HsaINT0180806 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000155975 | VPS37A
Description
vacuolar protein sorting 37 homolog A (S. cerevisiae) [Source:HGNC Symbol;Acc:24928]
Coordinates
chr8:17143856-17155533:+
Coord C1 exon
chr8:17143856-17143936
Coord A exon
chr8:17143937-17152495
Coord C2 exon
chr8:17152496-17155533
Length
8559 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTAAAT
5' ss Score
6.62
3' ss Seq
TTTTATTGTTTTCTTTCTAGATT
3' ss Score
10.86
Exon sequences
Seq C1 exon
ATTTGCCACTGTAGAAGAGCCAAGGAAGAGAAACTTCAGCAGGCGATAGCAATGCACAGCCAATTTCATGCTCCACTATAG
Seq A exon
GTAAATTGTATTTCAAGTTTGAGTCTCAAGGTGATTGCATCAGTGTTCTTTAAATAGACATGTTGTTAACGGTGCCTGTTCATCAGCCTTAAGCATAATTCTGTCATTATAGTTACTGTGCTATGTAACATAGAATGCTTTGTATTATATAATAAGCATAATATAAACATATAACTAGTAGAAATCTTTTGGATATTTTCTGTGATCTTGGCATGAATGAGATTTTTTTAACATTAGCTGCTAATGTAGAATTGTAAGTTATAGTCAGTTCCTTTCTCTCACCTGGTGTGTAGAGTATACCTTGTCATGTGGCTAACATTTCTCAGAAGGCTCCTTTGTCATTTCTTCCTTTAAAGTGAACTTCCAGCCAGTCTCTTTCTCTATCCCACACCACGATTACTCTAATAATTCACCTGTCCCCACGACTTGAGGGTTCTCTTCCTATGCAGCACTGATAGAATGATCTTCCTAAAATACCACTTTTATGATAAAATTTGCTCTACTCCAGAACCTGTAATTAATCGCTAGTAATGACAGTATCCATGCCAAATTCCTCTGCTTTTAAGATTTCCATAATCTTGCATATATTTCAGATCATCCATTTTAACTTTGCATTTTCCCCTTACATTGCGTTGTCTTACATGGCACATTCTTTCTTCTACCACGGTATCTTTGGCCGTGCTTGTACCTGATGTTAAGATGCCTTTCCTTTTCCTCTGCATCTGTTTTGTTTTAGGAATGATTTGTTTGCAAGAATAGTTCCCACCCCAACAAACTTAAGTAAAAGCTTATGTTATTTGATAGGACAGGGATTTATTATAGAGTAAAAATGAAGGAAAGTACAGTCACCTGAGACTGAAAACAGCCACTCAGTGACCAAAACAGCTCTTCTCACACCTTTTTTGAGGCTGCTTGTTTGGTTGTTTCTTATTTCTGCATCTCTATTCTTTTTTAAAATTTTTTCTGGCCGAGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGTGTGGATCACATGGTCAAGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAATATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGGAGGCAGACCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTCTTTTTTCTTACTAGCCCTTCACGTATTCCTGATTATATCATCTGACAGTTCAGACAGCCGATGGAGATAAACAAGAGTCCCTGGAGTTCTAGAACATTCCCTGGAAGAGTAACTGACCCAGTATGGGCAAGCTATCCATCCTACTGTAGTCAGTTTGGCCTGGAAATTGGTATCCTGTGGTCCTCTGCCCAGTCGACTGGGCTGAGGGAGTGGATTATGAGAAGAGAGCATGAGAGGTTCCCTAAAACAGGGACTAGGGTACAGGAAAAGAAATGACAGGCGTTTCTCATGTCCAGTAAACTATTTCTGCTCCTTGTAACATTAGTGCTCACAATGAATTGTTTTATGTGTTACTTTCCAAATCATACTATAAATTCCTTAAGGGTAGGGGCTGATTTTTGATACCAACTTTGCATATCTGCCAGCTTAAGAAGAAGTAGACACAGAGTAGTTGCTCATTTATATGAACATACTCAAATCCGTTCCTTACCTCTATTCCCTCATAGTCAAGTTATTTTATAGGAAAATCTTTTTTATTATTATTATGCTTTAAGTTCTGGGATACATGTGCAGAACGTACAGGTTTTTTACATAGGTATACATGTGCCATGATGGTTTGCTGCACCCATCAACCTGTCATTGACATTAGGTGTTTCTTCTAATGCTATTCCTCTCCTTGCCCCCAACTCCCCAACAGGCTCCAGTGTGTGATGTTCCCTCCTTGTGCCCATATGTTCTCATTGTTCAATTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCATTAGTTGGTTTTCTGTTCCCGTGTTAGTTTCCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCGTCTGTGTCCCTGCAAAGGACATGAACTCATTCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCATTCTATCATTGATGAGCATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATACGTGTGCATGCGCCTTTATAGGAGAGTGGTTTATAATACTTTGGGTATATACCCAGTAGTGGGATCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAACAGTGTAAAGGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCATCTGTTGTTTCCTAACTTTTTAATAATTGCCATTCTAACTGGTGTGACATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATGTCTCTAGTGACCAGTGATGATGAGCTTTTTTTCATGTTGGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTATGAAACTGTTCATATCCTTAGCCCACTTTTTGATAGGGTTGTATTTTTCTTGTAAATTTAAGTTCCTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGATAGATTCCAGAAATTTTCCCCATTCTGTAGGTGGCCTGTTGATTCTGATGGTAGTTTCTTTGCTGTGCATAAGGTCTTTAGTTTTATTAGATCTCATTTGTCCATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGTTTTTTTGTGTTTTAGACATGAAGTCTTTGCCCATGCCCATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTATAAGGTTAGGAAGGGGTCCATTTTTAGTTTTCTGTGTATGGCTAGCCAGTTTTCCCAACACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTCCCCCATTGCTTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGCCTCTGTTCTGTTCCATTGGTCTGTATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCGTGCTGTTTTGGTTACTGTAGTCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCATGATGCCTGCCGCCAGCTTTGTTCTTTTCGCTGAGGATTGTCTTGGATATATGGGCTCTTTCTTGGTTCCATATAAAATTTAAAGTATTTTTTCTAATTCTGTGAAGAAATTCAATGGTAGCTCGATGGGAACAGCATAGAATCTATAAATTACTTTGGTCAGTATGGCCGTTATCACGATATTGATTCTTTCTATCCATGAGCATGGAATGTTTTTCCATTTGTTTGTGTCCTCTCTTATTTCCTTGAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCATATCCCTTGTAAGTTGGATTCCTAGGTATTTTATTCTCTTTGAAGCAATTGTGAATGGGAGTTCACTCATGATTTGGCTGTTTGTCTATTATTGGTGTATAGGAATGCTTGTGATTTTTGCACATTGATTTTGTATCCTGAGACCTