HsaINT0137699 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000075391 | RASAL2
Description
RAS protein activator like 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9874]
Coordinates
chr1:178341471-178390206:+
Coord C1 exon
chr1:178341471-178341608
Coord A exon
chr1:178341609-178390099
Coord C2 exon
chr1:178390100-178390206
Length
48491 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGA
5' ss Score
10.77
3' ss Seq
ACTTTCCTCCTTTTTTCCAGAGG
3' ss Score
9.42
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development