HsaINT1011961 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000151914 | DST
Description
dystonin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1090]
Coordinates
chr6:56614356-56624628:-
Coord C1 exon
chr6:56624530-56624628
Coord A exon
chr6:56614485-56624529
Coord C2 exon
chr6:56614356-56614484
Length
10045 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAATC
5' ss Score
7.05
3' ss Seq
TTACCGCTCACAACTGTCAGAAG
3' ss Score
2.56
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000151914:ENST00000370788:32
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.100 A=NA C2=0.535
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
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R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
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