HsaINT0076367 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000156515 | HK1
Description
hexokinase 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:4922]
Coordinates
chr10:71055389-71103745:+
Coord C1 exon
chr10:71055389-71055436
Coord A exon
chr10:71055437-71103582
Coord C2 exon
chr10:71103583-71103745
Length
48146 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAAGA
5' ss Score
10.06
3' ss Seq
TCCTTCTCATCCCCCTCCAGATT
3' ss Score
10.75
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Other Inclusion Isoforms:
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Associated events
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Rat
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)