Special

MmuINT0077932 @ mm9

Intron Retention

Gene
Description
human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:96100]
Coordinates
chr13:42218529-42255687:+
Coord C1 exon
chr13:42218529-42218582
Coord A exon
chr13:42218583-42249748
Coord C2 exon
chr13:42249749-42255687
Length
31166 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGT
5' ss Score
11
3' ss Seq
TTTCTTTTTTGTCTTAACAGAAG
3' ss Score
10.16
Exon sequences
Seq C1 exon
ACAAAATCGAAGAAGCACAAAAAGAGCTTAATGGGGCAGAAGTTTCCAAAAAAG
Seq A exon
GTAAGTTAAAAAAAAAAAAAATCAACCTTGTGTGACGTCATTCTTTCAGAGTTGCCCGTAGGATCTCTCAGAATTATGCCTTCCCTGCCAGAAGCTGGTGCTGAAGTTCTGGACGTCCTGGGCCGTCTCAGCACCACCGTCAGTGTGTTTCTCTGGTACCCGTGTCCCACTGCTGGCAATAGAAAAGAGGGCACTGCTCCTTTGGGAGCGCTGCAGGAACCTGTCACGTAGTAGCATAGGCCGTGTGGATACCGTGATCCACATGTATGTTCTGCTGTAAGACAGGCATGCTTGGTTGAAGAAACTCATGCAGGATTTAAAAACTGTTAATTATTTCAAAGGACGGTGATGACTTTGTTAAATAAGAAAAATCTCAAATACAGCATATAAACAATTTTTTCCATGTATGTGAAAACAGGTCAGGGGTGTGGCCTCCTATATGTAGCAATAAATATGTGTAAACACACGTACGGGGTTGGGCACTGTTTGGCTCTATTTATGCAGATATGCTTTTGGAGTGGCAGGAAGGGAGAGCACTGGACTGTATTGCTCTGAACTATACAGTGGCCATAATTTGTGTTAAAAATCAAATCGATATGCAAAAATTGATCTTAAGGCAGAAAATATCTCGTCTTCCAGGTACTAAAACCTGTGAGAGGTGGGCGCTGCATGGGAGTGCCCCCACAGCAAGGTCTCTTAGCAAGAGGGTGGCGTCTCTCTGTCATTGGGGGAGAAGATCACGGTTCTCTTAGTGTTCATTTTCATGATTTAGTGTTTCCATTTCCTTATTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATACCCACCCACCCCCATTCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGAGTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGACAAGAGCTCCGGGGTACTGCTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGTTCCTTGGGTGCTTTCTCTAGTTCCTCCATTGGGGGCCCAGTGGTCCATTCAATAGCTAACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCTGGCATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATATCTGGGTCCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGAAGCTGACCATGGGATGGATCTCTGGATATGGCAATCACTGGATGGTCCATCCTTTGGTCACACTTCCAAATTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGTTTTGTTTCCTATTCTAAGGGGCAGAGTGTCCACTCTTTGGTCTTCGTTCTCTTGAGTTTAATGTTTTTAGCAAATTATATCTTATATCTTGGTTATCCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATTGTGAGAGTTTCTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGATGATGCCCTCCAGGTCCATCCATTTGGCTAGGAATTTCATAAATTCATTCTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTCCATTGTGTAAATGTACCACATTTTCTGTTGAGGGGCATCTGGGTTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTACCGGTTGGGGCATCTTCTGGATATATGCCCAGAAGAGGTATTGCTGGATCTTTCGGTAGTAATATGTCCAATTTTCTAAGGAACCGCCAGACTGATTTCCAGAGTGGTTGTACAAGCTTGCAATCCCACCGACAATGGAGGAGTGTTCCTCGTTCCTCTTTCTCCACATCCTCGCCAGCATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTTGTTTTAATTTGCATTTCCCTGATGATTAAGGATGTTGAACATCTTTTCAGGTGCTTCTCTGCCATTCGGTATTCCTTGGGTGAGAAATCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTATGGAGTCTACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTCCCCTGTCCGATTTGGGATAGGTAAAGATCCTTTTCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCCCATTTATCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCTATTCAGGAATTTTCCCCCTGTACCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCTACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTAATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGTAATGGATCAATTCAAAATCTTCTACATGATAACAGCCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTGGGTCTTCAATTCTGTTCCATTGGTCTACTTGTCTGTCGCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTAATCACAGTTGCTCTGTAGTACATCTTTAGGTCGGGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTCTAGATGAATCTGCCGATTGCCCTTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGTTGGAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATAGCCATTTTTACTATATTGATCCTGCTGATCCATGAGCATGGGAGATCTTTCCATCTTCTGAGATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCTTGTCATACAGATCTTTCACTCCTTAGTTAGAGTCACGCCTAGGTATTTTATATTATTTGTGACTATTGAGAAGGGTGTTGTTTCCCTAATTTCTTTCTCAGCCTGTTTGTCCTATGTGTAGAGAAAGGCCATTGACTTGTTTGAGTTAATTTTATATCCAGCTACTTCACTGAAGCTGTTTATCAGGCTTAGGAGTTCTCTGGTGGAATTTTTAGGGTCACGTATATATACTATCATGTCATCTGCAAAAAGTGATAATTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTGTATCCCCTTGATCTCCTTTTGTTGTCTAATTGCTCTGGCTAGGACTTCAAGTACAATGTTGAATAGGTAGGGAGAGAGTGGACAGCCTTGTCTAGTCCCTGATTTTAGTGGGATTGCTTCAAGCTTCTCACTATTTACTTTGATGCTGGCTACTGGTTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGTTTAGGTATGGGCCTTGAATTCCTGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAAATGCTTTCTCAGCATCTAATGAGATGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATACTGGATTACGTTGATGGATTTCCGTATATTGAACCATCCCTGCATCCCTGGGATGAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTGTTTTGATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCAAGAACTTTATTGAGGATTTTTGCATCAATATTCATAAGGGATATTGGTCTGAAGTTCTCTATTTGTGGGGTCTTTTTGTGGTTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGCTTCATAGAATGAGTTGGGTAGAGTACCTTCCGTTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGAAGAACTGGGATTAGATCTTCTTTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACCCATCTGGTCCTGGGCTTTTTTTAGTTGGGAGACTATTAATGACTGCTTCTATTTCTTTGGGGGATATCGGGCTGTTTAGATCATTAACCTGATCTTGATTCAACTTTGGTACCTGGTATCTGTCTAGAAACTTCTCCATTTCATCCAGGTTCTCCAGTTTTGTTGAGTATAGCCTTTTGTAGAAGGATCTGATGGTGTTTTGGATTTCTTCGGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTAGAATGCTTTTCCTGTGCCCTCTAGTGAGTCTGGCTAAGGGTTTGTCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGAACCAGCTCCTCGATTGGTTGATTCTCTGAATAGTTCTTCTTGTTTCCACTTGGTTGATTTCGCCCCTGAGTTTGATTATTTCCTGCTGTCTACTCCTCTTGGGTGAATTTGCTTCCTTTTGTTCTAGAGCTTTTAGGTGTGTTGTCAAGCTGCTAATGTATGCTCTCTCTAGTTTCTTTTTGGAGGCACTCAGAGCTATGAGTTTTCCTCTTAGAAATGCTTGCATTGTGTCCCATAAGTTTGGGTATGAAGTGGCTTCATTTTCATTGAACTCTTAAGAAGTCCTTAATTTCTTTCTTTATTCCTTCCTTGACCAAGGTATCATTGAGAAGAGTGTTGTTCAGTTTCCACGTGAATGTTGGCTTTCTATTATTTATTTTGTTATTGAAGATCAGCCTTAGTGCATGGTGATCTGATAGGATGCATGGGACAATTTCAATATTTTTGAATCTGTTGAGGCCTGTTTTGTGACCTATTATGTGGTCAATTTTGGAGAAGGTACCATGAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATCCTTTTATTTTAGGATAAAATGTTCTGTAGATATCTGTCAGATCCATTTGTTTCATAACCTCTGTTAGTTTCACTGTGTCCCTGTTTAGTTTCTGTTTCTATGATCTGTCCATTGGTGAAAGTGGTGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGCTTTGAGCTTTACTAAAGTATCTTTAATGAATGTGGCTGCCCTTGTATTTGGAGCATAGATATTCAGAATTGATAGTTCCTCTTGGAGGATTTTACCCTTGATGAGAATGAAGTGCCCCTCC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Seq C2 exon
AAGTCTTAGAGGCTGGCGTTAAAGGAACTTCTGAGTCTCTTAAAGGTGTGAAACGAAAAAAGATTGTTGCTGAGAATCACCTGAAAAAAATACCAAAATCCCCCCTGAGGAATCCTCTTCAGACAAAACACAAGCAAAACACAGAAGAGCCGCCGTTCAGTGTCCTCCCGAGCGCATCAGAGTCTCATAAGAAACACAACTGTGTCCCTGCTAAACAGGGGAGGCAATTTACCAAGCAAAATGGAGAAACTCCAGGGATGACTGCTGAGTCCTCAGAATCTGGGGACTTGGTCTCCCCAAAGAAAACCTCCTCTCCTCACCAGCGGTCAGAACTGCGGAGATGGAGGTCGGAGGGTTCAGACCCAACCAGGCTCAGTGGCCTCGATGGGCAGCGGGACTCCAGCTCCTCCTCCAGTAAAGCCAGGACTGACAATAGTGAATGTAGCTCTCCTTGCTGTAGCACCACGCCCCCCTCCTATACAAGTACCGCGTTCGATGTCTTACTGAAAGCAATGGAGCCAGAACTGAGCACCTTGTCACAAAAGGGCTCATCTTGTGCAATTAAGACAGAAAAACTGAGACCAAATAAAACTGTAAGATCCCCTTCTAAATTAAAGAACAGCTCCCTGGATGCCCCAAATGCTACGTCCCCAGACCTGGTTGTCGAGTCGCCCTGTCCTCCGTGTACCTCGTACCCAGTACATGTGGCCTCCACTCAGAAGAGTGAACAAGTGGCAGCTCAGTGTGTTTCTCACCTGTACAGCTCACAGGACCACCTTGTTCCCAAACTTAGCCAACAGAATCAGCAGCTTCCGGGGCATCTGGGCTTCACAGGCTCACTGACAAACCTGCACACCCTTGAGAGCACTAAACTTGAGCCGATCTATAATACAGCAGTGACATCCACTGTAGGTCTCACTTCTCCCTCCACTAGAACTCAGGTCACTCCTCCACACCAGCAAATGGATTCTGTGTCACCTTTGTCAGTAAGCCCTGCCAGTTCCACACAGTCACCCCCAGGGCCAATTTACAGCTCAGCCCATGTTGCTTCTGTTGTCAGTCAAAGTGTAGAACAAATGTGCAGTCTCCTTCTTCGAGATCAGAAGCCAAAAAAACAAGGCAAATATATCTGTGAGTACTGCAATAGAGCATGTGCAAAGCCCAGCGTGCTTTTAAAGCATATCCGCTCCCACACTGGAGAGCGGCCTTACCCCTGTGTGACTTGTGGGTTTTCATTTAAGACTAAAAGTAACCTGTATAAGCACAAGAAGTCCCATGCACACACCATCAAACTGGGCCTTGTCTTACAACCAGAGGCTGGGGGCTTGTTCTTGTCCCAAGAGTGCCCCAAAGCACTTAGTGTCCATTCAGACATTGAAGACAGTGGGGAGAGCGATGAAGAGGGGCTTGCAGATGGGAGACAGAACAACCCATGTGTCAAGGACCTGCAACCTGTGCAAACAATGAAGACGGTATCGAATCCCGAATCTTTACCCAAATTGATACCAAGCAATTCAGATCATGTGGTCCGTGGCTTCTCTTCACAGGACAGACCTTCAGACTCACAAGCCCCGACAGAGTTACCAAAGGTTGTGGTCCACCCAGTAAGCATGCCCCCCTTGAAAACTGACTGTCTTCAGGTGGCCAATCCCAATCCTGAACTTCCTAGTCCACAGAGCCCGAGGGACCTTCATGTTGCAAGCATACTGTCACATTCAGCCAGTGTGTCATCCTTAGAGATGGATGAGTCGTGCCATCAGAAAGGGGATGTGATTCAGTCAGAAGGGAAGCCAGATTCTCACAGTGGAACAGCACATGCGCAGCTCCAGAGACAGCAGGCCACAGAGGACCCCCAGGAACAGCAGGGGAAGCTGCTGCTGAGTCCCCGGAGCTTAGGAAGTACAGACTCTGGCTACTTTTCACGGTCCGAGAGTGCTGATCAAGCCGTGAGTCCTCCAACTCCGTTTGCCAGAACTTTTCCCACCATGGACCCAGACCCAGCTAAGAACGGTGGAGCCCCAGGGCCTCGAATCAGTGCTCCAGCACCTTCTGCTTTGGCTACCGGAGAGAAGTCATCGGTCGTCACAGGCCAGATGCGCCCACCCTTGGCCACCAAAACTCTGGAGGAAAGGATTTCCAAGCTGATCTCAGACAATGAAGCCTTGGTTGATGATAAGCAACTGGATAGCGTGAAGCCCCGGAGAACCTCACTTTCTAGACGGGGAAGCATTGACTCCCCCAAATCATACATATTCAAAGATTCCTTCCAGTTTGACCTAAAACCGATGGGACGGAGAACAAGCTCCAGCTCTGATATACCAAAGTCCCCGTTCACCCCAACTGAGAAGTCAAAGCAGGTGTTCCTCCTGTCTGTCCCTTCCCTGGACTGCCTGCCTATCACCAGAAGTAACTCCATGCCAACCACGGGCTATTCAGCAATCCCTGCAAATATAATTCCTCCCCCTCCCTCTTTGAGAGGAAGCCAGTCATTTGATGATAAAATTGGCACCTTGTATGATGATGTCTTTGTGTCAGGACCCAACCCATCCATGCCCCCAAGTGGCCATCACCGTCCCCTGGTCAGACAGGCTGCAGTGGAAGACTCCACAGCCAGTGAGAGTCATGTTCCAGGCTCTGGGCAGTCTGTGGATGAGAGCTGTCAAGGGTGCCCATCCTCCAGTGAGGCTGGACCAGTACAGAGCAAAGCAGCGCAGACCCCTCACCTAGAGAAGAAGAAGTCACATCAAGGACGAGGAACCATGTTTGAGTGTGAAACCTGTCGAAATAGGTATCGGAAGCTGGAGAATTTTGAGAATCATAAGAAATTTTACTGTTCAGAGTTACATGGGCCCAAAACAAAGGCAGCTGTGAGAGAGGCAGAGCACGGCCCGGCACCCGGTGGGGCACAACCCCAGGTTCTCCACTACAGAGTTGCTGCTCCCACAGCTGTGTGGGAGCAGACACCCCAGATAAGAAAAAGGAGGAAGATGAAAAGCGTAGGCGATGAGGAGGACTTGCAGCCACATGAGAGTGGGCGGTCCCCAGAAAGCGCTGATGCCCTTCAGCTGCAGCCGGTCCCAGGGGCTGCTCCCAGTCCATCCAAACATACCTCTGCCACGGCAGCTGACCAGGCACACAGAGGCGTCCAGCTTGTGGCCCGGGGCCCTGAACGGGCCTTGCCCCTGAAGCAGTGCCCCATGGTTGAACAGCAGCTGAATGCTGCAGCTCAGGACAAGATGGAGGTGAAGAGACAAGGGGGTGGCATCTCTGTCATCCAGCACACCAACTCCCTGAGCAGGCCCAATTCATTTGACAAGCCAGAGCCCTTGGAAGGGGGCATCACCTTTTCTTTACAGGAGTTAGGCAGAACTGGGATGCCTGGGGCCCTGAAAGTGATAGGAATGGCCCCAGAGGAAGGCCACCCACCTCAGGATGCCATGCATCAGACAGCACTGTCACATAACCTTAGAGGAGAGCCACGGGAAAGTGCTAGAAAGATTCCAAGTGAGCGGTATGTGTTAGGGCAGCCCTTGAGACTTGTCCGGCAGCACAACATCCAGGTCCCAGAAATTCTGGTCACTGAAGAGCCAGACCGGGACCTGGAAGCCCAGAGTCACGATGAAGAAAAGTCAGAGAAGTTCACTTGGCCTCAGCGTAGTGAAACCTTATCAAAGCTGCCAACAGAAAAGCTGCCACCTAAAAAGAAAAGGCTTCGGCTGGCTGAGATAGAGCACTCCTCAACCGAGTCAAGCTTCGAGTCCACTCTGTCCCGGAGTCTCAGCAGAGAGAGCAGCTTATCCCATGCATCTAGCTTCTCTGCCTCCCTAGACCTAGAAGACATTTCTAAAGTAGAGCTGGCCCCCAAAATTGACTTTCCAAGCAAAGCAGAGTTTCTTTTGATTCCACTGGGTTCAAACACACTGAGTGTCCCCGGAAGTCACAGGGAAATGAGGCGGGCGGCATCAGAGCAGATCAGTTGCGTGCCTACACTGATGGAGGTCTCTGATTTCAGAAGTAAGTCATTCGACTGCGGGAGCATTGCTCCTTCCCACGTGGTGCCAGCACTTGTTGAATCACAGCCCTCCTACTCCCCATCTGCTGTTGGGGGCACTGCACACGTGCCCCTTCTAGAACGGAGGCGAGGTCCCCTGATTCGGCAAATATCTTTAAACATAGCTTCAGATAGTCACCTCTCTCCTGGCAGTGCAGCAGCTCTCCAAACCATTGTTCTTCCTAGTGTGAACACAGTGCCGTTTCAGGCTCCGAGGCTCCCCGATATGGCTTCTGCTGACTGCCCTGCACATACTGTGCACCCCCAGGCCCTGGCTAAAGATCTTCAGGCAGAAATTTCAAGTTCCAGCTCTACGGACACATTTCCTCCTCAACAACTTTTTGGTGCCCATTTATTAAACAAAACCAATACATCCCTTAGTCACCAAAACACACCACTGCCTCTGCCAGTGTCTGCACAGGGTGGCAAACCAGATGCAGCACCCACTGCATGTGTGTCTTCGACAGGGGAGGGTAGCTTTGCTCCCAAGTACCAGCTTCAGTGTCAGGCCTTCACTTCAGACCAGGGTTGCTCTGCTCCTCTGCGTTCTTCACCTAATCAAGTTCTTCCAGGTCAAGCTGGAGCAGATCCATGCCCAGCGTCAGAAGCACCGCCAGCCAAAGCAGCCGATCCCATGGCTAAACCGTGCCCTCTGCCGCCGCTGGAGCTCGGGCTCCCGAGGGATGAGGTGCTGCAGAAGCAGCTGCCCTCCTTTGTGCTGCCCGTGCCCCAAAAGAGGAACGTGACAGTGGACTGTTTCACTCCTGTCACATCTCTGCCACAGATCTTAGTGACCCAGGATCTGCCCAACATGCCAATTTGCCAAACTAATCAAAGTCTAGTGCCAGTCAGCGAAGAACAAAATTCCATGCCAAAATCACAGAACTATCTCCAAAATGCATCGCCTACACCGGAGAAGGAGCTTGCATGCAAAACTGTTCTCCCAGAGGTGGGCCAGAGTGTTCCAGTTTCAGAGTCCTCGCCGACAGTTCAGAAGGTGTCTGTTGGTAGACTCTCCCCACAACAAGAATCCTCAGCCTCCAGTAAAAGGATGCTTTCCCCAGCAAATAGTTTAGACATTGCCATGGAAAAGCATCAGAAGCGGGCTAAAGATGAGAACGGAGCTGTTTGTAGCACAAACATAAGAGCGCTGGAGCTGCCAAGCTCAAGAGCTAATGAGAGCCATAAACAAAAGAAGCCAGTCCTGGTAAGGCAGCTCTGTACCACGGAGCCCCTTGAAGGAGCGGCGCTGGAACAGGGTGCTTGCTCGGCCTCTGGAAGGAGCAGCAACAAGGCTGCTAATTTGACTCAGGTTTTACCAACTGATAGTCTGTCATCCAGACCCTCCACGTTTGCAGTCACAGACCATGTCAATGAATTGCAGGAGTTTAAAAACACCAAGGTGTCCACATCTCTGACTCCTACAGTGGGAAGTTTCCCTGCTCCATCGGAAAGTGCCTGTGTTTTGCCTTTGAAGTCTATAGACAACAACCAGGAAAAGGGGTCGCCAGGGGTTAGACATGAAGAGAACAAGGTCATCCAAGGGCAGAGGCCGCCTCTAGTGTCTGGTCTTTCATTGGTGAGCAGCTCAGACACTCAACAGCCGTCATTTCCCAGCCTCAAGACTGCAACTAGCTTTACATGGTGTTACCTGCTGAGACAGAAGGCATTGCCGTTGGCTCAGAATGACCAGAAAACTTCAGCCTATACGGGGTGGACAGTAAGCTCCAGTAACCCAAATCCACTTGGTTTGCCTACAAAAGTTGCTCTTTCTCTTCTTAATTCTAAACAGAAGACTGGAAAGTCACTGTATTGCCAAGCAATAACCACCCATTCAAAATCAGATTTAGTGGTCTATTCAAGCAAGTGGAAAAACAACTTAAGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000021366-Hivep1:NM_007772:3
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.911 A=NA C2=0.678
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=1.3),PF139121=zf-C2H2_6=WD(100=1.4)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal4)
ALTERNATIVE
Zebrafish
(danRer10)
LOW PSI
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Pre-implantation embryo development
  • Muscular differentiation time course
  • Spermatogenesis cell types
  • Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
  • Hematopoietic precursors and cell types