HsaINT0099911 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000136536 | MARCH7
Description
membrane associated ring-CH-type finger 7 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17393]
Coordinates
chr2:159729009-159743253:+
Coord C1 exon
chr2:159729009-159729175
Coord A exon
chr2:159729176-159743060
Coord C2 exon
chr2:159743061-159743253
Length
13885 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAACA
5' ss Score
8.88
3' ss Seq
AAATTTTTTTGAACTCACAGTCT
3' ss Score
4.97
Exon sequences
Seq C1 exon
AAAAATCTTTAAGAATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGATGTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAATATCAG
Seq A exon
GTAACATTTTTATTTGGAATATATGTATACAGCCTTTTTCAAAATCCCTAGGGCCACTCTTTTGGGGGTATTTAAAAAATGTGTTAGCTGGATCTGAGGCATCCTGTAATCAAAACCAATATATATGTAGCAAAATGAATAACATTTTTCAAACTTTTTGGACTTCAGAATTATGGATAACAGATTGTAACCTCATATAAAATCATACTTTTGCGCTGGGAACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGCAGGCTGAGACTGGCAGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGACGAAACCCCGTCTCGACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGACATGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAAGAGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGAGACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATGCTTTCCAAAGACTTGGAAAACCTTGTACGTAAAAACATAAGTATAAATTTAACTAAACTGGTCAATCAATGTGAATGGCTTTGTCAGAGGAACAAAAACTGTACCTCCTTTCCCTCTAAGATCACACTGATTCATCTGACTTTTCTCTGCATATACACAAAGCAGTGGTGAAATAACAAATGTTAAGTGTTTTTCTGTGAGATTATAACTTCTAAATATTTTGCTTTGAATGTTGAATAATTTTTAAATTAACAGGTTATCTTTTTATGAAAGTGCTAAAAGTCTTTTACATGAATTTTTAAATTTGATTTTTATGGTGAGTAATGAGTTTGTATTGGTATGTCCATCTACTCTTATGTAGCTAGTTTTCGTTAGGACCACAAGCTTTTTGTTTTGTTTGAAACAGGGTTTTGCTATGTTGCCCAGACTGGTCTCAAACTCTGGCTCAAATGACTCTCCCACCTCATTCTCCTGAGTAGCTGAGATTATAGGCACATGCCCACCATGCCTGGCTAGTTCTTTGGCTTTTGAAATGGCTTATCATTGTAGCAAATTTAAGCTCATTGCATTTTTGGCTGAATGTTATAATTAATGTTTGATTTGCAAAAGTCTGATGTTGAGGTAATCTAAAAGAATCCTTTGAAAATTTCTTTGTGTTAAGTATTTATATATTTATATGTTATGTGATCTGATATATGACAAAGTCTCATAAAAATGTTCGTACACAGTAGTAAGCATTCTTTAAGATATTCAGAGCAAGACTGAAGTAAAAAACAAAACAAAACAAAAAATGAAAATGCTCATATCTACTACCCATTTCTTAATTGACTTTATATGAACTGTTTACCTGGTCTCTATTTTATTTTAAACTGCAGCTCAGCGGAACCTAGTCTCATTTTAAATGTCAATTGATACTGTACATTTTCTGCTTCTAGACAAGTTTATGATTCCTAGAGGTGTAGAATCATATATTTTGCCTTCTGTAGAAATGTCATGGTGACATATAAAGGGCACAGAATTGTGTTTTCCTGTATTGTCTTCATAAAATTTTGTCTACTCATTTTTGTCTAATTTTAAAAATATATATAGCTTATTAATGAGGAACACAAATTTTGAAACCAGACTGTACTGCCTAGAGAGGAGTCATGTTTCATGACTTACTAGCTATTGACATCTTTTTCTGTTGTGATTGTTTTTGATTGTTTGTTTGTTTCTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGAGTGGTGCAATCACGGCTCACTACAGCCTAGACCTCCCAGGCTCAAGTGGTCCTCTCACCTCAGCCTCTCCTCCAGCAGCTAGGACTGCAGGGACGTGCCACCATGCCTAGCTAATTTTTGTGTTTTTTTGAAGAGATGGGGTTTCGCTATGTTGCCCAGGCAGGTCTCACACTCCTGGGCTCAACCATTCTGCCCACCTTCCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCTGGCCGACATCTTTTTGTATCACCTACTTTATCCAGTTGTTATAGTTACATGACAATGCTTTATGTTAAATGATAATAGTGCCTGGCATATGATAAATACTATATAAATGTTAGCTACTGTTGCATGTTTTTTATAATTGTTATAATAATTATTATAATAGTGTAGGTGCTAAAATCCTGAATATATTTAGTAAATTTATTGACATTCTCCTTAAGATATGACCGTTTTCAAACTGTTTCTTCTAACTTGTTAATGTTGTAGATTATTCAAAAAAGTTCATTTCTGGCCTGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGTTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCTGGAGACGGAAGTTGCCATGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAATTCCATTTCTTATTATGTTAAACAAATAGCATTTTTTAAAAAAAACCATTTAAATTTCAGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTTAGGCAGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCCACTAAAATTACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCTGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAATCAAGATCACGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAATTTAAATGTCATGTTAATGACTTCAAAATGACCCCACCTAAATGATGGTTGTAGTAACATATTAGTGTTGATTTCATTCTGTTCCAAAATTTTCATGTATTTAAGTACCCAAGTAAAATTCAAAAATTACTTGCAAACATCCAAAAACCAAGTAGAATTTTTAAAATCTTTATTGATTCTTAAGATAAATTATTTTTATAAATTTTAGGTATTTTCTAAATGCTTTTTAGTTGCTTTAAGTTGCTTACAATCAGTTTTTTAATCGCTTTTTTCTTTTTAATGGTATGGGAGCAGTTTCAGCCATAAGTCAACCATTTTTAGGCTGCTTTGCTTATTTAGTTTTGATTTAGAAATTGAAACTCCTGTGTTCTTGAACAAAGTGTTACACTTTTTAAGAGACAGGGTCCTGCTCTGTCACCCAGCTTGTAGTGTAGTTGAGCAATCATGACTCGGCGCAGCCACAACTTTCTGGGCACAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGATGCGCAGCCCCCTGCCACACACACACACGTGGCTAATTTTTTAAAAAATTTTTCTTATAGAGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTGGATTCAAACTCCTGGCCTCCAGCAGTACTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGACATCTGCCATCATGCCTGGCCTGTATTTTATTTATCTGTATTTTCTTCTGTGAAATGGTGATAGTGATAGCGGTTTCTTCATACAGCCACATCTATATGTGAGATGTAAGATGAACAAGATTGTTCATCTTAATTGTTAAGATTAATTGAAAGAAAGAATACATGTGAAGCACTTGGAACAGTGCCTAGAACATAGTATAGGGGTTCAGGTGTTACTAATTATAATTATTTATAATTGTTATTTTTATTTAGTTATAATTATTTATAATTGTTAACTTTTACTGTTACCATTATTATTTCCTGGCTTTACATTGGTTTAAGATAATATCTGTAGGGTATAGTATAATGTTATCCAAATATTAAATTACATATAGTATGTTTAGTTTTATTTAGCATTGTTAAGATTACTCAGTGTCAAAGGGAGCATTTTAAAATTATTTAGTTTTTGAGACGGGTTCTCACACTCACCCAGGTTGGAGTATAGTAGCACAATCTCAGCTCACTGAAGCCTCTGCCTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTTGAGAATACAGGTGTGCACACCACACTGCACTGCTTTTTAAATTTTTTGTAGATGTGAAGTCTCACTGTATTGACCAGGCTGGTCTCGAACTTAGGAGATCAAGCAGTCTTCCTGCCTCACCCTCCAAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACTGCACCTGGCCAGAGGCAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAGATTGTTGAGGCTTTTTAACTCACAACTCTTGGAGACATAAAACTTCTGTTATCTCAGGCACTTGGTAAATCTGAAGCTTCAGAGAAAAGAGGGTCAGGGGGTAGGACATGATCAATTTCAGTTATGTTATAGACTTAATATGGGAACACCTTATATAGTGCTTGACATTTTATAGAACATTTTTTACTTCTGTTTTTAGTTAACATGGATATTTGTGTCAGTTCATCGATAAGGTTCTGAAATCTAGAAATATAGGTGGTTTCTCTCACTTACACGATTATTATGTAATATACTTGAGCTTAAGAATCCAAGATTCTGGATAGCATTGTTTCTTTGGGAAAATGTAGATTCTAAGTTCCGAACAGTTGATTTCCTAAATATCTTTCAGTTCTCAGCCATTTGTAAGCTGCGCTTCACCTGCTACTAATCTTGCTGTTACTTCTGCTATCCCATCTTTAAATTTTTATCACAATTTGAATGATTGGCAACTATGATCATCTTATGTCTTTAGTAACAGTAAGCAAAATTTACATGTTTTTAAAGGAAAATTTAATTTCTATAAATATTGTTAAAAAGGGGTTATTTGTGGATATGTAATTTTGTTTTGGTGTATTTTTCTGTAACTTTAAGGAAGCACTAATCTGTTTAGTGTTTGTTCTGTTTTGCCTTGTTGAGAGGTTGATTACTTTTAATATGAAATAATTTTAAAAGGAGGCTTTTTATAAGGTTGTAGGGGCTTTTTAAAGTTATTGATACCTTTTTTTTTTTAGTTTGTAGATAACTGCTATAGAGATCAGTACCATTGCATATTTTGCATAGTGTAGAACCAGTGGTCATTAATTTTTAAAACTACCTTATGCAAGTGTAGTTTTCAAGGAAATAAATACATAGATGCATATACAATTAAACAAGAAAATGAAAACAGTTTAAAATAGGATAAGGAAATATACAGATAGAATACTGAGAGTAATAAATATGGAGAGTGGGTCAGAATTGTAACATTGATAGGCATTGCATAAACCCTGCAGCATTTTTAAGTTAAACTTGCTCTCATTTTGGGTATCAAGAAAATTGCAGGAAAACACAACTAGCTCTATAATGAGTATTGCATATAAGAAAAAGAGACTGGACATGGTGGCTCACTCCTTTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGGTCACTTGTGGCCAGGAGTTCGAGACCAGTCTGGGTGACATAGTGGGACCCCTCTCTAAAAATAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAGGCATGGTAGCACACATCTTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAAGATTGCTTGAGCCCAGGAGGTTGAGGTTGCAATGACCCTTGATCATGCAATTGCACTCCAGCTTGGGTGACAGAACAGGACCCTGTCTCAAAAAGAAAAAGATTTACCATTCCTCCAAGGAAACACAGCTTGTCAATTTGGTCTTAAAGTGTACAGTGGAGTGACATGAGTTTCTTCTGCATTGGTGTGGAGATGGGTACTCTCCATCACATGAATATTTCAAACAAGGGAGAGCTCAAAGTCTTAAGTTGTTGCTCATGGCTAAGGTAATGTTGTTCTGGAAGTCTTTCAAAGCAGGATTTATTCACTTCACAGTCAAGTCATTAACTCATGGAAATGAGGAGCCCAGGAAAAGAATATCATTCTGGGCTAGTTTCTGTTCCTGTGCATTACATGATTTTTAATTAATCATTTGCCAGTGGATAACATTGATGTAAATTTGCAAGTATCTTTAAAGTTCTTTTTTAAGAAATGACTTTATTAAGTTGTAATTTCACATACCATATAGTTTGCCCATTTAAAGTTCAGTAGTCTTCAGTATATTCACAGAGCTGCACAACCATTATGGTTATCACTGCACTGCTCCTCTAGTCCCTCTTCCCCTACCAGTGCAAAGCAACCATTAATCTACTTTATATCTGTACATTTCCCTATTTTGGATTTTCATATACATGAGTAGAAACAGGTACTATGTAGTCTTTTGTTAGTAGCTTCTTTGACTTAGCATATTTTCAGTGTTCATCTATATTGTAGCATATGTCAGTACTTTATTCTTTTTTGTGGCTGAATACTATTTCATTGTATGGATATGCCATATTTTGTTCATTTATTTTCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCTACCTTCTGACTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTCATATGCAAGTTTCTGTGTGGACTTGTGTTTTCACTTGTGTTTGGTATGTACTAAGTGGAGCCAGGCATGTTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACAAAACGGCAGGAGTATTTAAGGCCAGGAGTACAAGACCAGCCTAGGCAATATAGTGATAGCCCATCTCTAAAAAAATTTCAAAACTAACCTGATATGGTGGTGCACACCTGTAGTCCTAACTTTTTGGGAGGCTGAGGTGGAAGGATCCCTTAAGCTCATAAGGTTGAGGCTTCAGTGAGCTATGATGGCACCACTTCACTACTGCTTGGGCCATAGAGTGAGACCCTGTCTCTTAAAATAAGGGAATGGAATTGCCGAGTCATGCATAACCTCTGTGTTCAATCGTTTGGGGAACTGCCATACTGTTTTCAAACTGGCTAGATCATTTTACATTCCCTTTTGTGTGTATGAAGATTCCAGTCTCTCCACATTCTCATCAGCACTTATCTTACTTTCTGATTCTAGCCATCCCAATGGGTATGAAGTGGTATGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGGATTTCCTTGATGACTAATGATGTTATACATCTTTTCATGTGCTAATTGGCCGTTTACTGTACATTTTTCAGAAATGCCTATTTATAATAGTTCCTTTGCTCATTTTAAAGTACACTTGTCTTGTTACTCAGTTGTAAGTGTTCTTTATATATTCTAGATACAAGCTCCTTATTGGATACATGATTTGCAAATATTTTCTCCTTAAGTTTTTTTATTTTTTTAATTGCATTGTTTTAAGGGCATTTGTGTTGGGAAAATATTTTAAAACCTTAGAAATAATTTTCTGAAAGCAAATATTGACTTATACAATAGTAATAGTAAATGATTTCATTGACTATACTTCCAGTAAACCTCTTGTTGGAAAGGTGGTATGAATAACTATTATGAAGGTAAAAAGAAATAAAATGAAAATTGGATGCCTGCTAGTTATATAAAGTCTTGGAAAGTTATTTTCTATTCATTGTGCATAGAGTATCTATAGCTATTAAGTCTCCAAGCTGTCTTATTGATGATTTCTCAGATACACTATATAGTATTTCAGCTACTTTGGTTGGGCTAGATAGCCCTCCACCTCTTCCCTCATTTTATTGAGTTATAATTCATATACCATACAATTCACCATATCACAGATAGCCTTTTGAATTGGAAATAACTGATGAAAACTATTTACTCTGGGAGCCAAATCTGTTACCTGTCTGGGTAGAGACTGGAAAGTTAATGAAAAAGAAAGAAACCTCTTTAAACTCCAGTGTAAATTTAGTTGCTTCCATCTAGTTTCATACGAGTGCTCATAGTCGGGAGGCAGGAAATGCAAAAAAAGATTGATTAGTTTTCATAAAAATTAAAATTTGTGTGCATCGATACCAAGAGAGTGAAAAGACAATCCACAGAATGAGAGAAAATATTTGCAAAGTATATATCTTACTGGATACTGAGACTTGTATCCAGAATATATGAAGAACTCTTACCTCTCAACAATAAAAATATAACCCAATTTCAAATGGGCAAAGGACTTTAATAAACATTTTTCCAAAGATATATTAATGGCTGATAAGCACATGAAAAAATATTAGTCATTAGGGAAATGCAAGTCAGAACTACAGTGAGATACTTAACACCCACTAGCATAGCCAAAATAAAAAAGATGGATAGGCTGGGCACAGTGACTCATGCCTGTAATCCCAGGCCTGAGTTGGGAGGCCAAATCTGGGAGGATTGCTTGAACCCAGGAATTTGAGACCTGTGCAACATAGTGAGACCCAGTCTCTACCAAGAAATAATTTAAAAATTAGCTGTGCATGGTGTCGCATGCCTGTAGTCTCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGAAGGATTGCTTGGGCCCAGGAAGTCAAGGCCACAGTCACCTGTGATTGCATCACTGCATTCTAGCCTGGGCAACAGAGCTGAGACCCTGTCTCAAAATTAAAAAAAAAGATGGACAATCACAGTGTTGGTAAGTGGTGGAGAAATTGGAACCTTCATACATAGTTGATGGGACTGTAAAATGGTACAGCTGTCAGCACTTGGAGTGTTGCTTTTCCAGCTAGAAGCCTCTGTGGCTGGTGGTGCCTTTGCCCAGGTTTTGCTCGGGCCTGCTGGGTGTGTTCTGCCTACTCGGACTGGCAGGCTTTGTTCGACTCGTGCTATCAGCTCGGATCCCACGCCTGCCAAGGGTGAGCCAGACATGGATCGGCAGGGGGTGCATGGGCAAGTGAGCGCAGGGTCCGGCCACCGTTTACAGCCAGGCACACTGGGTGCAGTGGGGCAGGCAGCTCTAGGCACTGGTGCCCTATGAGGCTGTGGATGGATCAGGTGTACCACAGGCAGCAGCTTCTGTGGGCACTGAGGAACGCAGTGGCACCCAAAAGCTTGGAGACACAAGGAACTACAGAGCCCCAAAGAGGTTGTCACAGCCCTGGTTCAGGGAGCTCCTAGGTCTGGACTCCCCAAAGGGTCAGAGCTCTTCCGTCCTTGTCGCCGGCAGCATGGTGAGTGGGGGGTAGGAAGGGATGTTTCAGCACTGTTTGTGTTACAGCTCTTCGAGTCCCACCATTTGGCGGGTCCCGAGTTCTTGTCCCACGTCCAGAGAGAATGAGGTACACAGACAGTTGGAGGGTTAGCAAGGCGAAGAGGGGCTTTATTGAGCAGTAGCACAGCTCTCAGGAGACCCAAAGTGGGTGGCTCCTTTCCACAGGCAGGTCATCCCAACGAGTGTGTAGCTTTCAGTGGAGAGGAGACCAGACAGGAGTGGGTAGCTCCTGTCCATAGGGAAGTCAGCCTGACATCTGGCTGAGTCAGATTTTCATGGGCTTCAGAGAAGAGGAAGTGCATGCTGATTGGTCCATGGGAGGCAATGGGTGGGCCTGGGATAAGCACCATAAGTTCTCACTCCGGTCCGTGGAACTGGCAGCCCAGCCTCCAGGCTTCAGGCCATCCCAGGCTTAAAGGTAGGGTTTCACTAGGGACCTGCCCCTTTTCACCCAGGAGCATGTCTGCCTCCTGCTACTGTTCATGGCACCCAGGCTGTTTGTGCCAAGGGATGCCTGCAGACCCATGCCAAGCCACCCTCAGTTCCCCCTTGGCTTCCCTTTGTGCTTGTTGGTGCCCAAAGTCCAGACGGGGGCCAAGGTAGCAGTGGGCTGGTGTGTCGGCACTGCCCCAAGCATGCGCATACACACCTGGATCGTGACAGTGCCCAAGCTTGGCCAAAACTTTGCTCCAAAATCGGAGCAGGAGGCGGGGGCGGGAAGGGAGGCTTCTCAGGCCCCTGAGAGCACAGGGATACCCAAGTCTACAGCCACAGCTGGGTCAGGGAGCACAGGGCTCCCACCCCACCAACTTGGAAGTGGTCAGGGCTCCCACCTGTTGCTGACTCTGTGGAGCGCACAGACCCTGCCACGCCTCCCCTGCTGCAGCCGGCGTCTTTGTGGCAGCCGCTCCAGATGAACTGCTGCTGCCATCACAGCTGTTAGCATCAACCTATAGTTGGAAAAATAGTAATTCCCCCAAATATCAAACATCAAGTTACTACATGATCTATCAGTTACACCCAAGAGTATTGAAAACATACATCCATACAAAAATTTACAGTTGTTCATAACGGCATTGTTTATAAGTGAAAACAACCCCAAAACTACTTGTTTAAGGATTCGTCATGCCCAATGTGGTATACTTTGAAGACAGACTTATTCCCTGATTTCATTTGGCCTATAGTTCTGGACAGCAGAAGAGATAATACATTGTTAAATGAATCTGACACTTTATTTAATTGTTCAAAGAATTCCGAGGGAAAAAAACAATTGCTTCAGACTGAGGATATTTGAACAAATATGGACAAAATTGGATTGTAGGAACCAGGAAAAGGTTTGATTTTGAACTCAAGCCAATAGCAAAACTAACCAAAACATTCCTTCTATATACTGACATTATGTATACTGATATGTATATCTATATGCTGATATTAACAAACATTTTTTGTCTTGGATATAGCCATATAATCTACATGTTGTGTCGTGAGTCATGAAAATTGTTTAATGAACAGTGAGTGTCACTTTAAGTCTTTGGACACTTCAGCATTCAAGAATCAAATGAAATTCATTATCTAAATCTGCTCCCCTATAATCAGTATTTTTAATGAATGGCATAGTCATTTATTTCACCAGTAGACAGTACCAAAAAACTTTTTTCTCTATTTCTCACATTGTCCCTAAATCTGATGAATTTTTATCTTTTATAATTGCCCTCTATTCCCATTACTTCATAGGGACTTATTTCTTGATATTCTAATGGCTTCCTAATTGGTTTTCTTTCTGTTCATCTATTTCGTCTTCCACATGCCTCTAAAAGTCTTTCTATATAGTAGTAGATCTGATTTATCCCCCCCTTCATTAGTTCCCAAAATCATGTTTGCAGAAGTGCTGTTCAGTAAGTTTATGCAGTCTGTGCAAAATGAGAAAAATAATGACAAGTTATGGAGTTTGTACAAATGTATTCAATTTAAAGTGCTCATTCTGAATTATATCCTTTATTCCTTTTTTAAAAATTGGGGACAGGATTAGGTATTAGTTGCTATTTTAGATGTCCTACTGGTCAAAAGTGACAGTTCTTTCTCAATTTTAAATTAAAACATTTTTTTATTTTGGTCTCTGAAATCCAGAGGTTTTAGAACCACTGGCCTGCAGGATAAGGTCCCTGATACCTTGATGATGATGGCATATGAAATGGTTTGATTCTAAAATATCAAATTAATTTCATTTCTTGTGCTAGCTCCAGTTCATTGATTGGGTGTCTGTAATATTAGGTACAGAAGGCTTGTGAGACTAAGTTTGTGCTAAGCTGAAAAATGCCATTATCAATTTACAAAATATTCTCTAGGCAAAGGATGGGCGAATTCCTGATGTAGCCCATTCCTACCTTTTCAGCCTCACACCTTCTACTTTATTTTCAAAGTTTCTTTTCCAGTGTTACCATGAACTAATACATCCCCTGAATGCAGGCAATATGTTTCTCATAATTGAACCATATTGGCTGGGTGCAGTGCCTCATGCCTGTAATCCCAGCTGTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAAACAAGCTTGGGCAACATAGTGGGACCCCATCTCTATAAAAAATAAATTTAAAAATTAATAATTGAAGTATAATAGAAAATAAAGTATAAATAGTAATGTCTTAGAAGAAAGCCAGGCCAGATGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGAGATGCTAAGGCAGAGGATTGTTTGAGCCCAGGAATTCAAGACCAGCTAGGCAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACAAAATAAAAATTACCTAGCCATGATGATATGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCTGGAGACTGAGGTGGGAGGATCAAGGCAGCAGTGAGCTGTGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGATGCTGTCTCAAAAAAAAACAACAAAAAAATCTGATGGTAAAATGGTTTATACGTCTTTTTGTGTTGTTTATTTGTAATGTCTTTTTTCATTCATCTACCCCGTGAACTTCAGTTACCATCTTTGACTCTTCCCCTGTGTCCTTCAAACATAGTTAGGGTCTTTCTGTAAAACTTTCACTGTACTTACTATTATAGTACTTATTTATAGTGTAATTATTTATTTACTTATCTGTTACCTGTACTGTAGAGCTTTGATGGACTACATTATTTGGGTTCTCATGTTTATCATGTGAATTTTAGATGAATGTAGACTGAAATTATGGCCCATGATGCATTCCATTTTAACTCTTTTGTTAAACAGAAGAACACTTAAAAGAATTTGGTTTCATTTTAATGTTCTTTAGCATAATAAACTATTTACCACATACTTAACTCATGGTAACATGCTTTAAAAAATTATTTTTCTTTTATATCCTGAAAAATTACTTTTATTTTAGAGGTCCTTACTGTCTCTGAGCCATTTAGAGATTATATGCCAAATCTGTGTTTCTTAGTTTATCTGTGTCCTGTCTGTGTGTGTGTGTCCAGATAATTACTTTGCCATGATGGAAACATTTTTGTAAAAAGAATAGTACAATTTCAATAATTGTGGTTGAAATATGTTGTCAATTAAACCTAAATATTTAAGGAGACAAACTGTTGCCTTTTTAATGCATTGTAGTGAGTGAACTTAACAAATTAAAGAATTGGAGAGAAGTAAAATAGTTTGTACATTATCAGTGATACTTGTTTACAAGCTTTATTTTGTGTACATATATGTTAAAAGAGAAAACCATGAGCCATGTTTTAAAATATGTACTTGTTTTAGTTGTTGATTCACTGATGAAGAAATTTCTGATGTTAGGATTTTTTTTTTTTGTTTTTTAGCATACTGTTACTAGTGTTGTATGACCGTATTCTGGAGACTAGGCATCAGAACAAGGATAAATTTGTTATTAGTTGAAAAATCTGATTTTCATGGTAGGGTAATTCACAGTTTCTTTATAGCTTAGTGTTCTGTCTACCTCTAAGAGGTGGACAGGGTTCCTGAAAAGACTGAAATATTAAACCAGTACAACAAGGATTTCATTTTCAAAAAGAAAAAAACAAATATTAGGAAAAATGATTACAGTTTTTGGTCTTCAGTGTTTCATAACCAAGTGTTTATAAAAAAAAAGGACTTACTCTGCATCAGATTGAGAGCCCAGCAAAGTACAATTATAGTGTATAGTAAATGGACAAGTGGGTAGAAGGAACAAAGACTAAAGAAGAACTACATGGTGGAGGCCAGGCACAGAGGCTCGTGCCTGTAATCCCAGCGGCCGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATGCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCTGGAGGCAAAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCCCCACTGCACTCCAGCTTGGGCAACAGAGCAAGACTCAGTCTCAAAAAAAAAAAAGAACTACGTGGTAGAAAAATTGATGCTTGTGGGAATTTATTAGAGGACTGTGGGTTAAATTTAGTACTGAATGCAGCCTTTTGTTGTTTAAAAAATTTTTTTGAACTCACAG
Seq C2 exon
TCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAGGGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTGTACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000136536:ENST00000259050:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.780
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development