MmuINT0077932 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000021366 | Hivep1
Description
human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:96100]
Coordinates
chr13:42123160-42160318:+
Coord C1 exon
chr13:42123160-42123213
Coord A exon
chr13:42123214-42154379
Coord C2 exon
chr13:42154380-42160318
Length
31166 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGT
5' ss Score
11
3' ss Seq
TTTCTTTTTTGTCTTAACAGAAG
3' ss Score
10.16
Exon sequences
Seq C1 exon
ACAAAATCGAAGAAGCACAAAAAGAGCTTAATGGGGCAGAAGTTTCCAAAAAAG
Seq A exon
GTAAGTTAAAAAAAAAAAAAATCAACCTTGTGTGACGTCATTCTTTCAGAGTTGCCCGTAGGATCTCTCAGAATTATGCCTTCCCTGCCAGAAGCTGGTGCTGAAGTTCTGGACGTCCTGGGCCGTCTCAGCACCACCGTCAGTGTGTTTCTCTGGTACCCGTGTCCCACTGCTGGCAATAGAAAAGAGGGCACTGCTCCTTTGGGAGCGCTGCAGGAACCTGTCACGTAGTAGCATAGGCCGTGTGGATACCGTGATCCACATGTATGTTCTGCTGTAAGACAGGCATGCTTGGTTGAAGAAACTCATGCAGGATTTAAAAACTGTTAATTATTTCAAAGGACGGTGATGACTTTGTTAAATAAGAAAAATCTCAAATACAGCATATAAACAATTTTTTCCATGTATGTGAAAACAGGTCAGGGGTGTGGCCTCCTATATGTAGCAATAAATATGTGTAAACACACGTACGGGGTTGGGCACTGTTTGGCTCTATTTATGCAGATATGCTTTTGGAGTGGCAGGAAGGGAGAGCACTGGACTGTATTGCTCTGAACTATACAGTGGCCATAATTTGTGTTAAAAATCAAATCGATATGCAAAAATTGATCTTAAGGCAGAAAATATCTCGTCTTCCAGGTACTAAAACCTGTGAGAGGTGGGCGCTGCATGGGAGTGCCCCCACAGCAAGGTCTCTTAGCAAGAGGGTGGCGTCTCTCTGTCATTGGGGGAGAAGATCACGGTTCTCTTAGTGTTCATTTTCATGATTTAGTGTTTCCATTTCCTTATTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATACCCACCCACCCCCATTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGAGTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGGGGTACTGCTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGTTCCTTGGGTGCTTTCTCTAGTTCCTCCATTGGGGGCCCAGTGGTCCATTCAATAGCTAACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCTGGCATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAAGCTGACCATGGGATGGATCTCTGGATATGGCAATCACTGGATGGTCCATCCTTTGGTCACACTTCCAAATTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGTTTTGTTTCCTATTCTAAGGGGCAGAGTGTCCACTCTTTGGTCTTCGTTCTCTTGAGTTTAATGTTTTTAGCAAATTATATCTTATATCTTGGTTATCCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGAGAGTTTCTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATGTACCACATTTTCTGTTGAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCGGTTGGGGCATCTTCTGGATATATGCCCAGAAGAGGTATTGCTGGATCTTTCGGTAGTAATATGTCCAATTTTCTAAGGAACCGCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTTGCAATCCCACCGACAATGGAGGAGTGTTCCTCGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTAATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATCTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGTATTCCTTGGGTGAGAAATCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTATGGAGTCTACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTCCCCTGTCCGATTTGGGATAGGTAAAGATCCTTTTCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCCCATTTATCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCTATTCAGGAATTTTCCCCCTGTACCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCTACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTAATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGTAATGGATCAATTCAAAATCTTCTACATGATAACAGCCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTGGGTCTTCAATTCTGTTCCATTGGTCTACTTGTCTGTCGCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTAATCACAGTTGCTCTGTAGTACATCTTTAGGTCGGGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCTAGATGAATCTGCCGATTGCCCTTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGTTGGAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATAGCCATTTTTACTATATTGATCCTGCTGATCCATGAGCATGGGAGATCTTTCCATCTTCTGAGATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCTTGTCATACAGATCTTTCACTCCTTAGTTAGAGTCACGCCTAGGTATTTTATATTATTTGTGACTATTGAGAAGGGTGTTGTTTCCCTAATTTCTTTCTCAGCCTGTTTGTCCTATGTGTAGAGAAAGGCCATTGACTTGTTTGAGTTAATTTTATATCCAGCTACTTCACTGAAGCTGTTTATCAGGCTTAGGAGTTCTCTGGTGGAATTTTTAGGGTCACGTATATATACTATCATGTCATCTGCAAAAAGTGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTGTATCCCCTTGATCTCCTTTTGTTGTCTAATTGCTCTGGCTAGGACTTCAAGTACAATGTTGAATAGGTAGGGAGAGAGTGGACAGCCTTGTCTAGTCCCTGATTTTAGTGGGATTGCTTCAAGCTTCTCACTATTTACTTTGATGCTGGCTACTGGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAATTCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAAATGCTTTCTCAGCATCTAATGAGATGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATACTGGATTACGTTGATGGATTTCCGTATATTGAACCATCCCTGCATCCCTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTGTTTTGATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCAAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATCAATATTCATAAGGGATATTGGTCTGAAGTTCTCTATTTGTGGGGTCTTTTTGTGGTTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGCTTCATAGAATGAGTTGGGTAGAGTACCTTCCGTTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAGAACTGGGATTAGATCTTCTTTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACCCATCTGGTCCTGGGCTTTTTTTAGTTGGGAGACTATTAATGACTGCTTCTATTTCTTTGGGGGATATCGGGCTGTTTAGATCATTAACCTGATCTTGATTCAACTTTGGTACCTGGTATCTGTCTAGAAACTTCTCCATTTCATCCAGGTTCTCCAGTTTTGTTGAGTATAGCCTTTTGTAGAAGGATCTGATGGTGTTTTGGATTTCTTCGGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTAGAATGCTTTTCCTGTGCCCTCTAGTGAGTCTGGCTAAGGGTTTGTCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGAACCAGCTCCTCGATTGGTTGATTCTCTGAATAGTTCTTCTTGTTTCCACTTGGTTGATTTCGCCCCTGAGTTTGATTATTTCCTGCTGTCTACTCCTCTTGGGTGAATTTGCTTCCTTTTGTTCTAGAGCTTTTAGGTGTGTTGTCAAGCTGCTAATGTATGCTCTCTCTAGTTTCTTTTTGGAGGCACTCAGAGCTATGAGTTTTCCTCTTAGAAATGCTTGCATTGTGTCCCATAAGTTTGGGTATGAAGTGGCTTCATTTTCATTGAACTCTTAAGAAGTCCTTAATTTCTTTCTTTATTCCTTCCTTGACCAAGGTATCATTGAGAAGAGTGTTGTTCAGTTTCCACGTGAATGTTGGCTTTCTATTATTTATTTTGTTATTGAAGATCAGCCTTAGTGCATGGTGATCTGATAGGATGCATGGGACAATTTCAATATTTTTGAATCTGTTGAGGCCTGTTTTGTGACCTATTATGTGGTCAATTTTGGAGAAGGTACCATGAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATCCTTTTATTTTAGGATAAAATGTTCTGTAGATATCTGTCAGATCCATTTGTTTCATAACCTCTGTTAGTTTCACTGTGTCCCTGTTTAGTTTCTGTTTCTATGATCTGTCCATTGGTGAAAGTGGTGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGCTTTGAGCTTTACTAAAGTATCTTTAATGAATGTGGCTGCCCTTGTATTTGGAGCATAGATATTCAGAATTGATAGTTCCTCTTGGAGGATTTTACCCTTGATGAGAATGAAGTGCCCCTCC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Seq C2 exon
AAGTCTTAGAGGCTGGCGTTAAAGGAACTTCTGAGTCTCTTAAAGGTGTGAAACGAAAAAAGATTGTTGCTGAGAATCACCTGAAAAAAATACCAAAATCCCCCCTGAGGAATCCTCTTCAGACAAAACACAAGCAAAACACAGAAGAGCCGCCGTTCAGTGTCCTCCCGAGCGCATCAGAGTCTCATAAGAAACACAACTGTGTCCCTGCTAAACAGGGGAGGCAATTTACCAAGCAAAATGGAGAAACTCCAGGGATGACTGCTGAGTCCTCAGAATCTGGGGACTTGGTCTCCCCAAAGAAAACCTCCTCTCCTCACCAGCGGTCAGAACTGCGGAGATGGAGGTCGGAGGGTTCAGACCCAACCAGGCTCAGTGGCCTCGATGGGCAGCGGGACTCCAGCTCCTCCTCCAGTAAAGCCAGGACTGACAATAGTGAATGTAGCTCTCCTTGCTGTAGCACCACGCCCCCCTCCTATACAAGTACCGCGTTCGATGTCTTACTGAAAGCAATGGAGCCAGAACTGAGCACCTTGTCACAAAAGGGCTCATCTTGTGCAATTAAGACAGAAAAACTGAGACCAAATAAAACTGTAAGATCCCCTTCTAAATTAAAGAACAGCTCCCTGGATGCCCCAAATGCTACGTCCCCAGACCTGGTTGTCGAGTCGCCCTGTCCTCCGTGTACCTCGTACCCAGTACATGTGGCCTCCACTCAGAAGAGTGAACAAGTGGCAGCTCAGTGTGTTTCTCACCTGTACAGCTCACAGGACCACCTTGTTCCCAAACTTAGCCAACAGAATCAGCAGCTTCCGGGGCATCTGGGCTTCACAGGCTCACTGACAAACCTGCACACCCTTGAGAGCACTAAACTTGAGCCGATCTATAATACAGCAGTGACATCCACTGTAGGTCTCACTTCTCCCTCCACTAGAACTCAGGTCACTCCTCCACACCAGCAAATGGATTCTGTGTCACCTTTGTCAGTAAGCCCTGCCAGTTCCACACAGTCACCCCCAGGGCCAATTTACAGCTCAGCCCATGTTGCTTCTGTTGTCAGTCAAAGTGTAGAACAAATGTGCAGTCTCCTTCTTCGAGATCAGAAGCCAAAAAAACAAGGCAAATATATCTGTGAGTACTGCAATAGAGCATGTGCAAAGCCCAGCGTGCTTTTAAAGCATATCCGCTCCCACACTGGAGAGCGGCCTTACCCCTGTGTGACTTGTGGGTTTTCATTTAAGACTAAAAGTAACCTGTATAAGCACAAGAAGTCCCATGCACACACCATCAAACTGGGCCTTGTCTTACAACCAGAGGCTGGGGGCTTGTTCTTGTCCCAAGAGTGCCCCAAAGCACTTAGTGTCCATTCAGACATTGAAGACAGTGGGGAGAGCGATGAAGAGGGGCTTGCAGATGGGAGACAGAACAACCCATGTGTCAAGGACCTGCAACCTGTGCAAACAATGAAGACGGTATCGAATCCCGAATCTTTACCCAAATTGATACCAAGCAATTCAGATCATGTGGTCCGTGGCTTCTCTTCACAGGACAGACCTTCAGACTCACAAGCCCCGACAGAGTTACCAAAGGTTGTGGTCCACCCAGTAAGCATGCCCCCCTTGAAAACTGACTGTCTTCAGGTGGCCAATCCCAATCCTGAACTTCCTAGTCCACAGAGCCCGAGGGACCTTCATGTTGCAAGCATACTGTCACATTCAGCCAGTGTGTCATCCTTAGAGATGGATGAGTCGTGCCATCAGAAAGGGGATGTGATTCAGTCAGAAGGGAAGCCAGATTCTCACAGTGGAACAGCACATGCGCAGCTCCAGAGACAGCAGGCCACAGAGGACCCCCAGGAACAGCAGGGGAAGCTGCTGCTGAGTCCCCGGAGCTTAGGAAGTACAGACTCTGGCTACTTTTCACGGTCCGAGAGTGCTGATCAAGCCGTGAGTCCTCCAACTCCGTTTGCCAGAACTTTTCCCACCATGGACCCAGACCCAGCTAAGAACGGTGGAGCCCCAGGGCCTCGAATCAGTGCTCCAGCACCTTCTGCTTTGGCTACCGGAGAGAAGTCATCGGTCGTCACAGGCCAGATGCGCCCACCCTTGGCCACCAAAACTCTGGAGGAAAGGATTTCCAAGCTGATCTCAGACAATGAAGCCTTGGTTGATGATAAGCAACTGGATAGCGTGAAGCCCCGGAGAACCTCACTTTCTAGACGGGGAAGCATTGACTCCCCCAAATCATACATATTCAAAGATTCCTTCCAGTTTGACCTAAAACCGATGGGACGGAGAACAAGCTCCAGCTCTGATATACCAAAGTCCCCGTTCACCCCAACTGAGAAGTCAAAGCAGGTGTTCCTCCTGTCTGTCCCTTCCCTGGACTGCCTGCCTATCACCAGAAGTAACTCCATGCCAACCACGGGCTATTCAGCAATCCCTGCAAATATAATTCCTCCCCCTCCCTCTTTGAGAGGAAGCCAGTCATTTGATGATAAAATTGGCACCTTGTATGATGATGTCTTTGTGTCAGGACCCAACCCATCCATGCCCCCAAGTGGCCATCACCGTCCCCTGGTCAGACAGGCTGCAGTGGAAGACTCCACAGCCAGTGAGAGTCATGTTCCAGGCTCTGGGCAGTCTGTGGATGAGAGCTGTCAAGGGTGCCCATCCTCCAGTGAGGCTGGACCAGTACAGAGCAAAGCAGCGCAGACCCCTCACCTAGAGAAGAAGAAGTCACATCAAGGACGAGGAACCATGTTTGAGTGTGAAACCTGTCGAAATAGGTATCGGAAGCTGGAGAATTTTGAGAATCATAAGAAATTTTACTGTTCAGAGTTACATGGGCCCAAAACAAAGGCAGCTGTGAGAGAGGCAGAGCACGGCCCGGCACCCGGTGGGGCACAACCCCAGGTTCTCCACTACAGAGTTGCTGCTCCCACAGCTGTGTGGGAGCAGACACCCCAGATAAGAAAAAGGAGGAAGATGAAAAGCGTAGGCGATGAGGAGGACTTGCAGCCACATGAGAGTGGGCGGTCCCCAGAAAGCGCTGATGCCCTTCAGCTGCAGCCGGTCCCAGGGGCTGCTCCCAGTCCATCCAAACATACCTCTGCCACGGCAGCTGACCAGGCACACAGAGGCGTCCAGCTTGTGGCCCGGGGCCCTGAACGGGCCTTGCCCCTGAAGCAGTGCCCCATGGTTGAACAGCAGCTGAATGCTGCAGCTCAGGACAAGATGGAGGTGAAGAGACAAGGGGGTGGCATCTCTGTCATCCAGCACACCAACTCCCTGAGCAGGCCCAATTCATTTGACAAGCCAGAGCCCTTGGAAGGGGGCATCACCTTTTCTTTACAGGAGTTAGGCAGAACTGGGATGCCTGGGGCCCTGAAAGTGATAGGAATGGCCCCAGAGGAAGGCCACCCACCTCAGGATGCCATGCATCAGACAGCACTGTCACATAACCTTAGAGGAGAGCCACGGGAAAGTGCTAGAAAGATTCCAAGTGAGCGGTATGTGTTAGGGCAGCCCTTGAGACTTGTCCGGCAGCACAACATCCAGGTCCCAGAAATTCTGGTCACTGAAGAGCCAGACCGGGACCTGGAAGCCCAGAGTCACGATGAAGAAAAGTCAGAGAAGTTCACTTGGCCTCAGCGTAGTGAAACCTTATCAAAGCTGCCAACAGAAAAGCTGCCACCTAAAAAGAAAAGGCTTCGGCTGGCTGAGATAGAGCACTCCTCAACCGAGTCAAGCTTCGAGTCCACTCTGTCCCGGAGTCTCAGCAGAGAGAGCAGCTTATCCCATGCATCTAGCTTCTCTGCCTCCCTAGACCTAGAAGACATTTCTAAAGTAGAGCTGGCCCCCAAAATTGACTTTCCAAGCAAAGCAGAGTTTCTTTTGATTCCACTGGGTTCAAACACACTGAGTGTCCCCGGAAGTCACAGGGAAATGAGGCGGGCGGCATCAGAGCAGATCAGTTGCGTGCCTACACTGATGGAGGTCTCTGATTTCAGAAGTAAGTCATTCGACTGCGGGAGCATTGCTCCTTCCCACGTGGTGCCAGCACTTGTTGAATCACAGCCCTCCTACTCCCCATCTGCTGTTGGGGGCACTGCACACGTGCCCCTTCTAGAACGGAGGCGAGGTCCCCTGATTCGGCAAATATCTTTAAACATAGCTTCAGATAGTCACCTCTCTCCTGGCAGTGCAGCAGCTCTCCAAACCATTGTTCTTCCTAGTGTGAACACAGTGCCGTTTCAGGCTCCGAGGCTCCCCGATATGGCTTCTGCTGACTGCCCTGCACATACTGTGCACCCCCAGGCCCTGGCTAAAGATCTTCAGGCAGAAATTTCAAGTTCCAGCTCTACGGACACATTTCCTCCTCAACAACTTTTTGGTGCCCATTTATTAAACAAAACCAATACATCCCTTAGTCACCAAAACACACCACTGCCTCTGCCAGTGTCTGCACAGGGTGGCAAACCAGATGCAGCACCCACTGCATGTGTGTCTTCGACAGGGGAGGGTAGCTTTGCTCCCAAGTACCAGCTTCAGTGTCAGGCCTTCACTTCAGACCAGGGTTGCTCTGCTCCTCTGCGTTCTTCACCTAATCAAGTTCTTCCAGGTCAAGCTGGAGCAGATCCATGCCCAGCGTCAGAAGCACCGCCAGCCAAAGCAGCCGATCCCATGGCTAAACCGTGCCCTCTGCCGCCGCTGGAGCTCGGGCTCCCGAGGGATGAGGTGCTGCAGAAGCAGCTGCCCTCCTTTGTGCTGCCCGTGCCCCAAAAGAGGAACGTGACAGTGGACTGTTTCACTCCTGTCACATCTCTGCCACAGATCTTAGTGACCCAGGATCTGCCCAACATGCCAATTTGCCAAACTAATCAAAGTCTAGTGCCAGTCAGCGAAGAACAAAATTCCATGCCAAAATCACAGAACTATCTCCAAAATGCATCGCCTACACCGGAGAAGGAGCTTGCATGCAAAACTGTTCTCCCAGAGGTGGGCCAGAGTGTTCCAGTTTCAGAGTCCTCGCCGACAGTTCAGAAGGTGTCTGTTGGTAGACTCTCCCCACAACAAGAATCCTCAGCCTCCAGTAAAAGGATGCTTTCCCCAGCAAATAGTTTAGACATTGCCATGGAAAAGCATCAGAAGCGGGCTAAAGATGAGAACGGAGCTGTTTGTAGCACAAACATAAGAGCGCTGGAGCTGCCAAGCTCAAGAGCTAATGAGAGCCATAAACAAAAGAAGCCAGTCCTGGTAAGGCAGCTCTGTACCACGGAGCCCCTTGAAGGAGCGGCGCTGGAACAGGGTGCTTGCTCGGCCTCTGGAAGGAGCAGCAACAAGGCTGCTAATTTGACTCAGGTTTTACCAACTGATAGTCTGTCATCCAGACCCTCCACGTTTGCAGTCACAGACCATGTCAATGAATTGCAGGAGTTTAAAAACACCAAGGTGTCCACATCTCTGACTCCTACAGTGGGAAGTTTCCCTGCTCCATCGGAAAGTGCCTGTGTTTTGCCTTTGAAGTCTATAGACAACAACCAGGAAAAGGGGTCGCCAGGGGTTAGACATGAAGAGAACAAGGTCATCCAAGGGCAGAGGCCGCCTCTAGTGTCTGGTCTTTCATTGGTGAGCAGCTCAGACACTCAACAGCCGTCATTTCCCAGCCTCAAGACTGCAACTAGCTTTACATGGTGTTACCTGCTGAGACAGAAGGCATTGCCGTTGGCTCAGAATGACCAGAAAACTTCAGCCTATACGGGGTGGACAGTAAGCTCCAGTAACCCAAATCCACTTGGTTTGCCTACAAAAGTTGCTCTTTCTCTTCTTAATTCTAAACAGAAGACTGGAAAGTCACTGTATTGCCAAGCAATAACCACCCATTCAAAATCAGATTTAGTGGTCTATTCAAGCAAGTGGAAAAACAACTTAAGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000021366:ENSMUST00000060148:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.678
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=1.3),PF139121=zf-C2H2_6=WD(100=1.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types