HsaINT0185499 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000142065 | ZFP14
Description
ZFP14 zinc finger protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29312]
Coordinates
chr19:36334453-36360533:-
Coord C1 exon
chr19:36360435-36360533
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Length
18844 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGT
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Seq C2 exon
ATTTGGAGTCCAGATACAGGACCAATACTTTATCTCCAGAAAAGGACATTTATGAAATATATTCATTTCAGTGGGATATAATGGAAAGAATTAAAAGCTATAGCCTTCAGGGTTCCATTTTTAGGAATGATTGGGAATGCAAAAGCAAGATTGAGGGGGAAAAGGAACAACAAGAGGGATATTTTGGGCAAGTGAAAATTACCTCTGAAAAAATGACCACTTACAAAAGGCACAATTTTCTTACTGAGTATCAGATCGTTCATAATGGAGAAAAGGTGTATGAGTGTAAGGAGTGTAGGAAGACCTTTATTCGTCGCTCAACACTTAGTCAACACCTGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCTTATAAGTGTAAGGAATGTGGGCAGGCCTTTAGACAGCGTGCACATCTTATTCGACATCACAAACTTCACACCGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCCTTTACAGTGCTCCAAGAACTTACTCAACATCAGAGACTTCATACGGGTGAAAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTTAGAGTACATCAGCAACTGGCTCGACATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGACTGTGGAAAGACCTTTAGACAGTGTACACACCTTACACGCCATCAGAGACTTCATACTGCTGAAAAGCTCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCGTATGTGGTCCAGACCTTAGAGTACATCAGAAAATTCATTTTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAGTGTGGAAAGGCTTTTAGAATATGCCAACAACTTACTGTTCATCAGAGTATTCATACTGGTGAGAAACCCTACGAATGTAAGGAATGTGGGAAGACTTTTAGATTAAGACAACAACTAGTTCGCCATCAGAGAATACATACTCGTGAGAAACCCTATGAATGTATGGAATGTTGGAAGACCTTTAGTAGTTACTCACAGCTTATTTCACACCAGAGCATTCATATTGGTGAGAGACCCTATGAATGTGAAGAGTGTGGAAAGGCCTTTAGACTGCTCTCACAACTTACTCAGCATCAAAGTATTCACACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAGGAATGTAGAAAACCTTTTAGACTGCTCTCACAACTTACCCAACATCAGAGTATTCACACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAGGAATGTGGTAAGGCTTTTAGACTTTATTCATTTCTTACTCAACACCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAGCCCTACAAGTGTAAGGAGTGTAAGAAGGCCTTTAGACAGCATTCACACCTTACTCAGCATCAGAAGATTCATAATGGAATTTAATAGAAGAAAGCCTTCAAATGTATATGATGTTACAGAACATCAGAAAATTCATTTTTGAGAAAATGTGTTTCATGCTCAATTCCAAGCATAATAAATTTTATATTAGAGAAAGAATATGTTGATTTAAAAGCCTTCCAACACCATTTAAACATGGTTTATCTTCAGCAAATTCCTATGAGAGAATAATGTAATGAATGTAGGAAAATCTTTAGCCTTATCTGTCATTATCTCCCTTTCTCCACTTGATTACCAGTTTGATTTATTGGACAAGATACTAAGCTTCTGTGCCTCATTTTGCTGACTTGTAAAATGGTAATAATAGTACTTATATGTATTAGTTATTTATTGCTGCGTAATAAATTACCACAGACTTAGTAGCATAAAATAACATATAATTATATCTTATAATTTGGATCAGGAGTATAGGCATGACTTAGTTGGGTCCTCTGCTTCAGGGTCTCTTGCAAGGCTACAGATTTCAGCCAGGGCTGAGGTCTCATCTGAAGGCTCAACTGGGGAAGGATCCACATCCAGACTAACATAGTTGTTACCCAATGTATTTCCGTGAGGCCTGTTGCATTGAGATTCTCAGTTTCTAGCTGGCTGTTGGCTGAACGCTGACTGCAGCTCCTGGCCACAATAGCCTCATCAACATGGCTGCTTGCTTCATCAAGGCATGCAAGCCAAAAGGGAGGACAGTCTGCTAGCAAGATGGAAGTTACCATCTTGTGTAATCTAATCATGGAAGTAACATTCCCTCACCTTCTACTGGTAGAAGTAAGTTACTAGGATAGTCCACACTCAAGAGAACGGGATGATACAAGAGTGTGAATAAGTCCTGGAGACAGGACCACTGGGGGGCCTGTTTAGAGTCAGCCTGCCACACTGTGGAATAGGATTGTTGCAAGGAGTAAGTAGTTAATACTTGGAGGAATCACAGTCATATAGCATGTATTCTGTAAATATTATCTGTAATTGTTATTATTGTCATTAGTATTAGTGAATTCACGTAAAAGGAAGATCTGTAGACATAATAAATGTAGAAATGCCTCCTGTCACCTCTCAGAAATTATTAAACATAATTTATTCTAGGTAAAATTTAGATTGTAGTGAATGTAGGAAGTTCTTCAGCACTTGAGCTGCATTAGAAATTTCATGCCAAAAATGAATTTCATGAATGTGAGGTCACTAGTAATACAGCTGTTGAAGAATTAGAGGGAAATAGGAAATGATTTTCCCATAATTCCAGAAAGCAAAAGGCTTACAATCCCTGTTGTCTGACCACAGTTTAAAATTAATTAGAAACTATCAAAAATGTGGCTTAAAAGAAATTAACCACCTAGGAATTTAATATTGTTGTGTATATTTATGTGTGTGTATAAAACTCCTGTGGGAAAGAAACAAAACATCATTCTATAAGTCAGTATACTTTTGGATGCTCAAAATGCCATATCTTCAACCAGTAGGAGTTGTTTCAAGTTGAGTTTTTGATGTGATCCCACCAATAATTTGATAGTTTACTTGATTGTGGCTGCATAATTTGGTAACCTATGAAAGATGCTAGAGCACCAATGTATAATTTTTTTGAGACAGGGTGTCACTTTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTACAAGCACAGTTCACTGTACCCTGTTCCTCCTGGGCTCAAGTGATTCTTCCACCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTAGAGAAAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCTCCTTGGCCTCCAAAGGTGCTGGGGTTACAGGTATGAGCCACCACACCCAGCCCAACTCATTATTCTTGAAATCAATAAATCAGAGGAAAAATTGTCATTTAGTTTCCTTTTCCCATGTGAACCAAATTTCAGGGTCACCAGAAGTTCATCAAATTCAAATGAATTTGGCCTGGCACAGGGGTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGACAAGGTGGGTGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGTTAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAAGAGGCAGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAATTTGTTTTTTGAATGGGTTTTTCTTTTTTGAAGAAGTCTAATAAATCTAGAAGGAATTAGAGGATTAGAAAAATCACCATTTTCTAGACCTTAATGGAATAATGGGTCCAGAAAACATGATCTTCAATGGGTACTACAACTAATAGGTGAAATATTTTATAGCGAGATTTTTATGGTGGATCTATCAAACTGGCCACCTCTGAACCCTTTGATCTGTTTTAACCTTAATAAAAATGGGTCTATCAGACAACACACTTCCTGACGTAATGCAATAGGAAGTCCACACCACCATCTACAAAGCCTTATTGCTGGAATAATGAACTGAAAGCAGACAGGGACTAGATGAACAGTATATGGTCATCCCTTGGTATCCATGGGGAATTGGTTCCAGGATCCTCCACTGATGGTAAAATCTGAGGATGCTCAAGTCCCTTGTATAAAATGGCATAGTATGTATTTGCATATTACCTACTCACATCTTCCTGTATACTTTAAATTATCTTTAGATCACTTATACCTATCACAATGTAAATACTATGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTTTCAATTTGCATTATTTTTATTGTATTTTATTTTTATTGTTTTTTTTTGAGTATTTTCTATTTGAGATTGGTTGAATCTGCACATATGGAGGGCTGGCTATAAAGGGCACCACAAGGAAGAAGCCAAACAGATCCAGAATGTGTGAAATTCTACAGAGCAAATTACCTGATTTCTTCAACTAACAGGTAGCATGAAAATACAAGGGGAAGGGCAACCATTAACAGATTAAAAGAGACTTAAAGAGACATATCAACTAAATTCAGTATGTTGGCATTACTTGGACCTGGTTTGAACAAAACATAAAAAGCCATTTTGGAGACAGTGAGGGAAGTGTGGACATGGACTAAATATTAAATGATATTTACATATATTAATTTGGTTAGGGATTATGTCAGTGTGATTATAAAAAATAAAAGATCGTATGATATGAGATACATACTATGAAATGAAGATAGACACATTTGGATTAAAATATTCTAGCAAAAGAAATAATTGGCAAAGAGAGCTGGAAACTAAATTGGCAACATGTTGATAATTTAAGTGGAGTGTTTTGTTCATGGAGACTTATTGTTCTAATATTTCTACTTTTGTATGTGTTTGAAATTTCAATAATAAAATGTTTAAAATCAAAACCAAAATTATAGACTATGTAGAAATGAATGACAGTGAGATGCCTGCACATCTAACCTTGTCAGATATAATCAAAGTTCTGTTCAGTGACAAATTAATGCCCTGTAATGTGGTAAGGAAATCTTATTTGTGGATACAGTCTTCATCTTCTTCACTTACCCACAGCAGCAACACCAGGCCTGTCACACAGATGAATGTGTTGAGGGAATGAATAAGTATTTCCGTCAAGAAAAAGGAAACAACAAAATAAAACCAACCCAAGTAAAGAACAGCCAAGTGGCCAGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCATGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCGGGATTTTGAGACCAGCCTGACCAACACTGAGAAACCCCATCTCTATTAAAGATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGTTTGTGGTGAGTTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGAGTCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGCCAAGTAACAGTAGAAAGTAGAAATTAAGAGAATGGAGAATATTAGACTTGATTCAATGTTAATAGTGATTAGATTTTGGCAGTTATAATCAAGGAAGAGAAAATGAAAGATAATACATTTAGAGTATTAATGATGATAAAAGAGACACAACTCTAGATTATATCAAGCAGATTTTTAAAATTATAAGGCAAAACTAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATAGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGTCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCTAAGCTACTGGGGAGCCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAACCAAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAACCTGTCTCAAAAATAATAAACATAATATGGTAAAACTATACATGCACACATGCACAAACGTGTATATTCATTCCAGTACAAGTAAAAATGTAGGATTGCATTTTTCCCCCAAAAGGAATATGTTTTACAATTAACTCACCGTATAACCCAAATAGATTAACAAAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACTCCCTGTTTAAAAAATCTGATACTTATAAAAACTTTAAGGAATAGATAATCCTAAAGATTTTACCAATTAATTCTGCAAGGTAAAATAATCCTAATAAAAATTAGATGAAGATAGTTTCTGAAAGCAAATTCTAGACCACCTTCATTATGAAGATTCTATTTTTCACAATTCTAAATAAAGTTTATTTAGAATTTATTACAAAATCTATCTTTGCTAATAGGTCAGTGTTTCTTTTCCCAAGCACCAAATACCTCCAGAAAGCCTGTGTTTGACCCCTAAATTCAACATTCTCCAGAAGTTTGCTTCAAGGAATATTAATTCTCGATGGTATTTGAAAAAAAGATTTCTTGGGAAAATAGGCAAATGAAGCAAAACATAAAACATCTACTTTTGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCAAGGCGAGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCTTGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAAATGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATTTTGCCATTGCACTCCAACCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCAGTCTCAAATAAAATAAAATAAAAATCTACTTTTGAGGAATTCAAAGTATACATGATCAGTTTGCCAAAGATTTAGTAAAGACATTTTTATTTAACTGAGTGTATCTCAAATTTATTGTGGAATTCTCAGTCCGAATATCTGGAATAGGAACAGCTTTGTTAGATGCTACCATAACCACAATGAATGTCTTCAAGGGTGTAATTTTAGATATGGTGAGTGGTTGTGTTGGGGGCGGCATAAGTCAGGGCAATTTTTTGCAGCTCATATCATGCTCTGAAAGTAGCTACCTGCTTTAATGGATGGTTAGTGCTTTTCTATAGAATGGAAAAGATTCCAGCCCGATCCTTGATATGTTTGTGTTAAACATGCTTATATATTATATTAAACAATGATTAAGGACATAAATGAGTTTCTGTGGTAATAAAGATGCTATATTGAATATCA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000142065:ENST00000270001:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.103 A=NA C2=0.020
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains