTACCAGGCAGGCTTGAGCTTAATTCCATTAAGTATACAAAACTGCATTATCTCTTTTTTTATTTTTTATTATTTTTTATTTTACTTTAAGTTTGGGGATACATGTGCAGAACACGCAGGTTTGTTACCTTCGTATACATATGTCATGGTGGTTTGCTGCACCTATCAACCTGTCATCTAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCATCTAGGTTCTAGGTTTTAAGCCCTGCATGCATTAGGTGTTTGTCCTAATGCTCTCCCTCCTCTTGCCCCCCAACCCCCGACAGGCCCCAGTGTGTGATATTTCCCTCCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCGTTTATGAGTGAGAACATGCAGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGAATGATGGCTTCCAGCTTCATCTATGTCCCCGCAAAGGACATGAACTCATTTTTTAAATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATTCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTACCGCAATAAACATACGTGTGCTTGTGGCTTTATGGTAGAATGATTTATAATCCTTTGGGTATATACCTAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTATTTCTGATCCTAGATCTTTGAGGAATCGCCACACTGTCTTCCACAATGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAACAGTGTAAAAGCGTTCCTATTTCTCCACATCTTCTCCAGCATCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGGCATTCTAACTGGCATGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATAACAAGTGATGATGAGCTTTTTTTCATAGGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTGTGTTTATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGGGTTGGTTTTTTTTTTAATTGGCTTAAGTTCCTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGATAGATTGCAAAAATGTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGATAGTTTATTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTATATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTGTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTAGCCAATGAAGTCTTTGCCCATGCCTGTATCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTTTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAAGTTTTACAATTAAGTCTTTAACCAATCTTGAGTTAATTTTTGTGTAAGGTGTAAGGAAGGGGTCCAGTTTCTGTTTTCTGCATGTGGCTAGCCAGTTTTCTCAGCACCATTTGTTAAATAGGGATTTTTTTCCCAATTGCTTGTTTTTATCAGGTTTGTCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTGATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTATATATCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGTTTTGGCTATAAGGGCTCTTTTCTGGTTCCATGTGAAATTTAAAGTAGTTTCTTCTAATTCTGCAAAGAAAGTCAGTGGTAGCTTGAGGGGAATAGCATTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCAGTTTCATGATATTGATCCTTCCTATCCATGAGCATGGAATTTTTTTCCATTTGTTTGTGTTCTCTCTTATTTCTTTGAGCAGTGACAAAACCGTATTTTCTATGAAACTTCCTAGTAGCAGAAATGAGAAAGCTCTCTATATACTCAATGTTTCGGGCCCCTGATATCACATTCATTTGGTTTAGAAATGTAAACCTAGTAGATCATCACTAGAGCTGATGAGATTGGTGGGTGGTTGTGAAGTAAAAGAAGACACTTAAAAATTGTCAGTCAGTGTTCTTTTAACCAAAAAAATGACAATTAATAATTCAATTCTTCCCCTTTAGGAGACAGAAAGTAATTAAAGTGTCAAAGAAGTCATACTAAGATTCAAATTTCTAGTAGCTTCCTGTTACAACATCTTATTGCTATGTTCTGAGGACATAGCTATGAAGTACCAGCCTTCTGTGACATGGAGGCTTGTACATTCCTTGAGTTTCCCTGTATGAGCCCAAGTGCAGTTCATCCTGCATTTGCTGAAGCACTCAACATGGAATGGTGACTCTGTACCAGGATTTGATGGCGATTCTTAGAGGAATTTAAAGTCAGTGTTATTTTACTATGATAAATACCTTTCTTGAAGGATGGAAGATTATAAAATGTTCATTTTAACTCCATAAAACATGGAGTGATGTAAATGCTTCATTTTCCCCTTTCCCCAGAGTCAATCCTTCCCCACCTGCACTCTTTCTAACAGACAATTTTGGGGTGAGGAGAAGGAAAGGGGGAGTAAAAGGGTCGCTTCAAGTGTCTGTGTGTTTTAGACACCATATTAGTCACTTCAAATACATTATCTAATTTAGTCCTCATACCGATTTTGAGAGAGGGCTTTTATCCCCATTTTCAAGATAATAAAAAAGGGACTCAGATTAAGCAGATGATCTAAGGTCGCACAGGTAGTGGGGAATAGAGTGTGGACAGACACCAAGTCTGTTCAACTTGGGCCCCTTTCTTTATCTGATACAGTCTTTATTATGTTTGTCTTCTCACTGGGAGAGAGTAAAGGTAGTTGAGTTGCCAGTCATAAGATGATTACTTTTATTTTAAAATCTTAAATCCATATACAAAGATACATAGATTATTGCCTGTGTTCATTTAAAAGTAGCATATTTGGTTCAGAGTTATTAAGCTAATCTGGTTAAATAGGTTTGACCCTGGAAATTCAATAATAAAAAAAGTTTACCTGAATGCTCTTTCCATGGTTTGTTGTTGTTTGTTTGTTATTTTGGCAATTATAATATTTAGCAAATGGAATATACTGGTTTAAATAACTGAGTTTTTAGCTTTCAAATCTTAGATTAAGAATGGAAACATTGCAATAATTTTTTTGGTTGAGAATAACAAATACTGTTCATGTGTGAAAGGAGTTTTTTACATTTATTAGCCACAATTCAGCTTTTTTCCCCAAACAAATACAGGCATACTTTTCCAGAAGGTGGCACTCTAAGAACATTATTTTGATATTTGGATTTAGGCGAACATGATGGCCTGAGTCTGTTATGCTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTCTATTTGAAACATAAAACAAGAAGCATAATAAAATTCCTTTTAAAAATTATGCACCTTTAAAGATAAATTGATCTAATTATATTATATGATTTATATATTCATGTTTTATTGAGGAAACAAGTAATGATAATTATTTTCTTTGATTAAATTGCTGTTTCCAAATTGCATTGTTGTAATCCAAAAAAAGCAAAAATTGTATCTTTCCTTTTCAGACACATTCAAAGTATGTTCACAAAAACATACTTTAGAGACTCCTGCAATTGAATAAAATTCCTATAGGAAAAAATTTACTGGTTACATTTTTGGTTATCTCTCAGTCATGGCTAAATACCAAAAATATCTAATTAGTTAATCTTGAAATTTAGTATTTAGTTTTTAACAATATTCTCTTGATTTAATTTCATATAAATTTCCTAAAATGCCCTGTTACATTAATAAATGTCTGGTGTATTTTCATGAGGTGTGCTACTTGGCGATTGAAATCTCTGTTGTGTTAGCACCTTTTTTGTTTTTTCAACACCTTCAAGCTTATTAAGTAAAGAACTTTCCTTACATTGTCAATGATGTCAGTGGTGAACACTGACTTTGGAATTATAAGACCAAGAATAGACCCAGATGACATCAACCATGTGTTAAAGAAAAAAAAGTAAAAAGAATTCTATTTCAACTATATCTAGGCTGTATTTTTATATGTATTTCTAAAGATTTTCATAAACTTGGTGGTTACTGTATAGATATTTTGAGAAATCAATAAACTCTATTTACTTTTTTTAAAAAATATGAGTTCTTTAAGATCAGCTTTTGGTTATAATTCTTATTTTGAATACACAGGATAAAAGAAAGCTCTTTTAAAAATATTTGATTGTGTTTGAATCACTTTAAAGCAAACAGCTCACAGTGACACTTTCAAGTGAGAATGTTCACCATGCCTTAAAGGTGGAACAGTCTGTCTCTAGAGAGTTCAGGAAGAGCACACCTTGAACTTCAGTCCTTCAGCAAGAAGTGTTATAAAGTAGTTTCAAGGGTCATTGTTTACAATGTAAGATCTTCTTAGAAAGCTTTCTTCCTCATTTCCTCAACCCTTACTTTTTTCTCTGTAGTTATAAAACAGGGATTCTGTTATGTTATTATTATTCATAACAATAAAATTCAAAATAATAATTATAATGATGACTTATTGTTTAGAATTCTTTTCCTCAAAGAATAAAATACAAAAGAAAATATCTCATACCAGTTTGTTTCCACTGTCCTTCTTGTGAGTTCAGGCAGTGTTCTCTCTCTCTCATTTTCTGTTTCTTACACTTCTCAACTTAGAATGAGAATCGTTATGAACAGGGCTGAGGATTAAATCAATGTGACTTTTACAGAATCAGAGAGGCCAAGTAGACCTAGAATATGCAAGACTACTTTTAAAAAACAAATACTCCCCTTAAAATTTACATAACCTTTGTTTGATTACAAACATATAATCTCAAATATAATATGAATATAAATAGAGTTAGTATCTAATATTTTTGAATTGAGTGTTTTTTATTTTTATTTTTAG
Seq C2 exon
GATAAACATGTTCTGACAGTTGTAACCATTGACAGAATGCTGGAAAGGCTGAAAAAATCTAATGAACTTTTGGAGCTCATTCTTAAAGGACTTAATGAATATTTGGAAAAGAAACGCCTCTTTTTCCCCAGATTCTTTTTTTTGTCCAATGATGAACTTCTTGAGATACTATCTGAGACTAAAGATCCCACTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000118997-DNAH7:NM_018897:19
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF083938=DHC_N2=FE(15.0=100)
A:
NA
C2:
PF083938=DHC_N2=FE(15.5=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)