HsaINT0086386 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000122733 | KIAA1045
Description
KIAA1045 [Source:HGNC Symbol;Acc:29180]
Coordinates
chr9:34958192-34971673:+
Coord C1 exon
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chr9:34971292-34971673
Length
12893 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCGGTAAGC
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000122733-KIAA1045:NM_015297:1
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.746
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)