HsaINT0100436 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000152601 | MBNL1
Description
muscleblind like splicing regulator 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:6923]
Coordinates
chr3:152414941-152432920:+
Coord C1 exon
chr3:152414941-152415111
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr3:152432717-152432920
Length
17605 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GTGGTAAGC
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development