HsaINT0071942 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000121957 | GPSM2
Description
G-protein signaling modulator 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29501]
Coordinates
chr1:108885275-108897085:+
Coord C1 exon
chr1:108885275-108885578
Coord A exon
chr1:108885579-108896863
Coord C2 exon
chr1:108896864-108897085
Length
11285 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGA
5' ss Score
10.77
3' ss Seq
TGTCCTGTATAATTTTGTAGAAT
3' ss Score
8.01
Exon sequences
Seq C1 exon
AAATGTTGCTGAAGTGCTGCTGAAAGGGCCAGAGATGCAAGGATTTGGGATACATTTTGAACCTTTAAGCTGTCTGACATTGACCTCCTTTCATTATTAATAAAGAAGAATCAGGAGCTTAGGATGTATTAACACCAACTCATTAATATACTAACCGGACAATGTTCTACAAACAATTCTACATTGTAAAGGACTGGATTGGCACAAAATAAAATAATTTTATTTTATTCAGCTTATAATATGACTCGATGGAGGAAAATTTGATAAGCATGAGAGAAGACCATTCTTTTCATGTTCGTTACAG
Seq A exon
GTAAGACTATTGCTGTCTTAATGGATGACTTTTAATCCTTATTTTAAAGTGTTTTTAACTCTGATGACCATTTCAAGTTTCAGTTGAAAATACTCAAATATACCAGCCATAGTATTGTCTGTAGACAATATTTTCTTTTTGTTGTAAGTTTTCCTTTCTGTAAGAAAATGATAGTAGAGACCAATTATGTACTATGGTTTGTTTAATGTTCTCTGGAAGAGTTTATGAATAATTTCTTTATAATTTGTAACTTTTTATGTAATGCAAATATGTAAATGAAATATGTTTGAAAATCTTTGGGGCTAAAAGGTGGATTTTTTAAAAATGTGGTCAGCTGAAGGACCAAACCTTTGCATTGTAATTTAATGTGATCTTTTAGACATGAACTTTTTATTTTTGATTTATTTTTATTTTTTGTAGTGTATTGTTTTGATTCCCTTCTCATTTCCTTTTTTTGTATATTTTTTATTTTATTAATTTTACTTTTTCTATATTATCAGAGATGGGAGTCTCACTATATTGCCCAGGCAAGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCAGGAACTACAGGTGTGTGCCACTGCACCTGGCTTTTTATTTTATCTTTAAAGGAAATTTTATTTCACAACCATTATTACTGTTTTAAATATGTACCTAATCCACATTAATATAAATACATTATTATTAAAATACAAACAAGCGCTGTTCAAAAGAAATGTCATTTTTAAGCTTAATGTCTAGTGACATTTTGTGTTGTTTTGCTGATTTAATACTTAAGACCACATTTTTACATGAAGTAGTGGTTTGGTAATCCCTAATTTACTCCAGAAAGCAAGTCAGGCTGAGGAAAGGCACCCACATGCATTCTCTCACAAGCTTCACGGTCCCTAGGGAAATGGCCTGGCTCCTCTAGGACTTACAGTGTTCCCTTGGATGCCCAAATGGATTGTCTACATTCCTGGTAGAAGGTTGCAGATTGTAAGGACCAGTGTTCCCACCTTTGTTCTGCATCCACAAGTGTCTTTCACAAATACAACACACTCCCTTTGGCTACACCTTATATATAATAGGTTATGCACATGTATGTGTGTTGGTGGGGGTGGATGCTTCCCACTGATCTAGATCAGGATCCAAATCAGACATACACATCAGGAAAGGAGGGAAGATAGCCAGGAAGTGATAGCTGGGCAGAATGAAGGTACAGAATGGGCAGGTCTTCCTGATTTTTCAGAAGAGCCCAGGAAATCTGAAAATCTGAAGAGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGTCTCACTCTGACGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGAGTTTGGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCCATGTTAAAGCGATTCTCTTGTCTCAGCTTCCCGAGTAGCTGGGATTATAGGCGTGTGTCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGATACAGGGTTTTGCCATATTGACCAGGCTGGTCTTGAGCTCCTGGCCTCAAGTGATATGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCAAGCCCGGCCGGAAATCTAAATCTTTATTGTGCTGTCTCCAAATTCTGAAATGTTGGCAGCTAATGCAAATTTTTTTTTAAAAATGTGGGTTGAACATTTTAAGGAGGAGAAAGAGGCCTGTAACAGACACAACTCTCTAAAAAACCACACAGGCAGGTGGGGGAGGTAGAGCTCAAGGTTTTGAGAAAGCTGCTCTCCAGGACGTAACATACACTTACCCTGGGACTCCGAGGCGCTAACCCTCCTGCACCTCGAGGCCCAGAGCACCAAGTGCGATGTCCCCATCTCCTGGCCTTGCCCACCTCATTGCCCTCCATATCTCCTCATCACACCTTCGATTCCCCAAACCCCATAGGTTTCTCTGCCTCCCAGACTTTGCCCCTTATTCCTTGGATGGCCTAGAATGCCATTACCTGCCATCCTCCCAGGCACTGCCTGTTGCAAGCCAGGCTCCCATTCTCATTCCTCACTCCTAGAGGGTTGCATACAGACCTTCCTATTGCACCCTTCTAGATGGGCTGCTTAGGTCAGTGTCACCCACAGACACCATGCACCCAGTGACAGTCTGTGAGAGCATGCAGCCTACCCCCATCCGTGTGTGGAGCTCAGCCTTCATAAATGAGCATCTTGAAGGAATGGGTATTAAATAAAGTCGGAATAGGTGGGTACTTTGTAAACATGATAACCAATAGCCAGTTTAATATTTAGTGTTAAATATTAATGACATCTCTAATGCAATTAGGAACAAAACAAGGCTATCTGCACTATGATTATTAATATTCTGCAAGTTCTGGTAATTGCACTAAACGATAAAATAAATGCAAACTTAAATATTATCATCATTTAATAAGGTGATTAGGGAATATGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGAAATGGAGTATCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCAAGCAGTGCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCTAACTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACTTGGCCTTTTTTTCCCCGTTGAGACAGAGTCTTGTTCTGTTTCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAACCTCTCAGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGCTATGCCTGGCTAATTTTTAAAATCTTTTTGTGAAGATGCGATCTCACTCTGTTGCCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCACCTACCTCAGCCTCCTCAAGTGCTGGGATTACAGGAATGAGCTGCCGTGCCCAGCTGGTAATAGATTCTTTATCAAAACTGTTACAAGTTAATTATTAGATGAACATCAGAATATAGTAGCAATTAATAGAATTCAAAATCTCAGGAGGGTGTACCAAATTTTAGATGTCTTAACATATTTAGGAAATGGGAGATTTATCATCCTGTAAATAGTTCACGTTAGGAAGGTTCATGCCAAGGAAGTTAACATAGGTAAGATGAGGACATTTCTATTAAAAAAGAGTTTCAAGTAAAATAAAATGGAAGACATTTAAGATAATTAAGATGAGCTTTTAATATACGAAATGCTGCCATCCTACCCTTTACATAAATTTCCAGAAACCTGGGAATTATATACTTTTTTCTTTTCTCATTCTGTATCCAGCATGAAGTATTGCTGGTTTCATCTCCTAAATGTTTCTCAGATTCATCTACTCATGTGCATCCTCCCAGTTGTTTGAAAGGCTTGTTCCCCGGTGCTGTAAAGAAATAGCACTTGAACATAAATTTAATTTATTTAGTAAGGCCATTTTTACTTGCTGCAGAAGGGGTACACTCATCAGCAGTTTTGCCTCGAGAGTACACTGAACAAAGGAGACAGGGTCATTTATAACCTGATGTATCCACCCTACTGCTGTGTCTGGTTTCCATTAACTGGAACGGGACCTCACATTCTGTATTTGTCCCGATTGGCTAGCAACTTAGAACTTTTTAAAAGAGGCAAAGGTAGAGGGGAACAAAGGAAGGAGGAAGTAACTTGTGGAATGTTGAGAAAGATAAAAACACTTTTAAATAAGGAAGAGGAACAGGCTATGACCTAATGCTTGCTTGGACCAGTGTAAGCATGCTAGGGCAAATACTTAGGCTAAATTGTGGGAGCTAAGAACATAAGGTACATTGATTTCCTTATTACCGCTAGCAGATATTTAAGAATGTTAACACAGTTCTTTGAATAAATTTTGCGTCTAAGGAATAAATACTATTTATTCCTAATTAGATGGGGAGGAAAGTCTTTGAAGAGGAACCTTTACTTTACTTTTTACACCGCCATAGCTATAATTGAGATCCTCAGGATCTTCTTTCCAGACTGCCTCCATTCTTCACCTCTTGGAACCCGTCGTTTTGACTTGTCACTAGTGGGCTCAATCTCAAAACACAGAGCTAACCGTGCAACCTCTCTGCTTAATACCTAGGGTGGCTCCTAGTCACCCGGCCAAGCTGAACATAGAACACAAGATCTTCATTATCTGGCTTCTGCCTATTCCTGGGACCTTACTTCCTGCCATTCTTCACCTTGCACTTTGAGCTCTGGTTTCCTGCATGTCATGCTGTTTTATATTTCAGTGTCTTTGCTCATGCTATGCCCTATGTTGAACTCCCTTCCCACTTTCTTTGTTTAGCTAATTCTACTCTAAGATACAGCTCGGAGATTATCTCCTCCTGGAAACCATTTCTAAGCTCCATAGTTAGGCTCTGTGGCCTCCGTGTGCTCATATTACAATCTGTGCATTTTTCTTTCTTAGCACCAACTGTATTAAAATTAAGTTAATCTGTTTTTATGGTGCTCCCTTCCTCCTCACCTCTCCCTTTGAGCATTAGCTCCTCAGCTGTGGTCACTCCTCAGCAGCCATGATAATTAGCATGTTGTCTGGCACATATTGAACTTCAATGGAATATGAACGTAATAAGATGTTTATCTGTCTTGCTAAATGTTTTGAATAGTATTGTGCTTTCTAATATGGTAAGAACAGTAGATAAGTAGGAATGGCTTGTACCTCTGCCTGTTGGAAGATCTTAGAATTGTCCTTTTTCTGTGATACAGTCTAGATCAAACATGGTTGCACTTTGCTATAGGACTTCACCAAGGGAAACTTAAAAATCTGTACTGTCTGTAATAGGACTATACCAAACAAATCTCTGGCTTTATCAGTGCTCTAAGACCAGCATTCTGTATATTGATTGGATTGTCGTATAATTGGGGGTAATGATTTGAACTCTTTATGTTAGGCCATAGGCTGGTATAAGTTATTCTTCTGCTATAGTAAATCCTTATGAAATGTTTTATCCATCTGGTTCTTCCATTGTGGAGGTCCTCCTCTATCCCTGGAGGAGTTTCTGTGGCACAATGAATTTGTAATTTTGAATGGAATGTTTCTTGGAACACTAAGTAACCTCCTAAGGGGACATCAGAATGCTTTATTGAAATATTTTGCACCTATTTCAAAAGGTAGAGACTGATAGCAAGTACAATTTAAGTTAAAAAAAAATTATATGGTTGATTTTTAAGGAATTATTAATTTTTTATGTGTGATAATGGTATTGTGATTGTATTTTTTGAAAAAGATTAATCTTTTAAAGATACATACTAAGGTATTTACAAATTAAATCATATGCTTTCCGGAATGTACTTCAGACCAATCTGGGGTTGGAAGAGTAACGATCAGAGTAGAGATGAATAAATAATATATTGATTATATATGTGTAATTATTGACGTTGAAAGATGGATACATTGGGTTTGTTACACTAGTTCCTCTGGTTTTGTGTTTCTTTGGAAAATGTCATTTATACTTCTTACTGTGAATAATAAGCATTTTAATACTTTAATATTGTAAAAGTTAGATTCTTGCATGTAAGTTGTGAAGGAATACAGATATGGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTAGCTCAATGTAGTTGTTAATGTGCTTTCTTGAGTAGTTTAAGGTAACATGGAGTGATGGAAAGACCACTGGATTTGGAGACAAAGATAAATTTTCATATCTCAACTTTGACATCCCATGACCTTAAGCAAGTCATTTAACCTGTCTCAGCATCACTTTCTCCTTCTGTAGCAATACCTATCTTAGAAGGTTATTTTTATTTTATTTTATTTGAGATAGGGTCTGGCTCTGTCACCCATGCTGGATTGCAGAGGTGTGATCTTAGCTTACTGCACCCTCTGCCTACTGGGCTCAAGCTATCCTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACTACAGGTGCATGCCACCACAGCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCACCCCCCCTTAGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACTGCACCCAGCCTCAGAGGGTTATTTTGAGAATTAAGTTTGATAAAGGTTAAAATCACTTTTAAAACTAAATTACCATACAAATTTTTGTTTTTTAATCATTTTCTTCCTTCTTATTCTATATTATTAATCATCTAACCATACAAATGTAAATCAATTGAGCACTACTTTTCCTTTTACATAATAAATGAGAACAGCTAGATATATGTGGTAAATTGAATGGATGAAATTTGTTTATTGGGGCTAGCACTGGTGATGGAAAAGGTTCATGCCCAATTAGAATACAGAGAAGGTAGAGCTAGGATTTATGAAAGAAGATCACACAACCACAGAAATGGAAAGCATAATAGAGAAAATGGAGAGTAGTCTTATTTTGCCTCTTAAGTCCTGAATTCCATCATTTATTCTTAAATAGTATGTAAGCCCTTTGAAGCAAGAGTCAAATCTGGACAAAATTGATGTTATTAAGTCTTTTAGAAAGATGTAGCATCATGGTTTTATGTTTTGCATTCACTGACGTCCTGTGAACACGAAACAAATTTAAGGAGGTAAAGAGGATAATAGTCAAGTGCAAAATCTAGTGTGGAAGAGAAGTTAAAAATTAAAAGAAAAATTGAAATGACATGAGTTTGCACAGAAAATGAGAAATTCTAGCTAAAATGTTCACTCTATTAGCAAAAATGAAAACACGTCAGTTAAGGATAGTAGTACTGTGTCTATTTGAAGTTTATTAGAAACATATTTTCTTTGATTATACAGCTAGATAGGCTCTCAGAAGCATAAAGGAAACTTTGTATGTGGGATGAATTTTAATGGAGGGGTATGTTCTTGGTTTTTCTTCTACATGTGGGTATGTTCTTTGTTTTCAACCCAACTGGTAAACAAAGGAAGTAATTCTATTCTCTCATAGTGACAGAGAGGATATGAAATTACTTTCTCTGTTACTATTTAATGATCTTCTAAAAAATTTATAAACCAAGCTGCCCTATTTTGCAGGCATAAATCTATATTTGATTCAGGTGTTAGAGATTTTTGCCAGAATATTAACTTATTTTCTAATAAAATACACCAGAGCCTGAATCTATCTAAGAATTAATCATAAACTAGAGTGTTTGGGACATTATTTCAGGTATTAGTCACTGGAATAACTTTTCTAAGATAGTCTCTCCTGTAGGGCATTCTCACTACATGGACTTCAAGGACAGCCATGTAGCCAGCAAGCTTCCAGTTTGCTAGTATTGTTTCTTATGACAATTATGTAAAATGCCTTTTTAAAAACGTGTAACACTTACGATGCCATTCAATCTATAGCTAAGTTTTGTGGGATGCCACATCATTTGGATCAATGGTTCCAGTAAAATGTTCTGTAAACTTAAATCCAGAAGATCAGTCATTTGTGGTGAAGTTATTTATTTGAAGAAGATACTTCTCAGTTTTATATGAATATTGGCAAACACTTTTATACTTCCGATTTTTAAATGTTGTTCACATGAATAGCCAGTTCTGCCTTATTCCTAATTTCCCGGCCAGCAACCCAGTCATCCTGAACTGATGGTGCTGTCATGTGTGACCATTTCCTCACTTCCCCCTCAGTGAAATGATGCGCCATCATTAGTAATCCATTGTATAGTGGCGTGTAATTTTTTTTACCCAGTACTCTATTGGTGGACATTTAATTCATTTGTGGTTTTTTTGCTGCTGTGAATATCCTTTCATATGTATCTTCTTAAATTTGTGTAAGTATACCTTAAGATCAATTCTTAGCACTGAAAATGCTTGAGATATAATTTTTAACATAATTTAGAATGCTTAAATTAAAAACTTTTTGTAGGAAAAGAATTATTTTACAAATAAAAATATCTTTTCCATTTTTTTAAATAATATTTCTTAGAAATTCATTGGTTTCAGTTTTTGACAAATAAAGACAACCAGTTCAGGTACTTCATCTAGCAAAATAATCCTTTAATAAAAATCACATTTTGACTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCTGAGGCAGGCGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAAGAGGCTGAGGCAGAAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCATTGCGCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAGAAAAAAAAAATTACATTTTTATATATCTTTTGTTGATTTATTTATCTTTATACATAGAATATGACAATAACTTCATAAAATCTTAAACAGATATACTCAATTTTTTCTTTTATGAAATATCTCATTTTCAGAAATACAATTCTAAAGGGCAGTTTTCATTTTTGGAAGGCAAAAATAGGCTTTATTAATTGTGAAGTGACATATAAAGAAACATAAATATAGCTGTTTAAGGTTTCTGATTTAACTGCTTATCTTACTATGTATTTTAGATCTTCTCTCCTGTATCTAATTGGCTTGTAGTCTAATATTGTAGCAAAATGTTGGAGGTTTACCTGCATTATTTTGCATAGATCCATAAAGTGAAGATGGGGCCAGCCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGATGGGTGGATTGCTTGAGGTCAGGAGATTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAATTACAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGACTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGACTGAGGCACGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTTAGCCAAGATTGTACTGCTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGTGAGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAGTGAAGATGAGCAAGCAGTAGCCATTGGCTAAGTCATTTGAATTCTTAAAAAAAAAAAAGATACCTAGATAGAAAACTTGAAAATTACCTATTGGAATTGGCTACATATATCTGCTTGTTCTAAACCAGAAGTCTGCTTTGAACCTTTACAATTGGCTCAGTTTATCTTTGTCCAGGCTTTTAGCTTCATCAGGTACATTTTCTACTTTACAATCCCATTTTAATTTATGGCTCTAAGGACCCTTGAAATTTTGCAGACTGAAAAACAGCACTCACAAAAACATGTTAATTGATCTACCACTAGATATACAGAGTATAATCATATTTGAATGATATTAGGGTGGGTGGTGGTTTAATTCACATTTCTTATAAAAGCACTGATTCTCAACCCTAACTTGTACTTTAGAATTACCTGGGGCTTTAAAAAAATACAGGTGGCCAGACATCACCCAGAGGGTGGAGTTCAGCGTTGGGAGTTTTAGAAAGTGCTCCAGGTGAGCTCTGCTGTTGTACAGCCAGCATTAAGAACAACTGCTCTATTGGAGTGGCTCAAAGCTCATTCTAGTAAGGAGTAACTTAATGCTGTTCCAAAAATTAAAACATTTGATGAGCTTAATCAGAGCTTCTCAAAGAGTGATATGTATGCCACTGGTGGTACATAAGGTAACTTTACTCACTTTTAGATTTTAATAATTTCATATTTGTTTAATGTGTATTAGAACGGGGTTCCCAACCCCTGGGCCACAGACCAGTACTGTTGTAGCCTGTTAGGAGGTAAGCTGCAGGTGGGCAGGACGAGTGAGCATTTTCACCTGAGCTCCGCCTCCTGTCAGATCAGCAGTACCATTAGATTCTCATAGGAGTGCAAACCCTATTGTGAACTGCACATTCGAGGGATCCAGATTGCACATTCCTTATGAGAGTTTAATGCCTGATGATCTGTCACTGTCTCCAGTCACACCCAGAGGAGACCATCTAGTTGCAGGAAAACAAGCTCAGGGCTCCCACTGATTGTACATTATGGTGAATGTATAGTAACAAGAGGAATAAAGTACACAATAAATGTAATGCACTTGAATCATCCCAAAACAATCCCCTGCCACCCGTCCATGGAAAAATTGTCTTCCACAAAACCGGCCCCTGGTGCCAAAAAGATTGGAGACCGTTGTATTAGAATATACATATAAGTATCGTATCAAATTCACAGTTTCATGAGTACTGCTTTGGATGAAGCTCCATTTTTTTAAAATGATAAGTTAAAGATAGTGTGCCAATTTAAAGGAAATTTGCCAAATTACAGAAATAATTAAACGAATAGGTAGTTCCTACATATGGCAGAAATCATGAAGATGCTGAAGAAACACAATGGCAACTTTGGTGAAGGGCACCCTCTAAAATTTAGGATTTGAATCCAAAGTATCAGTGTTTTTTTCTCCCAGATATGTTTACAGTGACTTAATCCTTCTTTTTCAATTCAGGGACAGACTTTCAAAATTAGTATTTCTGCAAATTTTTGAATCATTGTTTTCTAACTTAGTTTCTTGACACCTAGTTCTCTTGTGAAAATGTGTCTTACAGATCAAGAATATTTTGTTCCTCTATTTTTCTAGGGTATAAGTGGACATGTGGTGGTAAGAAGAGGAAGGAGAGTGAGTGTGTGTTGTGTGTGTATGAGAGAGAGAGCGAGGGATGGATGGCTGGATGGTCAGAGGGGCTGATGAACAGGTGACTAGATTACTTGGATACCTGGGTAGAGAACAATATTAATAATTGTAGGGCCTCACTTTCCTACATACTCATCTTCTCAGACTCTAAGGAAGTCCAGAGGTCTGTTACAACTCAGAATTGTTTGGGAAATACTGCTTTAGGCTCTTTCACTAGTAACGTGGATTGCTCTGGGCCAATTAAAATGAGCTCCACATAAAGATATTTAGCTATCCTGACCTCTCTGAGCAGGCTCAGAGAAATTCGAATAGGCAAATTACCTCTTGCTACAAATAACTGCTTACTGTTTTATCAGGAATGTATATAAACTTCAGTTATAGAGGCAGCTGCCCTGAACAAGAGTAGCCGCTTAAATTATATTACGGGAAGTTAAAAATACTGTGATGCAGCTGTAATGTTATGTTTAAATGTCTGTCCTGTATAATTTTGTAG
Seq C2 exon
AATGGAAGCTTCTTGCCTAGAGCTGGCCTTGGAAGGGGAACGTCTATGTAAATCAGGAGACTGCCGCGCTGGCGTGTCATTCTTTGAAGCTGCAGTTCAAGTTGGAACTGAAGACCTAAAAACACTTAGCGCTATTTACAGCCAGTTGGGCAATGCTTATTTCTATTTGCATGATTATGCCAAAGCATTAGAATATCACCATCATGATTTAACCCTTGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000121957:ENST00000406462:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134141=TPR_11=WD(100=96.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development