HsaINT0187510 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000175322 | ZNF519
Description
zinc finger protein 519 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30574]
Coordinates
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Seq C2 exon
CTGTGTATTCTTATTACAACCAAGGCATTTTACCAGAGCAAGGCATACAAGATTCATTCAAAAAAGCAACACTGGGAAGATATGGGAGCTGTGGCCTTGAAAATATATGCTTATGGAAAAACTGGGAAAGTATAGGTGAAGGTGAAGGACAAAAGGAATGTTATAATCTATGTAGCCAATATTTGACAACTAGTCATAACAAACATTTAACTGTGAAAGGAGACAAAGAATATAGAATATTTCAGAAGAAGCCTCAGTTTCTGTCAGCTGCTCCTACAGAACCATGTATTCCTATGAATAAATATCAACATAAATTTTTGAAATCTGTCTTTTGTAATAAAAATCAGATAAATTTTAACCATGACTCAAATATTAGTAAACATCATAGTACTCATTTTCTAGAAAACTATTACAATTGTAATGAATGTGAAAAAGTATTTTACCAATCCTCAAAGCTTATTTTCCCTGAAAATATCCATATTCAAAAAAAGCCTTACAACTCTAATGAATGTGGTGAAACTTCTGACCCATTCTCAAAGCTTACTCAACATCAAAGAATTTATATTGGAGAGAGCTCACAAAGATGTAATAAAAAATGTATAATAGTCTTTAGTCAATCACATCTAAAGGGACATAAGATAATTAACACTGGAGAAAAATCAGTGAAATATAAAGAACGTGGCAAAGCTTTTACCAGGGGCTTACATCTTGGACATCAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTAAAAAATGTGACAAAGCCTTTAACAAGAGTTCACACCTTGCTCAACATCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAGCCTTTCAAGTGTAAGGAATGTGGCAAAGCTTTTAACAGAGGCTCATACCTTACTCAACATCAGAGAATCCATACTGGAGAGAGAGCTTTCAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACAGGGGGTCATACCTTACTCAACACCAGAGAATCCATACCGGAGAGAAACCTTTCAGATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTAATAGAAGCTCATACGTTACTCAGCATCAGAGAATGCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAGTGTAAGGAATGTGGCAAAGCTTTTAACAGAGCTTCACACCTTACTCAACATCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAACACTTCAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACAGGGGCTCACACCTTACTCGACATCAAAGAATCCATACTGGAGAGAAGTCTTTCAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTATCTGGGGCTCACACCTTACTCAACATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAATTCTTCAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCTTTTACCAGGAGCTCACACCTTACTCAACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTAAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACAGACGCTCAACCCTTACTCAACATCAAATAATTCATACCAGGTAGAAACCCTGCAAGTGTAAAGAATGTGCTAAAACCCTAAACTGGTGCTCACACCTTACTCAACATTAGAAAATCAATACTGGATAGAAATCCCATATGTGTAATGATTTTTGAAACATCAAAATGAAGATTAAATAAAAATTAGAAGTGTCACTTTAGAAAGAACTAAGGTGCTAGCACTTCCGTAAATTACTCTGAATCAGTGTGTTTATTATAACAAATAATTCAAACTCAATTAGATAATTAAATTGTATGTTTAAAAAGAGGGACGACATTGATGGAGAGGCATAATTATATTCAATGTTCACTTATTTTTGTAATCACAGTATTCATGATTGAGAAAGTATTATTGATGTAATTAAATTCAAATTAACCTTTTTTTTCCCCACTGTGGTTGATTATTGCTGTCTCTGACATGAGAGTCCCTTCTACGTTAGGTAGGCATCATTCACATGTCTCATTCACATGTCATCATTCACATGTCTCATGACGTCATTCACAAGTTTCCCATGGAAGACTAAGAGCATTGGCATATAGGATGTATGATGAAATCTAAATGGAGTTGCTCTTTTTGTTTGACTTACAACACTGAATATAAGTCATATATGAGTTAGGTGTTCAGAATATTATTGTTCTGCATTAAAGTGTGAGACAGAAACACTCTGAGTTTTAGATATGAATAGTTTTACCAACTACCCATTAAAAGGTCTTGCTAGTCCATTAATATTCTAATGTATCTTCATAGCAGCAAGTTAGAAGTCCTGAATGTTACTGTGATAACAATAAAGAAATCACAAATATCAGAGAGTGGTGCAAATAACTTCTCTCTGGTAGAACATAGATTATTAATTCAATCCTCTAAATACTTAGGCTCAGTTTAAGAAAAGAGAGAACACATTTTTTTAACATAGGTCATGGTATCAGAATAAGAATGCTTTTTGAATGTTTGCAGTCTGTAATTTTGATGATTGAGGAAACTGGATTTTGAAATGCTTTATTCAGTCTGTAAACTTAATTTTTTTTTAAGAATAAAATGAAATGTCTTTTAATTTGTTAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000175322:ENST00000590202:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.082
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=WD(100=95.3)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains