HsaINT0076315 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000095951 | HIVEP1
Description
human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:4920]
Coordinates
chr6:12089417-12126103:+
Coord C1 exon
chr6:12089417-12089470
Coord A exon
chr6:12089471-12120122
Coord C2 exon
chr6:12120123-12126103
Length
30652 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAAT
5' ss Score
8.88
3' ss Seq
GTTGTTGTTGTTTTTTCCAGAAA
3' ss Score
8.92
Exon sequences
Seq C1 exon
ACAAAATTGAAGAAGCACAAAAAGAACTTAATGGGGCAGAAGTTTCAAAAAAAG
Seq A exon
GTAAATTAAAATCAGCTTGAATGTAAACTTTATTCTTGCAATGATGCCTATACATATACCTCATAAATGTAGCCTTATGAAATAAATCAGTATAGACATATCACAAAATTAGAAATCCCCTTGAACTTATTGATACTTAAAATGTTGTGGACTTTGCTTCATGAAACATTTTAGCCACATAGCACATTCTATAACTGTTTCCCACATATTAATGTATGACTGGTAGAAGTGTGAAAGGTTATTGCAGCTCTTTTGAAAGTCCTGTTTGTGAGACTGTCCTGTAGCAATAAAAGTACCAATATAAGGAACACAGTTGGCCGTGTCCATGCATGTGTGTTCATGTGTGCATTCATGTGATGCAGTTTTCTTTTTTTTTTTGTAGCGACAAAAACCTAAGGCAACTAAAACAGCCTGAATACCAGTCAGTGGAAGAACAGTTGAATCATTTGTAGTATACTCATATTTTGGGGTATCACGCAGCTTTGAAAAAGTGTTAATTACTTTAGTTGATGGTGATAACTTATCAAATAAGAAAAATAACATTGCAATGTAGTATGTAAAATATCTTATTTTTTTGTGAAAACTAACAAAGTCAAGTGTGTATACAAGTATTTATATGTATATATATATACGCATACACACACAGAGGCTTCTGTGAGATTGGACAATGTTGGAAAGGATTTATACACAGATATGTGTTAATAGTGGGAAGAGGAGCAAGGGAAGATGACCCACTCATTTATATGCCTTTGTATTATTTCACCAGCTGCAATGGGTGTAATTTTGTATTAAAATTAAAAACTTGAAAGGAAAAAATTGGTTTTCACCATAGAAAACATAGATTATCTTTCCAAGTAATATAAAAAAATAGATGTGATGCAGAAGAGCATGTAGGGATGGTCAGGTAGTGAGGTAAATACTGTTGAAACACTATCTGTTAATGAGCAAAATTGATTATGTGCTTTTAATATTGTGGGCAAATAAAGTTCTCTTTATGACATTTGTATTCCGTGATTTATTATTTATTTTGCCTTGTATCTTCAAATTACAGCAGACTATTTTGACAGAGTAATTTAGCTAAATAGGATTCCAGTTGAAAGCCGTTTTACAAAAAATAGCTTTTAAATCTAGTTAGACTACTGAGCAGGTATCTGTAGGGGAAATAATTTCCTGCCATCCCAGTTCTCCATCCCTTAAACCAGCCTGTGAAGCCTTCAGGATGGTTTGGGGTTGGTCTTACATTTATGGGGTACTATGTAGCACCCCTCATGTCTGCCTTCTCCTCACCCCACGCTCCTTCCATGGGAGCTCTGGAAGGGCCATGTATATCTGACCCTCTAATGACATTCTTACAGAAAAACAAGCATAGAAGAGTAAAGATGTCTCCATGGCCACCTTGTCCCTTTGAAGGGTTGACTGACTTAAACGCATGAGGCATTTGAGACACTCAGGTTATAAGAGGCCATACTTTTAAAGTTTTCTTTCTCTATAGCCAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACATCTAGTCATGGTTTAGAGCTGCTTCTAGTAGCAAAGCAAATGTGAGCCTGTCTTCCTTTTCCTTGTTACTTCTTTGGCAAGAGTTTTCAGAACAGTGAACTAAATGCCTGATAGGAAGGAGGAAATGAAACAAAGGTTCTAGAAAGAGAAATTGGATAATGAGGTTCAGAATAATGGATTGGGCTACAGTTGGCAGGCTACACTTATTTAAGAGCTAGGATGAATACCAAGTGAGCATTGTTCTGTGCAGTTCACTGCATAGAATTACTGCTTGGCTTTCATTTTTATACAGAAATTAAAAATAAAATAGTTTTCCCTTTCAAATATAAGTAAGAAATAATATCAGTTTCTCTTTAACAACATGAAAAGTCTGAGTAACAGTGGTGTTGAGATTTTTCAAACCTTTTCTTGCTGATACCTATTTTATTTTAAAGGATATTCATTTCTTCCATCAAAGAATATACTTTAAAAATATAGACGTTCATTTTAGATTATGGTAAGTCATCTACAATAGATCTCTTTTTCATTGTTTTTCTGACGTACTTTGGGTTTTTTCACCCTGTAAGTTTAGCCACATTGCTTTTTAAAAAAATTATTTTTAAACACTGCTTGTAGTTCTAAGGCTTTGTCTCCATTAAAGGTTCTGTGGTCTTTAACTTATTTGAGGCTCTTTCTCCCTTTCTCTCTTTTTTGTAATTATTAGGACAAGTAACTAATTTATTTTCAGAAGTATCTAGCATAGTAGTAGGCTCTTAAAAGCAACTTCCTCATTAATAGATTAAAAAAGACATTTCCTCTTGTATTTTAATAATTTAAGGAGGATTAAATCTGTTTAGTGTAATATGGAAGTAAAGAAACTGACTTTGCCTATCATACACCAATAGAATAAAGAAATGCACTAAATTATGTTAATGTACTTATTTTATTCTTTTTCTCTTTTGAATGAAAATCAGATGACTTTAATTTGATTTATTTTGATTTTAATCAATTTAGGGATAGAGATAAGGATGCAACATTCACACAAGTCTCCATAAAGTCATTATGTTTTTCCTTACAGTGCTATCTCCTGATTCTTAACACACATTGTGCTTGACACTATTTTTAAAATTGTTGAGTGGGATTTAAATGAAATAGTGACTGTCACAGATGTGGTAATGGAATATGAATAAAATTAACTGGGAAGAAATAAATAGATCGATTAGGAGAGCTTTTATGGCTTTCTCAAGCTTTAATTTTAATACTCTTAAATTTTTATCATACAATGTTTGACACATATAAATTAATATATGTAGCATATTAAATTACAAAGCATAAGAATGACATGGTAATCTTTGATTCTCACACCCAATTTAAGAACGGGAATGTTGCCAGTACCATTGTATCCACCCACATGCTGATCGGCAATTCATCCCATTGTCTCTTCTGTAGAGGTTTTACTGTCCTTAGTTTTGTGTTCATCATTTCAGTCCTTTTAAAAAACAATTATGTCATATAAGTATGTACCCCCAAACAATATATTTTCTAGTTGTGCCTGAGTTTGAACTTTTAAATGAAACCATATTGTACGTAGTCTTCTGCAGCTTTTTTCACTTAACGTTGTTCCTAAGATTCACCCATGCCGTTGCACATAGCTGTTACTTTTCATTGTTGTAATATTGCACTGTATGAAATTGTTGGCCCATTCTTCTGTTGATATTTAAGTTATTTCCACCTTTTTGCTATCATAAACAATGCAGGTATGAATATTTTTATATCCTAGTGCCTATGTGTGAGTTTCTAGAGCATATATAGGGAATGTGAATGTTCAGCTCTACAAAATGATGCTATATTGTTTTCCAGAGTTTTTTTTGGGGAAACTTTTTGCATTCCCACTATCAGTGTCCAAGAATTCATTTTGTACTATCAAGTACATGGTATGTTTAGTCTTTTTTTTCCTAATTGGATAGATGTTAAATCCTCTTTTATTCTGCTTTGATTTTTGTTTCCCTGGTTACTAATGTTAAAAGAAAAACTTTAGACACAAAAAGTTTAACTGATTTTATTTAAACAAAGAATGATTCATGAATCAGGCATCATTCAGAACCAGAAGAGGTTCAGAGAGCTCTGCCGAGCAGTGTGAGCAGCAAGCTCGTACAGGCTGAACTCGCAAGCAAAGTGAGAAATCACCTGATTGGCTGCAACTAGCCACCTGCCTTGTTCAGGTAGGGTGTGATGAAGTATTTGCCTTATTTGGGCATGATCTGATCAGTTGACTTCCTGTGATTGGCTGAAAAGTAGCTATTTTTTACAAAAAATACTCTAAATTAGGTTTGTGTTTGCGCACTAAATGAGGTTGTAGTTTGTTAGGTCATAACTCGAGGTAAGGAGACAGCCTCAGGCAAATGGCCTCCTGCTTATTTAATTTAATAATGTCAAACATGTCTTCATTTGTATTCCCCCTTACTGAAATGCTTGCTATTATTATTTGTCCATTTTGTAAAAATTGAGTTATCTTTTTCTTAATATATTTTGAATAACTATTCATTTTATGTGCTTTATTTTTCAGATTTATTTTTTACTTCATTTAAAGTGCCTTCTATTCACTAAAGTGAATAGAAGCTCTTGATTTTAATACTGTCAACCTATTAATTTCTTGATTTTGTGATTCATTTTTTTGTATTTTTATTTGTCTTAAATTCTTCTCTATCACAAGGTCTTAAGTATATATATATATTTTCTATATTTTCTTCTAAAAGACTTTCACGTTTCAGATTAAAAACCCATCTGGAGTTTGTTTTTTTAAAAAAATATACCTAGTTTTTTAATGTAGTGTAAGTTAGGATTCAAGTTTCTTTTTTTTCTCAAGTGGGTAACCATTGCTAATATTGTTAAATGTCCCTGAAACATTTAGTATGTTTTCCTTTTACTGTTTCGTATTAATTTTTCATTTTTGTGTGGGTTTGCTTCTTAGCTCTCTATTCTGTTCTGTGAATTTGTTTACCCATATTTTAATATCACAGTATGTTAATTACTTACCACTTTATTGTCTTGATATATACAGTGTGCAATAACTAGTATATACTATATACAGTAGGGCAGATTCCTTGTGTTATTTGCCTTCAGGAATGTTTTCACTATTTCTAGTCCTTTGCTCATCTATTTGAATTTTAGAATCAGGTCTTTAAAAAACTTGTTGGAATTTTGTTTGGGTTTGATTGAATCTGGGGCAAACTGACCATCTTCACAGTTTTCAGGCCTTCTATTCAAAAAAGATTGTATATTTCTGATACTTGTGTTTTCTTTAGTGTCTTATCATTTTCCTCCATATGAATCTTTATTTTTTTCTGCTCTATTTCTTAGAATTTGGTGTTTTCCTCATTTTAATGATTTTTTCTTTTGTAAAATTGTTTTCTAGTTCCTGGCAAATAAAAATGCAATATATTTTTGAATATTTATTTTTATATCCAGCTACTTGGCTGGATTCTCATTCATTATG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Seq C2 exon
AAATCTTACAGGCTGGTGTTAAAGGAACTTCGGAATCCCTTAAAGGTGTGAAACGCAAAAAGATCGTAGCTGAGAATCACCTGAAAAAAATACCAAAATCCCCACTGAGAAATCCTCTTCAGGCAAAACATAAACAAAATACAGAAGAGTCATCTTTCGCCGTTCTTCATAGTGCTTCGGAGTCTCACAAGAAACAGAATTATATTCCTGTAAAAAATGGGAAGCAGTTTACCAAACAAAATGGAGAAACACCTGGAATAATTGCTGAAGCCTCAAAATCTGAAGAATCTGTCTCCCCAAAGAAGCCCTTGTTTCTGCAGCAACCATCTGAACTGCGTAGATGGAGATCCGAAGGCGCTGATCCTGCCAAATTCAGTGACCTCGATGAACAATGTGACTCAAGTTCCTTGTCAAGTAAAACCAGGACTGACAATAGCGAATGCATCTCTTCTCATTGTGGCACTACGTCCCCCTCCTATACAAACACTGCATTCGATGTCTTACTGAAAGCAATGGAGCCAGAACTGAGCACCTTGTCACAAAAGGGCTCACCTTGTGCAATTAAGACAGAAAAACTGAGGCCAAATAAAACTGCACGTTCCCCTCCCAAATTAAAAAACAGTTCAATGGATGCCCCAAATCAGACTTCACAGGAATTGGTTGCTGAATCACAGTCTTCTTGTACCTCATACACAGTCCATATGTCTGCTGCTCAGAAGAATGAGCAAGGGGCAATGCAGTCAGCTTCTCATTTGTATCATCAACATGAACACTTTGTTCCCAAATCCAACCAACATAATCAACAGCTTCCGGGGTGTTCAGGTTTCACAGGATCACTGACAAATCTGCAAAATCAAGAGAATGCCAAACTTGAACAGGTTTATAATATAGCAGTGACATCATCTGTAGGCCTAACTTCACCTTCCAGTAGATCTCAGGTTACTCCTCAAAACCAGCAAATGGATTCTGCTTCACCTTTGTCAATAAGTCCGGCTAATTCTACACAGTCGCCCCCCATGCCAATCTATAATTCAACTCATGTTGCCTCTGTTGTTAATCAAAGCGTAGAGCAAATGTGCAATCTTCTTCTGAAAGATCAGAAGCCAAAAAAACAAGGAAAATATATTTGTGAGTATTGCAATAGAGCATGTGCAAAGCCTAGTGTGCTTTTAAAGCATATCCGCTCCCACACTGGAGAGCGACCCTATCCCTGTGTGACTTGTGGATTTTCATTTAAGACTAAAAGTAATCTGTATAAGCACAAGAAATCCCACGCACATACTATCAAACTGGGTCTTGTCTTGCAACCAGATGCTGGTGGCTTGTTCTTGTCCCACGAGTCCCCCAAAGCACTTAGTATTCATTCAGACGTAGAAGACAGTGGGGAGAGCGAGGAGGAAGGCGCCACTGATGAGAGACAGCATGACCTGGGCGCCATGGAGCTGCAGCCTGTGCACATAATAAAGAGGATGTCAAATGCTGAAACTTTACTAAAATCAAGCTTCACTCCAAGCAGTCCAGAAAATGTGATAGGTGACTTTTTGCTACAGGACAGATCTGCAGAATCACAAGCTGTGACAGAGTTACCGAAAGTTGTGGTCCACCATGTCACTGTGTCCCCCTTAAGAACTGACAGTCCAAAGGCCATGGATCCCAAGCCTGAACTTTCTAGTGCACAAAAGCAGAAGGACCTTCAGGTGACAAACGTACAGCCACTTTCAGCCAACATGTCCCAGGGTGGAGTCTCCAGGTTGGAGACTAATGAGAATTCCCACCAGAAAGGCGACATGAATCCACTGGAAGGAAAGCAAGACTCTCACGTAGGAACGGTACACGCCCAGCTACAAAGGCAGCAGGCTACCGATTACTCCCAAGAGCAGCAAGGAAAGCTCCTGAGTCCTCGAAGTTTAGGAAGTACGGATTCTGGTTACTTTTCACGTTCTGAAAGTGCCGATCAAACAGTGAGTCCACCAACTCCCTTTGCCAGAAGGTTACCCAGCACAGAACAAGACTCTGGAAGGAGTAACGGACCCTCTGCAGCTCTTGTCACCACGTCAACACCCTCTGCTTTGCCCACAGGGGAAAAGGCATTGCTTTTACCAGGTCAGATGCGCCCACCTTTGGCCACAAAAACACTTGAGGAGCGGATATCGAAGCTTATCTCAGACAATGAAGCTTTGGTAGATGACAAGCAACTGGATAGTGTGAAGCCGCGGAGAACCTCACTGTCAAGACGAGGAAGCATTGATTCCCCCAAATCATACATATTTAAAGATTCTTTCCAGTTTGATTTAAAACCAGTGGGACGGAGAACAAGTTCAAGCTCTGATATACCGAAGTCACCTTTCACCCCTACTGAAAAATCAAAGCAAGTGTTTCTTCTGTCTGTACCTTCACTTGACTGTTTACCTATCACAAGAAGTAATTCCATGCCGACCACAGGTTATTCAGCAGTACCTGCAAATATAATACCTCCTCCTCATCCACTAAGAGGAAGTCAGTCATTTGATGACAAAATTGGCACTTTCTATGATGATGTCTTTGTATCGGGACCTAACGCTCCTGTGCCCCAGAGTGGGCATCCCCGTACACTTGTGAGACAAGCAGCCATAGAAGACTCTTCAGCAAATGAAAGTCATGTTCTTGGTACTGGACAGTCCCTGGATGAGAGCCACCAAGGATGCCATGCTGCTGGTGAAGCCATGTCAGTGAGGAGCAAGGCACTGGCACAAGGCCCACATATAGAAAAAAAGAAGTCTCATCAAGGGCGAGGGACAATGTTTGAGTGTGAAACTTGTAGAAACAGGTATAGGAAACTGGAAAATTTTGAAAATCATAAGAAATTTTACTGTTCTGAGTTACATGGACCAAAAACAAAGGTAGCCATGAGAGAACCTGAGCACAGCCCTGTGCCCGGCGGTCTGCAGCCTCAGATTCTACACTACAGAGTCGCTGGGTCCTCCGGCATCTGGGAACAGACGCCCCAGATAAGAAAAAGGAGGAAAATGAAAAGTGTTGGGGATGATGAAGAACTTCAGCAAAATGAAAGTGGAACATCTCCAAAAAGTTCTGAAGGCCTTCAGTTTCAGAATGCTCTGGGCTGTAATCCCAGTTTGCCTAAACATAATGTTACCATAAGAAGTGACCAGCAGCATAAAAATATACAGTTGCAAAACTCCCATATTCACCTTGTTGCCAGGGGCCCTGAGCAGACCATGGATCCCAAGCTGTCGACCATCATGGAACAACAGATAAGTTCAGCAGCCCAGGACAAGATAGAACTGCAGAGACACGGAACTGGAATCTCTGTCATCCAGCACACCAACTCCCTGAGCAGGCCCAACTCATTTGACAAGCCTGAGCCTTTTGAAAGAGCCTCCCCAGTTTCTTTCCAGGAGCTGAATAGAACGGGGAAGTCCGGGTCTCTAAAAGTGATAGGAATCTCCCAAGAGGAAAGTCACCCTTCTCGGGACGGGTCTCATCCTCACCAGCTTGCACTATCAGACGCTCTCAGAGGAGAACTTCAGGAAAGCTCCAGAAAGAGTCCAAGTGAACGACATGTGTTAGGACAGCCCTCAAGACTTGTCCGGCAGCACAACATCCAAGTTCCAGAGATTTTGGTCACAGAAGAACCAGATCGAGACCTGGAAGCTCAATGCCATGATCAAGAAAAGTCAGAGAAGTTCAGTTGGCCCCAGCGTAGTGAAACCTTGTCAAAATTGCCAACAGAGAAACTGCCACCCAAAAAGAAAAGGCTCCGTCTGGCTGAGATAGAACATTCCTCAACAGAATCGAGCTTTGATTCCACTCTCTCCAGGAGTCTAAGTAGGGAGAGCAGTTTATCTCACACTTCAAGTTTCTCAGCCTCTTTAGACATAGAGGACGTTTCTAAAACGGAGGCTTCCCCCAAAATCGATTTTCTAAATAAAGCCGAGTTTCTTATGATTCCAGCTGGCTTGAATACTCTGAATGTTCCTGGATGTCACCGGGAAATGAGGCGTACTGCATCAGAACAGATTAATTGCACGCAAACGTCAATGGAGGTCTCTGATCTCAGAAGCAAATCATTCGATTGTGGAAGCATCACCCCACCCCAGACAACACCACTTACTGAATTGCAGCCTCCATCTTCACCTTCTCGAGTGGGAGTGACTGGGCATGTGCCTCTCTTAGAAAGAAGGAGAGGCCCACTGGTACGGCAAATATCTTTAAACATAGCCCCAGATAGTCATCTGTCTCCTGTACACCCAACATCTTTCCAAAATACTGCTCTTCCCAGTGTGAATGCAGTGCCATATCAGGGGCCTCAGCTCACTAGTACATCTTTAGCTGAGTTTTCTGCAAATACTTTGCACTCTCAGACTCAGGTTAAGGATCTGCAGGCAGAAACATCAAACTCCAGCTCTACCAACGTTTTTCCTGTTCAACAGCTCTGTGATATCAATTTGTTAAATCAAATCCATGCACCGCCTAGCCACCAGAGCACACAGCTATCTCTGCAAGTGTCTACGCAGGGTAGCAAGCCAGATAAAAATTCTGTTTTATCTGGGTCTTCTAAAAGTGAGGATTGCTTTGCTCCCAAATACCAATTGCATTGTCAGGTTTTCACTTCAGGCCCATCTTGCTCTTCTAATCCTGTGCATTCTTTGCCAAATCAAGTTATTTCAGATCCAGTTGGAACAGATCATTGTGTGACATCAGCAACATTACCAACCAAATTAATTGACAGCATGTCTAATTCGCATCCTCTGCTACCACCAGAGCTCAGGCCCCTTGGAAGTCAGGTGCAGAAGGTGCCATCATCATTCATGCTGCCCATACGCCTGCAGAGTAGTGTTCCTGCTTACTGTTTTGCTACACTCACATCCCTGCCACAAATACTAGTGACCCAAGATCTGCCCAATCAGCCAATTTGCCAGACTAATCATAGTGTAGTGCCAATCAGTGAAGAACAAAATTCTGTGCCAACATTACAAAAAGGTCATCAGAATGCTTTGCCAAACCCAGAGAAGGAATTTCTATGTGAAAATGTTTTTTCAGAGATGAGCCAAAATTCTTCTCTATCAGAATCCTTGCCCATAACTCAGAAAATATCTGTTGGTCGACTTTCCCCTCAACAAGAATCTTCAGCTTCGAGTAAAAGGATGCTTTCCCCAGCAAATAGTTTAGACATTGCCATGGAAAAGCACCAGAAGCGGGCCAAAGATGAAAATGGAGCTGTTTGTGCAACAGACGTGAGACCTTTAGAGGCTTTGAGTTCGAGAGTTAATGAAGCTAGTAAACAGAAGAAGCCTATTTTAGTGAGACAGGTTTGTACTACAGAGCCCCTGGACGGTGTGATGTTGGAAAAGGATGTTTTTTCTCAACCTGAAATTAGTAATGAGGCTGTTAATTTGACAAATGTTTTACCAGCTGATAATTCATCAACAGGATGCTCTAAATTTGTCGTTATAGAACCTATAAGTGAATTGCAGGAATTTGAAAACATCAAGTCATCCACATCATTAACTCTTACAGTTCGAAGTTCACCTGCTCCTTCAGAAAATACTCATATTTCTCCTTTGAAATGTACAGACAATAACCAAGAAAGGAAGTCTCCAGGGGTTAAAAATCAAGGTGACAAAGTGAACATCCAAGAGCAAAGTCAACAGCCAGTCACTTCTCTTTCATTGTTTAACATCAAGGACACCCAGCAGCTGGCTTTCCCTAGCCTGAAAACTACAACCAACTTTACATGGTGTTATCTCTTAAGGCAGAAGTCGTTGCATTTGCCTCAGAAGGACCAGAAAACTTCAGCCTATACTGATTGGACAGTAAGCGCCAGTAATCCAAATCCACTCGGTTTGCCCACAAAAGTTGCACTTGCTCTCCTTAATTCAAAACAGAACACTGGAAAATCACTATACTGTCAAGCAATAACTACCCATTCCAAGTCAGACTTATTGGTCTATTCAAGCAAGTGGAAAAGCAGCTTAAGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000095951-HIVEP1:NM_002114:3
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.864 A=NA C2=0.679
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=1.3),PF139121=zf-C2H2_6=WD(100=1.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)