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGCTTTTGGGCTGAGACAGTGGGGTTTCCTAAATATACAATCGGGTCATCTGCAAACAGAGAAAAATTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGAATACCTTTATTTCTTTTTCTTGCCTCATTGCACTGGCCAGAACTTCCAGTACTGTGTTGAATAGGAGTTGTCTTGTGCCAGTTTTCAAAGGCAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAGTATGACATTGGCTGTGGGTTTGTCATAAATAGCTCTTATTATTTTCAGATACATTCCATCATTACCTAGTTTACTGAGTGTTTTTAGCATGAAGGGGTGTTGAATTTTATCGAAGGCCTTTTCTGCATCTATGAGATAATTGTGGTTTTTGTCATTGCCTCTGTTTATGTCGTGGATTACGTTTATTGATTTGCGTATGTTGAACCAGCCTTGCATCCCAGGGATGAAGCCAACTTGATCGTGGTGGATAAGCTTTTTAATGCGCTGCTGGATTCAGTTTGCCAGTACATTAATGAGGATTTTCGCATTGATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGAAATTTTCTTTTGTTGTTGTGTCTTAGCCAGGTTTTGGTATCAGGATGATGCTGGCCTCATACAATCAGTTAGGGAGGAGTCCCTCTTTTTCTGTTGTTTGGAATAGTTTTAGAAGGAATGGTACCAGCTTCTCTTTGTACCTCTGGTAGAATTTGGCTATGAATCAGTCTGGTACTGGGCTTTTTTTGGTTGGTGAGCTATTACTGCCTCGGTTTCAGAACTTGTTATTGGTCTATTCAGGGATTTGACTTCTTCCTGGTTGGGAGGATGTATGTGTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTAGATTTTCTAGTTTGTGTAAAGGTGTTTATAGTATTCTCTGATGGTAGGTTGTATTTCTGTGGGATCGGTGGTGATCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTGTGATGGACTCTCATTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCATTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCAGGTTTAAGCAGTTCTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGTGCCATCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCATACGATCTCCCCTTTATCATTTTTTATTTTGTCTATTTGATTCTTCTCTCTTTTCTTCTTTTTTAGTCTGGCTAGTGGTCTATTTTGTTAATCTTTTCAAAACAGCTGCTGGATTCATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGGGTTTTTCGTGTCTCTGTCTCTTTAAGTTCTGCTCTGATCTTGGTTATTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGTTTGCTCTTGCTTCTCTAATTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGTGTTGATTTTTTAGATTTTTACCGCTTTCTCCTGTGGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCTAAACACAGTTTTGCTCTGTCCCAGAGATTCTGGTACATTGTGTCTTTGTTCTCATTGGTTTCAAAGAACTTATTTATTTCTGTCTTCATTTCATTATTTACCAAGTAGTCATCGAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTGTGGTTTTGAGTGAGTTTCTTAATCCGGAATTCTAATTTGATTGCAGTGTGGTCTGGGAGACTGTTATGATTTCCATTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTTTTACTTCCAATTATGTGGCCAATTTTAGAATAATTGCTATGTGGTGCTGAGAAGAAGGTATATTCTGTTGATTATGGGTGGATAGTTCTGTAGATGTCTATTAGTTCCGTTTGGTCCAGAACTCAGTTCAAGTCCTGAATATCCTTGTTAATTTTCTGTCTCGTTGATCTAATATTGACAGTGGGGTGTTAAAGTCTCCCACTATTATTGTGTGGGAGTCTAAGTCTCTTTGAGGTCTCTAAGAACTTGCTTTATGAATCTGGGTGCTCCTGTATTGGGTGCATATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTTCCTACATTGATCCCTTTACCATTATGTAATGCCCTTCTTTGTCTTTTTTGGTTTTTCTTGGTTTAAACTCTGTTTTATCAGAGACCAGGATTGCAACCCCTGCTTTTTTTTACTTTCCATTGGCTTGGTAAATCTTCCTCCATCCCTTTATTTTAAGCCTGTGTGTGTCTTTGCACATGAAATGGGTTTCCTGAATACAGCATACTGATGGATCTTGACTCTGTATCATTTGCCAGTCTGTGCCTTTTAATTGGGGCATTTAGCCCGTTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATTTGATCCTGTCATTATGATGCTAGCTGGTTATTTTGCCCATTAGTTGATGCAGTTTCTTCATAGTATCAATGGTCTTTACATTTTGGTTTGATTTTGCAGTGGCTGGTACCAGTTATTCCTTTCCATGTTTAGTGCTTCCTTCAGGAGCTCTTGTAAGGCAGTCCTCGTGGTGACAGAATCCCTCAGCATTTGCTTGTCTGTAAAGGGTTTTATTTCTCCTCCACTTATGAAGCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTATTGGTTGAAAATTCTTTAAGAATGTTGAATATTGGCCCCCATTCTCTTCTGGCTTATAGGGTTTCTGCAGAGAGATCCACTGTTAGTCTGATGGGCTTCCCTTTGTGGGTAACCCAACCTTTTTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACCTTGGTAAATCTGACAATTACGTCTTGGGTTTGCTCTTCTCAAGGAGTGTCTTTGTGGTATTCTCTGTATTTTCTGAATTTGAATGTTGGGCTGTCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGGATATCCTGAAGTGTGTTTTCCAACTTGGTTCCAGTCTCTCTGTCACTTTCAGGTACACCAATCAAACATAGGTTTTGTCTTTTCACATAGTCCCATGTTTCTTGGAGGCTTTGTTTGTTCCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAATCTTGTCTTCACGCTTTTTTTCATAAAATTGATCTTCAGTCTCTGATATCCTTTCTTCTGCTTGATCGATTGGGCTGTTGATACTATGTATGCTTCATGAAGTTCTCGTGCTGTGTTTTTCAGTTCCATCAGGTAGGTCATTTATTTATGTTCTTCTCTAAACTGATTATTCTAGTTAGCAATTCTTCTAACCTTTTATCAAGGTTCTTAGCTTCCTTGCATTGAGTTAGAACATGCTCCTTTAGCTCTAAGGAGTTTATTACCCACCTTCTGAAGCCTACTTCTGTCAATTCATCAAACTCATTCTCAGTCCAGTTTTGTTCCCTTGCTGGCGAGGAGTTGTGATCCTTTGGAGGAGAAGAGGCTTTCTGGTTTTTTGAATTTTCAGCCTTTTTGCACTGGTTTTTCCTCATCTTCATGGATTTATCTACCTTTGTTCTTTGTTGTTGGTGACCTTCGGATGGAATTTTTGCATGGTCGTCATTTTTGTTGATGTTGATGCTATTGCTTTCTGTTAGTTGTCTTTCTAACAAGCCCCTCTTCTGCAGGTCTGCTGGAGTTTGCTGGGGGTCTACTCCACATCCTGTTTGCCTGGGTATCACCAGCGGAGGCTGCAGAACAGCAAAGATTGCTGCCTGCTCCTTCCTCTGGAAGCTTTGTCCCAGAGGGGCACCTGCAAAGTGCCAGCCAGAGCTCTCCTGTATGAGCTGTCTGTCAACCCCTGCTGGGAGGTGTCTGCCTGTCAGGAGGCACGGTGGTCAGAGAACCACTTGAGGAGGCAGTCTGTCTCTTAGCAGAGCTAGAGCATGGTGCTGGGTGATCCGCTGCTCTCTTCAGAGCCGGCAGGCAGGAACGTTTAAGTGTGTGCAAGCTGCGCCCACAGCCACCCCTTCCCCCAGGTGCTCTGTTGCAGGGAGATGGGAGTTTTATCTATAAGCCCCTGACTGGGGCCTCTGCCTTTCTTTCAGAGATGCCCTGCCCAGAGAGGAGGAATCTAGAGAGGCAGTCTGGCTACAGTGGCTTTGTGGAGCTGAGGTGGGCTTTGCCCAGTCCAAACTTCCCGGAGGCTTTGTTTACACTGTGAGGGGAAAACAGACTACTCAAACCTCATTAATGGTGGACGCCCCTCCCCCCACCAAGCTCCAGCATCCCAGGTCGACCTCAGACTGCTATGCTGGCGGTGAAAATTTCAAGCCAGTGGATCTTAGCTTGCTAGACTCCATAGGGGTGGGATCCGCTGAGCAAGACCATTTGGCTCCCTGGCATCAGCCCCCTTTCCAGGAGAGTGAAGGGTTCTGTCTCGCTGGCATTCCAGGCAGTACGAAAAAAAATTCCTGCAGCTAGCTCGATGTCTGGCCAAACGGCCACCTAGTTTTGTGGTTGAAACCCGGGCCCCTGGTGGTGTAGGCACCTGAGGGAATCTCCTGGTCTGTGGGTTGCGAAGACCGTGGAAAAAGCGTAGTTTCTGGGCTGGGTAGCACAGTCCCTCAAGGCTTCCCTTGGCTAGGGGAGGTAGTTCCCTAACCCCTTGCACTTACCGGGTGAGGCAACACCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCTCCGTGGGCTACACCCACTGTCTAACCAGTCCCAGTGAGATGAACCAGGTATCTCAGCTGGAAATGCAGAAATCACCTGCCTTCTCTGTTGGTCTCCCTGGGAGCTGCAGACTGGAGCTGTTCCTATTCAGCCATCTTGCCTGGGAGCCACTGTGGGCAAATCTTAATTGGAAGATAATGTAAAGAGATACATATTCATCTTCTTAAATATTAGAGGTATTTTTTATTGTTTTCTTTCTAG
Seq C2 exon
ATTTTCCTGGAAACATGAACTGCCAAGAGAGGAATGGGACACAAAACCAAACACTGTTTTATATTTATGGTTTGCAAACTGGCATTTCATCAGTGGCTAAATTCACAGATATCCTATATAGATTGTATACAGAACTGAGACTGATTTTGTACCGATTAGAATGATTGCTATGATCTTTGAGAAATTTTTCTGCACTATTTGCACTGAAATGTTTATTTATTGTTGATAAATTGTATCATATTTAAGTTCCACTGCTGTTCCTCTTACCTTGATTAAATGCCTATGCATGTACTTTTAGCTAGTTTTTAATATTTTATAAAACTTCATTTAAATTTGTATTTTTAACTTGAAGTTCCATTTCTTTATCAAGGATGGTATTTAGATTTTTTTCCTCTTAACCTTTTTTCAAAAACTATTTTCAACTGTGAGGAAACCCTTATTTTTCTTTCTTTGTGGATAAAACTTTCAAAAGCAATTTAAGATATTCATAGTGTTAGGAAACACCAAACCTGCCTATGTGCCATCTCACAAAAGAAACTTTTAATACCTACAATAAATCAAAAGAATAAACCAGCTGTTCTTATATATTGTTTCATTTTTAAAACTAAAGATGCATTTAAGAAGCAATACAAGTAAATATTTTACCTAATAGGAAAAAAAAAAGTTGCCTTTCATTTAAACCATTCCAACAGAAATTCTTATGCTAATTTAAAACATATATATATCTGGTAGGTTTGTGGTTGGATAGGTTTTCTAAATTCCTAATGTTAAAAACAATCTTTATGTTAATATACACTAAATCTATACACAAAAAAAGTCAGTGAACTTTTCTGACCTTTACTGTGAGTTACCTTTTCCTAAGAGGAAAGCTATAGTAATAAGTAAAATTTAATTTTTAGGCAATCCTGATTTTTAATGAATTTAATTGAGTGTTCTTGTATACTACATTGAGCAGTTTGCTTCTATACCGTGTCACAAAATTCATGTATTTCTTGAGAAGCCCTAAAAGCTCATAAAGGAAAATGCCGTGAACTATGTAGCTCAGGCTTGGTAAGGTGCCATCTAAATTACAAAACAAACTAATGCATAATTTTGCTTAAATTTCATCCCAGTATGATTGTCTTCCCAACACCAGCATATAGTATAGATTGTCTGTCTTTTTTATATTTTTTAGTTCTTCCTGTACATGTTTTTGGCAATAAAGTTATAGGAAGAACAAAATTATTTTGTTAGAATTAAAACATGCTTAATATTTAGTCTGTTTGTGGAGGGCAGGTATTCACGTGGACTGAGATACAATGTTGGATACAGAAAATAACTTTCATTGTCTTCCTGACACTGTGCTAAGGACATGCTGTTAAAGCTTCAAAGTGACCAGATGAGGAAGGAATAATTAATTATTACTCCTGATTTGTAGATAACTGAGGTAAGAGTGTTTCAAATTTATGATAGTCTTTTGGGTATTCAGAAACCTTTCCTTATACTGCACTGGCCACCAGAGCTTAATTTTCCCAGCAGTTACAGCAATGGGAGATAGAACAGTCTCAATCTTTTGCCAACCATCAGGTTCCTAGAAACCAGGTAGGTGTATCCCATAACAAGGGAGGAGCATACCACAGCCCCTCATTTGATTAATTCATTTGATCTATCTATGTTATTAAGTACCTACTAGGAATAAGGCATTGTGGAAATACTATACAAAGATAAACATTGTTTAGATGCTTATCTACTTTCCTTTTCACCAGAAAAACAGAAAAAAAAGAAACATTTTCTTACAGAGTAAAAATGTTCTACATAATCACATGAGTAGTTCATCTCAGTGTTTTTTATTCTTTAAAGTTGAACTATCCCAGTTTCATTCTATACCATTCATTGGATAACCTTGTTACAACCCAGTCATGAAACAGAGCAGTGTGATCAGTTATCTGCATTTAACAAATAGACAAATCAGTTTACATAAAGGTTATGTATGTCACCCACGATGAAAAGAATCTGCATTTGAATATGCCCGTATGAATGTGGGTTCTGTTTTTGCAACAGAGATTAAGTGACCATTTTTTCTAATTTTATGGCTATATATTTTCTTCATAAAAATTGGTCACATCGGAGAAGCAGTGCCACAGGAAAAATGAAATGCATGTGAAAGTTTGTATTCTGATTTTACAAGATGAGATAGAAATCAGAATTAAAGAGGAATACTTAGGAGTTACTAGGCTAATCAGTGTACGAATTTGTCATAGGTAGAGATTTAAAGGTTAATATCTTAAAATAGAAGAAAATTCTAAATCAATCAATCAGTGAGATATAAACTAAACAGACCCACTTCAAAGTTGAAAGAAATTTCTAGGCATAAATTGAGACTAGGAAATTTATATCAGAATAGAGGGTGCTTGACACATATATATGCTTAAATTGAAGGACAGCTCAGATTCATTTTTAGGAGAAGAAAGTAAACTAATGTGCTCTTAAAGAATAAAAATTTATTCTATGGTTTCTGTCTCTGATCATCACCTTCCATTCTATAAAAAGCTCAGTTACTGATTTGCTGGGTCATGGTCAAAATTCTTACCTATTTATTTCATATCAACTTTAAAAAATAAATTACTTGCATTCTATATATTACTAATTGGGAAGTAATATGCCTCAAATCAGTTTTATACTGGATTATTCCCTATGCTTTAAACCACTGCTCTCAATAAAACACTTCCTGATTAATGTTTGATTATTAGATATTTTAGTCTTGTTGGGGATATTTTAGTCTTGTTGGGTTAGCCATGCTCTGAAGAATCTGTGAAAGTACAGTAAAGTTTTAATAAGCAATAAATGTAACCTTTTATATAAATCTCAGTGCTAGGTTAACTTCTAATAAGCAGACGAACATGTTACATAAATTATAATGTCTGTCTTGTAAAAAAGTTGAGGGGACTAAAAGTTTATGACTCTGATATGGAAGTTGTCATATTAAAAAACTACATTTTAAAACATCAAATATTTATACTATTTGCTTTTCAAATAAAAGCATAGTGCTGTTTGGCATA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000155975-VPS37A:NM_152415:11
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
3' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.038 A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF072008=Mod_r=PD(7.3=40.7)
A:
NA
C2:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)