HsaINT0166126 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000198176 | TFDP1
Description
transcription factor Dp-1 [Source:HGNC Symbol;Acc:11749]
Coordinates
chr13:114265311-114277601:+
Coord C1 exon
chr13:114265311-114265377
Coord A exon
chr13:114265378-114277494
Coord C2 exon
chr13:114277495-114277601
Length
12117 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGG
5' ss Score
10.51
3' ss Seq
CTGGTGTCCTTGTGTTGCAGGCG
3' ss Score
9.87
Exon sequences
Seq C1 exon
GCCGGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTCAAGGTCTTCATAGACCAGAACCTTAGTCCCGGGAAAG
Seq A exon
GTAAGGGCACCTGTTCTGGACACACTCTTGTGTTGATGAATGCATGAAGCTTCACATGTTTATGAAGCTGTTGACGCTGAAGCCTCTTGCTAATGATGGCATCTCCTGCATGGGCACCTTTGTGCTCCGGGAACCCAGGAGGGTGGGCGTAGGAGCCTTCTAGCATTTAGAACACAGCCTGCACACACACCAGTAGCTTTGTGGATTTTGAATTCTAAGGTATGTATACTATTTGCAAAAGTTTAGAAAAGGTAGAATATTGTAAAGAAGAAATAAAGATAGTTTGTTTTCTCTCCACCCAAAGATAATGACGTTTCAGCTGTGGTGTGGGCTCTTCCAGAGGCCGGCCTCACCTGTGCTGTTTGAGGAAAGATGGGCCTACCATGGTGCATGCCTTCTGCGAAGCAGGCACTTGCCACCTTTAACGCTTCGCGTGTGTATTTTACTAGCTCTTGAGGAAGAGCCGTTTTTCTTGTCTTGGGGAATCCAGGGGAGGAAGTCAGCTGGAGAGGTTGAAGCCACCTCTTCCAGGGTCCCACGGTTGGTAGTTTCCATTTTACACCTCGGAGTGGTGCTGTGGTTTACGTTCGTGAAGGTGTGTGTGCTCACCTGGTTACTTCCTGGGTAAACTCCTTACCTGTGCTGGGTCAGGGCACGCCATTTAGAAGCTTTGATGTGCGATGCTTGGCCCCTCGTGAGAGGCTGTGCTGTGTGGATCTGGGATTGCGTGCAGGGTAGTTCGTTGTGGTTTGTTGCGATATTCCTGGGAGACAAGCTTGTGGAAGAGCTTGCTTTGTCCCAAGACCTGTCTGCCTGCAGAGCCTAGTGGGTCCACTGAGTGCCCTGGTCGCAACATCCACGTGGTCGCATCAGCCCAGGGAGGAGCCCAGAGGCCTGGATGTGTTTCCGTTTTGGGTTCCTAAAAGGAACCTTAAGATTTTTCTAATTATTCCCATATATAAAATTAGCTTTTTTTACTCTTAACATTGTGACCCTTGTAAGTGACCTCTCAGTGCTTGCCATGGCTCTGGGGCGTGGGAGTGTGGTGACCAGGCCCCCACCTCTCTGCTGAGGCTTGGCCTTGCCACCCGTCCCTTTCTGTCCAGTGCTGGTGCGGGCGCCCATGGTGCCATCTGCCTCCAACCCCTACATGCTGTGGATCCAGGTGTCTCCTTGGGGCCTGTCCCTAGGTCCTGCTCTGGTCTCTTCCTTGAGAGAACTTGGCTTTGTGACCTGAGCCAGCCTGCAGCCTCCCCAGCCTCCTGCTGTCCCCGGGCCCTGTCAGAGGGAGGTGGTGGGACTGGCCCTGCTCTTCTGCTGAAGCAGGTCCTTCCCTGCCGCTTTTCTAGGAATAGGGACCAAATCTACGCAGCCCTTTTGGGATTATTTATGAGCTTTTTGTCTTGATCATTTGAGGATTCACAGATTGCTTGAGAGAAATATCGTTTTAGTGTAACTAATTGAACACTTAAAAGTGGACAAGTTGCAGGCGTGACATTTTCTGTTCAAGTGGTGAAGCAGAAATAACAATAAAAAAGTTCACCATTTTATTTGCTTGGAAATGATGAAGTCTGTTACTATGGTGTTGAATTTGAATTTCTCTTGTTAGGTTACATGCAGTAGGCTTTCTTACCACATGTGGGCTGTCTCCTTTTCCATTCTTACTCACAAATCTGTGCTTGAATCTGTAACAAGTTTAATTGAGCTGAAGAGTTGAATTGCAGGGATTAGGAAGGAACATATTCTGCATTCATGACATAGCTGAAAATGTTCTGGTTTTGAGCCGGCCCAGCAGGGCCGTGCATTTCCCCTCAGCTCGCCCCGCGTGCCCCGGCCCCCAGATCCCTCCCACATGAGCCTTGGGACGGTCAGTTCTTTCCCTGGATCGCCGGCAGCAGCTCCTGGACCTCCCCTGCCCTCACCTGGTGTTGATTCCACCGCACAGACGGTGGTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCGTCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGATTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTAGAGGTGCCCACCACCATATCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTTTCGAACTCCTGACATCATGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGGGAGCCACTGCACCCGGCCACACGTGGTTATTTTAAATTTGCTTTTGAATCAGTGACACGTTCATGTTTTTAAATTTTGAAGTATGAAAAGGTGCAGAGAGGTTTCCTTTTTTCCTCTTCTGTCCATGCAGGTGAGCACCAATGTTCACTTCCGGTGTTCGTTCCAGAGAATTCTGTTTAACAAATAGAATGGTTTGTTGGTGTTTGCATGTGTCTGTGTCAATATGTGTGCATGAGTGTGTGTGAGGAATGTGTGTGTCACTGAGTGTGCATACGAGTGTGTGTGTGCATGAGTGTGTGTGTGTATGCGTGAATGCGTGGGTATGTGAGGAGTGTGTGTGCATGTGTGTCTGCGTGAATGCGTGGGTATGAGTGTGTGTGTGCATGAGTGTGTGTGTGTATGCGTGAATGCGTGGGTATGTGAGGAGTGTGTGCATGAGTGTGTCTGTGTGTATGCGTGAATGCGTGGGTGTGTGAGGAGTGCTTATCAGTGCATTGTGCGTGTGGAGTGTCTGTGCGTGTCTGTTCATGGGTTGCATATGTGTTGAGTGTGCATGTGTGTTGAGTGTGCATGAGTTGTGTGAGTGGATGTGAGTGTACCTGTGAGTTTGCGTGTGTGTGCATGCGTGTGAGTTGTGTGCGTGTGTGTGCATGTGAATTGTGAGGAGTGCATATGGAGTGCATGTGTTGTGAGTGTGCATGAGTTCACGTGAGTTGTGTCAGTTGTGTGCGTGCGTTTGTGAGTTGTGTGTGAGATGTGTGTTGTGTGCATGAGTTGTGTGCATGAGATGTATGTGAGTTGTGTGCATATGCACGTGTGAGTTGAGTTGTGTGCATGGAGTGTTATGTGCGTGTGCATGTGTGTGTGTTGTGTGCATGAGTTGAATGAGTTGTATGTGTGTGTTGTGTGCGAGTTGAGTATGATGTGTGTGCGTGTGTGAGTTGAGTGTGAGTTCTGATTGTGCGTGTGTGTGAGTTGTGTGTGTGTAAGCGTGCAGTCCTCGCCTCCCCAACAGACACCTGTCTTCACTAGTGGGCCCCCCTTGCCTCTAGTTGGGAGTGGGGTGGTCCAGGCAGGGTCCTCGGCGCCCTTAGATGGAGCCGTTGCAGCTGCTTTTTGAGTTGCCCTCGGCGGTGCCAGTGAGCAAGGCTCTGCCTTCCTCCGTTTGTGCCCTGGGAGCCCAGGGCATGGTCGGTAGCACTTTGAGGGCTGTAGAGGCCTCCCTTGAGTCAGACCTTGAGGAAGGACAGGAGCTGTCCAGGTGAGAGTGGATCAGGGGAAGGTAGAGGGGACCAGCCCAGCCGAGGCTCCTCATGGGCCCCTGGCCCTGGTCCTGGTCCTCCCAGCTCCACTCCACGTCACAGCCTCCCGGGGCCACTGTGTCTCTTCCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCCTGTGTCCAGTTCCCCACTGTGTCAGCGTTCTCTAAAGTAGCAGCCAGTGAGCGACGGGAACCTGGGTGGGGACTCACTACAGGACCCACCTAGCCATAGTGGGGCCGTCAGGGCGGAACCTGCAGGGTGGTTGGTGGTGAATTCCTTTTCTGGGAAAATGCAGGTGTTGCTCTGAAAGCCTTCAGTGGGTTAGACGAGGCCCACCTGCATCGAGCACAGTCTCCTTTGCTTAACGGCTCCTCTTTGAGGAGCTCCGCGGCAAGTTCTCGGCTGGCCTTTGGCTGAATAATGGATAGAGCACCGTCAGGTTGACACGTAAAACTGACTGTCACACCCTTCGAGGCTTAGAAGGCTGCTTTCCACCCAGAGAAATGCACCAAACTCGAGACATTTTGCATCCACAGGCTCCCCAAGGATGGGAGTCCCAATGTGGAGGTTTGGCAATACATCTTACGTGGGCCATTTTAGTTGTGGCTGTTTGGGTTGCCTCTGATTGTTTCCTGAGAGCAAAATGCTGGTGTGAACATTTGCACACACACTTTGTGTGTCTGGCAGTTCCACTTCCTCACCAGCATTTGGTAGTGGTGGGTTTTTAGGCTTTCTGTGTCACAGGTGGGCTCTTACTCATATCATGCCTACGGCCCCGCAGTGCTGATAGGAGCTTTTCCTCTCGCTTTGCCTGGTCCACCCTGCCCCTGTCTGAGGGTGACCTGGCCCCATGGCTGCCTGCACTCTCCTCCCTGATGTGTGCAATCCTGCCCGGCCTGTGCCTCGTCCTCAGGGAGGCCATCCGGGAGGCCACAGCTGGCCTGGAAGTGTGCTTGTCTGTCTCTACCTCAGGGCTGCTTGTGCACCTCCTGTACCTAGAGGTGATCCAGGCTCACTGAGAATCTGCCCACACTGTTCCACACGTTTAGGCCAGGTGCAGGGGCTCACACCAGAAATCCCGGTGCTTTGGGAGACTGCAGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAACAACGGGAGACCCCATCTCTATAAAAAATTTTAAAAAAAAGTAGCCAAGCATGGTGGCGCATGTCTATAGATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGGATCGCTTGAGCCTGGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGTTGTGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCCAGACCCTGTCTCAAAATGAGTAGGCTGGGCATGGTGGCTCAAGCCTGTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGTATCACCTGAGGTCAGGAGCTCAAGACCAGCCTAGCCAACATGATGAAACCACCTCTCCACTAAAAATATAAAAATTAGTGGGGCGCTGTGGTACACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGTAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCTCCACTGCACTCTAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTAAGTGTGTAAGTGTACATTTGAGCGTGCACTTTCGCAGCTGGTGCGTGGAGTGTCTGTCCTCTCCATGCCGTGTGGTGGCTCCTGTCTGTAGTCACTGGGACCCTTCCAGTCACGGTTTCGGTGGCTGCGTTTTGCTACCTTTTGTTATTTGCTGCCGTTTTCTCGTAGAGTGCTCATGATTTTTAACATAGTAAATCCGTGGAGAGCGCTCAGGTACAGATCATGGCTGTGTGCAGTGCAGGCTCACCGTCTGCGGCGCCAGGCCGGGTCCCTCGTTTGCTGCTCATCTGGGAGTGCCCAGCACATGTGGCCATTGATTATACATATCCTCTTAGCCCAGAATGACTGCTTACTAAAGAGCATCTCCCTTTGTTGTGTCTTTACTTTCCTCCTGCTTCAATCTCATATCTGTCGGCTTTAGGGTTCTAAGTGGAGGAGGAAATTTAGCAATGATGTGTGGTCAGAAGCTTAGTGTTGCTTACGTAATTCCTCACTCGTGACCGTCGCCTGTGAACTAACTGTGCCCCTTGCCCCCCGACACACGCACTGGTCTTTGTAGAGCTGTTAGGAAGGGGGTTATAGGAAGGGAGGGTATAAGTTTTGGTTGGCCTCTTCAAACTGCCAGCCTCCTACAAAACTGTCAGGAGAGGCCATCAGCTTTTTCTCTCTTTGTATTTCTCTGTTTTTAACCCGAAGGATGTTAAAAGCCCAGCCTCTGTTTTTAGCCCAGTCATGACATTTCTGTGGCCGTAACCCTTGTTCCAGGTGTGAGATGGTGACTCTTGGATGCAGGGTAGCCTCCCAGAGCTTTGTGTGTTTGTATAGAGAGGTTTGTGGGAGTGACTTGAGCCGTGCTGTGAACTTGGACTAGCACCCGTGTGTTCTCAGGAGCGGGTCCTGCTGGAGGCCCAGCCACGTCAGGCACAGTAGGTGTGTGATTTGTGCAACGGAGGCCTCTGATAACTGCCAGAGTAGATAGCTTTTGTGTGGGAGCTGCCTCAGCCTGCATTCCAGGAGCTCAGGTTTCCTGAGTCTGAATGGAGTCTGGAGAGAGCAATGTCTCCATGGAGCGGGTGCCTGGCTGTGGTCGCTTAGGCAGGAGCTTCCTCCTCAGTGCTGACAACAGAGAAGAACATTCTGTTGTGGCCAGTCAAGTGTGCACAAATGCTGCTTGCGAGCCAGTCACAGAGGCACTCACATGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAACCGTTCACCTGCAGAGCCCTTCACCTGCAGAACCGTTCACCTGCAGAGCCCTTCACCTGCAGAACCATTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAACCCTTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCCCTTCACCTGCAGAACCCTTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCCGCTCACCTGCAGAGCTGCTCACCTGCAGAGGGGTTGTGCTTGGCCAGATAAGCAAACAAAACATCTCCAGCATGGTGGGCAAAATAGTAACTCTTAGACATCTGGCTCTGACAACGTAAAGATGTTAAAATTGTTTTTCAGAAAATACAAAACTGTATGGTTTCATAATTTATCTTAAGCCCTATAGATATTAATAGAATAGGATTAGTAATGATAAAAACGTGAATACTATATTTAGACTCCTTTTTCTGTTAATGGATTATAGCAACTGAGACCATATATATTCTTAACTAGTTTTCTTCCCAAGAAAGGAATTCTCCATTTAAAATGCTGTATATAAAATGTTTTTAATTAGTTCATTTGAAAAACGCTGTGTAGTGCCTTTTACAGTTGAAACAATATTATTTCTATTGAGTTGGCTTGTGGGCCATGTCTTCATGTGACTCAGCTTGTCCCTGAAATGTTAGCCCTCCTCCCTCCCATGCATAGATTGTGTGGCAGTCTTATCAAGAAAATGTGTGGAACACTCTACTCTACTTATATTGCCAGATTAAAACTAAATGATTGGCTGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCGGGTGGATCGCTTGAACTCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGTGATGTGGCGAAACTCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTATGGTTGTGCGAGCCTGTAGTACCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCCCTTGAACCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTCTACAACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAACAACAACTACTACTACTAATTGAAATAACATTCTATCCTGAGGTGGACAAAAAAAGTGGTGGGGAGCGGCAGCCTGGCTGCCACTGGTGCGTCTGGCCTGGAATGACCACTTGGGGAGCTGGGTGGACTCTGGGACAGCGGCCGCTGGGACCCGGGCTTCCCTGGTGGCAGGTGTGCCGAGGAAAACACACAGCATGTGGTTCAGTAATAACAAACAGCATTTTCATATGACATCTGTGTTCATATGACCACTTTATTATAATGGCATAGCATAACAGCATTTAAGGAAATCAGCCTGACGGCTCTATGTATGGGTAAATCTGAAACACAATGTTGGCAGAATTGCAGAATGCGAGCCATATAATATTTGTCTGTGTTTCAGACGCACACAAAAACAATCATTTATAGCCTTAGGTTCAGCACATCCTGGAAAAGTATGAAAAATAAAGTGAGTACGTCCCTGCAGGCCCTGGGAGTTGCACACAGGGCAGACTCGGGGGGAGGCTGAGGATCCTGGGGACTGTAATTTTATTTCTGCTCTTTATGTCTCTATGAAACTTGAAGCAAGTATGATGATAACAGTGAATTTTAAGTGTACTGGAATAAAATTGTCATGTTATTGTTTGTATTTGAAAAGTTTCTCAGTGAATAGAAACAAGAAGCCCGGCTGGGCGTAGTGGCTAACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACCAGAGGTCAGGCGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAGTTAGCCAGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGGGAATCGCTGGAACGCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCATGTCACTGCCCTCCAGCCTGGGCGACACAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGCCCACCCACCCAGGTCTGGCCCCAGAAGCCACTGCCACTGCCCTTTCCAGCCTGTACGTCTGGGTGTGGGTCTGAGATGTATTCAGGGAGGGGCCTTGCTGCTCGCTGTGGTCGGGTGGCTGTGCAAGCTCAGCCCCTATCTCCAGGCCCTTCTGAAGTGCTGCTCGGGGCCGGACAGGGGGTATTCACCCTCAGCCTCAGGATTTCTTTCTTCTCCCTGTTACTGATGTACGTACCCTGCCCTCTGTCCCGTAGAGACTCAGCTGGTGACCCAGGGGTGCTGCTGGGTTGGTGTGGTGTGCCACTCAGAGGTCCTCTGTTGGTTTGTGTCTAGGCTGGGAGGGGCCCTCTGTGCTTGGCAAGGCCTTGGGCTCCGAAACCCTTTACCTGCAGCTGGTGTGGGGGCTCAGACTCCAGGTGGACAGCAGGAGTGAGTGGGGAAGCTCAGGGGCCCTGGATGTCTGCCTGCATTCACTCATCCTGCCCTGGGTACCAGAGGAGGGACCCTCTTCCCTCTGTGTGTTTGTCTCCCCCTTCCTAATTGTGAAAACCCTTAGCGACCCACCCCAGCCTCACGGTGCTGGCCTCTGGCCCAGAGGGAGAGACCTGGTTGGAAGGACAGATGGTGTAGGCAGGCCAGCCGGCCGGCCTGTGGGTGGAGCAGATGGAGGGCAGGCCGGATGCCCCGAGGGTCTCAGCTACACTGCTGTCCCACAGCCCCACCACCACCTGAATCCCTGAGTCCTACCCACACTCCCTGATGGGGCAGGAAAGGGGAGCCCCAGACTGGGATGCCTGAGTGTATGCTACCTGTGGTGCTGGTGGACGGGCGCCGTGGCCTGGCTGTTCAGGACGGAAAGAGCCGCCTGGGCTGCTGATGGAGAGTGACAGTGCCACTGGCTTTTGTGAACTCAGAGGTCTGTTTCTTTCTTCACATTTATTGAAATTAGAGACTCGTTTGCAAATTTTAAAAGATGTTATCTTTGTAATGAATCAACTACATATTCTTGAAAACTGAGTGTTTACTCATCTGTATGTGAATCTGAAAAGTGTTTAATTGCGTACTTTAAATCATTCCCTGCATAGTAGAATATTATTTTTGCTTTTAAAATGCCTTTCCCTGGTAAGTATTACACCGTGTATATGTGCATCCAATCATCACTGGTACATTTCGAATATGTACAATCTTTACTTTTCAATTGAATATTCTGAAAATACCTTTCACATATATAAAACAATAAAAAAGTAAATATTTGCTTTTCTTAGGATGCACACCTTTATTTTTGGAAGAAAATTTCCCAAAGCAGATCATCTTATTTTAGTTCCAGAAGAGAATTTTAAATATGTGCTGACATTGGTTGGTAAAAATACTAATATTTAACCCAGTTGAATCAAAAGGCAAATGTCTTTTTAATCACTTCCTAATGATCTGTCTTGGCCAACTTAGGTTATTAAGAGAAATTACTAAGTGTCCTTATGTAGCACAAAATTCATTGTTTAATATATTTTAAAGAAATGCATAAAAAGCAGTAGATGTTTTAAAAATGCATGGGTTGTAAAGGGCCCCAAAATGAAACTTCAGATCGCAAAGGCAATGTATTCGAAAGTCTCACCGATGATTCATGAGTCATTTTGGTGCTAACTGGTGGGAATGAAGGGAGATGCCTGTGGGGAGGTCCAGGGTCCTGCAGCTCTGCGGATGGGCGGCCGTCCGGGGAGGCCCAAGGTGTGGCGAGATCGGGGAGTTCTTCTTTCCTGATGTTGTTGTGACCCGAAAGTCTGTGTTTTCTTCACCTGAGAGTATCATGTATTTTCAAATGGGGGGCTATCCGCTCAGCTCCCCCAGCCGTGGGGTGGGGTGTGGGTGGCAAGCCACCCAGGTGCCGAGGCAAGAGACCGAGGACACGAGCTGTTCCAGTATAATAAAATATAAAACAAGAATGGTTATTCCAGATATAGATCTTAGATATGATTATATATGAATATCATTAATCATTAGTTTGTAGCAATTACTCTTTATTCCAATATTACAATAATCCTCACTCTACAATCATAACCCAGGAAAAACCAGGCCATACAGAGATAGGAGCTGAGGGGACATAGTGAGGAGTGACCAGAAGACGAGTGCGAGCCTTCTGTTATGCCCGGACAGGGCCACCAGAGGGCTCCTTGGTCTAGCGGTAACGCCAGCGTCTGGGAAGATGTCCGTTGCCAGGTGGACTGTGGTCTAGCGGTAGCCTCAGTGTCACGGAAAAACAGCGGCTACTTAGCAGACCGGGAAAGGGAGTTTAGAGAAGACTCTGTTCCTCCACCTCTTGTGGAGGGCCTGACATGAGTCAGGCTCGCCTGCAGTTATCTGGAGGCCTAACCGTCTCCCTGTGATGCTGTGCTTCAGTGGTCACGCTCCTAGTCCACCTTCATGTTCCATCCTGTACACCTGGCTCTGCCTTCTAGATAGCAGTAGTAAATTAGTGAAAGTACTAAAAGTCTCTGATATGCAGAAATAATGGCGTAAGCTGTCTTTCTCTTTGCCTCCTCTCTCTCTCTGCCTCGGCTGCCAGGCAGGGAAGGGCCCCCTGTCCAGTGGACGCGTGACCCACATGGCCTTACCTGTGATTGGAGATGGCTTACTCTCCTTATCTTTCCCTTTTGTCTTGTATCCAATAAATATCAGTGCAGCCTGGCATTCGGGGCCACTACCGGTCTCTGCGACTTGGTGGTAGTGGTCCCCCGGGCCCAGCTGCCTTTTCTTTTATCTCTTTGTCTTGTGTCTTTACTTCTACACTCTCTCGTCTCCGCACACGGGGAGAAACCCACCGACCCTGTGGGGCCGGTCCCTACAGTGGGGCACTGCGAGCCCCTTGCTGCCTCTGTGTGGCCGCCCACCCTTCCAGTGTTGCCCTGACGCCCCTCCCGGGCTGTGCTGACCACCCAGGCCTCCCAACTTGTTTCCCAGGGTGCTCGCTACCACCTGGTTTACGGTTTCTTTGTTTAGTTCTCTCTGCCCGCTGATGCCAGTTTTTGAACTTTATCATTACTACTTCTGTTTATGTGTAAATGTTCCAGGACTTTTATCCACCGCCCTGTCCCTAGGACCTTTTGCATACCGCTGTTGGAAGACAGAGGCTTCACATCTCCTGCAGAGGGGTCTCCCGCTTGCTTCACCAGTGTTCTGAGGGCACCTGCATGTTTAGAGCCGCAGCCTCTGTGGAAGGCACACTCCTTCCTAGGAACAAATGTGGTTCTCCTTCCTAAGGAAAAGTGGATTATCAGATTTCCAAACTAGTTTTGCAGCCTTATAGAGAAATGTTGCGATAAAAATTCTAGTTTTAAAATTCTGTTCCATAATTGTCATAGAATCACAGACTTTTCCAGGCCGTGGTCCCCACCAGCACGTTCCATAGCAGACATCGCCGAGGGGCTGGAGCAGTGGATGATCTGCCTGGGTCACCTGGGTGGCGTCAGCGCGGCCCTGCGGCCCTCCCCTTACGGGTTTACATTGGGAATCAAGCTTCATGGAGGTGTTGCTCTTGAGCCCTGGATTTGAGACAGTACACGTGGGGAAAGCTAAGCATCTCTAATTGCAAGCACCGTCTTGCATTTAGAATGGTCGCTTGTAGCCTTAACTTAGAAAAGGAGTCTCGCCCTTGACCTGGTGTCCTTGTGTTGCAG
Seq C2 exon
GCGTGGTGTCCCTCGTGGCCGTTCACCCCTCCACCGTCAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCAAAAACCTTTGGACAGTCCAATGTCAACATTGCCCAGCAAGTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000198176-TFDP1:NR_026580:3
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.389
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)