Special

HsaINT0177907 @ hg38

Intron Retention

Gene
Description
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GTTTGAAGGTCCGCGAAGTGTTCATCAATGTTACTAGGCAACAGGTGGAGGACTTCCATGGGCCCGAGGACTATTGGTGCCAGTGTGTGGCGTGGAGCCACCTGGGTACCTCCAAGAGCAGGAAGGCCTCTGTGCGCATAGCCT
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Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000156687:ENST00000453357:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.271 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Chicken
(galGal4)
ALTERNATIVE
Chicken
(galGal3)
ALTERNATIVE
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains